Comparing of level of circulation of respiratory viruses during epidemic seasons 2015–2020 and COVID-19 pandemic in Saint Petersburg

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

BACKGROUND: Respiratory viruses circulate everywhere. Problem of pandemic respiratory virus SARS-CoV-2 is especially relevant. The understanding of level of circulation of different viruses can help in developing a strategy of respiratory viruses combat.

AIM: To compare circulation of respiratory viruses during different seasons.

MATERIALS AND METHODS: PCR-diagnostic.

RESULTS: The most common viruses before the pandemic were influenza and respiratory syncytial viruses. COVID-19 pandemic season 2020/2021 had significant difference from previous epidemic seasons. Influenza viruses have largely disappeared, but the circulation of seasonal coronavirus and metapneumovirus has increased. The circulation of rhinovirus remained at the same level.

CONCLUSIONS: The emergence of pandemic SARS-CoV-2 virus had a significant impact on some respiratory viruses’ circulation, such as influenza or respiratory syncytial viruses.

About the authors

Andrey D. Ksenafontov

Smorodintsev Research Institute of Influenza

Author for correspondence.
Email: ksenandrey@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-4532-6210

Postgraduate student, Research Assistant

Russian Federation, Saint Petersburg

Maria M. Pisareva

Smorodintsev Research Institute of Influenza

Email: maria.pisareva@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-1499-9957
SPIN-code: 9662-5361
Scopus Author ID: 6506831021
ResearcherId: J-2696-2016

PhD, Cand. Sci. (Biol.), Leading Researcher

Russian Federation, Saint Petersburg

Veronica A. Eder

Smorodintsev Research Institute of Influenza

Email: veronika.eder@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-9970-3325
SPIN-code: 4793-1377
Scopus Author ID: 56387095900
ResearcherId: G-6907-2017

PhD, DSc (Biol.), Senior Researcher

Russian Federation, Saint Petersburg

Tamila D. Musaeva

Smorodintsev Research Institute of Influenza

Email: tamilamusaeva94@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-3050-1936
SPIN-code: 3767-2899
Scopus Author ID: 57189459858
ResearcherId: J-1174-2016

Junior Researcher

Russian Federation, Saint Petersburg

Mariya M. Timofeeva

Smorodintsev Research Institute of Influenza

Email: timofeyeva.mariya@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9505-8819
SPIN-code: 1921-2899

Research Assistant

Russian Federation, Saint Petersburg

Irina V. Kiseleva

Saint Petersburg State University; Institute of Experimental Medicine

Email: irina.v.kiseleva@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-3892-9873
SPIN-code: 7857-7306
Scopus Author ID: 7102041346
ResearcherId: E-6555-2014

PhD, DSc (Biol.), Professor, Head of the Laboratory

Russian Federation, Saint Petersburg

References

  1. Pisareva MM, Eder VA, Buzitskaya ZhV, et al. Etiological structure of influenza and other ARVI in St. Petersburg during epidemic seasons 2012–2016. Problems of Virology. 2018;63(5):233–239. (In Russ.) doi: 10.18821/0507-4088-2018-63-5-233-239
  2. Calderaro A, De Conto F, Buttrini M, et al. Human respiratory viruses, including SARS-CoV-2, circulating in the winter season 2019-2020 in Parma, Northern Italy. Int J Infect Dis. 2021;102:79–84. doi: 10.1016/j.ijid.2020.09.1473
  3. Nowak MD, Sordillo EM, Gitman MR, Paniz Mondolfi AE. Co-infection in SARS-CoV-2 infected patients: Where are influenza virus and rhinovirus/enterovirus? J Med Virol. 2020;92(10):1699–1700. doi: 10.1002/jmv.25953
  4. Piedimonte G, Perez MK. Respiratory syncytial virus infection and bronchiolitis. Pediatr Rev. 2014;35(12):519–530. doi: 10.1542/pir.35-12-519
  5. Borchers AT, Chang C, Gershwin ME, Gershwin LJ. Respiratory syncytial virus – a comprehensive review. Clin Rev Allergy Immunol. 2013;45(3):331–379. doi: 10.1007/s12016-013-8368-9

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2. Figure. Distribution of respiratory viruses (excluding SARS-CoV-2) by epidemic seasons

Download (136KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2021 Ksenafontov A.D., Pisareva M.M., Eder V.A., Musaeva T.D., Timofeeva M.M., Kiseleva I.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».