Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 61, № 2 (2025)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОБЗОРНЫЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ СТАТЬИ

Регуляция активности транскрипционного фактора NRF2 посредством деацетилирования, индуцированного SIRT1: возможная петля обратной связи SIRT1–NRF2

Гуреев А.П., Крутских Е.П.

Аннотация

NRF2 является одним из ключевых компонентов, обеспечивающих защиту клеток от повреждений. Его активность связана с другими сигнальными путями, которые могут оказывать на него как прямое, так и косвенное воздействие. К ним относятся белки, которые могут влиять на его активность посредством ацетилирования и деацетилирования, такие как p300/CBP, HDACs. Однако исследования разных научных групп иногда противоречат друг другу. С одной стороны, имеются данные, свидетельствующие о том, что ацетилирование повышает активность NRF2, в то время как деацетилирование снижает его активность. С другой стороны, некоторые результаты демонстрируют, что активация деацетилазы SIRT1 увеличивает посттрансляционную активность NRF2. В то же время сам NRF2 может влиять на экспрессию SIRT1, образуя петлю положительной обратной связи. В этом обзоре рассматриваются различные аспекты взаимодействия между активностью фактора транскрипции NRF2 и ацетилазами/деацетилазами, в первую очередь SIRT1. Кроме того, рассматриваются варианты непрямого взаимодействия между NRF2 и SIRT1 через другие сигнальные пути, связанные с PGC-1α и p62.

Генетика. 2025;61(2):3-11
pages 3-11 views

ОБЩАЯ ГЕНЕТИКА

Цитогенетические эффекты в культурах лимфоцитов человека, экспонированных гербицидом паракватом

Кузьмина Н.С., Орджоникидзе К.Г., Лаптева Н.Ш., Когарко И.Н., Петушкова В.В., Абилев С.К., Рубанович А.В.

Аннотация

Проведены эксперименты по кратковременному (один час) тестирующему воздействию гербицида параквата – сильнейшего индуктора окислительного стресса на культивируемые клетки крови (поздняя G1-стадия первого митоза, 4 х 10–8 моль/л) девяти здоровых доноров. В 60-часовых (краткосрочных) и в 120-часовых (долгосрочных) культурах лимфоцитов, подвергшихся воздействию параквата in vitro, средние частоты аберрантных клеток составили, соответственно 4.05 ± 0.55 и 9.42 ± 1.23%, что существенно превышает соответствующие контрольные уровни: 1.16 ± 0.30 и 1.70 ± 0.50% (р = 0.008 и 0.018, соответственно). Наблюдаемые генотоксические эффекты обусловлены в первую очередь индукцией этим оксидантом простых аберраций хроматидного типа (одиночные фрагменты), уровни которых составили 3.32 ± 0.40 и 8.92 ± 1.40 на 100 клеток при кратковременном и длительном культивировании лимфоцитов, соответственно (против 1.03 ± 0.34 и 1.56 ± 0.38 на 100 клеток в соответствующем контроле). В клеточных культурах обоих типов частоты парных хромосомных фрагментов также значимо (или на уровне тенденции) превышали таковые показатели в контроле (р = 0.046 и 0.068 для 60- и 120-часовых культур, соответственно). Различий между 60- и 120-часовыми неэкспонированными культурами клеток по уровню аберрантных клеток и аберраций хромосом всех типов не выявлено. Напротив, долгосрочные культуры лимфоцитов, подвергшиеся воздействию параквата, демонстрируют значимо повышенный уровень аберрантных метафаз и одиночных хроматидных фрагментов по сравнению с краткосрочными экспонированными культурами (р = 0.001). Показано, что долгосрочные эффекты характеризовались более высокими индивидуальными значениями показателя омега Коэна (w) – от 0.157 до 0.259 по сравнению с таковыми для 60-часовых культур – от 0.057 до 0.153. Полученные данные свидетельствуют об индукции геномной нестабильности в отдаленных потомках лимфоцитов человека, подвергшихся в начале культивирования кратковременному воздействию параквата, и ее индивидуальном характере.

Генетика. 2025;61(2):12-23
pages 12-23 views

ГЕНЕТИКА МИКРООРГАНИЗМОВ

Репаративная сборка хроматина играет важную роль в стабильности генома

Скобелева И.И., Евстюхина Т.А., Алексеева Е.А., Торощина А.В., Пешехонов В.Т., Федоров Д.В., Королев В.Г.

