Prediction of the biological activity of a compound depending on its NH-acidity

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Abstract: Acetamides are building blocks for the synthesis of compounds containing pharmacophores in their structure, manifesting a diverse range of biological activity. The drugs based on these substances possess antidiabetic effect and inhibit blood coagulation. Some of them act as chemosensitizers (i.e., cancer cell inhibitors). However, the full potential of these compounds remains to be fully accomplished. In a previous study, we synthesised acetamides with the RCONHCH (R´) CCl3 general formula (where R = CH3, CH2Cl; R´ = C6H5, C6H4CH3, C6H4OCH3, C6H4OH) and studied their acid-base behaviour. The NH-acidity of the studied acetamides is controlled by the polar effects of substituents. In this paper, the potential biological activity of the previously obtained acetamides is calculated, and the dependence of their biological potential on the NH-acidity values is elucidated. Prediction of biological activity was carried out using the PASS software. An analysis of the types of biological activity occurring in all compounds allowed us to determine a linear dependence between the probability of biological potential and the value of dissociation constant.

About the authors

G. B. Nedvetskaya

Irkutsk State University

Email: galinanedvetskaya@gmail.com

Yu. A. Aizina

Irkutsk National Research Technical University; A.E. Favorsky Irkutsk Institute of Chemistry SB RAS

Email: aizina@ex.estu.edu

References

  1. Wilkinson BL, Innocenti A, Vullo C, Supuran CT, Poulsen S-A. Inhibition of carbonic anhydrases with glycosyltriazole benzene sulfonamides. Journal of Medicinal Chemistry. 2008;51(6):1945–1953. https://doi.org/10.1021/jm701426t
  2. Moeker J, Mahon BP, Bornaghi LF, Vullo D, Supuran CT, McKenna R, et al. Structural insights into carbonic anhydrase IX isoform specificity of carbohydrate-based sulfamates. Journal of Medicinal Chemistry. 2014;57(20):8635–8645. https://doi.org/10.1021/jm5012935
  3. Lichtenstein DR, Wolfe MM. COX-2 selective NSAIDs: new and improved? Journal of the American Medical Association. 2000;284(10):1297–1299. https://doi.org/10.1001/jama.284.10.1297
  4. Bunyatyan ND, Kovalenko SN, Severina HI, Mokhamad EKW, Zalevskyi SV, Shtrygol’ SY, et al. Synthesis and anticonvulsant activity of new 2-(4-oxo-2-thioxo-1,4-dihydro-3(2h)-quinazolinyl)acetamides. Pharmaceutical Chemistry Journal. 2020;54(1). 6 p. https://doi.org/10.1007/s11094-020-02147-5
  5. Shadyro OI, Sorokin VL, Ksendzova GA, Savinova OV, Samovich SN, Boreko EI. Comparative evaluation of the antiherpes activity of compounds with different mechanisms of action. Pharmaceutical Chemistry Journal. 2019;53(7):646–649. https://doi.org/10.1007/s11094-019-02055-3
  6. Mikhailovskii AG, Pogorelova ES, Pershina NN, Makhmudov RR, Novikova VV. Synthesis, analgetical, antihypoxic and antimicrobial activity for (z)-2-(2-arylhydrazono)-2-(3,3-dimethyl-3,4-dihydroisoquinoline-1-yl)acetamides. Khimiko-farmatsevticheskii zhurnal. 2019;53(11):25–29. (In Russian) https://doi.org/10.30906/0023-1134-2019-53-11-25-29
  7. Kostina M.N. Food scent as the safety method against flies in the buildings. Dezinfektsionnoe Delo = Disinfection Affairs. 2015;94(4):52–60. (In Russian)
  8. Plotnikova AS, Nedvetskaya GB, Aizinа YuA. NН-acidity of substituted trichlorethyl acetamides in dimethyl sulfoxide. Izvestiya Vuzov. Prikladnaya Khimiya i Biotekhnologiya = Proceedings of Universities. Applied Chemistry and Biotechnology. 2018;9(1):36–43. (In Russian) https://doi.org/10.21285/2227- 2925-2019-9-1-36-43
  9. Aizina JA, Rozentsveig IB, Levkovskaya GG. A novel synthesis of chloroacetamide derivatives via C-amidoalkylation of aromatics by 2-chloro-N-(2,2,2-trichloro-1-hydroxyethyl)acetamide. Arkivoc Arkat USA. 2011;8:192–199. https://doi.org/10.3998/ark.5550190.0012.815
  10. Sergeev PV, Shimanovskii NL, Petrov VI. Receptors of physiologically active substances. Moscow; Volgograd: Sem' vetrov; 1999. 640 p. (In Russian)
  11. Durnev AD, Seredenin SB. Mutagens. Screening and famacological prevention of exposures. Moscow: Meditsina; 1998. 328 p. (In Russian)
  12. Aizina YuA. Use of modern information technologies for revealing biological potency of organic compounds. Vestnik Irkutskogo gosudarstvennogo tekhnicheskogo universiteta = Proceedings of Irkutsk State Technical University. 2012;4:145–149. (In Russian)
  13. Aizina YuA, Nikitin AYa, Levkovskaya GG. PASS method calculated and experimental assessment of biological activity of sulfonamide polychlorinated ethylated arenes and hetarenes. Vestnik Irkutskogo gosudarstvennogo tehnicheskogo universiteta = Proceedings of Irkutsk State Technical University. 2014;12:188–191. (In Russian)
  14. Bykova LN. Semi-neutralization potential as a chemical-analytical characteristic of electrolytes in potentiometric titration. Zhurnal analiticheskoi khimii = Journal of Analytical Chemistry (USSR). 1969;24 (12):1781 – 1789. (In Russian)
  15. Kreshkov AP, Aldarova NSh, Tanganov BB. Chemical-analytical behavior of sulfur-containing aliphatic dicarboxylic acids in non-aqueous solvents. Zhurnal analiticheskoi khimii = Journal of Analytical Chemistry (USSR). 1970;25(2):362–368. (In Russian)
  16. Fialkov YuYa, Zhitomirskii AN, Tarasenko YuA. Physical chemistry of non-aqueous solutions. Leningrad: Khimiya; 1973. 376 p. (In Russian)
  17. Fialkov YuYa. Not only in the water. Leningrad: Khimiya; 1989. 88 p. (In Russian)
  18. Krestov GA, Novoselov NP, Perelygin IS, Kolker AM, Safonova LP, Ovchinnikova VD et al. Ionic Solvation. Moscow: Nauka; 1987. 320 p. (In Russian)
  19. Kloоs ОV, Nedvedskaya GB, Aizina YА, Rozentsveig IB. Sulfonamides and their acidic properties in dimethylsulfoxide. Izvestiya Vuzov. Prikladnaya Khimiya i Biotekhnologiya = Proceedings of Universities. Applied Chemistry and Biotechnology. 2016;6(2):23–29. (In Russian) https://doi.org/10.21285/2227-2925-2016-6-2-23-29

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».