Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 26, № 6 (2021)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Грибковые осложнения при новой коронавирусной инфекции COVID-19

Авдеева М.Г., Зотов С.В., Кулбужева М.И., Мошкова Д.Ю., Журавлева Е.В.

Аннотация

Обоснование. Наблюдаемый в последнее десятилетие рост грибковой патологии, в том числе инвазивных микозов, создающих угрозу жизни, связывают с распространением иммунодефицитных состояний различной этиологии. Пандемия новой коронавирусной инфекции COVID-19 внесла свой отрицательный вклад, вызвав значительное увеличение числа пациентов с грибковыми осложнениями.

Цель исследования — характеристика видов грибковых осложнений в остром периоде новой коронавирусной инфекции COVID-19 на основе анализа клинического течения и терапевтической тактики ведения основного заболевания.

Материалы и методы. Рассмотрены результаты бактериологического исследования 1284 культур из образцов мокроты пациентов с подозрением на вторичную пневмонию при COVID-19. В исследование включено 404 культуры различных видов грибов. Анализ клинической картины проведён у 70 пациентов с грибковыми осложнениями различной локализации, проходивших лечение в условиях краевого ковидного госпиталя. В этой группе учтены результаты микробиологического исследования мокроты, бронхоальвеолярного лаважа, соскобов из очагов поражения в ротоглотке, мочи, крови, биопсийного и аутопсийного материала. Исследование проведено в период с 1 апреля 2020 г. по 31 декабря 2021 г. Пациенты разделены на подгруппы в зависимости от выделенного возбудителя: Candida spp. — 64 пациента и плесневые грибы (Aspergillus spp. и Mucor spp.) — 6 пациентов; от исхода заболевания: благоприятный — 66, летальный — 4.

Результаты. В микробном пейзаже дыхательных путей у больных COVID-19 преобладала грамотрицательная микробная флора, 1/3 культур была представлена грибами. В течение двух лет пандемии доля грибковых культур увеличилась с 26,9% в 2020 г. до 34,2% в 2021 г. при сохранении чувствительности к амфотерицину B и флуконазолу в большинстве случаев. В 2021 г. отметилась негативная тенденция роста в мокроте плесневых грибов вида Aspergillus spp. (5 культур) и Mucor spp. (1 культура).

Типичными грибковыми осложнениями COVID-19 являлись кандидозный стоматит, обусловленный Candida albicans (71%), кандидоз других урогенитальных локализаций в виде кандидурии (20%), поражение лёгких смешанной вирусно-грибковой этиологии, в единичных случаях приводящее к летальному исходу вследствие инвазивного микоза. Только грибковая флора выделялась в 57,1% случаев, различные сочетания грибковой и бактериальной флоры — в 42,9%. Диагностика кандидозного стоматита происходила в среднем на 11,6±1,08 день заболевания COVID-19, что соответствовало 2–3-му дню госпитализации. Предшествовавшее амбулаторное лечение в большинстве случаев включало антибиотики и гормональную терапию глюкокортикоидами. Урогенитальная грибковая инфекция диагностировалась на 17,7±5,17 день болезни на 2-й неделе госпитального лечения (8,0±3,11 день). Грибковая флора в мокроте определялась в среднем на 18,5±4,33 день болезни на 2–3-й неделе госпитализации на фоне интенсивной иммуносупрессивной терапии.

Заключение. Факторами риска развития грибковых осложнений служат возраст пациентов старше 50 лет, избыточная масса тела и гипертоническая болезнь, бесконтрольное применение антибиотиков и глюкокортикоидов на догоспитальном этапе. Микозы регистрируются как при тяжёлом, так и при среднетяжёлом течении COVID-19. Дополнительным фактором их развития является иммуносупрессивная терапия основного заболевания. Наиболее грозными осложнениями течения COVID-19, ухудшающими прогноз выживания, являются присоединение грибов с инвазивным ростом — Aspergillus spp., Mucor, а также развитие грибково-бактериальных ассоциаций с поражением лёгочной ткани.

В условиях продолжающейся пандемии SARS-CoV-2, использования иммуномодулирующих средств, включая комбинированное применение глюкокортикоидов и таргетных иммуносупрессивных препаратов, важно выработать риск-ориентированный подход к диагностике и лечению пациентов с риском генерализованных и инвазивных микозов.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021;26(6):252-269
pages 252-269 views

Видовой спектр микроорганизмов, выделенных у пациентов госпиталя COVID-19 многопрофильного федерального медицинского учреждения

Петрова Л.В., Миронов А.Ю., Гусаров В.Г., Камышова Д.А., Хакулова А.Э., Замятин М.Н., Суранова Т.Г.

