Апробация метода электрофоретического разделения и идентификации некоторых белков мочи у крыс при токсической нефропатии

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования. Целью настоящей работы была апробация метода определения некоторых белковых маркеров в моче крыс методом электрофоретического разделения с последующей масс-спектрометрической идентификацией для раннего выявления нефротоксичности. В задачи исследования входили оценка воспроизводимости метода разделения белков, сравнение белковых профилей мочи в норме и при введении гентамицина сульфата, а также биохимическое и морфологическое исследования биоптатов почек.

Материалы и методы. Гентамицина сульфат вводили крысам обоего пола внутримышечно в дозе 60 мг/кг в течение 5 дней. Суточную мочу собирали в день 0, на 3, 7 и 14-е сутки от начала введения гентамицина сульфата в обменных клетках. Измеряли концентрации общего белка и креатинина в пробах мочи, уровень липидов в гомогенатах почек. Электрофоретическое разделение белков мочи проводили в Mini-PROTEAN Tetra Vertical Electrophoresis. Гели окрашивали, а окрашенные зоны полиакриламидного геля вырезали и выполняли ферментативный гидролиз белков. Спектры триптических пептидов регистрировали на MALDI-TOF/TOF-масс-спектрометре ultrafleXtreme (Bruker, Германия). Белки идентифицировали в программе Biotools при обращении к базе данных Mascot (matrixscience.com).

Результаты. Оценка воспроизводимости результатов электрофоретического разделения белков мочи крыс показала приемлемую величину коэффициента вариации (в среднем 8,03 %) и погрешности анализа (Δанализа = 14,53 %). Было обнаружено, что в норме у крыс-самцов в моче доминирует предшественник альфа-2-уроглобулина, у самок преобладают легкие цепи иммуноглобулина G. На фоне введения гентамицина сульфата в моче у крыс обоих полов появляются лейкоциты в патологических концентрациях; у самцов протеомный профиль характеризуется сильной внутривидовой дисперсией, в том числе за счет спермальной контаминации; у самок наблюдаются хорошо идентифицируемые зоны альбумина, альфа-1-антитрипсина, аминопептидазы М, бета-2-микроглобулина, трансферрина. При биохимическом исследовании гомогенатов почек выявлено увеличение уровня общего холестерина (самцы) и триацилглицеридов (самки). Патоморфологические изменения были схожими у самцов и самок крыс в виде жировой дистрофии нефротелия проксимальных канальцев и лейкоцитарной инфильтрации интерстиция и подтверждали изменения в спектре белков мочи.

Заключение. На основании данных исследования было установлено, что технология электрофоретического разделения белков в полиакриламидном геле в денатурирующих условиях с последующей MALDI-масс-спектрометрической идентификацией и денситометрическим определением доли белковых фракций применима для выявления нефротоксичности. Из-за половых различий в белковом спектре предпочтительно исследовать мочу крыс-самок.

Об авторах

Константин Владимирович Сивак

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа имени А.А. Смородинцева» Минздрава РФ

Автор, ответственный за переписку.
Email: kvsivak@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4064-5033
SPIN-код: 7426-8322
Scopus Author ID: 35269910300

канд. биол. наук, заведующий отделом доклинических исследований

Россия, Санкт-Петербург

Яна Александровна Забродская

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа имени А.А. Смородинцева» Минздрава РФ; ФГБУ «Петербургский институт ядерной физики имени Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»; ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»

Email: zabryaka@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2012-9461

канд. физ.-мат. наук, научный сотрудник отдела молекулярной биологии вирусов; 

Россия, Санкт-Петербург

Ольга Андреевна Добровольская

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа имени А.А. Смородинцева» Минздрава РФ

Email: dobrovolskaya.od@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-0857-4733

научный сотрудник лаборатории генной инженерии и экспрессии рекомбинантных белков

