Экологическая генетика жуков рода Adalia: изменчивость и симбиотические бактерии в европейских популяциях десятиточечной божьей коровки Adalia decempunctata

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Задачей настоящей работы было изучить изменчивость ДНК десятиточечных божьих коровок Adalia decempunctata L. (Coleoptera: Coccinellidae) из девяти городов Европы и филогенетические связи их симбиотических бактерий.

Методы. Исследовали полиморфизм гена COI митохондриальной ДНК и зараженность Wolbachia, Spiroplasma и Rickettsia методом ПЦР и секвенированием.

Результаты. Восемь гаплотипов гена COI мтДНК, семь из которых до этого не были известны, обнаружены у 92 особей A. decempunctata из девяти мест сбора в Европейской части ареала, а именно: из Праги, Рима, Флоренции, Гамбурга, Парижа, Стокгольма, Москвы, Феодосии и Ялты. A. decempunctata менее изменчивы по мтДНК по сравнению с двуточечной A. bipunctata. Симбиотические бактерии Wolbachia и Spiroplasma в изученных A. decempunctata не выявлены. Зараженность Rickettsia обнаружена у A. decempunctata в Стокгольме и Феодосии. Проведено сравнение симбионтов A. decempunctata, A. bipunctata и семиточечной Coccinella sp. ДНК бактерии Rickettsia из A. decempunctata из Феодосии и Стокгольма по гену gltA различаются на 0,5 % и один из вариантов идентичен симбионту A. bipunctata и Coccinella sp.

Выводы. Три гаплотипа мтДНК присутствуют в генофонде A. decempunctata, собранных в географически далеких местах обитания. Количество нуклеотидных замен между Rickettsia из A. decempunctata и A. bipunctata позволяет предполагать единое происхождение симбионта у божьих коровок рода Adalia, полученные результаты не исключают последующих горизонтальных переносов Rickettsia между особями обоих видов.

Об авторах

Елена Владимировна Шайкевич

ФГБУН «Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова» РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: elenashaikevich@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6504-5547
SPIN-код: 4746-3067

д-р биол. наук, ведущий научный сотрудник, лаборатория генетики насекомых

Россия, 119991, г. Москва, ГСП-1, ул. Губкина, 3

Илья Артемьевич Захаров

ФГБУН «Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова» РАН

Email: iaz34@mail.ru

член-корр. РАН, д-р биол. наук, главный научный сотрудник, лаборатория генетики насекомых

