Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 20, № 2 (2025)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Научные обзоры

Белок HMGB1: регуляция специфическими Е3-убиквитин-лигазами

Чихиржина Е.В., Томилин А.Н., Цимоха А.С.

Аннотация

Белок HMGB1 относится к семейству белков с высокой электрофоретической подвижностью (high mobility group), отличительной особенностью которых является наличие структурно-консервативного ДНК-связывающего HMGB-домена. Помимо двух ДНК-связывающих доменов, соединённых коротким линкером, белок HMGB1 содержит в своём составе короткую N-концевую последовательность и неупорядоченный участок в С-концевой области. Показано, что посредством отрицательно-заряженного С-концевого участка HMGB1 модулирует ДНК-белковые и белок-белковые взаимодействия. HMGB1 принимает участие практически во всех ключевых клеточных процессах, включая репарацию и транскрипцию, а также вовлечён в организацию хроматина. Кроме того, для белка HMGB1 показано функционирование в качестве молекулярного фрагмента, ассоциированного с повреждениями и запускающего воспалительные процессы. Поскольку активность HMGB1 критически важна для поддержания нормальной клеточной активности и жизнедеятельности, нарушения его функционирования часто связаны с возникновением и развитием различных заболеваний, включая онкологические и сердечно-сосудистые, воспалительные процессы, а также аутоиммунные расстройства. Таким образом, для поддержания нормальных функций активность HMGB1 в клетке должна строго регулироваться на уровне экспрессии гена, посредством посттрансляционных модификаций и на уровне стабильности белка. В последние годы были идентифицированы специфические Е3-убиквитин-лигазы, которые способствуют деградации белка HMGB1 через убиквитин-протеасомную систему. В настоящей работе приведён обзор таких ферментов и обсуждаются их функции.

Гены и Клетки. 2025;20(2):72-86
pages 72-86 views

Оригинальные исследования

Оптимизация протокола медленной криоконсервации трёхмерных клеточных структур на примере органоидов мозга и хондросфер

Баринова А.А., Голубинская П.А., Пикина А.С., Ручко Е.С., Еремеев А.В.

Аннотация

Обоснование. Криоконсервация является широко применяемым методом длительного сохранения жизнеспособности культур клеток или сложных клеточных структур, включая органоиды, которые используются как для научных задач, так и в скрининговых исследованиях и клинической практике. Данных о криоконсервации органоидов на основе дифференцированных производных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) в настоящее время недостаточно.

Цель. Оптимизация протоколов медленной криоконсервации нейральных органоидов из дифференцированных производных ИПСК и хондросфер.

Методы. Нейральные органоиды, полученные из дифференцированных в нейральном направлении ИПСК человека, на 9, 14, 22, 29 и 43-и сутки подвергали криоконсервации в четырёх вариантах растворов. После размораживания оценивали целостность и размеры органоидов, выполняли количественную полимеразную цепную реакцию на нейральные маркёры МАР2 и NES, а также иммуногистохимическое (ИГХ) окрашивание на бета-3-тубулин, МAP2, SOX2 и ядерный антиген пролиферирующих клеток (proliferating cell nuclear antigen, PCNA).

Хондросферы получали из хондроцитов человека и криоконсервировали их через 29 дней после перевода в 3D-условия культивирования в растворе 82% DMEM + 10% FBS + 8% DMSO + 10 мкмоль ROCK-ингибитора Y27632 (Ri, Rho-associated protein kinase inhibitor). После размораживания проводили ИГХ-анализ на экспрессию хондрогенных маркёрных белков аггрекана, коллагена II типа и SOX9, а также на PCNA.

Результаты. Нейральные органоиды, замороженные на 3–6-й неделе от начала дифференцировки, показали наибольшее сохранение целостности после разморозки. Через неделю после разморозки диаметр нейральных органоидов уменьшался в среднем на 14,5%, однако ещё через неделю их размер практически достигал значений на соответствующий день дифференцировки для органоидов, не подвергавшихся криоконсервации. Количественная полимеразная цепная реакция, а также ИГХ-окрашивание показали сохранение нейрального фенотипа клетками нейральных органоидов через 2 нед после разморозки. Хондросферы в течение 2 нед после разморозки не демонстрировали изменений диаметра и показали 100% сохранение целостности органоидов. ИГХ-анализ продемонстрировал присутствие хондроцитарных белков в хондросферах через 2 нед после разморозки.

Заключение. По итогам исследования оптимальной стадией для криоконсервации нейральных органоидов на основе ИПСК можно считать 3-ю неделю от начала дифференцировки, а криопротекторный раствор 82% DMEM + 10% FBS + 8% DMSO — наиболее подходящим для заморозки. Этот раствор также подходит для криоконсервации хондросфер.

