Неподелённая электронная пара сурьмы как стереоэлектронный барьер на пути к стибатрану

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

С целью исследования влияния неподелённой электронной пары 5s2 атома сурьмы на результат реакции трифторида сурьмы с триэтаноламином в присутствии метилата натрия уточнена кристаллическая структура продукта реакции - 2-фтор-6-(2’-гидрооксиэтил)-1,3-Диокса-6-аза-2-стибациклооктана (1-фтор-2-гидростибатрана) FSb(OCH2CH2)2NCH2CH2OH. В структуре данного соединения атом водорода 2-гидроксиэтильной группы каждой молекулы образует межмолекулярную водородную связь с кислородным атомом одного из пятичленных полуциклов SbOCH2CH2N соседней молекулы. Геометрия обоих пятичленных гетероциклов N-C-C-O-Sb, замкнутых трансаннулярной связью N→Sb в молекуле 1 -фтор-2-гидростибатрана, практически одинакова. Межатомные расстояния С-O, C-C, N-C и валентные углы в двух эндоциклических фрагментах (NCCOSb) соизмеримы с наблюдаемыми в силатранах RSi(OCH2CH2)3N. Координационный полиэдр атома Sb может быть представлен как переходный от бисфеноида до тригональной пирамиды Sb(O3)N с атомом азота в вершине и тремя атомами кислорода в основании. Длина трансаннулярной координационной связи N→Sb равна 2,402(4) Å, что на 0,40 Å больше стандартной длины ковалентной связи Sb-N. Связь Sb-F (1,997(4) А) на 0,12 Å длиннее, чем в молекуле SbF3, и незначительно короче значения Sb-Fax (2,028(3) Å) в кристаллическом комплексе SbF3-Gly. Атом фтора существенно отклонен от оси N→Sb в сторону атомов О(1) и О(2). Атом кислорода 2-гидроксиэтильной группы отстоит от атома Sb на расстоянии 2,899(3) Å, промежуточном между длиной валентной связи и суммой ван-дер-ваальсовых радиусов этих атомов. Вкупе с положением атома F это позволяет предположить кристаллическую структуру 1-фтор-2-гидростибатрана как «замороженное» состояние нуклеофильной атаки атома кислорода типа SNi (Sb), незавершенной вследствие его отталкивания неподелённой электронной парой 5s2 атома сурьмы.

