First data on genetic variability of the siberian wood frog rana amurensis in western siberia and its differentiation from the moor frog rana arvalis

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

The article presents data on genetic variability in populations of two brown frog species: the moor frog Rana arvalis and the siberian wood frog R. amurensis, in Western Siberia, Russia. Persentage of polymorphic ISSR-PCR-bands in R. arvalis was 63-93 %, in R. amurensis - 90 %, genetic diversity indices were 0.18-0.20 and 0.31, respectively. The high level of genetic variability in the siberian wood frog is contrary to its low population size, restricted distribution in the study area and the boundary position of the population. Some ISSR-PCR-bands were species-specific, they can be used for fast genotyping and further population genetic studies of the siberian wood and the moor frog in their areas of cohabitation.

About the authors

Oksana Nikolaevna Zhigileva

Tyumen State University

Email: zhigileva@mail.ru
PhD, Associate Professor, the Chair of Ecology and Genetics

Irina Yur’yevna Kirina

Tyumen State University

Email: irina_kirina2009@mail.ru
undergraduate

References

  1. Abramson N. I., Rodchenkova E. N., Kostygov A. Y. (2009) Genetic variation and phylogeography of the bank vole (Clethrionomys glareolus, Arvicolinae, Rodentia) in Russia with special reference to the introgression of the mtDNA of a closely related species, red-backed vole (Cl. rutilus). Rus. J. Genet. V. 5: P. 533-545.
  2. Babik W., Branicki W., Sandera M., Litvinchuk S., Borkin L. J., Irwin J. T., Rafinski J. (2004) Mitochondrial phylogeography of the moor frog, Rana arvalis. Mol. Ecol. V. 13: P. 1469-1480.
  3. Bender W., Pierre S., Hognes D. S. (1983) Chromosomal walking and jumping to isolate DNA from Ace and rosy loci of bithorax complex in Drosophila melanogaster. J. Mol. Biol. V. 168: P. 17-33.
  4. Che J., Pang J., Zhao E. M., Matsui M., Zhang Y. P. (2007) Phylogenetic relationships of the Chinese brown frogs (genus Rana) inferred from partial mitochondrial 12S and 16S rRNA gene sequences. Zoolog. Sci. V. 24 (1): P. 71-80.
  5. Hitchings S. P., Beebee T. J. C. (1997) Genetic substructuring as a result of barriers to gene flow in urban Rana temporaria (common frog) populations: implications for biodiversity conservation. Heredity. V. 79: P. 117-127.
  6. Ishchenko V. G. (1996) Problems of demography and declining populations of some euroasiatic brown frogs. Russ. J. Herpetol. V. 3 (2): P. 143-151.
  7. Kim J. B., Min M. S., Yang S. Y., Matsui M. (2002) Genetic relationships among Korean brown frog species (Anura, Ranidae), with special reference to evolutionary divergences between two allied species Rana dybowskii and R. huanrenensis. Zoolog. Sci. V. 19 (3): P. 369-382.
  8. Knopp T., Merilä J. (2009) Microsatellite variation and population structure of the moor frog (Rana arvalis) in Scandinavia. Mol. Ecol. V. 18 (14): P. 2996-3005.
  9. Lada G. A., Borkin L. J., Vinogradov A. E. (1995) Distribution, population systems and reproductive behavior of green frogs (hybridogenetic Rana esculenta) in the Central Chernozem Territory of Russia. Russ. J. Herpetol. V. 2 (1): P. 46-57.
  10. Litvinchuk S. N., Borkin L. J., Rosanov J. M. (2008) Genome size variation in Rana arvalis and some related brown frog species, including taxonomic comments on the validity of the R. arvalis subspecies. Z. Feldherpetol. V. 3: P. 95-112.
  11. Nei M. (1972) The genetic distance between populations. Amer. Natur. V. 106: P. 283-291.
  12. Palo J. U., Schmeller D. S., Laurila A., Primmer C. R., Kuzmin S. L., Merilä J. (2004) High degree of population subdivision in a widespread amphibian. Mol. Ecol. V. 13: P. 2631-2644.
  13. Rafiski J., Babik W. (2000) Genetic differentiation among northern and southern populations of the moor frog Rana arvalis Nilsson in central Europe. Heredity. V. 84: P. 610-618.
  14. Roček Z., Šandera M. (2008) Distribution of Rana arvalis in Europe: a historical perspective. Z. Feldherpetol. V. 13: P. 135-150.
  15. Shapovalov S. I., Zhigileva O. N. (2002) Spatial variability of morphological and biochemical characters of moor frog (Rana arvalis) from three research locations. Contemporary Problems of Ecology. V. 6: P. 729-734.
  16. Sjogren-Gulve P., Berg L. M. (1999) Allozyme variation as a demographic predictor at high latitudes: the moor frog and the pool frog at 60 degrees N. Hereditas. V. 130 (3): P. 317-323.
  17. Song J. Y., Matsui M., Chung K. H., Oh H. S., Zhao W. (2006) Distinct specific status of the Korean brown frog, Rana amurensis coreana (Amphibia: Ranidae). Zool. Sci. V. 23 (2): P. 219-224.
  18. Tanaka-Ueno T., Matsui M., Sato T., Takenaka S., Takenaka O. (1998) Local population differentiation and phylogenetic relationships of Russian brown frog, Rana amurensis inferred by mitochondrial cytochrome b gene sequences (Amphibia, Ranidae). Jap. J. Herpetol. V. 17 (3): P. 91-97.
  19. Veith M., Kosuch J., Vences M. (2003) Climatic oscillations triggered post-Messinian speciation of Western Palearctic brown frogs (Amphibia, Ranidae). Mol. Phylogenet. Evol. V. 26: P. 310-327.
  20. Yeh F. C., Yang R., Boyle T. (1999) POPGENE. Version 1.31. University of Alberta and Centre for International Forestry Research. Cited 24.01.2015. URL: http://www.ualberta.ca/~fyeh/popgene_download.html.
  21. Zhang M., Jia X., Ma Y., Ma J. (2010) Genetic diversity and differentiation of the Dybowski’s frog (Rana dybowskii) in Northeast China. J. Forest. Res. V. 21 (2): P. 239-245.
  22. Zhigileva O. N., Kirina I. Y., Burakova A. V. (2014a) Genetic diversity and differentiation of the moor frog (Rana arvalis) in Western Siberia. Herpetology Notes. V. 7: P. 569-574.
  23. Zhigileva O. N., Politov D. V., Golovacheva I. M., Petrovicheva S. V. (2014b) Genetic variability of sable Martes zibellina L., pine marten M. martes L. and their hybrides in West Siberia: polymorphism of proteins and DNA. Rus. J. Genetics. V. 50 (5): P. 508-517.
  24. Zietjiewicz E., Rafalski A., Labuda D. (1994) Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics. V. 20: P. 176-183.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2015 Zhigileva O.N., Kirina I.Y.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».