Estimation of serological landscape of nazofaringeal strains of Streptococcus pneumoniae circulating in the territory of Barnaul

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Aim. To study the prevalence of S. pneumoniae serotypes in nasopharyngeal carriage among different age groups in organized groups to optimize the information and analytical system of epidemiological surveillance of pneumococcal infection.

Methods. By classical bacteriological method 75 nasopharyngeal isolates of pneumococcus, which later were serotyped, were identified in 319 subjects of different age from children's and adults' organized groups in Barnaul.

Results. In 2017 the epidemiological screening was used to evaluate the prevalence of S. pneumoniae carriage. After identification, nasopharyngeal pneumococcal strains underwent serotyping. The greatest proportion of serological landscape of the studied strains was 3 and 19F serotypes, the total proportion of which was 75±9.7%. 13-valent pneumococcal conjugated vaccine had the maximum coverage of local strains - 62.5%. Based on the data on community-acquired pneumonia caused most often by pneumococcus, from information and analytical system received from the territories of the region, the database «Community-acquired pneumonia of the Altai Krai» was created. However, for an adequate assessment of the epidemiological situation regarding pneumococcal infection in the region, incoming information was not enough. The analysis of information from the territories on community-acquired pneumonia allowed identifying disadvantages of epidemiological surveillance of this nosology and inability to adequately assess the epidemiological situation with regard to pneumococcal infection in the region.

Conclusion. The results of serotyping allowed determining further tactics of immunization in the Altai Krai; information and analytical system requires supplementing microbiological monitoring data regarding antibiotic susceptibility and resistance to disinfectants of the etiological agent.

About the authors

Yu A Kozyanova

Altai State Medical University

Author for correspondence.
Email: ykozyanova@yandex.ru
Barnaul, Russia

T V Safyanova

Altai State Medical University

Email: ykozyanova@yandex.ru
Barnaul, Russia

References

  1. Nikolenko V.V., Feldblyum I.V., Golodnova S.O., Vorob'eva N.N. Medical workers as risk group concerning pneumococcal infection. Meditsinskiy a'lmanakh. 2014; (4): 30–34. (In Russ.)
  2. Baranov A.A., Briko N.I., Namazova-Baranova L.S. Modern clinical and epidemiological characteristics of pneumococcal infections. Lechahschiy Vrach. 2012; (4): 79–82. (In Russ.)
  3. Sanitary-epidemiological Regulations ussied on 2.02.2014 SP 2.1.2.3116-13 «Prevention of community-acquired pneumonia». (In Russ.)
  4. Briko N.I., Nazarova-Bazarova L.S., Kostinov M.P. et al. Epidemiologiya, klinika i profilaktika pnevmokokkovoy infektsii. Mezhdistsiplinarnoe uchebnoe posobie dlya vrachey. (Epidemiology, clinic and prevention of pneumococcal infection. Interdisciplinary manual for doctors.) Moscow: Remedium Privolzhye. 2017; 112 р. (In Russ.)
  5. Tatochenko V.K. Bolezni organov dykhaniya u detey. Prakticheskoe rukovodstvo. (Diseases of the respiratory system in children. A practical guide.) Moscow: Pediatr. 2012; 479 р. (In Russ.)
  6. Kosenko I.M. Antibiotic therapy of community-acquired respiratory and ENT-infections: new potentials for overcoming resistance. Farmateka. 2011; (18): 15–20. (In Russ.)
  7. Mayanskiy N.A., Alyabyeva N.M., Lazareva M.A. et al. Sensitivity to antibiotics, clonal and serotypic variety of pneumococci in children with acute otitis media in Moscow. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2016; 18 (2): 84–92. (In Russ.)
  8. Yakovlev S.V., Sidorenko S.V., Rafal'skiy V.V., Spichak T.V. Strategiya i taktika ratsional'nogo primeneniya antimikrobnykh sredstv v ambulatornoy praktike. Rossiyskie prakticheskie rekomendatsii. (Strategy and tactics of rational use of antimicrobial agents in outpatient practice. Russian practical recommendations.) Moscow: Presto. 2014; 121 р. (In Russ.)
  9. Tatochenko V.K., Bakradze M.D., Khokhlova T.A., Rogova O.A. Rational antibacterial therapy of respiratory tract infections. Meditsinskiy sovet. http://www.remedium.ru/pda/doctor/detail.php?ID=65131 (access date: 31.03.2018). (In Russ.)
  10. Boronina L.G., Samatova E.V., Blinova S.М. Changes in antimicrobial resistance in clinical pediatric isolates of Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, and Moraxella catarrhalis in Middle Ural area. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2017; 19 (2): 51–58. (In Russ.)
  11. Pai R., Gertz R.E., Beall B. Sequental multiplex PCR approach determining capsular serotypes of Streptococcus pneumoniae isolates. J. Clin. Microbiol. 2006; 44: 124–131. doi: 10.1128/JCM.44.1.124-131.2006.
  12. Sidorenko S.V., Savinova T.A., Il'ina E.N., Syrochkina M.A. Population structure of pneumococci with reduced sensitivity to penicillin and prospects of antipneumococcal vaccination to contain the spread of antibacterial resistance. Antibiotiki i khimioterapiya. 2011; 56 (5–6): 11–18. (In Russ.)
  13. Briko N.I. The burden of pneumococcal infections and the directions of improving epidemiological surveillance in Russia. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2013; (6): 4–9. (In Russ.)
  14. Briko N.I. Prevalence and possibilities of preventing pneumococcal infections in the world and in Russia. Vaktsinasiya. 2009; (2): 5–7. (In Russ.)
  15. Epidemiologicheskiy nadzor za vnebol'nichnymi pnevmoniyami. (Epidemiological surveillance of community-acquired pneumonia.) Methodological Instructions MU 3.1.2.3047-13 (approved and put into effect by the Chief State Sanitary Doctor of the Russian Federation on January 10, 2013). http://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70194836 (access date: 02.04.2018). (In Russ.)
  16. Ryapis L.A., Briko N.I. Epidemiological surveillance and tactics of specific prevention of invasive pneumococcal infections in Russia. Zhurnal mikrobiologii. 2009; (6): 112–118. (In Russ.)

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

© 2018 Kozyanova Y.A., Safyanova T.V.

Creative Commons License

This work is licensed
under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.





Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».