Об авторах

В. П. Барышок

Иркутский национальный исследовательский технический университет

Email: baryvik@yandex.ru

Э. А. Зельбст

Педагогический институт Иркутского государственного университета

Email: zelbst@rambler.ru

Список литературы

  1. Voit E.I., Udovenko A.A., Kovaleva E.V., Makarenko N.V., Zemnukhova L.A., Beleneva I.A. Structure and properties of the molecular complex of antimony(III) fluoride with Y-glycine // Journal of Structural Chemistry. 2019. Vol. 60. Issue 4. P. 630-639. https://doi.org/10.1134/S0022476619040140
  2. Ковалева Е.В., Макаренко Н.В., Удовенко А.А., Земнухова Л.А. Синтез, строение и свойства фторидных комплексных соединений сурьмы(111) с аминокислотами // Вестник Дальневосточного отделения Российской академии наук.2019. N 6 (208). С. 5-22. https://doi.org/10.25808/08697698.2019.208.6.001
  3. Udovenko A.A., Makarenko N.V., Kovaleva E.V., Zemnukhova L.A. Crystal structure of DL-valinium tetrafluoroantimonate(III) monohydrate // Journal of Structural Chemistry. 2018. Vol. 59. Issue 7. P. 1653-1657. https://doi.org/10.1134/S0022476618070181
  4. Udovenko A.A., Makarenko N.V., Kovaleva E.V., Zemnukhova L.A. Crystal structure of DL-serinium heptafluorodiantimonate(III) // Journal of Structural Chemistry. 2018. Vol. 59. Issue 6. P. 1421-1426. https://doi.org/10.1134/S0022476618060240
  5. Benjamin S.L., Burt J., Levason W., Reid G., Webster M. Synthesis and structures of antimony trifluoride complexes with N-heterocyclic ligands // Journal of Fluorine Chemistry. 2012. Vol. 135. P. 108-113. https://doi.org/10.1016/j.jfluchem.2011.09.007
  6. Udovenko A.A., Makarenko N.V., Davidovich R.L., Zemnukhova L.A., Kovaleva E.V. Crystal structure of the molecular adduct of antimony(III) fluoride with L-phenylalanine // Journal of Structural Chemistry. 2011. Vol. 52. Issue 3. P. 616-620. https://doi.org/10.1134/S0022476611030243
  7. Khan M., Gul S., Hussain I., Khan M.A., Ashfaq M., Inayat-Ur-Rahman, et al. In vitro anti-leishmanial and anti-fungal effects of new Sb(III) carboxylates // Organic and Medicinal Chemistry Letters. 2011. Vol. 1. Issue 2. 7 p. https://doi.org/10.1186/2191-2858-1-2
  8. Udovenko A.A., Davidovich R.L., Zemnu-khova L.A., Kovaleva E.V., Makarenko N.V. Crystal structure of DL-serinium tetrafluoroantimonate(III) // Journal of Structural Chemistry. 2010. Vol. 51. Issue 3. P. 540-544. https://doi.org/10.1007/s10947-010-0078-z
  9. Udovenko A.A., Makarenko N.V., Davidovich R.L., Zemnikhova L.A., Kovaleva E.V. Crystal structure of L-leucinium tetrafluoroantimonate(III) // Journal of Structural Chemistry. 2010. Vol. 51. Issue 5. P. 904-908. https://doi.org/10.1007/s10947-010-0137-5
  10. Voronkov M.G., Pestunovich V.A., Alba-nov A.I., Kuznetsova G.A., Selbst E.A., Baryshok V.P. 1-Fluoro-2-hydrostibatrane // Journal of Structural Chemistry. 2006. Vol. 47. Issue 3. P. 527-531. https://doi.org/10.1007/s10947-006-0332-6
  11. Zemnukhova L.A., Davidovich R.L., Udovenko A.A., Kovaleva E.V. Sb(III) fluoride complexes with DL-valine. Crystal structure of molecular complex SbF3{(Ch3)2ChCh(+Nh3)COO-} // Russian Journal of Coordination Chemistry. 2005. Vol. 31. Issue 2. P. 115-120. https://doi.org/10.1007/S11173-005-0040-3
  12. Tanski J.M., Kelly B.V., Parkin G. Multidentate aryloxide and oxo-aryloxide complexes of antimony: synthesis and structural characterization ofSb(OSMe2), {{Sb}2(p2-O)}2 and {Sb}4 (p3-O)2 // Dalton Transactions. 2005. Issue 14. P. 24422447. https://doi.org/10.1039/b505308k
  13. Udovenko A.A., Zemnukhova L.A., Kovaleva E.V., Davidovich R.L. Crystal structure of monohydrate and anhydrous в-alaninium tetrafluoroanti-monates(III) // Russian Journal of Coordination Chemistry. 2005. Vol. 31. Issue 4. P. 225-229. https://doi.org/10.1007/s11173-005-0081-7
  14. Voronkov M.G., Pestunovich V.A., Zelbst E.A., Kashaev A.A., Fundamenskiy V.S., Albanov A.I., et al. The puzzle of stibatrane: (O >Sb< N)-2-Fluoro-6-(2''-hydroxyethyl)-1,3-dioxa-6-aza-2-stibacyclooctane // Doklady Chemistry. 2001. Vol. 381. Issue 4-6. P. 344346. https://doi.org/10.1023/A:1013316824768
  15. Singh A.K., Amburosea C.V., Jha N.K., Sharma P., Cabrera A., Espinosa-Perz G.: synthesis and crystal structure // Journal of Chemical Research. 2000. Issue 4. P. 198-199. https://doi.org/10.3184/030823400103166959
  16. Zemnukhova L.A., Davidovich R.L. 121,123Sb NQR study of antimony(III) fluoride complexes // Russian Chemical Bulletin. 1998. Vol. 47. Issue 11. P. 2164-2168. https://doi.org/10.1007/BF02494273
