Микробиологический мониторинг в урологическом стационаре как метод контроля антибиотикорезистентности уропатогенов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Актуальность. Выбор рациональной антибактериальной терапии госпитальной инфекции является условием успешного лечения больных.

Цель — сравнительная оценка видового состава уропатогенов и уровня их резистентности к антибактериальным препаратам у пациентов с осложненными инфекциями мочевыводящих путей в урологическом стационаре.

Материалы и методы. Проведен анализ результатов микробиологического исследования образцов мочи 1317 пациентов (795 мужчин и 522 женщины) с осложненной инфекцией мочевыводящих путей, находившихся на стационарном лечении в урологической клинике в период 2020–2021 гг.

Результаты. У 703 (53,4 %) пациентов выявлена грамотрицательная, у 531 (40,3 %) — грамположительная, и у 83 (6,3 %) — смешанная микрофлора. Среди грамотрицательных бактерий преобладали Escherichia сoli (23,1 %) и Klebsiella pneumoniae (16,1 %), реже выявляли Pseudomonas aeruginosa (4,9 %) и Proteus mirabilis (2,8 %). Отмечена высокая частота выявления грамположительной микрофлоры родов Enterococcus (21,4 %) и Staphylococcus (12,7 %). При сравнении с результатами аналогичного исследования 2018–2020 гг. отмечается снижение частоты выявления E. coli c 28,2 до 23,1 %. Антибиотикорезистентность госпитальных штаммов уропатогенов существенно варьирует для разных антимикробных препаратов. Наиболее часто резистентность к представителям трех и более групп антибиотиков отмечали у K. pneumoniae (46,6 %), реже у E. coli (19,5 %) и редко у Enterococcus spp. (5,9 %).

Выводы. Микробиологический мониторинг позволяет оценить этиологическую структуру и уровень антибиотикорезистентности нозокомиальных инфекций мочевыводящих путей. Локальные данные чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам дают возможность рационально проводить периооперационную антибиотикопрофилактику и назначать эмпирическую терапию инфекциям мочевыводящих путей до получения результатов микробиологического исследования.

Об авторах

Маргарита Николаевна Слесаревская

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Автор, ответственный за переписку.
Email: mns-1971@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-4911-6018
SPIN-код: 9602-7775

канд. мед. наук; старший научный сотрудник НИЦ урологии НИИ хирургии и неотложной медицины

Россия, Санкт-Петербург

Анна Анатольевна Спиридонова

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: annaasbac@mail.ru

врач-бактериолог, заведующая лабораторией бактериологических и микологических исследований отделения клинической микробиологии

Россия, Санкт-Петербург

Арсен Семенович Мкртчян

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: mkrarsensem@mail.ru

врач-уролог, урологическая клиника

Россия, Санкт-Петербург

Софья Олеговна Кручинова

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: kru4sof@gmail.com
ORCID iD: 0009-0000-8706-9219

студент

Россия, Санкт-Петербург

Сергей Борисович Петров

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: petrov-uro@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3460-3427
https://www.1spbgmu.ru/ru/klinika/kliniki-pspbgmu/308-universitet/structura/universitetskaya-klinika/kliniki/251-klinika-urologii

д-р мед. наук, профессор, руководитель Научно-исследовательского центра урологии НИИ хирургии и неотложной медицины

Россия, Санкт-Петербург

Адель Сальманович Аль-Шукри

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: ad330@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6543-8589
SPIN-код: 5024-2184

д-р мед. наук, профессор, руководитель урологического отделения Научно-исследовательского центра урологии НИИ хирургии и неотложной медицины

Россия, Санкт-Петербург

Игорь Валентинович Кузьмин

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: kuzminigor@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7724-7832
SPIN-код: 2684-4070

д-р мед. наук, профессор кафедры урологии

Россия, Санкт-Петербург

Юлия Анатольевна Пономарева

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: uaponomareva@mail.ru

канд. мед. наук, заведующая урологическим отделением Научно-исследовательского центра урологии НИИ хирургии и неотложной медицины

Россия, Санкт-Петербург

Сергей Александрович Рева

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: sgreva79@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5183-5153
SPIN-код: 8021-1510

канд. мед. наук, заведующий онкоурологическим отделением Научно-исследовательского центра урологии НИИ хирургии и неотложной медицины

Россия, Санкт-Петербург

Дмитрий Сергеевич Горелов

Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова

Email: dsgorelov@mail.ru
SPIN-код: 3138-5214

врач-уролог урологического отделения № 2 (дистанционной литотрипсии и эндовидеохирургии) Научно-исследовательского центра урологии НИИ хирургии и неотложной медицины