Россия, 119991, г. Москва, ГСП-1, ул. Губкина, 3

Алоис Хонек

Научно-исследовательский институт изучения сельскохозяйственных культур

Email: honek@vurv.cz

д-р биол. наук, главный научный сотрудник

Чехия, Прага-Ружине

Список литературы

  1. Добржанский Ф.Г. Географическая и индивидуальная изменчивость Adalia bipunctata L. и Adalia decempunctata L. (Coleoptera, Coccinellidae) // Русское энтомологическое обозрение. – 1924. – Т. 18. – № 4. – С. 201–212. [Dobzhansky T. Über geographische und individuelle Variabilität von Adalia bipunctata und A. decempunctata. Russk Entomol Obozrenie. 1924;18(4):201-211. (In Russ.)]
  2. Лус Я.Я. О наследовании окраски и рисунка у божьих коровок Adalia bipunсtata L. и Adalia decempunctata L. // Изв. Бюро генетики АН СССР. – 1928. – № 6. – С. 89–163. [Lus YaYa. On the inheritance of color and pattern in lady beetles Adalia bipunctata L. and Adalia decempunctata L. Izv. Byuro genetiki AN SSSR. 1928;(6):89-163. (In Russ.)]
  3. Majerus ME. Ladybirds. London: Harper Collins; 1994. 367 p.
  4. Schulenburg JH, Hurst GD, Tetzlaff D, et al. History of infection with different male-killing bacteria in the two-spot ladybird beetle Adalia bipunctata revealed through mitochondrial DNA sequence analysis. Genetics. 2002;160(3):1075-1086.
  5. Jiggins FM, Tinsley MC. An ancient mitochondrial polymorphism in Adalia bipunctata linked to a sex-ratio-distorting bacterium. Genetics. 2005;171(3):1115-1124. https://doi.org/10.1534/genetics.105.046342.
  6. Захаров И.А., Шайкевич Е.В. Полиморфизм мтДНК в петербургской популяции Adalia bipunctata и его связь с зараженностью симбиотической бактерией Spiroplasma // Экологическая генетика. – 2011. – Т. 9. – № 1. – C. 27–31. [Zakharov IA, Shaikevich EV. An mtDNA polymorphism in the St. Petersburg population of Adalia bipunctata and its correlation with infection by the symbiotic bacterium Spiroplasma. Ecological genetics. 2011;9(1):27-31. (In Russ.)]. https://doi.org/10.1134/S207905971202013X.
  7. Шайкевич Е.В., Ившина Е.В., Захаров И.А. Полиморфизм митохондриальной ДНК и распространение цитоплазматических симбионтов в популяциях двуточечной божьей коровки Adalia bipunctata // Генетика. – 2012. – T. 48. – № 5. – C. 666–671. [Shaikevich EV, Ivshina EV, Zakharov IA. Polymorphism of mtDNA and distribution of cytoplasmic symbionts in populations of the two-spot ladybird beetle Adalia bipunctata. Russian Journal of Genetics. 2012;48(5):567-571. (In Russ.)]
  8. Hilgenboecker K, Hammerstein P, Schlattmann P, et al. How many species are infected with Wolbachia? – A statistical analysis of current data. FEMS Microbiol Lett. 2008;281(2):215-220. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2008.01110.x.
  9. Elnagdy S, Messing S, Majerus ME. Two strains of male-killing Wolbachia in a ladybird, Coccinella undecimpunctata, from a hot climate. PLoS ONE. 2013;8(1): e54218. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054218.
  10. Von der Schulenburg JH, Habig M, Sloggett JJ, et al. Incidence of male-killing Rickettsia spp. (alpha-proteobacteria) in the ten-spot ladybird beetle Adalia decempunctata L. (Coleoptera: Coccinellidae). Appl Environ Microbiol. 2001;67(1):270-277. https://doi.org/10.1128/AEM.67.1.270-277.2001.
  11. Zakharov IA, Shaikevich EV. The Stockholm populations of Adalia bipunctata (L.) (Coleoptera: Coccinellidae) – a case of extreme female-biased population sex ratio. Hereditas. 2001;134(3):263-266. https://doi.org/10.1111/j.1601-5223.2001.00263.x.
  12. Weinert LA, Tinsley MC, Temperley M, Jiggins FM. Are we underestimating the diversity and incidence of insect bacterial symbionts? A case study in ladybird beetles. Biol Lett. 2007;3(6):678-681. https://doi.org/10.1098/rsbl.2007.0373.
  13. Van Kuppeveld FJ, van der Logt JT, Angulo AF, et al. Genus- and species-specific identification of mycoplasmas by 16S rRNA amplification. Appl Environ Microbiol. 1992;58(8):2606-2615.
  14. Braig HR, Zhou W, Dobson SL, O’Neill SL. Cloning and characterization of a gene encoding the major surface protein of the bacterial endosymbiont Wolbachia. J Bacteriol. 1998;180(9):2373-2378.