  17. Battaglia L.P., Corradi A.B., Pelosi G., Cantoni A., Alonzo G., Bertazzi N. Crystal and molecular structure of antimony trifluoride-terpyridine 1:1 adduct: a case of pseudo-pentagonal-bipyramidal geometry // Journal of the Chemical Society, Dalton Transactions. 1991. Vol. 11. P. 3153-3155. https://doi.org/10.1039/DT9910003153
  18. Abboud K.A., Palenik R.C., Palenik G.J., Wood R.M. Syntheses and structures of four antimony complexes with planar tridentate pyridine ligands // Inorganica Chimica Acta. 2007. Vol. 360. Issue 11. P. 3642-3646. https://doi.org/10.1016/j.ica.2007.05.007
  19. Voronkov M.G., Baryshok V.P. Metallatranes // Journal of Organometallic Chemistry. 1982. Vol. 239. Issue 1. P. 199-249.
  20. Bradiey D.C., Gaur D.P., Mehrotra R.C. Metal Alkosides. London: Academic Press, 1978. 411 p.
  21. Muller R. The splitting of the 1-organyl-silatranes by metal fluorides // Organometallic Chemistry Reviews. 1966. Vol. 1. P. 359.
  22. Das R., Pani S. Trichloromonopyridineantimony complex // Journal of the Indian Chemical Society. 1954. Vol. 33. P. 538.
  23. Keogan D.M., Oliveira S.S.C., Sangenito L.S., Branquinha M.H., Jagoo R.D., Twamley B., et al. Novel antimony(III) hydroxamic acid complexes as potential anti-leishmanial agents // Dalton Transactions. 2018. Vol. 47. Issue 21. P. 72457255. https://doi.org/10.1039/C8DT00546j
  24. Urgut O.S., Ozturk I.I., Banti C.N., Kourkoumelis N., Manol M., Tasiopoulos A.J., et al. New antimony(III) halide complexes with dithiocarbamate ligands derived from thiuram degradation: The effect of the molecule's close contacts on in vitro cytotoxic activity // Materials Science and Engineering: C. 2016. Vol. 58. P. 396-408. https://doi.org/10.1016/j.msec.2015.08.030
  25. Hadjikakou S.K., Ozturk I.I., Banti C.N., Kourkoumelis N., Hadjiliadis N. Recent advances on antimony(III/V) compounds with potential activity against tumor cells // Journal of Inorganic Biochemistry. 2015. Vol. 153. P. 293-305. https://doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2015.06.006
  26. Ozturk I.I., Urgut O., Banti C.N., Kourkoumelis N., Owczarzak A.M., Kubicki M., et al. Synthesis, structural characterization and cytostatic properties of N,N-dicyclohexyldithiooxamide complexes of antimony(III) halides (SbX3, X: Br or I) // Polyhedron. 2014. Vol. 70. P. 172-179. https://doi.org/10.1016/j.poly.2013.12.025
  27. Tiekink Е.Р.Т. Anticancer activity of molecular compounds of arsenic, antimony and bismuth. In: Biological chemistry of arsenic, antimony and bismuth. Ed. Sun. H. Chichester. UK: John Willey & Sons Ltd, 2011, pp. 293-310. https://doi.org/10.1002/9780470975503.ch12
  28. Ковалева Е.В., Земнухова Л.А. Экотокси-кологические свойства комплексных фторидных соединений сурьмы(Ш) // Вестник Томского государственного университета. Химия. 2019. N 13. C. 28-41. https://doi.org/10.17223/24135542/13/4
  29. Adeyemi J.O., Onwudiwe D.C. Chemistry and Some Biological Potential of Bismuth and Antimony Dithiocarbamate Complexes // Molecules. 2020. Vol. 25. Issue 2. P. 305-326. https://doi.org/10.3390/molecules25020305
  30. Pestunovich V.K., Kirpichenko S.V., Voronkov M.G. Silatranes and their tricyclic analogs. In: Saul P., Rappoport Z., Apeloig Y. (eds.) Chemistry of organic silicon compounds. Vol 2. Part 2. Chichester: Wiley, 1998, pp 1447-1537.
  31. Sterkhova I.V., Smirnov V.I., Kuznetsova G.A., Zel'bst E.A. Crystal and molecular structure of 1-(iodmethyl)- and 1-(iodpropyl)silatranes // Journal of Structural Chemistry. 2016. Vol. 57. Issue 1. P. 209212. https://doi.org/10.1134/S0022476616010285
  32. Харгиттаи М., Харгиттаи И. Геометрия молекул координационных соединений в парообразной фазе / пер. с англ. В.П. Спиридонова. М.: Мир, 1976. 248 c.
  33. Pauling L. The nature of the chemical bond. Ithaca: Cornell University Press, 1960. 644 p.
  34. Бацанов С.С. Атомные радиусы элементов // Журнал неорганической химии. 1991. Т. 36. N 12. С. 3015-3037.
  35. Воронов В.К., Дударева О.В., Фунтикова Е.А. Исследования комплексов ZnCl2 и CdCl2 с триэтаноламином методами спектроскопии ЯМР и квантовой химии // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. 2020. Т. 10. N 4. С. 548555. https://doi.org/10.21285/2227-2925-2020-10-4-548-555
  36. Kupce E., Liepins E., Lukevics E. The conflict between the conformational properties of the eight-membered heterocycle and trigonal bipyramid of fire-coordinated silicon in 1,3-dioxa-6-aza-2-silacycleoctanes // Journal of Organometallic Chemistry. 1983. Vol. 248. Issue 2. P. 131-147. https://doi.org/10.1016/0022-328X(83)85020-7

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».