Fluorescent dyes for the study of siliceous sponges

Capa

Citar

Texto integral

Resumo

New fluorescent dyes containing coumarine and rhodamine groups were applied as vital dyes capable of staining growing siliceous spicules of Baikal sponge Lubomirskia baicalensis (Pallas, 1773). Cultivation of the sponge primmorphs in the presence of fluorescent dyes allows the use of confocal microscopy to study the morphology of the spicules and, in the case of two-color staining, to draw some conclusions about the growth rate of the spicules. 5-6.5 months were estimated to be the time required for the full formation of the spicules.

Sobre autores

E. Danilovtseva

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: annenkov@lin.irk.ru
Rússia, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

V. Palshin

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: annenkov@lin.irk.ru
Rússia, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

S. Zelinskiy

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: annenkov@lin.irk.ru
Rússia, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

V. Annenkov

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Autor responsável pela correspondência
Email: annenkov@lin.irk.ru
Rússia, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

Bibliografia

  1. Annenkov V.V., Danilovtseva E.N., Zelinskiy S.N. et al. 2010. Novel fluorescent dyes based on oligopropylamines for the in vivo staining of eukaryotic unicellular algae. Analytical Biochemistry 407: 44-51. doi: 10.1016/j.ab.2010.07.032
  2. Annenkov V.V., Glyzina O.Yu., Verkhozina O.N. et al. 2014. Fluorescent amines as a new tool for study of siliceous sponges. Silicon 6: 227-231. doi: 10.1007/s12633-014-9220-4
  3. Annenkov V.V., Pyshnyj D.V., Danilovtseva E.N. et al. 2016a. Analogues of natural deoxyribonucleoside triphosphates and ribonucleoside triphosphates containing reporter fluorescent groups, for use in analytical bioorganic chemistry. Patent RU 2582198
  4. Annenkov V.V., Danilovtseva E.N. 2016b. Spiculogenesis in the siliceous sponge Lubomirskia baicalensis studied with fluorescent staining. Journal of Structural Biology 194: 29-37. doi: 10.1016/j.jsb.2016.01.010
  5. Annenkov V.V., Zelinskiy S.N., Pal’shin V.A. et al. 2019. Coumarin based fluorescent dye for monitoring of siliceous structures in living organisms. Dyes and Pigments 160: 336-343. doi: 10.1016/j.dyepig.2018.08.020
  6. Blunt J.W., Carroll A.R., Copp B.R. et al. 2018. Marine natural products. Natural Product Reports 35: 8-53. doi: 10.1039/c7np00052a
  7. Carroll A.R., Copp B.R., Davis R.A. et al. 2019. Marine natural products. Natural Product Reports 36: 122-173. doi: 10.1039/c8np00092a
  8. Custodio M.R., Prokic I., Steffen R. et al. 1998. Primmorphs generated from dissociated cells of the sponge Suberites domuncula: a model system for studies of cell proliferation and cell death. Mechanisms of Ageing and Development 105: 45-59. doi: 10.1016/S0047-6374(98)00078-5
  9. Denikina N.N., Dzyuba E.V., Bel’kova N.L. et al. 2016. The first case of disease of the sponge Lubomirskia baicalensis: investigation of its microbiome. Biology Bulletin 43: 263-270. doi: 10.1134/S106235901603002X
  10. El-Demerdash A., Atanasov A.G., Horbanczuk O.K. et al. 2019. Chemical diversity and biological activities of marine sponges of the Genus Suberea: A systematic review. Marine Drugs 17: 115. doi: 10.3390/md17020115
  11. Khalifa S.A.M., Elias N., Farag M.A. et al. 2019. Marine natural products: a source of novel anticancer drugs. Marine Drugs 17: 491. doi: 10.3390/md17090491
  12. Khanaev I.V., Kravtsova L.S., Maikova O.O. et al. 2018. Current state of the sponge fauna (Porifera: Lubomirskiidae) of Lake Baikal: sponge disease and the problem of conservation of diversity. Journal of Great Lakes Research 44: 77-85. doi: 10.1016/j.jglr.2017.10.004
  13. Kwon J.Y., Jang Y.J., Lee Y.J. et al. 2005. A highly selective fluorescent chemosensor for Pb2+. Journal of the American Chemical Society 127: 10107-10111. doi: 10.1021/ja051075b
  14. Mcheik A., Cassaignon S., Livage J. et al. 2018. Optical properties of nanostructured silica structures from marine organisms. Frontiers in Marine Science 5: 123. doi: 10.3389/fmars.2018.00123
  15. Taylor M.W., Radax R., Steger D. et al. 2007. Sponge-associated microorganisms: evolution, ecology, and biotechnological potential. Microbiology and Molecular Biology Reviews 71: 295-347. doi: 10.1128/MMBR.00040-06
  16. Veynberg E. 2009. Fossil sponge fauna in Lake Baikal region. In: Müller W.E.G., Grachev M.A. (Eds.), Biosilica in Evolution, Morphogenesis, and Nanobiotechnology. Berlin, Heidelberg, pp. 185-203. doi: 10.1007/978-3-540-88552-8
  17. Wilson H.V., 1907. On some phenomena of coalescence and regeneration in sponges. Journal of Experimental Zoology 5: 245-257. doi: 10.1002/jez.1400050204.
  18. Zhang Y.Q, Reed B.W., Chung F.R. et al. 2016. Mesoscale elastic properties of marine sponge spicules. Journal of Structural Biology 193: 67-74. doi: 10.1016/j.jsb.2015.11.009
  19. Zvereva Y., Medvezhonkova O., Naumova T. et al. 2019. Variation of sponge-inhabiting infauna with the state of health of the sponge Lubomirskia baikalensis (Pallas, 1776) in Lake Baikal. Limnology 20: 267-277. doi: 10.1007/s10201-019-00576-0

Arquivos suplementares

Arquivos suplementares
Ação
1. JATS XML

Declaração de direitos autorais © Danilovtseva E.N., Palshin V.A., Zelinskiy S.N., Annenkov V.V., 2019

Creative Commons License
Este artigo é disponível sob a Licença Creative Commons Atribuição–NãoComercial 4.0 Internacional.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».