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Spellberg B., Gilbert D.N. The future of antibiotics and resistance: a tribute to a career of leadership by John Bartlett // Clin Infect Dis. 2014. Vol. 59, No. S2. P. S71–S75. doi: 10.1093/cid/ciu392
  2. Antimicrobial Resistance Collaborators. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis // Lancet. 2022. Vol. 399, No. 10325. P. 629–655. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02724-0
  3. Всемирная организация здравоохранения. Глобальный план действий по борьбе с устойчивостью к противомикробным препаратам. ВОЗ, 2016. 40 с.
  4. Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г. Мониторинг антибиотикорезистентности: обзор информационных ресурсов // Бюллетень сибирской медицины. 2020. Т. 19, № 2. С. 163–170. doi: 10.20538/1682-0363-2020-2-163-170
  5. Программа СКАТ (Стратегия Контроля Антимикробной Терапии) при оказании стационарной медицинской помощи: Российские клинические рекомендации / под ред. С.В. Яковлева, Н.И. Брико, С.В. Сидоренко, Д.Н. Проценко. Москва: Перо, 2018. 156 с.
  6. Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г., Трушин И.В., и др. AMRmap — система мониторинга антибиотикорезистентности в России // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2021. Т. 23, № 2. С. 198–204. doi: 10.36488/cmac.2021.2.198-204
  7. Medina-Polo J., Naber K.G., Bjerklund Johansen T.E. Healthcare-associated urinary tract infections in urology // GMS Infect Dis. 2021. Vol. 9. ID Doc05. doi: 10.3205/id000074
  8. Борисов В.В. Диагностика и терапия инфекций мочевыводящих путей. О чем следует помнить всегда (клиническая лекция). Часть 2 // Урологические ведомости. 2017. Т. 7, № 4. С. 60–66. doi: 10.17816/uroved7460-66
  9. Роюк Р.В., Яровой С.К., Шикина И.Б. Антибиотикорезистентность уропатогенов у пациентов с нефролитиазом на фоне сопутствующей ишемической болезни сердца // Фармакоэкономика. Современная фармакоэкономика и фармакоэпидемиология. 2022. Т. 15, № 4. С. 453–462. doi: 10.17749/2070-4909/ armakoekonomika.2022.134
  10. Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В., и др. Осложненные внебольничные инфекции мочевых путей у взрослых пациентов в России // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 1. С. 39–56.
  11. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории: Методические указания / под ред. К.И. Савицкой, Е.Е. Круглова, В.В. Кутырева, и др. Москва: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2006. 126 с.
  12. Чеботарь И.В., Поликарпова С.В., Бочарова Ю.А., Маянский Н.А. Использование времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TОF MS) для идентификации бактериальных и грибковых возбудителей III–IV групп патогенности // Лабораторная служба. 2018. Т. 7, № 2. С. 78–86. doi: 10.17116/labs20187278-86
  13. EUCAST. Area of Technical Uncertainty (ATU) in antimicrobial susceptibility testing (15 January, 2022). EUCAST Guidance Documents. 3 p.
  14. Magiorakos A.P., Srinivasan A., Carey R.B., et al. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance // Clin Microbiol Infect. 2012. Vol. 18, No. 3. P. 268–281. doi: 10.1111/j.1469-0691.2011.03570.x
  15. Слесаревская М.Н., Спиридонова А.А., Краснова М.В., и др. Микробиологический мониторинг возбудителей нозокомиальной инфекции в урологической клинике // Урологические ведомости. 2020. Т. 10, № 4. С. 293–300. doi: 10.17816/uroved54607
  16. Учваткин Г.В., Гайворонский Е.А., Слесаревская М.Н. Уросепсис. Патогенез, диагностика и лечение // Урологические ведомости. 2020. Т. 10, № 1. С. 81–91. doi: 10.17816/uroved10181-91
  17. Exner M., Bhattacharya S., Christiansen B., et al. Antibiotic resistance: What is so special about multidrug-resistant Gram-negative bacteria? // GMS Hyg Infect Control. 2017. Vol. 12. ID Doc05. doi: 10.3205/dgkh000290