Гены и Клетки. 2025;20(2):87-105
pages 87-105 views

Моделирование взаимодействия аэрозольных частиц с клетками лёгочного эпителия на базе платформы «лёгкое на чипе»

Канев И.Л., Верхолашин М.В., Тайлаков М.Е., Антонова О.Ю.

Аннотация

Обоснование. Оценка ингаляционной токсичности естественных и искусственных аэрозолей, а также эффективности аэрозольных лекарственных средств является важной практической задачей. Однако во многих in vitro исследованиях в настоящее время тестируемое вещество растворяют в жидкости, полностью покрывающей клетки лёгочной ткани. Для ингаляционной терапии эта методика является значительно отличающимся от физиологического сценарием взаимодействия аэрозоля с лёгочным эпителием.

Цель. Создание платформы для изучения взаимодействия вдыхаемых аэрозольных частиц с лёгочным эпителием на внутренней поверхности лёгочных альвеол на границе раздела жидкость–воздух, способной имитировать сценарии периодического изменения уровня жидкости при дыхании.

Методы. В качестве модельной культуры клеток лёгочного эпителия использована культура клеток аденокарциномы человека А549. Анализировали показатели сохранения жизнеспособности клеток методом флуоресцентной микроскопии при различных параметрах экспозиции на границе раздела жидкость–воздух, а также при осаждении аэрозольных частиц различной природы.

Результаты. Сконструирована и испытана установка, имитирующая внутреннюю поверхность лёгочных альвеол, которая представляет собой слой клеток на границе жидкость–воздух. Клетки культивируются на пористой полимерной мембране, находящейся на поверхности резервуара с культуральной средой. Степень обводнённости клеток контролируется с помощью изменения давления жидкости под мембраной и регистрируется с помощью оптического датчика, который измеряет степень рассеивания лазерного луча, отражённого от поверхности клеточного слоя. Мембрана с клеточным слоем размещена в камере, позволяющей создавать направленное электрическое поле, перпендикулярное потоку аэрозоля, проходящего над клеточным слоем (слой соединён с одним из электродов). Наличие электрического поля позволяет многократно ускорять процесс доставки аэрозольных частиц, имеющих электрический заряд, на поверхность клеток. Определены параметры статической экспозиции модельного монослоя клеток на границе жидкость–воздух, позволяющие сохранить высокую степень выживаемости клеток. Продемонстрирована эффективность циклического режима изменения обводнённости клеток, имитирующего дыхательный цикл для сохранения жизнеспособности клеток в течение длительного времени (60 мин). Продемонстрирована эффективность наноаэрозольной формы противоракового препарата доксорубицина при осаждении на поверхность опухолевых клеток аденокарциномы человека, находящихся на границе раздела фаз жидкость–воздух. Модельный аэрозоль нетоксичного вещества (глюкозы) не проявляет токсического действия в аналогичных условиях.

Заключение. Предлагаемая модель «лёгкое-на-чипе» представляет собой комплексную платформу для изучения ингаляционной токсичности естественных и искусственных аэрозолей, а также проверки безопасности и эффективности аэрозольной формы лекарственных препаратов in situ.

Гены и Клетки. 2025;20(2):106-119
pages 106-119 views

Кардиомиоциты человека, полученные путём направленной дифференцировки индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, как модель для изучения аритмогенности на примере изопреналина

Коваленко С.Г., Фролова Ш.Р., Романова С.А., Цвелая В.А., Сюняев Р.А., Агладзе К.И.

Аннотация

Обоснование. Кардиомиоциты человека, полученные методом направленной дифференцировки из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК), представляют собой перспективную модель для изучения аритмогенности и электрофизиологических реакций при бета-адренергической стимуляции. Изопреналин, неселективный бета-адренергический агонист, широко применяется как в исследованиях электрофизиологии сердца, так и в клинической практике для лечения брадикардии, сердечной блокады и остановки сердца. Однако количественные данные о его воздействии на ионные каналы человеческого сердца остаются ограниченными, так как большинство исследований выполняются на моделях животных и в условиях, не отражающих физиологическую норму.

Цель. Исследование влияния изопреналина на потенциалзависимые ионные каналы в желудочковых кардиомиоцитах человека, полученных методом направленной дифференцировки из ИПСК от здорового донора.

Методы. Методом пэтч-кламп были зарегистрированы токи ионных каналов, включая быстрые натриевые каналы, кальциевые каналы L-типа и медленные компоненты калиевых каналов задержанного выпрямления. Желудочковые кардиомиоциты человека получены методом направленной дифференцировки из ИПСК здорового донора.

Результаты. Установлено, что изопреналин в концентрации 1 мкМ значительно усиливает активность ионных каналов, увеличивая амплитуду быстрых натриевых токов на 73%, кальциевых токов L-типа — на 120% и медленных калиевых токов — на 98%. Кроме того, получены дополнительные параметры электрофизиологической активности, что позволило глубже понять бета-адренергическую реакцию в человеческих кардиомиоцитах.

