Журнал основан в 2002 году. В период с 2002 по 2010 годы выходил как электронное издание, с 2011 года журнал «Вестник Смоленской государственной медицинской академии» зарегистрирован в качестве печатного СМИ.  С 2015 года журнал входит в Перечень ведущих российских рецензируемых научных журналов и изданий, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки Российской Федерации для опубликования основных научных результатов диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук. С 2010 года журнал включен в Российский индекс научного цитирования (РИНЦ).