МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ EschErichia coli СЕРОГРУППЫ О26, ВЫЗЫВАЮЩИХ ДИАРЕЙНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ У ДЕТЕЙ


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования - определить серотиповую принадлежность и факторы вирулентности штаммов E. coli серогруппы О26, выделенных от детей с диарейным синдромом. Материалы и методы. Изучены 53 штамма E. coli О26, выделенные в 2014-2016 гг. из испражнений детей с клиническими проявлениями острой кишечной инфекции (ОКИ) в Санкт-Петербурге. Использовали фенотипические (определяли ферментативные и антигенные свойства, продукцию шига-токсинов) и молекулярно-генетические (ПЦР) методы: проводили детекцию генов вирулентности, характерных для энтеропатогенных (EPEC) и энтерогеморрагических (ЕНЕС) E. coli (eae, bfp, hlyA и eae, stx1, stx2, ehxA соответственно), генов, кодирующих О- и Н-антигены (rfb и fliC), генов, определяющих филогенетическую группу (chuA, yjaA и TspE). Определяли филогенетическую группу и продукцию шига-токсинов. Результаты исследований. Все штаммы E. coli были идентичны по антигенной характеристике - относились к серотипу О26:Н11 и принадлежали к филогенетической группе В1. По набору генов вирулентности относились к двум патогруппам: а-ЕРЕС (64,2 %) и ЕНЕС (35,8 %). Штаммы ЕНЕС продуцировали шига-токсин 1, кодируемый геном stx1. Различия в ферментативной активности между штаммами E. coli О26:Н11 ЕРЕС и ЕНЕС выявлены не были. Заключение. В данной работе показано, что в популяции E. coli О26:Н11, вызывавших ОКИ у детей в Санкт-Петербурге, более 30 % штаммов принадлежали к группе ЕНЕС. Молекулярно-генетические методы позволяют достоверно определять высоковирулентные штаммы возбудителей эшерихиозов.

Об авторах

М А Макарова

ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера»

А В Дмитриев

ФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»

З Н Матвеева

ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера»

Л А Кафтырева

ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера»

