Representatives of Diplomonadida in fishes of East Siberia

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

In this study, we analyze the diversity of flagellated protozoa Diplomonadida, which are parasites in the digestive system of animals, in fishes of East Siberia. We have developed a method to diagnose the presence of DNA of Diplomonadida representatives, in particular, of Spironucleus barkhanus, in the analyzed samples. In our previous studies, we used molecular genetic methods to analyze salmonids of East Siberia for the presence of diplomonads and to determine the infection. The analysis of genetic diversity of diplomonads in the fishes of the genera Coregonus and Thymallus revealed the presence of one species, S. barkhanus. However, in addition to a cosmopolitan genotype widespread among Holarctic salmonids, in C. migratorius and C. lavaretus baicalensis, we have found a new genotype obviously different from those registered previously. Probably, S. barkhanus of this genotype is endemic for Lake Baikal. To determine a probable parasite exchange between C. migratorius and other fish species in the pelagic zone of Lake Baikal, we performed a screening of near-shore pelagic and pelagic cottoid fish for the presence of S. barkhanus. The analysis did not indicate the presence of DNA of S. barkhanus in the studied samples. We suppose the presence of other diplomonads species in endemic cottoid fish different from S. barkhanus.

About the authors

N. N. Denikina

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: kondratovig@mail.ru
Russian Federation, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

I. A. Nebesnykh

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: kondratovig@mail.ru
Russian Federation, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

I. G. Kondratov

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Author for correspondence.
Email: kondratovig@mail.ru
Russian Federation, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

I. V. Khanaev

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: kondratovig@mail.ru
Russian Federation, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

E. V. Dzyuba

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: kondratovig@mail.ru
Russian Federation, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

References

  1. Belkova N.L., Dzyuba E.V., Sukhanova E.V. 2008. Molecular-genetic detection of a nonpathogenic genotype of Spironucleus barkhanus (Diplomonadida: Hexamitidae) in the black Baikal grayling (Thymallus arcticus baicalensis Dybowski, 1874). Biology Bullutin 35: 219–221. doi: 10.1134/S1062359008020179
  2. Belkova N.L., Dzyuba E.V., Sukhanova E.V. 2009. Molecular-genetic identification of the intestinal microflora and protozoa of the baikalian fish. In: Timoshkin O.A. (Ed.), Index of animal species inhabiting Lake Baikal and its catchment area. Vol. 2. Novosibirsk: Nauka. (In Russian)
  3. Denikina N.N., Nebesnykh I.A., Sukhanova E.V. et al. 2011. Development and approbation of detection method of the Diplomonadida order for the fish infection research. Biologicheskiye nauki Kazakhstana [Biological sciences of Kazakhstan] 4: 28–33. (in Russian)
  4. Denikina N., Nebesnykh I., Maikova O. et al. 2016. Genetic diversity of Diplomonadida in fish of the genus Coregonus from East Siberia. Acta Parasitologica 61: 299–306. doi: 10.1515/ap-2016-0040.
  5. Denikina N.N., Nebesnykh I.A., Belkova N.L. et al. 2017. The genetic diversity of the Diplomonadida and the infection of the genera Coregonus and Thymallus of Eastern Siberia. Map № 144.4. In: Plusnin V.M. (Ed.), Ecological atlas of the Baikal region. [http://atlas.isc.irk.ru] (In Russian)
  6. Jerlstrom-Hultqvist J., Einarsson E., Xu F. et al. 2013. Hydrogenosomes in the diplomonad Spironucleus salmonicida. Nature communications 4: 2493. doi: 10.1038/ncomms3493 |www.nature.com/naturecommunications
  7. Jørgensen A., Sterud E. 2006. The marine pathogenic genotype of Spironucleus barkhanus from farmed salmonids redescribed as Spironucleus salmonicida n. sp. Journal of Eukaryotic Microbiology 53: 531–541. doi: 10.1111/j.1550-7408.2006.00144.x
  8. Keeling P.J., Doolittle W.F. 1997. Widespread and ancient distribution of a noncanonical genetic code in Diplomonads. Molecular Biology and Evolution 14: 895–901. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025832
  9. Kent M.L., Ellis J., Fournie J.W. et al. 1992. Systemic hexamitid infection in seawater pen-reared chinook salmon. Diseases of Aquatic Organisms 14: 81–89. doi: 10.3354/dao014081
  10. Kolisko M., Cepicka I., Hampl V. et al. 2008. Molecular phylogeny of diplomonads and enteromonads based on SSU rRNA, alpha- tubulin and HSP90 genes: Implications for the evolutionary history of the double karyomastigont of diplomonads. BMC Evolutionary Biology 8: 205. doi: 10.1186/1471-2148-8-205
  11. Koryakov E.A. 1972. Pelagic sculpins of Baikal. Moscow: Nauka. (In Russian)
  12. Noga E.J. 2010. Fish disease- diagnosis and treatment. 2nd edition. Wiley-Blackwell.
  13. Poppe T., Mo T.A. 1993. Systemic, granulomatous hexamitosis of farmed Atlantic salmon: interactions with wild fish. Fisheries Research 17: 147–152. DOI: doi.org/10.1016/0165-7836(93)90014-X
  14. Pronin N.M. 2001. Polymastigotes (Mastigophora: Polymastigota). In: Timoshkin O.A. (Ed.), Index of animal species inhabiting Lake Baikal and its catchment area. Vol. 1. Novosibirsk: Nauka. (In Russian)
  15. Pugachev O.N. 2001. Catalog of parasites in freshwater fish of Northern Asia. Protozoa. Saint Petersburg: ZIN RAS. (In Russian)
  16. Rusinek O.T. 2007. Fish parasites of Lake Baikal (fauna, communities, zoogeography and historical background). Moscow: KMK Scientific Press Ltd. (In Russian)
  17. Sterud E., Mo T.A., Poppe T.T. 1998. Systemic spironucleosis in sea-farmed Atlantic salmon Salmo salar, caused by Spironucleus barkhanus transmitted from feral Arctic char Salvelinus alpinus? Diseases of Aquatic Organisms 33: 63–66. doi: 10.3354/dao033063
  18. Taliev D.N. 1955. Baicalian sculpins (Cottoidei). Moscow-Leningrad: Publishing House of the USSR Academy of Sciences. (In Russian)
  19. Williams C., Lloyd D., Poynton S. et al. 2011. Spironucleus species: economically-important fish pathogens and enigmatic single-celled Eukaryotes. Journal of Aquaculture Research and Development S2-13. DOI: dx.doi.org/10.4172/2155-9546.
  20. Zaika V.E. 1965. Parasitofauna of Lake Baikal fishes. Moscow: Nauka. (In Russian)

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Denikina N.N., Nebesnykh I.A., Kondratov I.G., Khanaev I.V., Dzyuba E.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».