DISTRIBUTION OF TWO-LOCUS HAPLOTYPES OF HLA-DRB1-TNFA-308 IN PATIENTS WITH ULCERATIVE COLITIS OF THE RUSSIAN POPULATION OF CHELYABINSK REGION

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

The analysis of the distribution of HLA-DRB1-TNFA-308 two-locus haplotypes frequencies in patients with ulcerative colitis (UC) of the Russian population of the Chelyabinsk region is carried out in this article. The 19 haplotypes were identified, among which 4 haplotypes, containing -308*G TNFA allele, were characterized by high incidence rates in groups of UC patients and healthy individuals. A peculiarity of the UC patient group was the presence of two haplotypes containing the rare allele with the substitution -308*A TNFA: HLA DRB1* 01-TNFA-308*A; HLA DRB1* 13 -TNFA-308*A. These haplotypes were not found in the comparison group of healthy individuals. These haplotypes can be considered as markers of susceptibility to ulcerative colitis in the Russian Chelyabinsk region.

About the authors

D. S. Stashkevich

Chelyabinsk State University

Author for correspondence.
Email: noemail@neicon.ru
Russian Federation

S. V. Belyaeva

Chelyabinsk State University; Chelyabinsk Blood Transfusion Station

Email: noemail@neicon.ru
Russian Federation

T. A. Suslova

Chelyabinsk State University; Chelyabinsk Blood Transfusion Station

Email: noemail@neicon.ru
Russian Federation

A. G. Vasilenko

Chelyabinsk Regional Clinical Hospital

Email: noemail@neicon.ru
Russian Federation

References

  1. Сташкевич Д. С. Распределение генов HLA-DQA1, DQB1 у больных неспецифическим язвенным колитом русской популяции Челябинской области / Д. С. Сташкевич, А. О. Складчикова, С. В. Беляева, Т. А. Суслова, А. Г. Василенко// Российский иммунологический журнал.- 2015.-T. 9(18), № 2.- С. 564-566.
  2. Bouzid D. Inflammatory bowel disease: susceptibility and disease heterogeneity revealed by human leukocyte antigen genotyping / D. Bouzid, A. Kammoun, A. Amouri et al. // Genetic testing and Molecular Biomarkers.-2012.- Vol.16(6).-P. 482-487.
  3. Excoffier L. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows / L. Excoffier, HE. Lis-cher // Molecular Ecology Resources.- 2010.- Vol. 10, Is. 3.- P. 564-567.
  4. Mohammadi M. Association of HLA-DRB 1 Alleles with Ulcerative Colitis in the City of Kerman, South Eastern Iran / M. Mohammadi, М. Rastin, H. Ra-fatpanah et al.// Iranian Journal of Allergy, Asthma and Immunology.- 2015.- 14(3).- P. 306-312.
  5. Tavares M. Tumour necrosis factor-alpha (-308G/ A) promoter polymorphism is associated with ulcerative colitis in Brazilian patients /M. Tavares, C. de Lima, W. Fernandes et al. // International journal of immunogenetics.- 2016.- Vol.43(6).-P. 376-382.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2017 Stashkevich D.S., Belyaeva S.V., Suslova T.A., Vasilenko A.G.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».