INFLUENCE OF THE CULTIVATION CONDITIONS OF THE GLIOBLASTOMA NEUROSPHERE ON THE EXPRESSION OF MALAT1 AND LINCROR LONG NON-CODING RNA GENES

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

ABSTRACT Glioblastoma multiforme (GBM) is the most aggressive malignant brain tumor. One of the reasons for the resistance of MGB to treatment is the extreme heterogeneity of the tumor and, in particular, the presence of cancer stem cells (CSCs) in the population of glioblastoma cells. In this work, we investigated the effect of conditions that reduce the proportion of CSCs in the GBM cell population on the levels of long noncoding RNAs (lincROR and MALAT1) involved in the formation of the phenotype of glioblastoma cancer stem cells. We have shown that culturing under conditions that cause a decrease in cell stemness (when fetal calf serum is added to the culture medium) affected the content of these transcripts: in the cells of most of the analyzed lines, a decrease in the level of the positive stemness regulator lincROR and an increase in the content of MALAT1 were noted.

About the authors

D. V. Mazur

Institute of Bioorganic Chemistry named after M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov

Email: nadine.antipova@gmail.com
Russian Federation, Moscow

A. V. Mishanova

Institute of Bioorganic Chemistry named after M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov

Email: nadine.antipova@gmail.com
Russian Federation, Moscow

T. F. Kovalenko

Institute of Bioorganic Chemistry named after M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov

Email: nadine.antipova@gmail.com
Russian Federation, Moscow

M. I. Shakhparonov

Institute of Bioorganic Chemistry named after M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov

Email: nadine.antipova@gmail.com
Russian Federation, Moscow

N. V. Antipova

Institute of Bioorganic Chemistry named after M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov; Department of Biology and Biotechnology, Higher School of Economics

Author for correspondence.
Email: nadine.antipova@gmail.com
Russian Federation, Moscow; Russian Federation, Moscow

References

  1. Louis D.N., Perry A., Wesseling P. et al. // The 2021 WHO Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary. Neuro Oncol. 2021. V. 23. P. 1231–1251.
  2. Simon J.M., Toubiana T., Lang P. et al. // Radiotherapy for glioblastomas: from radiobiology to concomitant chemotherapy. Cancer Radiother. 2005. V. 9. P. 322–331.
  3. Bradshaw A., Wickremsekera A., Tan S.T. et al. // Cancer Stem Cell Hierarchy in Glioblastoma Multiforme. Front. Surg. 2016. V. 3. P. 21.
  4. Rao M.R.S. // Long non-coding RNA biology. Singapore: Springer Nature. 2017. 323 p.
  5. Loewer S., Cabili M.N., Guttman M., et al. // Large intergenic non-coding RNA-RoR modulates reprogramming of human induced pluripotent stem cells. Nat. Genet. 2010. V. 42. P. 1113–1117.
  6. Chen W., Yang J., Fang H. et al. // Relevance Function of Linc-ROR in the Pathogenesis of Cancer. Front. Cell. Dev. Biol. 2020. V. 8. P. 696.
  7. Kovalenko T.F., Yadav B., Anufrieva K.S. et al. // Functions of long non-coding RNA ROR in patient-derived glioblastoma cells. Biochimie. 2022. V. 200. P. 131–139.
  8. Li Z. // CD133: a stem cell biomarker and beyond. Exp. Hematol. Oncol. 2013. V. 2. P. 17.
  9. Ma R., Zhang B.W., Zhang Z.B. et al. // LncRNA MALAT1 knockdown inhibits cell migration and invasion by suppressing autophagy through miR-384/GOLM1 axis in glioma. Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci. 2020. V. 24. P. 2601–2615.
  10. Latorre E., Carelli S., Raimondi I. et al. // The Ribonucleic Complex HuR-MALAT1 Represses CD133 Expression and Suppresses Epithelial-Mesenchymal Transition in Breast Cancer. Cancer Res. 2016. V. 76. P. 2626–2636.
  11. Larionova T.D., Bastola S., Aksinina T.E. et al. // Alternative RNA splicing modulates ribosomal composition and determines the spatial phenotype of glioblastoma cells // Nat Cell Biol. 2022. V. 24. P. 1541–1557.
  12. Lee J., Kotliarova S., Kotliarov Y. et al. // Tumor stem cells derived from glioblastomas cultured in bFGF and EGF more closely mirror the phenotype and genotype of primary tumors than do serum-cultured cell lines. Cancer Cell. 2006. P. 391–403.
  13. Brewer G.J., Torricelli J.R., Evege E.K. et al. // Optimized survival of hippocampal neurons in B27-supplemented neurobasal, a new serum-free medium combination. Journal of Neuroscience Research. 1993. P. 567–576.
  14. Minata M., Audia A., Shi J. et al. // Phenotypic Plasticity of Invasive Edge Glioma Stem-like Cells in Response to Ionizing Radiation. Cell Rep. 2019. V. 26. P. 1893–1905.
  15. Freedman L.P., Gibson M.C., Ethier S.P. et al. // Reproducibility: changing the policies and culture of cell line authentication. Nat Methods. 2015. V. 12. P. 493–497.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2.

Download (2MB)
3.

Download (229KB)

Copyright (c) 2023 Д.В. Мазур, А.В. Мишанова, Т.Ф. Коваленко, М.И. Шахпаронов, Н.В. Антипова

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».