Заключение. Определена ценность использования кардиомиоцитов человека, полученных методом направленной дифференцировки, как надёжной модели для изучения аритмогенности и реакций на бета-адренергическую стимуляцию. Эти количественные данные могут быть полезны для построения математических моделей функции сердца и прогнозирования поведения сердечной ткани при симпатической стимуляции.

Гены и Клетки. 2025;20(2):120-129
pages 120-129 views

Эквивалент конъюнктивальной ткани на основе коллагена: исследование биосовместимости и биомеханических свойств in vitro

Криволапова Д.А., Андреев А.Ю., Суббот А.М., Аветисов С.Э., Осидак Е.О., Ильина П.Н., Панова А.Д.

Аннотация

Обоснование. Создание эквивалента конъюнктивы, способного замещать дефекты ткани и предотвращать патологическое рубцевание, — ключевая задача разработки биоматериалов, для изготовления которых часто используется коллаген, в реконструктивных вмешательствах. Оценка биосовместимости и биомеханических свойств таких биоматериалов способствует развитию перспективных хирургических методик устранения дефектов конъюнктивы.

Цель. Оценить биосовместимость эпителиальных клеток конъюнктивы (ЭКК) человека и коллагеновой мембраны (КМ) оригинальной технологии in vitro; отсутствие её цитотоксичности для ЭКК; морфологию и паттерн характерных белков ЭКК на КМ; охарактеризовать биомеханические свойства КМ в сравнении с нативной конъюнктивой.

Методы. Первичная культура ЭКК получена эксплантным методом и верифицирована путём окрашивания на маркёры цитокератин 7 и муцин 5АC. Исследовали КМ с концентрацией коллагена 10 и 30 мг/мл. Цитотоксичность КМ 30 мг/мл оценивали при высеивании ЭКК в плотности 50 тыс./см2, проведя MTS-тест и оценку на выживаемость путём окраски кальцеином АМ и Hoechst. Морфологию ЭКК оценивали по фазовоконтрастным снимкам культуры клеток после посева на КМ и иммуноцитохимического окрашивания на цитокератин 7 и муцин 5АC. Биомеханические показатели КМ 30 мг/мл и конъюнктивы исследованы статическими и динамическими тестами на машине-инденторе.

Результаты. По результатам фазовоконтрастной микроскопии, в течение недели после посева на КМ 10 мг/мл отмечена миграция ЭКК во внутренние слои носителя, на КМ 30 мг/мл выявлен рост сливным монослоем по поверхности мембраны. Тест на метаболическую активность не установил значимого различия между группами контроля и КМ 30 мг/мл. В тесте live/dead и в группе контроля, и в группе КМ 95% клеток были положительно окрашены кальцеином. Иммуноцитохимический профиль ЭКК не изменялся: как и в группе контроля, на КМ клетки экспрессировали характерные для конъюнктивы цитокератин 7 и муцин 5АC. Показатели модуля Юнга КМ и бульбарной конъюнктивы оказались сопоставимыми: 0,0008739±0,0004332 и 0,0009472±0,001323 ГПа соответственно (p=0,0549). Показатель твёрдости КМ оказался выше конъюнктивы (p <0,0001), а показатель вязкости — ниже показателей нативной ткани (p <0,0001).

Заключение. ЭКК сохраняли жизнеспособность после посева на исследованные КМ, подтверждая отсутствие её цитотоксичности. Миграция ЭКК вглубь матрикса свидетельствует о способности материала создавать благоприятную микросреду для эпителизации конъюнктивы и резорбироваться после заселения клетками. Сохранение молекулярного паттерна ЭКК свидетельствует о высокой биосовместимости КМ с клетками конъюнктивального эпителия. КМ 30 мг/мл обладают упругостью, аналогичной конъюнктиве; имеют бóльшую жёсткость и меньшую вязкость. Перспективна оптимизация биомеханических свойств КМ под конкретные клинические задачи.

Гены и Клетки. 2025;20(2):130-140
pages 130-140 views

Возрастные особенности иммунофенотипа мезенхимальных стволовых клеток периваскулярной жировой ткани у пациентов с пороками сердца

Слесарева Т.А., Учасова Е.Г., Дылева Ю.А., Горбатовская Е.Е., Белик Е.В., Матвеева В.Г., Торгунакова Е.А., Двадцатов И.В., Халивопуло И.К., Тарасова О.Л., Груздева О.В.

