The β-actin and 36B4 Genes in the Soft Coral Sclerophytum heterospiculatum (Verseveldt, 1970)

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Coral polyps are the subject of various studies, including in the field of molecular biology. At the moment, much attention is being paid to molecular studies of corals of the Hexacorallia subclass. For this purpose, we identified and characterized the sequences of the β-actin and 36B4 genes from the soft coral Sclerophytum heterospiculatum (Verseveldt, 1970).The 36B4 and β-actin genes are necessary for the normal functioning of cells and are highly conservative between taxa, which are confirmed by the phylogenetic tree obtained in this work.

About the authors

E. T. Bizikashvili

Zhirmunsky National Scientific Center of Marine Biology, Far East Branch, Russian Academy of Sciences

Author for correspondence.
Email: bilielena801@gmail.com
Russian Federation, Vladivostok, 690041

E. V. Shamshurina

Zhirmunsky National Scientific Center of Marine Biology, Far East Branch, Russian Academy of Sciences

Email: bilielena801@gmail.com
Russian Federation, Vladivostok, 690041

T. V. Sikorskaya

Zhirmunsky National Scientific Center of Marine Biology, Far East Branch, Russian Academy of Sciences

Email: bilielena801@gmail.com
Russian Federation, Vladivostok, 690041

References

  1. Daly M., Brugler M.R., Cartwright P. et al. The phylum Cnidaria: A review of phylogenetic patterns and diversity 300 years after Linnaeus* // Zootaxa. 2007. V. 1668. P. 127–182. https://doi.org/10.5281/zenodo.180149
  2. Tursch B., Tursch A. The soft coral community on a sheltered reef quadrat at Laing Island (Papua New Guinea) // Mar. Biol. 1982. V. 68. P. 321–332. https://doi.org/10.1007/bf00409597
  3. Fabricius K.E. Soft coral abundance on the central Great Barrier Reef: Effects of Acanthaster planci, space availability, and aspects of the physical environment // Coral Reefs. 1997. V. 16. P. 159–167. https://doi.org/10.1007/s003380050070
  4. Boilard A., Dube C.E., Gruet C. et al. Defining coral bleaching as a microbial dysbiosis within the coral holobiont // Microorganisms. 2020. V. 8. https://doi.org/10.3390/microorganisms8111682
  5. Sikorskaya T.V., Ermolenko E.V. Changes of phospholipid molecular species profile upon bleaching and subsequent restoration of coral sinularia heterospiculata // Chem. Nat. Compd. 2024. V. 60. P. 215–219. https://doi.org/10.1007/s10600-024-04291-w
  6. Dean J.M., Lodhi I.J. Structural and functional roles of ether lipids // Protein Cell. 2018. V. 9. P. 196–206. https://doi.org/10.1007/s13238-017-0423-5
  7. Karge W.H., Schaefer E.J., Ordovas J.M. Quantification of mRNA by polymerase chain reaction (PCR) using an internal standard and a nonradioactive detection method // Methods Mol. Biol. 1998. V. 110. P. 43–61. https://doi.org/10.1385/1-59259-582-0:43
  8. Kozera B., Rapacz M. Reference genes in real-time PCR // J. Appl. Genet. 2013. V. 54. P. 391–406. https://doi.org/10.1007/s13353-013-0173-x
  9. Nguyen L.-T., Schmidt H.A., von Haeseler A. et al. IQ-TREE: A fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies // Mol. Biol. Evol. 2015. V. 32. P. 268–274. https://doi.org/10.1093/molbev/msu300
  10. Hoang D.T., Chernomor O., von Haeseler A. et al. Ufboot2: Improving the ultrafast bootstrap appro-ximation // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. P. 518–522. https://doi.org/10.1093/molbev/msx281
  11. Kalyaanamoorthy S., Minh B.Q., Wong T.K.F. et al. ModelFinder: Fast model selection for accurate phylogenetic estimates // Nat. Methods. 2017. V. 14. P. 587–589. https://doi.org/10.1038/nmeth.4285
  12. Gagou M., Ballesta J.P., Kouyanou S. Cloning and characterization of the ribosomal protein CcP0 of the medfly Ceratitis capitata // Insect. Mol. Biol. 2000. V. 9. P. 47–55. https://doi.org/10.1046/j.1365-2583.2000.00156.x
  13. Kabsch W., Vandekerckhove J. Structure and function of actin // Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1992. V. 21. P. 49–76. https://doi.org/10.1146/annurev.bb.21.060192.000405
  14. Ishii K., Washio T., Uechi T. et al. Characteristics and clustering of human ribosomal protein genes // BMC Genomics. 2006. V. 7. P. 37. https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-37

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».