The History of Manayunkia [Polychaeta: Sedentaria: Sabellidae] propagation in North Eastern Asia

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

This study aimes to elucidate the history of propagation of the freshwater Manayunkia polychaetes in North-Eastern Asia and their speciation in Lake Baikal. Nucleotide polymorphism analysis of of the CO1 Folmer fragment allowed to establish the sequence of migration and speciation events. Phylogenetic analysis and bayesian comparison of possible scenarios supports the hypothesis that the origin of the Manayunkia migration was the Kolyma river basin, from where the polychaetes migrated into Baikal and diverged into at least three species, one of which (M. godlewskii) served as the source of migrants into the Lake Baunt system.

About the authors

Tatyana Anatolyevna Pudovkina

Limnological Institute, Siberian Division, Russian Academy of Sciences

Email: tap77@rambler.ru
engineer. Laboratory of Molecular Systematics

Tatyana Yakovlevna Sitnikova

Limnological Institute, Siberian Division, Russian Academy of Sciences

dr., senior researcher. Laboratory of Biology of aquatic invertebrates

Arkadiy Nikolayevich Matveyev

Irkutsk State University

dr., professor. Head of Department of Biology and Soil Sciences

Dmitriy Yuryevich Shcherbakov

Limnological Institute, Siberian Division, Russian Academy of Sciences

Email: sherb@lin.irk.ru
Head of Laboratory of Molecular Systematics

References

  1. Верещагин Г. Ю. (1940) Происхождение и история Байкала, его фауны и флоры. Труды Байк. лимн. ст. АН СССР. Т. X.
  2. Гоманенко Г. В., Камалтынов Р. М., Кузьменкова Ж. В. (2005) Популяционная структура байкальского бокоплава Gmelinoides fasciatus (Stebbing). Генетика. Т. 41: С. 1108-1114.
  3. Клишко О. К. (1994) Фенотипические различия полихет Manayunkia baicalensis Nusb. из водоемов бассейнов рек Лены и Амура. Докл. АН СССР. Сер. Общ. биология. Т. 335: С. 116-117.
  4. Клишко О. К. (1996) Полихета Manayunkia baicalensis Nussb. в водоемах бассейнов рек Лена и Амур. Известия РАН. № 1: С. 101-105.
  5. Кожов М. М. (1962) Биология озера Байкал. М.: Наука. 315 с.
  6. Кожов М. М. (1972) Очерки по Байкаловедению. Иркутск: Вост.-Сиб. книжн. изд-во. 254 с.
  7. Ламакин В. В. (1952) Ушканьи острова и проблема происхождения Байкала. М.: Географгиз. 199 с.
  8. Мац В. Д., Уфимцев Г. Ф., Мандельбаум М. М. и др. (2001) Кайнозой Байкальской рифтовой впадины: Строение и геологическая история. Новосибирск: Изд-во СО РАН., филиал «Гео». 252 с.
  9. Мац В. Д., Фуджии, Ш., Машико, К. и др. (2002) К палеогидрологии Байкала в связи с неотектоникой. Геология и геофизика. Т. 43 (2): С. 142-154.
  10. Остерман Л. А. (1981) Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Электрофорез и ультрацентрифугирование. М.: Наука. 288 с.
  11. Перетолчина Т. Е., Ситникова Т. Я., Щербаков Д. Ю. (2006) Исследование популяционного генетического полиморфизма эндемичного байкальского вида Baicalia carinata (Mollusca, Caenogastropoda). Ruthenica. Т. 16(1-2): С. 105-111.
  12. Ситникова Т. Я. (2001) Многощетинковые черви (ANNELIDA: POLYCHAETA). Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна. Под ред. О. А. Тимошкина. Т. 1 книга 1: С. 428-431.
  13. Ситникова Т. Я., Щербаков Д. Ю., Огарков О. Б., Щербакова Т. А. (1995) О родственных взаимоотношениях байкальских полихет. Вторая Верещагинская. Байк. конференция. Иркутск. С. 177.
  14. Ситникова Т. Я., Щербаков Д. Ю., Харченко В. В. (1997) О таксономическом статусе полихет рода Manayunkia (Sabellidae, Fabricinae) из Байкала. Зоол. журнал. Т. 76: С. 16-27.
  15. Сластников Г. С. (1940) К нахождению многощетинкового червя Manayunkia в бассейне реки Гыда. Природа. № 7: С. 76-77.
  16. Тахтеев В. В., Снимщикова Л. Н., Окунева Г. Л. и др. (1993) Характеристика донного населения глубинной зоны Байкала. Экология. № 6: С. 60-67.
  17. Томилов А. А. (1954) Материалы по гидробиологии глубоководных озер Олекмо-Витимской горной страны. Тр. Иркутск. ун-та. Сер. биол. Т. 11: С. 1-86.
  18. Bukin Ju. S., Pudovkina T. A., Sherbakov D. Ju., Sitnikova T. Ya. (2007) Genetic Flows in a Structured One-Dimensional Population: Simulation and Real Data on Baikalian Polychaetes M. Godlewskii. In Silico Biology. V. 7: P. 277-284.
  19. Canales-Aguirre C. B., Rozbaczylo N., Hernández C. E. (2011) Genetic identification of benthic polychaetes in a biodiversity hotspot in the southeast Pacific. Revista de Biologia Marina y Oceanografia. V. 46: P. 89-94.
  20. Doyle J. J., Dickson E. E. (1987) Preservation of plant samples for DNA restriction endonuclease analysis. Taxon. V. 36: P. 715-722.
  21. Folmer O., Black M., Hoeh W. et al. (1994) DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome C subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol. Mar. Biol. Biotech. V. 3: P. 294-299.
  22. Kaygorodova I. A., Sherbakov D. Yu., Martin P. (2007) Molecular phylogeny of Baikalian Lumbriculidae (Oligochaeta): evidence for recent explosive speciation. Comparative Cytogenetics. V. 1: P. 71-84.
  23. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J. (1982) Molecular cloning: A laboratory manual. Gold Spring Harbor Laboratory Press. New York. 545 p.
  24. Nusbaum J. (1901) Dybowcella baicalensis nov. gen. Ein in Sueswasser lebendes Polychaet. Biol. Ctrbl., V. 21: P. 6-19.
  25. Posada D. (2008) jModelTest: phylogenetic model averaging. Mol. Biol. Evol. V. 25: P. 1253-1256.
  26. Rambaut A. (2006-2012) Tree figure drawing tool. Version 1.4.0. Institute of evolutionary biology. University of Edinburgh. http://tree.bio.ed.ac.uk.
  27. R Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. http://www.R-project.org.
  28. Ronquist F., Teslenko M., van der Mark P., et al. (2012) MrBayes 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Syst. Biol. V. 61: P. 539-542.
  29. Tajima F. (1989) Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism. Genetics. V. 123: P. 585-595.
  30. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. (2011) MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. V. 28: P. 2731-2739.
  31. Wilke T., Schultheib R., Albrecht C. (2009) As time goes by: A simple fool's guide to molecular clock approaches in invertebrates. Amer. Malac. Bull. V. 27: P. 25-45.
  32. Xie W., Lewis P. O., Fan Y. et al. (2011) Improving marginal likelihood estimation for Bayesian phylogenetic model selection. Syst. Biol. V. 60: P. 150-160.
  33. Zenkewitsch L. (1935) Über d. Manayunkia (M. polaris) an dem Murman - Küsten. Zool. Anz. B., 199, 718.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2014 Pudovkina T.A., Sitnikova T.Y., Matveyev A.N., Shcherbakov D.Y.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».