Аннотация

Обоснование. На сегодняшний день имеется ограниченное количество исследований, раскрывающих роль мезенхимальных стволовых клеток (МСК) периваскулярной жировой ткани (ПВЖТ) в патогенезе сердечно-сосудистых заболеваний, в частности пороков сердца, которым подвержены люди всех возрастов. В связи с этим представляет интерес изучение биологических особенностей МСК ПВЖТ при данной патологии. Профиль экспрессии поверхностных маркёров является базовой характеристикой клеток, которая отражает их функциональное состояние, поэтому данная работа посвящена оценке и сравнительной характеристике иммунофенотипа МСК ПВЖТ, полученных от пациентов разных возрастов с пороками сердца различной невоспалительной этиологии.

Цель. Изучение морфотипа и иммунофенотипа МСК ПВЖТ у пациентов детского и пожилого возраста с пороками сердца разной этиологии.

Методы. В исследование было включено 16 пациентов с пороками сердца разных возрастных групп. Из ПВЖТ выделяли МСК и культивировали их. Со 2-го по 4-й пассаж проводили исследование уровня экспрессии данными клетками поверхностных маркёров СD90, CD105, CD73, CD34 и HLA-DR методом проточной цитофлуориметории.

Результаты. В культуре МСК, полученной из ПВЖТ пациентов детского возраста, на 2-м пассаже лишь 47,97% клеток экспрессировали специфические поверхностные маркёры. Однако с увеличением количества пассажей число клеток с фенотипом, характерным для МСК, повышалось (р=0,0016). При пассировании МСК ПВЖТ пациентов старшего возраста обнаружено, что на втором пассаже 95,98% клеток несли на своей поверхности специфические маркёры, экспрессия которых уменьшалась по мере пассирования и к 4-му пассажу снизилась до 44,59% (р=0,0016).

Заключение. Изучаемые поверхностные маркёры (СD90, CD105, CD73, CD34 и HLA-DR) экспрессировались в МСК ПВЖТ пациентов старшего возраста с пороками сердца невоспалительной этиологии слабее, чем в МСК ПВЖТ, полученных от детей со схожей патологией сердца.

Гены и Клетки. 2025;20(2):141-151
pages 141-151 views

Прорегенераторные эффекты 5-гидрокситриптамина в культуре фибробластов кожи и мезенхимальных стромальных клеток подкожно-жировой клетчатки

Чибирова Т.Т., Кокаев Р.И., Ислаев А.А., Кокаев Г.С., Скупневский С.В.

Аннотация

Обоснование. Мезенхимальные стволовые клетки кожи и подкожно-жировой клетчатки играют важную роль в регуляции регенерации эпителиальных покровов, так как пролиферируют и дифференцируются в клетки кожи для возобновления взамен повреждённых или мёртвых клеток и также действуют аутокринным и паракринным путём для активации регенерации тканей и процесса заживления ран.

Цель. Определить в эксперименте in vitro влияние серотонина на регенераторный потенциал (пролиферацию, миграцию, клеточную гибель) фибробластов дермы (ФД) и мезенхимальных стромальных клеток подкожно-жировой клетчатки (МСК-ПЖК).

Методы. Исследование проводилось на первичных культурах ФД и МСК-ПЖК, получаемых от крыс линии Wistar и разделённых на группы: ФД/МСК-ПЖК — стандартная питательная среда; ФД/МСК-ПЖК — с добавлением серотонина. Морфологию и пролиферацию оценивали визуально с помощью микроскопа Axio Vert.A1 (Carl Zeiss, Германия). Изучали динамику миграции клеток в «культуральной ране». Клеточную гибель в результате апоптоза и/или некроза оценивали с помощью флуоресцентной микроскопии с применением набора Annexin V-FITC/PI (ServiceBio, Китай).

Результаты. Как ФД, так и МСК-ПЖК отреагировали на введение в стандартную среду серотонина повышением пролиферации. В результате подсчёта количества мигрировавших клеток выявлено повышение условной скорости перемещения МСК-ПЖК в условиях добавления серотонина. Отмечено также меньшее количество клеток, подвергшихся некрозу и апоптозу, в культурах клеток с добавлением в среду серотонина.

Заключение. Активация сигнальных механизмов серотонина играет важную роль в заживлении ран в контексте различных травм кожи и подкожно-жировой клетчатки, способствуя повышению клеточной жизнеспособности, пролиферации ФД, пролиферации и миграции МСК-ПЖК, что было продемонстрировано в нашем исследовании. Исходя из результатов исследования можно предположить, что агонисты серотонина или рецептора 5-гидрокситриптамина могут быть потенциальными кандидатами для улучшения заживления кожи у пациентов с травмами. При этом направление реализации сигнальных влияний серотонина на клетки имеет выраженную тканеспецифическую избирательность и варьирует в зависимости от типа рецепторов и внутриклеточных сигнальных путей активации вторичных посредников.

Гены и Клетки. 2025;20(2):152-161
pages 152-161 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».