Аннотация

При завершении репарации ДНК важную роль играют процессы, связанные с восстановлением нормальной структуры хроматина. Некорректная сборка хроматина может привести к геномным перестройкам, которые, в свою очередь, могут быть причиной развития многих болезней, включая рак. Ранее мы обнаружили, что нарушения правильности сборки нуклеосом и их ремодулирования в процессе репаративной сборки хроматина приводят к повышенному уровню мутагенеза. В настоящей работе мы показали, что мутация asf1Δ имеет конститутивно гиперактивированную киназу Rad53, что служит причиной дезорганизации структуры хроматина и значительно изменяет спектр спонтанных репаративных мутаций. Нарушение сайта связывания адаптерного белка Rad9 с ДНК в результате инактивации гена DOT1 нивелирует hif1Δ-специфический мутагенез, который является следствием некорректной репаративной сборки нуклеосом. Отсутствие белка Rad9 при нормальных условиях роста и при обработке низкими дозами УФ-лучей приводит к аберрантной активации комплекса RNR. При этом дальнейшее увеличение дозы УФ-облучения практически не влияет на экспрессию RNR3. Эти результаты подтверждают, что корректная сборка хроматина критична для нормального функционирования генома.

Генетика. 2025;61(2):24-34
pages 24-34 views

Сравнительный анализ кишечных метагеномов пациентов с депрессией по сигнатурным генам Faecalibacterium prausnitzii на штаммовом уровне

Аверина О.В., Ковтун А.С., Даниленко В.Н.

Аннотация

С использованием двух различных методических подходов, биоинформатического и количественного ПЦР-анализа, был проведен сравнительный анализ кишечных метагеномов пациентов с депрессией и здоровых добровольцев по представленности сигнатурных бактериальных генов, кодирующих ключевые ферменты для продукции метаболитов, биомаркерных для депрессии, комплементарных генам из геномов комменсальной бактерии Faecalibacterium prausnitzii. С использованием in silico подхода была выявлена штаммовая специфичность этих биомаркерных генов, проведена их кластеризация на группы и исследовано распространение представителей различных групп в 36 метагеномах пациентов с депрессией и 38 здоровых добровольцев. К ряду генов из наиболее распространенных групп были подобраны праймеры, с использованием которых был проведен количественный ПЦР-анализ 15 метагеномов от пациентов с депрессией и 15 метагеномов от здоровых добровольцев. Сравнительный анализ полученных данных выявил статистически значимое снижение уровня представленности генов, кодирующих глутаматсинтазу GltB, аспарагинсинтетазу AsnA, серин-гидроксиметилтрансферазу в кишечных метагеномах пациентов с депрессией. На основе полученных данных можно рекомендовать эти гены как биомаркеры для разработки тест-систем для диагностики клинической депрессии по кишечному микробиому.

Генетика. 2025;61(2):35-44
pages 35-44 views

ГЕНЕТИКА РАСТЕНИЙ

Генетическая изменчивость и дифференциация популяций сосны кедровой сибирской (Pinus sibirica Du Tour) в Предуралье и на урале

Петрова Е.А., Белоконь М.М., Белоконь Ю.С., Мудрик Е.А., Валуйских О.Е., Горошкевич С.Н., Политов Д.В.

Аннотация

С помощью анализа аллозимных генотипов взрослых растений изучена генетическая изменчивость сосны кедровой сибирской, Pinus sibirica Du Tour, в западной части ареала. Установлено, что предуральские и уральские популяции обладают сходными паттернами генетической изменчивости и объединяются в две близкие группы, отличающиеся от популяции из Западной Сибири. Параметры внутрипопуляционного разнообразия изученных выборок в западной части ареала оказались ниже, чем в центральной, согласно ранее полученным данным. Клинальный характер изменчивости по некоторым аллозимным локусам, по-видимому, может отражать процессы расселения вида в северо-западном направлении из уральского рефугиума и быть результатом адаптации популяций к климатическим условиям Предуралья и Урала. Современная динамика ареала P. sibirica обусловлена антропогенным влиянием и климатическими изменениями, которые вызывают фрагментацию западной границы распространения вида и могут приводить к исчезновению отдельных островных популяций.