Аннотация

Обоснование. Несмотря на доказанную важность вторичных бактериальных инфекций, влияющих на тяжесть вирусных респираторных заболеваний, их этиология всё ещё недостаточно изучена. Существует пробел в знаниях о природе, частоте и профилях антимикробной устойчивости бактериальных патогенов в нынешней пандемии COVID-19.

Цель исследования — описать видовой спектр микроорганизмов у пациентов госпиталя COVID-19 на базе многопрофильного федерального медицинского учреждения.

Материалы и методы. Получены и обработаны клинические образцы (кровь, отделяемое нижних дыхательных путей, моча, прочие биологические материалы) пациентов с COVID-19, находившихся на лечении в условиях госпиталя COVID-19 на базе многопрофильного федерального медицинского учреждения.

Результаты. В бактериологическую лабораторию поступила 1821 проба биоматериалов от 452 пациентов, микроорганизмы выделены из 620 (38,0%) проб. БÓльшая часть биоматериала была представлена кровью — 35,9% и отделяемым нижних дыхательных путей — 31,7%. В структуре микроорганизмов доминировали Candida albicans — 19,7%, Staphylococcus aureus — 10,2%, Klebsiella pneumoniae — 10,1%, Enterococcus faecalis — 7,9%. В начале периода работы госпиталя наиболее часто идентифицируемыми микроорганизмами были S. aureus и Haemophilus influenzae — 19,7 и 7,9% соответственно, в то время как в заключительном периоде произошла смена спектра микроорганизмов на нозокомиальные ESKAPE-патогены с множественной лекарственной устойчивостью: в структуре доминировал Acinetobacter baumannii — 24,3%. Потребление антибиотиков в стационаре выросло с 18,3 DDD/100 пациенто-дней в 2019 г. до 28,8 DDD/100 пациенто-дней в 2020 г.

Заключение. Выявлена значимая колонизация различных локусов пациентов с COVID-19 грибами рода Candida. Произошла смена микробного спектра возбудителей инфекций от внебольничных (H. influenzae и S. pneumoniae) до нозокомиальных ESKAPE-патогенов с множественной лекарственной устойчивостью. Значимо возросло потребление антибиотиков.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021;26(6):270-282
pages 270-282 views

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

Вакцины от новой коронавирусной инфекции в России и мире

Данилов А.Н., Ерёмин В.И., Филиппова Н.А., Денисова Е.Г.

Аннотация

Статья посвящена обзору вакцин от новой коронавирусной инфекции в мире и России.

Вакцинопрофилактика является доступным и экономичным способом снижения заболеваемости и смертности от COVID-19. Значимость вакцинации не вызывает сомнений и является методом создания активного искусственного иммунитета на основании сформированной иммунологической памяти к инфекционному агенту. Условно вакцины можно разделить на две группы ― классические (рекомбинантные, пептидные и вирусинактивированные) и генные (векторные и мРНК-вакцины). Классические вакцины основаны на введении в организм уже готовых антигенов, которые могут представлять собой очищенные вирусные белки, фрагменты вирусных белков (пептиды) или целые инактивированные (убитые) вирусные частицы. Инактивированные цельновирионные вакцины содержат ослабленный или инактивированный вирус, способствующий выработке противовирусного иммунитета. Субъединичные вакцины содержат только поверхностные антигены (специфические фрагменты ― субъединицы), что позволяет снизить количество белка в вакцине и тем самым уменьшить её аллергенность. В векторных вакцинах используются безопасные вирусы, которые не способны размножаться в организме человека (векторы), в состав которых встроен ген ― небольшой участок генома коронавируса. Векторные вакцины эффективно вызывают клеточный и гуморальный иммунный ответ, так как вектор, попадая в клетку, воспринимается организмом как вирусная инфекция. Генные вакцины существенно отличаются от классических и вырабатывают иммунный ответ на генном уровне, так как содержат не сам вирус или белок, а генетический материал коронавируса SARS-CoV-2. Вакцина на основе РНК доставляет в клетки организма определённый набор инструкций для синтеза специфического белка, на который иммунная система организма должна дать иммунный ответ.

Критерием эффективности вакцины служит иммунный ответ, который она создаёт. Чем более он выражен и устойчив, тем выше защита от инфекции. Пока не разработано препаратов, имеющих 100% защиту от заражения, так как иммунный ответ зависит от многочисленных причин, в том числе индивидуальных особенностей организма, общего состояния здоровья, возраста и др.

