The genetic heterogeneity of Streptococcus pyogenes strains of emml2 genotype


Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Streptococcus pyogenes strains of emml 2 genotype, isolated from children in Saint-Petersburg in 2007, were investigated employing different molecular-genetic approaches. Smal restriction patterns of genomic DNA of the strains were analyzed. Distribution of the phage genes, including virulence genes and integrase genes, was studied. The significant genetic heterogeneity was observed. The transposon gene, which has not been previously discovered in S. pyogenes strains, was identified.

About the authors

E M Polyakova

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

Email: katerinapolyakova@rambler.ru

E S Mnatsakanyan

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

L A Burova

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

A V Dmitriev

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

References

  1. Полякова Е.М., Гао В., Янг Я. и др. Молекулярногенетическое сравнение штаммов Streptococcus pyogenes типов еттl и еттl 2 по набору профаговых генов // Журн. микробиол. 2009. Т. 2. С. 18-24.
  2. Banks D.J., Lei В. & Musser J.M. Prophage induction and expression of prophage-encoded virulence factors in group A streptococcus serotype М3 strain MGAS315 // Infect. Imirnin. 2003. Vol. 71. № 12. P. 7079-7086.
  3. Beres S.B., Sylva G.L., Barbian K.D. et al. Genome sequence of a serotype М3 strain of group A Streptococcus: phage-encoded toxins, the high-virulence phenotype, and clone emergence // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. № 15. P. 10078-10083.
  4. Beres S.B., Musser J.M. Contribution of Exogenous Genetic Elements to the Group A Streptococcus Metagenome // PLoS ONE 2: e800.
  5. Carapetis J., Robins-Browne R., Martin D. et al. Increasing severity of invasive group A streptococcal disease in Australia: clinical and molecular epidemiological features and identification of a new virulent M- non-typeable clone // Clin. Infect. Dis. Vol. 21. № 5. P. 1220-1227.
  6. Cunningham M.W. Pathogenesis of Group A Streptococcal diseases // Clin. Microbiol. Rev. 2000. Vol. 13. №3. P.470-511.
  7. Dopazo J., Mendoza A., Herrera.1. et al. Annotated draft genomic sequence from a Streptococcus pneumoniae type 19F clinical isolate // Microbiol. Drug. Resist. 2001. Vol. 7. № 2. P. 99-125.
  8. Ekelund K., Skinhoj P., Madsen J. et al. Reemergence of emm and a changed superantigen profile for group a streptococci causing invasive infections: results from a nationwide study // J. Clin. Microbiol. 2005. Vol. 43. №4. P. 1789-1796.
  9. Elliot J.A., Farmer K.D., Facklam R.R. Sudden increase in isolation of group В streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new pulsed-fteld gel electrophoresis type // J. Clin. Microbiol. 1998. Vol. 36. P.2115-2116.
  10. Facklam R.F., Martin D.R., Lovgren M. et al. Extension of the Lancefield classification for group A streptococci by addition of 22 new M protein gene sequence types from clinical isolates: emml03 to emml24 // Clin. Infect. Dis. 2002. Vol. 34. № 1. P. 28-38.
  11. Ferretti J.J., McShan W.M., Ajdic D. et al. Complete genome sequence of an M1 strain of Streptococcus pyogenes 11 Proceeding of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2001. Vol. 98. № 8. P. 4658-4663.
  12. Green N.M., Beres S.B., Graviss E.A. et al. Genetic diversity among type emm28 group A Streptococcus strains causing invasive infections and pharyngitis // J. Clin. Microbiol. 2005. Vol. 43. № 8. P. 4083-4091.
  13. Holden M.T., Scott A., Cherevach I. et al. Complete genome of acute rheumatic fever-associated serotype M5 Streptococcus pyogenes strain manfredo 11 J. Bacterid. 2007. Vol. 189. № 4. P. 1473-1477.
  14. Holm S.E., Norrby A., Bergholm A.M. et al. Aspects of pathogenesis of serious group A streptococcal infections in Sweden 1988-1989//.1. Infect. Dis. 1992. Vol. 166. № 1. P.31-37.
  15. Ho P.L., Johnson D.R., Yue A.W.Y. et al. Epidemiologic analysis of invasive and noninvasive group A streptococcal isolates in Hong Kong // J. Clin. Microbiol. 2003. Vol. 41. № 3. P. 937-942.
  16. Jing H., Ning В., Hao H. et al. Epidemiological analysis of group A streptococci recovered from patients in China // Med. Microbiol. 2006. Vol. 55. № 8. P. 1101-1107.
  17. Kaul R.A., McGeer A., Low D.E. et al. Population- based surveillance for group A Streptococcal necrotizing fasciitis, clinical features, prognostic indicators, and microbiologic analysis of seventy-seven cases // Am. J. Med. 1997. Vol. 103. № 1. P. 18-24.
  18. Kiska D.L., Thiede B., Caracciolo J. et al. Invasive group A streptococcal infections in North Carolina: epidemiology, clinical features, and genetic and serotype analysis of causative organisms // J. Infect. Dis. 1997. Vol. 176. №4. P.992-1000.
  19. Matthews R.C. PCR fingerprinting microbes by random amplification of polymoiphic DNA // J. Med. Microbiol. 1993. Vol. 39. № 3. P. 161-162.
  20. Musser J.M. and Krause R.M. The revival of group A streptococcal diseases, with a commentary on staphylococcal toxic shock syndrome // Emerging Infections. 1998. P. 185-218.
  21. Nandi S., Ganguly N., Kumar R. et al. Genotyping of group A streptococcus by various molecular methods // Indian J. Med. Res. 2008. Vol. 127. № 1. P. 71-77.
  22. O’Brien K.L. et al. Epidemiology of invasive Group A Streptococcus disease in the United States, 1995-1999 I I Clin. Infect. Dis. 2002. Vol. 35. № 11. P. 268-276.
  23. Rogers S., Commons R., Danchin M. et al. Strain prevalence, rather than innate virulence potential, is the major factor responsible for an increase in serious group A streptococcus infections // J. Infect. Dis. 2007. Vol. 195. № 11. P. 1625-1633.
  24. Seppala H., He Q., Osterblad M. et al. Typing of group A streptococci by random amplified polymorphic DNA analysis // J. Clin. Microbiol. 1994. Vol. 32. № 8. P. 1945-1948.
  25. Sharkawy A. et al. Severe group A streptococcal soft tissue infections in Ontario: 1992-1996 // Clin. Infect. Dis. 2002. Vol. 34. № 4. P. 454-460.
  26. Smoot J.C., Barbian K.D., Van Gompel J.J. et al. Genome sequence and comparative microarray analysis of serotype Ml8 group A Streptococcus strains associated with acute rheumatic fever outbreaks // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. № 7. P. 4668-4673.
  27. Suvorov A., Polyakova E., McShan W. & Ferretti J. Bacteriophage content of M49 strains of Streptococcus pyogenes // FEMS microbiology letters. In press.
  28. Vlaminckx B.J., Schuren F.H., Montijn R.C. et al. Determination of the relationship between group A streptococcal genome content, M type, and toxic shock syndrome by a mixed genome microarray // Infect. Immunol. 2007. Vol. 75. № 5. P. 2603-2611.
  29. Wahl R.U., Ltitticken R., Stanzel S. et al. Epidemiology of invasive Streptococcus pyogenes infections in Germany, 1996-2002: results from a voluntary laboratory surveillance system // Clin. Microbiol. Infect. 2007. Vol. 13. № 12. P. 1173-1178.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2010 Polyakova E.M., Mnatsakanyan E.S., Burova L.A., Dmitriev A.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».