  18. Писаненко Д.В., Гасраталиев В.Э., Горшкова Т.Н., и др. Микробиологический анализ как эффективный инструментоптимизации стартовой эмпирической антибактериальной терапии в урологической клинике // Урология. 2018. № 6. С. 45–51. doi: 10.18565/urology.2018.6.45-51
  19. Котов С.В., Пульбере С.А., Беломытцев С.В., и др. Антибиотикорезистентность — новый вызов современной урологии // Экспериментальная и клиническая урология. 2020. Т. 13, № 5. С. 113–119. doi: 10.29188/2222-8543-2020-13-5-113-119
  20. Codelia-Anjum A., Lerner L.B., Elterman D., et al. Enterococcal urinary tract infections: A review of the pathogenicity, epidemiology, and treatment // Antibiotics (Basel). 2023. Vol. 12, No. 4. ID 778. doi: 10.3390/antibiotics12040778
  21. Dunny G.M., Hancock L.E., Shankar N. Enterococcal biofilm structure and role in colonization and disease. 2014 Feb 14. Enterococci: from commensals to leading causes of drug resistant infection / M.S. Gilmore, D.B. Clewell, Y. Ike, N. Shankar, editors. Boston: Massachusetts Eye and Ear Infirmary, 2014.
  22. Ch’ng J.-H., Chong K.K.L., Lam L.N., et al. Biofilm-associated infection by enterococci // Nat Rev Microbiol. 2019. Vol. 17, No. 2. P. 82–94. doi: 10.1038/s41579-018-0107-z
  23. Tien B.Y.Q., Goh H.M.S., Chong K.K.L., et al. Enterococcus faecalis promotes innate immune suppression and polymicrobial catheter-associated urinary tract Infection // Infect Immun. 2017. Vol. 85, No. 12. ID e00378-17. doi: 10.1128/IAI.00378-17
  24. Arias C.A., Murray B.E. The rise of the Enterococcus: beyond vancomycin resistance // Nat Rev Microbiol. 2012. Vol. 10, No. 4. P. 266–278. doi: 10.1038/nrmicro2761
  25. Jones R.N., Pfaller M.A. Antimicrobial activity against strains of Escherichia coli and Klebsiella spp. with resistance phenotypes consistent with an extended-spectrum beta-lactamase in Europe // Clin Microbiol Infect. 2003. Vol. 9, No. 7. P. 708–712. doi: 10.1046/j.1469-0691.2003.00555.x
  26. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). M 100. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 31st edition. USA: Laboratory Stabdards Institute, 2021. 351 p.
  27. Яковлев С.В., Суворова М.П. Нозокомиальные инфекции мочевыводящих путей // Урология. 2016. № 3-S3. С. 45–64.
  28. Белобородов В.Б., Голощапов О.В., Гусаров В.Г., и др. Диагностика и антимикробная терапия инфекций, вызванных полирезистентными штаммами микроорганизмов. Методические рекомендации. 2022.
  29. Tompkins K., van Duin D. Treatment for carbapenem-resistant Enterobacterales infections: recent advances and future directions // Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2021. Vol. 40, No. 10. P. 2053–2068. doi: 10.1007/s10096-021-04296-1
  30. Bush K., Bradford P.A. Epidemiology of β-lactamase-producing pathogens // Clin Microbiol Rev. 2020. Vol. 33, No. 2. ID e00047-19. doi: 10.1128/CMR.00047-19
  31. Kazmierczak K.M., Karlowsky J.A., de Jonge B.L.M., et al. Epidemiology of carbapenem resistance determinants identified in meropenem-nonsusceptible enterobacterales collected as part of a global surveillance program, 2012 to 2017 // Antimicrob Agents Chemother. 2021. Vol. 65, No. 7. ID e0200020. doi: 10.1128/AAC.02000-20
  32. Tamma P.D., Simner P.J. Phenotypic detection of carbapenemase-producing organisms from clinical isolates // J Clin Microbiol. 2018. Vol. 56, No. 11. ID e01140–18. doi: 10.1128/JCM.01140-18
  33. Перепанова Т.С., Козлов Р.С., Руднов В.А., и др. Антимикробная терапия и профилактика инфекций почек, мочевыводящих путей и мужских половых органов. Федеральные клинические рекомендации / под ред. Ю.Г. Аляева, О.И. Аполихина, Д.Ю. Пушкаря и др. Москва, 2022. 126 с.
  34. Gutu A.D., Sgambati N., Strasbourger P., et al. Polymyxin resistance of Pseudomonas aeruginosa phoQ mutants is dependent on additional two-component regulatory systems // Antimicrob Agents Chemother. 2013. Vol. 57, No. 5. P. 2204–2215. doi: 10.1128/AAC.02353-12

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Эко-Вектор, 2023


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».