  15. Porter CH, Collins FH. Species-diagnostic differences in a ribosomal DNA internal transcribed spacer from the sibling species Anopheles freeborni and Anopheles hermsi (Diptera: Culicidae). Am J Trop Med Hyg. 1991;45(2):271-279. https://doi.org/10.4269/ajtmh.1991.45.271.
  16. Tamura K, Stecher G, Peterson D. et al. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013;30(12):2725-2729. https://doi.org/10.1093/molbev/mst197.
  17. Librado P, Rozas J. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics. 2009;25(11):1451-1452. https://doi.org/ 10.1093/bioinformatics/btp187.
  18. Bandelt HJ, Forster P, Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol Biol Evol. 1999;16(1):37-48. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036.
  19. Животовский Л.А. Показатель внутрипопуляционного разнообразия // Журнал общей биологии. – 1980. – Т. 41. – № 6. – С. 828-836. [Zhivotovskiy LA. Pokazatel’ vnutripopulyatsionnogo raznoobraziya. Journal of general biology. 1980;41(6): 828-836. (In Russ.)]
  20. Токарев Ю.С., Юдина М.А., Малыш Ю.М., и др. Встречаемость эндосимбиотической бактерии рода Wolbachia в природных популяциях Ostrinia nubilalis и Ostrinia scapulalis (Lepidoptera: Pyraloidea: Crambidae) на юго-западе России // Экологическая генетика. – 2017. – Т. 15. – № 1. – С. 44–49. [Tokarev YuS, Yudina MA, Malysh YuM, et al. Prevalence rates of Wolbachia endosymbiotic bacterium in natural populations of Ostrinia Nubilalis and Ostrinia Scapulalis (Lepidoptera: Pyraloidea: Crambidae) in South-Western Russia. Ecological genetics. 2017;15(1):44-49. (In Russ.)]. https://doi.org/10.17816/ecogen15144-49.
  21. Юдина М.А., Быков Р.А., Котти Б.К., и др. Наследуемые бактерии рода Wolbachia в популяциях блох (Insecta: Siphonaptera) // Журнал общей биологии. – 2018. – Т. 79. – № 3. – С. 237–246. [Yudina MA, Bykov RA, Kotti BK, et al. Wolbachia infection in flea populations (Insecta: Siphonaptera). Journal of general biology. 2018;79(3):237-246. (In Russ.)]. https://doi.org/10.7868/S0044459618030053.
  22. Bykov RА, Yudina MA, Gruntenko NE, et al. Prevalence and genetic diversity of Wolbachia endosymbiont and mtDNA in Palearctic populations of Drosophila melanogaster. BMC Evol Biol. 2019;19(Suppl 1):48. https://doi.org/10.1186/s12862-019-1372-9.
  23. Haag-Liautard C, Coffey N, Houle D. et al. Direct estimation of the mitochondrial DNA mutation rate in Drosophila melanogaster. PLoS Biol. 2008;6(8): e204. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0060204.
  24. Elnagdy S, Majerus ME, Handley LJ. The value of an egg: resource reallocation in ladybirds (Coleoptera: Coccinellidae) infected with male-killing bacteria. J Evol Biol. 2011;24(10):2164-2172. https://doi.org/10.1111/j.1420-9101.2011.02346.x.
  25. Kajtoch Ł, Kotásková N. Current state of knowledge on Wolbachia infection among Coleoptera: a systematic review. Peer J. 2018;6: e4471. https://doi.org/10.7717/peerj.4471.
  26. Nakamura K, Ueno H, Miura K. Prevalence of inherited male-killing microorganisms in japanese population of ladybird beetle Harmonia axyridis (Coleoptera: Coccinellidae). Annals of the Entomological Society of America. 2005;98(1):96-99. https://doi.org/10.1603/0013-8746(2005)098[0096: POIMMI]2.0.CO.
  27. Goryacheva I, Blekhman A, Andrianov B. et al. Spiroplasma infection in Harmonia axyridis – Diversity and multiple infection. PLoS One. 2018;13(5): e0198190. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0198190.
  28. Weinert LA, Werren JH, Aebi A. et al. Evolution and diversity of Rickettsia bacteria. BMC Biol. 2009;7:6. https://doi.org/10.1186/1741-7007-7-6.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Внутривидовой полиморфизм гаплотипов мтДНК A. decempunctata. Восемь гаплотипов представлены на сети пропорционально их встречаемости в выборке

Скачать (21KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Дендрограмма сходства последовательностей ДНК гена gltA Rickettsia. Указаны хозяева внутриклеточных симбиотических бактерий Rickettsia и места их сборов. Последовательности, полученные в данной работе, отмечены черными ромбами. Другие последовательности выбраны из GenBank для сравнения, приведены регистрационные номера. ДНК Rickettsia из Ixodes colasbelcouri использована в качестве аутгруппы

Скачать (143KB)
Метаданные

© Шайкевич Е.В., Захаров И.А., Хонек А., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».