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Slater MB, Gruneir A, Rochon PA, et al. Identifying high-risk medications associated with acute kidney injury in critically ill patients: a pharmacoepidemiologic evaluation. Paediatr Drugs. 2017;19(1):59-67. https://doi.org/10.1007/s40272-016-0205-1.
  2. Сивак К.В. Механизмы нефропатологии токсического генеза // Патогенез. – 2019. – Т. 17. – № 2. – С. 16–29. [Sivak KV. Mechanisms of toxic nephropathology. Pathogenesis. 2019;17(2):16-29. (In Russ.)]. https://doi.org/ 10.25557/2310-0435.2019.02.16-29.
  3. Magalhães P, Pontillo C, Pejchinovski M, et al. Comparison of urine and plasma peptidome indicates selectivity in renal peptide handling. Proteomics Clin Appl. 2018;12(5):e1700163. https://doi.org/10.1002/prca.201700163.
  4. Rus-LASA. Директива Европейского парламента и Совета Европейского союза 2010/63/EU от 22 сентября 2010 г. по охране животных, используемых в научных целях. – СПб., 2012. – 48 с. [Rus-LASA. Directive of the European parliament and of the Council of the European Union 2010/63/EU for the protection of animals used for scientific purposes. Saint Petersburg; 2012. 48 р. (In Russ.)]
  5. Kimura J, Ichii O, Otsuka S, et al. Quantitative and qualitative urinary cellular patterns correlate with progression of murine glomerulonephritis. PLoS One. 2011;6(1):e16472. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0016472.
  6. Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970;227(5259):680-685. https://doi.org/10.1038/ 227680a0.
  7. Antimonova OI, Lebedev DV, Zabrodskaya YA, et al. Changing times: fluorescence-lifetime analysis of amyloidogenic SF-IAPP fusion protein. J Struct Biol. 2019;205(1):78-83. https://doi.org/10.1016/j.jsb.2018.11.006.
  8. Стандартные технологические процедуры при проведении патологоанатомических исследований: клинические рекомендации RPS1.1. 2016 / П.Г. Мальков, Г.А. Франк, М.А. Пальцев; Российское общество патологоанатомов. – М.: Практическая медицина, 2017. – 135 с. [Standartnyye tekhnologicheskiye protsedury pri provedenii patologoanatomicheskikh issledovaniy: klinicheskiye rekomendatsii RPS1.1. 2016. P.G. Malkov, G.A. Frank, M.A. Pal’tsev. Russian Society of Pathologists. Moscow: Practical medicine; 2017. 135 p. (In Russ.)]
  9. Lehman-McKeeman LD, Caudill D. Biochemical basis for mouse resistance to hyaline droplet nephropathy: lack of relevance of the alpha 2u-globulin protein superfamily in this male rat-specific syndrome. Toxicol Appl Pharmacol. 1992;112(2):214-221. https://doi.org/10.1016/0041-008X(92)90190-4.
  10. Lehman-McKeeman LD, Caudill D. d-Limonene induced hyaline droplet nephropathy in alpha 2u-globulin transgenic mice. Fundam Appl Toxicol. 1994;23(4):562-568. https://doi.org/10.1006/faat.1994.1141.
  11. Ланда С.Б., Аль-Шукри С.Х., Горбачев М.И., и др. Патохимические особенности олигомерных форм белка Тамма – Хорсфалла при уролитиазе // Клиническая лабораторная диагностика. – 2016. – Т. 61. – № 6. – С. 335–341. [Landa SB, Al-Shukri SH, Gorbachev MI, et al. The pathochemical characteristics of oligomeric forms of Tamm-Horsfall protein under urolithiasis. Klinicheskaia laboratornaia diagnostika. 2016;61(6):335-341. (In Russ.)]. https://doi.org/10.18821/0869-2084-2016-6-335-341.
  12. Saunders DA, Begg EJ, Kirkpatrick CM, et al. Measurement of total phospholipids in urine of patients treated with gentamicin. Br J Clin Pharmacol. 1997;43(4):435-440. https://doi.org/10.1046/j.1365-2125.1997.00568.x.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Определяемые зоны типовой ПААГ-электрофореграммы белков мочи крыс (M — самцы и F — самки) и их молекулярные массы (кДа). МM — маркер молекулярных масс (Bio-Rad). * обозначен характерный для самцов предшественник альфа-2-уроглобулина или главный мочевой белок; # — порядковый номер пробы

Скачать (148KB)
3. Рис. 2. Фрагмент масс-спектра триптических пептидов (сверху), по которому достоверно идентифицировали белок — предшественник альфа-2-уроглобулина (Rattus norvegicus), Score = 135 (пороговое значение 92). Отмечены ионы и соответствующие им номера аминокислотных остатков. Предполагаемые последовательности пептидов, а также их масса и погрешность представлены снизу

Скачать (288KB)
4. Рис. 3. Фрагмент масс-спектра триптических пептидов, по которому достоверно идентифицировали легкие цепи иммуноглобулинов (каппа) (Rattus norvegicus), Score = 78 (пороговое значение — 72) (а). Отмечены ионы и соответствующие им номера аминокислотных остатков. В таблице представлены предполагаемые последовательности пептидов, а также их масса и погрешность. Спектр фрагментации иона 1004.52 достоверно идентифицирован как легкие цепи иммуноглобулинов (каппа) (Rattus norvegicus), Score = 46 (порог 42), последовательность WKIDGTER (b)

Скачать (335KB)
5. Рис. 4. Динамика лейкоцитурии у крыс, получавших гентамицина сульфат (a — самцы, b — самки крыс)

Скачать (744KB)
6. Рис. 5. Патоморфологические изменения в почке у самцов (а) и самок (b) крыс после воздействия гентамицином. * жировая дистрофия нефроэпителия; # лейкоцитарная инфильтрация интерстиция. Парафиновые срезы, окраска гематоксилином и эозином, увеличение ×400

Скачать (624KB)

© Сивак К.В., Забродская Я.А., Добровольская О.А., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».