На современном этапе задачи вакцинопрофилактики усложняются такими факторами эпидемиологического процесса, как появление новых высокопатогенных штаммов коронавируса.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021;26(6):283-293
pages 283-293 views

Эмерджентный подход к формированию стратегии противоэпидемической готовности организаций здравоохранения в условиях новой эпидемиологической реальности

Брюханова Г.Д., Городин В.Н., Носиков Д.В., Шестакова И.В., Нежурин А.В.

Аннотация

В обзоре представлены фактические данные, неохраняемые цифровые и качественные сведения по случаям инфекционных болезней и вспышкам актуальных инфекций в период пандемии коронавирусной инфекции COVID-19. Источники информации: материалы Всемирной организации здравоохранения, Центров по контролю заболеваемости (США, стран Европы), Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, конференций и научных докладов и др.

В обзоре рассматривается проблема новой эпидемиологической реальности как сложной комплексной открытой системы, обладающей присущим таким системам свойством эмерджентности ― возникновением новых явлений, не равных эффектам простой суммы эпидемических процессов или их движущих сил. Непредсказуемость новой эпидемиологической реальности ― от быстрого роста заболеваемости к обратному развитию и наоборот ― при интеграции в неё новых элементов (биологических, социальных, технологических) в значительной степени обусловлена эффектами коэмерджентности (взаимного влияния внезапно возникающих явлений), что требует углублённого изучения процессов, происходящих на разных иерархических уровнях этой системы для успешного купирования эпидемических осложнений. Для проведения исследований на уровне инфекционного процесса предложено создание федерального специализированного научно-практического клинического медицинского центра с учебно-тренинговыми модулями. Научные исследования центра будут ориентированы на изучение характерных «системных качеств» инфекционного процесса с опорой на знания о свойствах и связях между элементами системы, между системой и объектами её среды; на диагностику (включая случаи коинфекций, суперинфекций) и выявление модифицирующих и лимитирующих факторов в патогенетическом и клиническом проявлении болезней. Учебно-тренинговые модули центра предоставят современные возможности для подготовки различных профессиональных групп специалистов медицинского и немедицинского профиля (конструкторов приборов и проектировщиков медицинского оснащения, работников инженерно-эксплуатационных служб медицинских учреждений) по вопросам работы в условиях строгого противоэпидемического режима, а также по задачам проектирования, технологической подготовки к эксплуатации и доработки новых моделей оборудования, средств индивидуальной защиты, расходных материалов.

Таким образом, специализированный научно-практический клинический медицинский центр с учебно-тренинговыми модулями станет платформой, на которой посредством межотраслевого сотрудничества и взаимодействия будет реализован эмерджентный подход к формированию стратегии противоэпидемической готовности медицинских организаций ― обнаружение изменений в клинических проявлениях инфекционных болезней и соразмерное им реагирование на будущие внезапные внешние эпидемические вызовы.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021;26(6):294-307
pages 294-307 views

ПИСЬМА В РЕДАКЦИЮ

Журнал «Эпидемиология и инфекционные болезни» и Russian Science Citation Index

Никифоров В.В., Филиппова Е.А., Филиппов Ю.И.

Аннотация

Журнал «Эпидемиология и инфекционные болезни» (Epidemiology and Infectious Diseases) индексируется во многих базах данных, в том числе в Russian Science Citation Index (RSCI). Журнал включён в рекомендуемый Высшей аттестационной комиссией «Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание учёной степени кандидата наук, на соискание учёной степени доктора наук» (далее — Перечень ВАК), отличительной особенностью которого является структурирование по отраслям науки, научным направлениям и научным специальностям. С 2021 года цитирование журнала в базе данных RSCI приравнено по своему значению к индексации в Web of Science Core Collection и/или Scopus, что служит критерием качества издания и ориентиром в выборе авторами научного журнала для публикации результатов диссертационных исследований. Таким образом, при подготовке диссертации в список публикаций можно включать те работы соискателя, которые опубликованы в научных журналах, представленных в Перечне ВАК по соответствующей специальности, либо в научных журналах, индексируемых в RSCI, Web of Science и/или Scopus, независимо от того, по какой научной специальности и соответствующим направлениям науки данные журналы включены в Перечень ВАК, и включены ли вообще.

С учётом произошедших изменений редакция и издатель продолжают публиковать в журнале «Эпидемиология и инфекционные болезни» статьи по эпидемиологии (3.2.2), инфекционным болезням (3.1.22), вирусологии (1.5.10), медицинской микробиологии (1.5.11) и паразитологии (1.5.17).

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021;26(6):308-312
pages 308-312 views


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».