Генетика. 2025;61(2):45-58
pages 45-58 views

Изменение содержания аскорбата и профиля экспрессии генов его метаболизма в листьях чеснока Allium sativum L. В ответ на холодовой стресс

Середин Т.М., Щенникова А.В., Кочиева Е.З., Филюшин М.А.

Аннотация

У двух озимых сортов чеснока (Allium sativum L.) определена экспрессия генов ключевых ферментов L-галактозного пути биосинтеза аскорбата (АК) (VTC2, GPP, GalDH, GalLDH) и генов восстановления АК из окисленных форм (MDHAR1, MDHAR4, MDHAR5) в динамике (0, 2, 4, 6 и 24 ч) кратковременного (24 ч) воздействия холодового (2°С) стресса. Обнаружено, что в листовой ткани обоих сортов (Сармат и Дубковский) уровень транскриптов VTC2 стабильно растет в процессе стрессового воздействия. Сорта также сходны по экспрессионному ответу на стресс генов GalLDH и MDHAR1, но различаются по реакции генов GPP, GalDH, MDHAR4 и MDHAR5. В листовой ткани обоих сортов в динамике холодового стресса определено содержание АК, каротиноидов (сумма) и хлорофиллов (a и b). Показано, что количество всех анализируемых метаболитов исходно выше у сорта Сармат, чем у сорта Дубковский, и изменяется в динамике стресса сортоспецифичным образом. Для обоих сортов показана положительная корреляция между количеством АК и уровнем экспрессии гена GalDH.

Генетика. 2025;61(2):59-66
pages 59-66 views

ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ

Взаимосвязь полиморфизма генов GH и LEP С качественными характеристиками мяса овец

Скокова А.В., Скорых Л.Н., Суховеева А.В., Сафарян Е.Ю., Ефимова Н.И.

Аннотация

Проведено секвенирование ДНК овец породы советский меринос для выявления однонуклеотидного полиморфизма в генах GH и LEP, связанных с качественными показателями мяса. На основании проведенного анализа в нуклеотидной последовательности гена GH в экзоне 5 обнаружена миссенс-мутация с.321С>Т, приводящая к замене аргинина на глицин; в гене LEP в экзоне 3 выявлена миссенс-мутация с.387G>Т, результатом которой является замена аминокислоты валин на лейцин. Установлены частоты встречаемости аллелей и генотипов в обнаруженных вариантах полиморфизма с.321С>Т гена GH и с.387G>Т гена LEP. Выявлена взаимосвязь между качественным составом мышечной ткани у овец и их генотипическими вариантами по обоим исследуемым генам. Мышечная ткань гетерозиготного генотипа по мутантным аллелям с.321Т гена GH и с.387Т гена LEP содержала больше протеина на 3.3 и 2.4%, но меньше влаги на 3.3 и 2.4%, чем у овец гомозиготного генотипа по диким аллелям с.321С гена GH и с.387G гена LEP. Исследования длиннейшего мускула спины овец породы советский меринос позволили выявить большее количество мышечных волокон у носителей мутантных аллелей с.321Т гена GH и с.387Т гена LEP на 4.7 и 7.6%, но меньший диаметр мышечного волокна на 8.9 и 5.0% в сравнении с мышечными клетками овец, гомозиготных по диким аллелям с.321С гена GH и с.387G гена LEP. Общая оценка “мраморности” мышечной ткани у овец гетерозиготных генотипов по мутантным аллелям с.321Т гена GH и с.387Т гена LEP выше на 2.3 и 1.5 балла, чем у гомозигот по референсным аллелям с.321С гена GH и с.387G гена LEP. Полученные результаты позволяют рассматривать полиморфизм с.321С>Т в гене GH и полиморфизм с.387G>Т в гене LEP как генетические маркеры для оценки и улучшения качественных показателей мяса овец.

Генетика. 2025;61(2):67-74
pages 67-74 views

Анализ взаимосвязей экспрессионных изменений микроРНК miR-767, miR-335-3p и miR-106b-5p и метаболитов молока и сыворотки крови коз (Capra hircus)

Позовникова М.В., Лейбова В.Б.