Список литературы

  1. Кафтырева Л.А., Егорова С.А., Макарова М.А., и др. Характеристика биологических свойств E. coli О104:Н4 - возбудителя крупной пищевой вспышки, возникшей в Германии в мае 2011 г. // Клиническая лабораторная диагностика. - 2012. - № 1. - С. 44-47. [Kaftyreva LA, Egorova SA, Makarova MA, et al. The characteristics of biological properties of E. coli O104:H4 - the causative agent of large-scale alimentary ictus in Germany May 2001. Klin Lab Diagn. 2012;(1):44-47. (In Russ.)]
  2. Федеральная служба государственной статистики (Росстат). Здравоохранение в России - 2017. Статистический сборник. - М., 2017. [Federal’naya sluzhba gosudarstvennoy statistiki (Rosstat). Zdravookhranenie v Rossii - 2017. Statisticheskiy sbornik. Moscow; 2017. (In Russ.)]
  3. Bell BP, Griffin PM, Lozano P, et al. Predictors of hemolytic uremic syndrome in children during a large outbreak of Escherichia coli O157:H7 infections. Pediatrics. 1997;100(1):E12. doi: 10.1542/peds.100.1.e12.
  4. Bielaszewska M, Zhang W, Tarr PI, et al. Molecular profiling and phenotype analysis of Escherichia coli O26:H11 and O26:NM: secular and geographic consistency of enterohemorrhagic and enteropathogenic isolates. J Clin Microbiol. 2005;43(8):4225-4228. doi: 10.1128/JCM.43.8.4225-4228.2005.
  5. Онищенко Г.Г., Дятлов И.А, Светоч Э.А., и др. Молекулярно-генетическая характеристика шига-токсинпродуцирующих Escherichia coli, выделенных при вспышке пищевой инфекции в Санкт-Петербурге в 2013 году // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2015. - Т. 70. - № 1. - С. 70-81. [Onishchenko GG, Dyatlov IA, Svetoch EA, et al. Molecular-genetic Characterization of Shiga-Toxin Producing Escherichia сoli Isolated During a Food-Borne Outbreak in Saint Petersburg in 2013. Annals of the Russian academy of medical sciences. 2015;70(1):70-81. (In Russ.)]. doi: 10.15690/vramn.v70i1.1234.
  6. Bielaszewska M, Mellmann A, Bletz S, et al. Enterohemorrhagic Escherichia coli O26:H11/H-: a new virulent clone emerges in Europe. Clin Infect Dis. 2013;56(10):1373-1381. doi: 10.1093/cid/cit055.
  7. Misselwitz J, Karch H, Bielazewska M, et al. Cluster of hemolytic-uremic syndrome caused by Shiga toxin-producing Escherichia coli O26:H11. Pediatr Infect Dis J. 2003;22(4):349-354. doi: 10.1097/01.inf.0000059338.38673.ae.
  8. Nataro JP, Kaper JB. Diarrheagenic Escherichia coli. Clin Microbiol Rev. 1998;11(1):142-201. doi: 10.1128/CMR.11.1.142.
  9. Kruger A, Lucchesi PM, Sanso AM, et al. Genetic characterization of Shiga toxin-producing Escherichia coli O26:H11 strains isolated from animal, food, and clinical samples. Front Cell Infect Microbiol. 2015;5:74. doi: 10.3389/fcimb.2015.00074.
  10. Vygen-Bonnet S, Rosner B, Wilking H, et al. Ongoing haemolytic uraemic syndrome (HUS) outbreak caused by sorbitol-fermenting (SF) Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) O157, Germany, December 2016 to May 2017. Euro Surveill. 2017;22(21). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.21.30541.
  11. Bonardi S, Alpigiani I, Tozzoli R, et al. Shiga toxin-producing Escherichia coli O157, O26 and O111 in cattle faeces and hides in Italy. Vet Rec Open. 2015;2(1):e000061. doi: 10.1136/vetreco-2014-000061.
  12. Brooks JT, Sowers EG, Wells JG, et al. Non-O157 Shiga toxin-producing Escherichia coli infections in the United States, 1983-2002. J Infect Dis. 2005;192(8):1422-1429. doi: 10.1086/466536.
  13. Durso LM, Bono JL, Keen JE. Molecular serotyping of Escherichia coli O26:H11. Appl Environ Microbiol. 2005;71(8):4941-4944. doi: 10.1128/AEM.71.8.4941-4944.2005.
  14. Guion CE, Ochoa TJ, Walker CM, et al. Detection of diarrheagenic Escherichia coli by use of melting-curve analysis and real-time multiplex PCR. J Clin Microbiol. 2008;46(5):1752-1757. doi: 10.1128/JCM.02341-07.
  15. Tobias J, Vutukuru SR. Simple and rapid multiplex PCR for identification of the main human diarrheagenic Escherichia coli. Microbiol Res. 2012;167(9):564-570. doi: 10.1016/j.micres.2011.11.006.
  16. El-Rami FE, Rahal E, Sleiman FT, Abdelnoor AM. Identification of virulence genes among antibacterial-resistant Escherichia coli. Adv Stud Biol. 2012;4(8):385-396.
  17. Slanec T, Fruth A, Creuzburg K, Schmidt H. Molecular analysis of virulence profiles and Shiga toxin genes in food-borne Shiga toxin-producing Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 2009;75(19):6187-6197. doi: 10.1128/AEM.00874-09.
  18. Clermont O, Bonacorsi S, Bingen E. Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Appl Environ Microbiol. 2000;66(10):4555-4558. doi: 10.1128/AEM.66.10.4555-4558.2000.
  19. Afset JE, Bergh K, Bevanger L. High prevalence of atypical enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) in Norwegian children with diarrhoea. J Med Microbiol. 2003;52(Pt 11):1015-1019. doi: 10.1099/jmm.0.05287-0.
  20. Соколова Е.Д., Галтаева А.М., Замурин О.Ю., и др. Полимеразно-цепная реакция в диагностике острых кишечных инфекций в детском инфекционном стационаре: возможности и проблемы // Инфекция и иммунитет. - 2016. - Т. 6. - № 3. - С. 225-231. [Sokolova ED, Galtaeva AM, Zamurin OY, et al. Acute enteric infections polymerase chain reaction assay in pediatric practice: opportunities and challenges. Russian journal of infection and immunity. 2016;6(3):225-231. (In Russ.)]. doi: 10.15789/2220-7619-2016-3-225-231.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Макарова М.А., Дмитриев А.В., Матвеева З.Н., Кафтырева Л.А., 2018

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».