Gastrointestinal symptoms and RT-PCR in adults with COVID-19:а post-hoc analysis

Аннотация

Background: Reverse transcription polymerase chain reaction (RT‑PCR) using lower gastrointestinal (GI) specimens can detect SARS‑CoV‑2 RNA in patients with gastrointestinal symptoms. However, the association between cycle threshold (Ct) values from such specimens and the presence of GI manifestations remains unclear.
Materials and methods: An analytical cross‑sectional study was conducted using secondary, de‑identified hospital records from three Indonesian medical centers (July–November 2020). Adult patients with positive lower GI RT‑PCR results and available Ct values were included. Ct values were dichotomized as low (<25) or high (≥25). GI symptoms assessed included nausea, vomiting, abdominal pain, diarrhea, and constipation. The primary outcome was the association between Ct category and the presence of any GI symptom, analyzed using Fisher’s exact test. Results are presented as prevalence ratios (PRs) with 95% confidence intervals (CIs).
Results: A total of 37 patients met the inclusion criteria (43.2% male; mean age 44.8 ± 13.2 years). Only one patient (2.7%) exhibited a low Ct value, while 36 (97.3%) had high Ct values. Overall, 22 patients (59.5%) reported at least one GI symptom. The most frequently reported symptom was nausea (54.1%), followed by vomiting (18.9%), abdominal pain (16.2%), and diarrhea (13.5%); constipation was not observed. No significant association was found between Ct category and the presence of GI symptoms (p = 0.595; PR 1.048, 95% CI 0.956–1.148).
Conclusion: Among adults with SARS‑CoV‑2 detected via RT‑PCR from lower GI specimens, Ct value category was not significantly associated with GI symptom presence. These findings underscore the limited prognostic value of Ct values from lower GI sampling and emphasize the need for larger, prospectively designed studies with standardized protocols.

Список литературы

  1. Harapan BN, Harapan T, Theodora L, Anantama NA. From Archipelago to Pandemic Battleground: Unveiling Indonesia’s COVID-19 Crisis. J Epidemiol Glob Health. 2023;13(4):591-603.
  2. https://doi.org/10.1007/s44197-023-00148-7
  3. Goudouris ES. Laboratory diagnosis of COVID-19. J Pediatr (Rio J). 2021;97(1):7-12.
  4. https://doi.org/10.1016/j.jped.2020.08.001
  5. Abdullah M, Sudrajat DG, Muzellina VN, et al. The value of anal swab RT-PCR for COVID-19 diagnosis in adult Indonesian patients. BMJ Open Gastroenterol. 2021;8:e000590.
  6. https://doi.org/10.1136/bmjgast-2020-000590
  7. Wang Y, Chen X, Wang F, et al. Value of anal swabs for SARS-CoV-2 detection: a literature review. Int J Med Sci. 2021;18(11):2389-2393.
  8. https://doi.org/10.7150/ijms.59382
  9. Liu M, Li Q, Zhou J, et al. Value of swab types and collection time on SARS-CoV-2 detection using RT-PCR assay. J Virol Methods. 2020;286:113974.
  10. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2020.113974
  11. Li X, Rong L, Zhang P, Xu J, Rong Y. Significance of nucleic acid-positive anal swabs in COVID-19 patients. Open Med (Wars). 2021;16(1):332-337.
  12. Rabaan AA, Tirupathi R, Sule AA, et al. Viral dynamics and RT-PCR Ct values correlation with disease severity in COVID-19. Diagnostics (Basel). 2021;11(6):1091.
  13. https://doi.org/10.3390/diagnostics11061091
  14. Cheung KS, Hung IFN, Chan PPY, et al. Gastrointestinal Manifestations of SARSCoV-2 Infection and Virus Load in Fecal Samples From a Hong Kong Cohort: Systematic Review and Meta-analysis. Gastroenterology. 2020;159(1):81-95. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2020.03.065
  15. Park SK, Lee CW, Park DI, et al. Detection of SARS-CoV-2 in Fecal Samples From Patients With Asymptomatic and Mild COVID-19 in Korea. Clin Gastroenterol Hepatol. 2021;19(7):1387-1394.e2.
  16. https://doi.org/10.1016/j.cgh.2020.06.005
  17. Wolff D, Nee S, Hickey NS, Marschollek M. Risk factors for Covid-19 severity and fatality: a structured literature review. Infection. 2021;49(1):15-28.
  18. https://doi.org/10.1007/s15010-020-01509-1
  19. Taziki Balajelini MH, Rajabi A, Mohammadi M, et al. Virus load and incidence of olfactory, gustatory, respiratory, gastrointestinal disorders in COVID-19 patients: A retrospective cohort study. Clin Otolaryngol. 2021;46(6):1331-1338. https://doi.org/10.1111/coa.13844

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».