Аннотация

В представленной работе охарактеризован профиль экспрессии микроРНК miR-767, miR-335-3p и miR-106b-5p в пробах молока и сыворотки крови коз с первой по 23-ю недели лактации с учетом динамики некоторых белковых и липидных метаболитов молока и крови. Экспрессия микроРНК в молоке была ассоциирована с некоторыми изменениями анализируемых метаболитов. MiR-767 положительно коррелировала с молочным белком, казеином, жирными кислотами (C18:0, СЦЖК и МНЖК). Для miR-335-3p была установлена отрицательная связь с содержанием общего холестерина и триглицеридов крови, но положительная с содержанием молочного жира и СЦЖК, КЦЖК, ТЖК и НЖК, в том числе С14:0, С16:0 и С18:0. Экспрессия miR-106b-5p показала однонаправленную связь с общим холестерином крови. Среди всех трех анализируемых микроРНК сыворотки крови только экспрессия miR-106b-5p была положительно ассоциирована с содержанием молочного белка, казеина, ДЦЖК и МНЖК. Высокий прогностический эффект (R2 > 0.800, p < 0.001) предполагает значимую роль микроРНК, синтезируемых молочной железой (miR-767 и miR-335-3p), для белково-жировых компонентов молока, и miR-106b-5p, циркулирующей в крови, для молочного белка и казеина. Результаты нашего исследования позволяют предположить, что повышение уровня экспрессии miR-767, miR-335-3p в молоке и miR-106b-5p в сыворотке крови приводит к активации транскрипции и трансляции их генов-мишеней, что фенотипически выражается в увеличении значений ряда белково-жировых компонентов молока коз. Изучение роли микроРНК в регуляции лактации является перспективным направлением современной молекулярной биологии, которое имеет большой потенциал для повышения эффективности молочного производства, улучшения качества продукции и в программах разработки прогностических биомаркеров.

Генетика. 2025;61(2):75-92
pages 75-92 views

КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ

Первое обнаружение гена toxb2 в штаммах Pyrenophora tritici-repentis из России и Казахстана

Мироненко Н.В., Орина А.С., Коваленко Н.М.

Аннотация

Для 18 штаммов аскомицетного гриба Pyrenophora tritici-repentis – возбудителя желтой пятнистости пшеницы – была определена расовая принадлежность и идентифицированы toxb-гены. Анализируемые штаммы были отнесены преимущественно к расе 4, непатогенной для мягкой пшеницы. Сравнение нуклеотидных последовательностей гена toxb одного штамма P. tritici-repentis из Казахстана и пяти штаммов гриба из Татарстана с референсными последовательностями генов ToxB1, toxb2, ToxB4, toxb12 и toxb14 позволило точно идентифицировать исследуемые гены как toxb2. Это первое обнаружение гена toxb2 в популяциях P. tritici-repentis из России и Казахстана. Также были продемонстрированы различия между последовательностями ToxB1 и toxb2 в области ORF: 27 нуклеотидных замен и одна делеция 3 пн у ToxB1. В нетранслируемой 5’UTR-области всех полученных последовательностей toxb2, как и в последовательностях ToxB1, между TATA-боксом и интроном выявлено присутствие четырех микросателлитов размером 25 пн. У исследуемых штаммов в 5’UTR-области toxb2 перед интроном обнаружена инсерция 167 пн, такая же, как у референсной последовательности гена toxb2 штамма P. tritici-repentis SD20, которая отсутствует во всех известных последовательностях ToxB1, и, вероятно, влияет на функциональность гена. Накопление информации о структуре гена toxb2 имеет значение для понимания эволюции ToxB/toxb-генов гриба P. tritici-repentis.

Генетика. 2025;61(2):93-97
pages 93-97 views

Гены β-actin и 36B4 у мягкого коралла Sclerophytum heterospiculatum (Verseveldt, 1970)

Бизикашвили Е.T., Шамшурина Е.В., Сикорская Т.В.

Аннотация

Коралловые полипы являются объектом для различных исследований, в том числе в области молекулярной биологии. На данный момент большое внимание уделяется молекулярным исследованиям кораллов подкласса Hexacorallia. Для этой цели мы установили и охарактеризовали последовательности генов β-actin и 36B4 из мягкого коралла Sclerophytum heterospiculatum (Verseveldt, 1970). Гены 36B4 и β-actin необходимы для нормального функционирования клеток, отличаются высокой консервативностью между таксонами, что подтверждается филогенетическим деревом, полученным в этой работе.

Генетика. 2025;61(2):98-102
pages 98-102 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».