DIFFERENT PROTEIN GROUPS INVOLVED IN TRANSCRIPTION REGULATION IN GENES OF DEVELOPMENT AND HOUSEKEEPING IN  DROSOPHILA

I. F. Zhimulev; Жимулев И. Ф.; T. Yu. Vatolina; Ватолина Т. Ю.; G. V. Pokholkova; Похолкова Г. В.; O. V. Antonenko; Антоненко О. В.; M. V. Maltseva; Мальцева М. В.

doi:10.31857/S2686738923700348

В процессах регулирования транскрипции генов развития и домашнего хозяйства у дрозофилы участвуют различные группы белков

Авторы: Жимулев И.Ф.¹, Ватолина Т.Ю.¹, Похолкова Г.В.¹, Антоненко О.В.¹, Мальцева М.В.¹
Учреждения:
1. Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной и клеточной биологии Сибирского отделения Российской академии наук (ИМКБ СО РАН)
Выпуск: Том 512, № 1 (2023)
Страницы: 438-443
Раздел: Статьи
URL: https://bakhtiniada.ru/2686-7389/article/view/140842
DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738923700348
EDN: https://elibrary.ru/SRXVUU
ID: 140842

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Белки и модифицированные гистоны принимают участие в процессах инициации и элонгации транскрипции в геноме дрозофилы. По данным работы белок CHRIZ (инсулятор хроматина) и гистона H3K36me3 (элонгация РНК) выявляются в участках локализации генов домашнего хозяйства (междиски и серые диски политенных хромосом) и никогда – в районах генов развития (черные диски и в возникающие из них крупные пуфы). Модификация гистона H3S10P, который связывают с начальной элонгацией нити РНК в ходе транскрипции, выявляются исключительно в малых пуфах, но не в участках локализации генов домашнего хозяйства или крупных экдизон-индуцируемых пуфах, в которых локализованы гены развития. Модифицированный гистон H4R3me2 (ко-репрессор экдизонового рецептора) выявляются только в крупных экдизон-индуцируемых пуфах.

Ключевые слова

модификации гистонов Н3К36me3, H3S10P, H4R3me2, белок CHRIZ, гены домашнего хозяйства, гены развития, промоторы генов, политенные хромосомы, дрозофила

Список литературы

Lenhard B., Sandelin A., Carninci P. Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation // Nat. Rev. Genet. 2012. V. 13. № 4. P. 233–245.
Andersson R., Sandelin A. Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements // Nat. Rev. Genet. 2020. V. 21. P. 71–87.
Boros I.M. Histone modification in Drosophila // Briefings in Functional Genomics. 2012. V. 11. № 4. P. 319–331.
Lindehell H., Glotov A., Dorafshan E., et al. The role of H3K36 methylation and associated methyltransferases in chromosome-specific gene regulation // Sci. Adv. 2021. V. 7. № 40. eabh4390.
Zhimulev I.F., Zykova T.Yu., Goncharov F.P., et al. Genetic organization of polytene chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster // PLoS One. 2014. V. 9. № 7. P. e101631.
Bridges C.B. A revised map of the salivary gland X-chromosome of Drosophila melanogaster // J. Hered. 1938. V. 29. № 1. P. 11–13.
Kozlova T.Yu., Semeshin V.F., Tretyakova I.V., et al. Molecular and cytogenetical characterization of the 10A1-2 band and adjoining region in the Drosophila melanogaster polytene X chromosome // Genetics. 1994. V. 136. № 3. P. 1063–1073.
Zykova T.Yu., Levitsky V.G., Belyaeva E.S., et al. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome // Curr. Genomics. 2018. V.19. № 3. P. 179–191.
Ashburner M., Chihara C., Meltzer P., et al. Temporal control of puffing activity in polytene chromosomes // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1974. V. 38. P. 655–662.
Zhimulev I.F. Genetic organization of polytene chromosomes // Advances in Genetics. 1999. V. 39. P. 1–589.
Thummel C.S. Ecdysone-regulated puff genes 2000 // Insect Biochem. Mol. Biol. 2002 V. 32. № 2. P. 113–20.
King-Jones K., Thummel C. Nuclear receptors – a perspective from Drosophila // Nat. Rev. Genet. 2005. V. 6. № 4. P. 311–323.
FlyBase version FB2022_06, released Desember 13, 2022.
Pokholkova G.V., Demakov S.A., Andreenkov O.V., et al. Tethering of CHROMATOR and dCTCF proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes but does not affect their transcription and replication timing // Plos One. 2018. V. 13. № 4. P. e0192634.
Boldyreva L.V., Goncharov F.P., Demakova O.V., et al. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster Cell Lines // Curr. Genomics. 2017. V. 18. № 2. P. 214–226.
Sharda A., Humphrey T.C. The role of histone H3K36me3 writers, readers and erasers in maintaining genome stability // DNA Repair. 2022. № 119: 103407.
Kimura S., Sawatsubashi S., Ito S., et al. Drosophila arginine methyltransferase 1 (DART1) is an ecdysone receptor co-repressor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008. V. 371. № 4. P. 889–893.
Karam C.S., Kellner W.A., Takenaka N., et al. 14-3-3 mediates histone cross-talk during transcription elongation in Drosophila // PLoS Genetics. 2010. V. 6. № 6. P. e1000975.
Cai W., Bao X., Deng H., et al. RNA polymerase II-mediated transcription at active loci does not require histone H3S10 phosphorylation in Drosophila. Development. 2008. V. 135. № 17. P. 2917–2925.