Распространенность и чувствительность к антибиотикам термотолерантных Campylobacter spp., выделенных от людей и птиц в Республике Гвинея

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Проблема диарейных заболеваний остается актуальной для современного здравоохранения всех стран. Кампилобактериоз является наиболее распространенным инфекционным заболеванием, передающимся через пищевые продукты, а мясо птицы — общепризнанный фактор передачи. Цель исследования: оценка распространенности термотолерантных Campylobacter spp. в Гвинейской Республике у пациентов с диарейным синдромом и кур при различных типах содержания. Материалы и методы. Изучено 724 пробы испражнений пациентов с диарейным синдромом и 283 пробы помета кур, содержащихся в личных хозяйствах и птицефермах. Для бактериологического метода использовали селективные питательные среды. Идентификацию штаммов Campylobacter spp. проводили традиционными рутинными тестами (морфология клеток, оксидазный и каталазный тесты, гидролиз гиппурата натрия и индоксилацетата) и методом MALDI-ToF масс-спектрометрией. Чувствительность штаммов к антибиотикам определяли диско-диффузионным методом. Результаты интерпретировали в соответствии с критериями EUCAST версий 2019–2022 гг. Результаты. Campylobacter spp. был выявлен в 65 из 724 пробах испражнений пациентов с острой диареей, из них 83,08% были идентифицированы как C. jejuni и 16,92% — как C. coli. Из 237 штаммов Campylobacter spp., выделенных из помета кур были идентифицированы C. jejuni 54,0% и C. coli 46,0%. Кампилобактерии, выделенные от людей были устойчивы к тетрациклину 40,0%, к эритромицину 6,15%, к ципрофлоксацину 12,31%. Штаммы, выделенные от промышленной птицы, были устойчивы к тетрациклину 42,55%, к ципрофлоксацину 22,70% и эритромицину 11,35%. Штаммы, выделенные от домашних кур, характеризовались резистентностью к тетрациклину — 4,17%, к ципрофлоксацину — 1,04%, все штаммы были чувствительны к эритромицину. Выводы. В связи с широкой распространенностью Campylobacter spp., вызываемые ими инфекционные заболевания остаются актуальной проблемой. Изучение устойчивости к антибиотикам Campylobacter spp. среди домашней птицы может позволить разработать новые подходы к подтверждению значимости их как фактора передачи и усовершенствовать национальную систему профилактики кампилобактериоза.

Об авторах

Р. Балдэ

Институт прикладной биологии

Email: makmaria@mail.ru

научный сотрудник отдела бактериологии

Гвинея, г. Киндия

З. Н. Матвеева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: makmaria@mail.ru

к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Л. А. Кафтырева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; ФБГБОУ ВО Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова

Email: makmaria@mail.ru

д.м.н., ведущий научный сотрудник группы эпидемиологии брюшного тифа; профессор кафедры медицинской микробиологии

Россия, Санкт-Петербург; Санкт-Петербург

Мария Александровна Макарова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; ФБГБОУ ВО Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова

Автор, ответственный за переписку.
Email: makmaria@mail.ru

д.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций; доцент кафедры медицинской микробиологии

Россия, Санкт-Петербург; Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Bian X., Garber J.M., Cooper K.K., Huynh S., Jones J., Mills M.K., Rafala D., Nasrin D., Kotloff K.L., Parker C.T., Tennant S.M., Miller W.G., Szymanski C.M. Campylobacter Abundance in Breastfed Infants and Identification of a New Species in the Global Enterics Multicenter Study. mSphere, 2020, vol. 5, no. 1: e00735-19. doi: 10.1128/mSphere.00735-19
  2. Buss J.E., Cresse M., Doyle S., Buchan B.W., Craft D.W., Young S. Campylobacter culture fails to correctly detect Campylobacter in 30% of positive patient stool specimens compared to non-cultural methods. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2019, vol. 38, no. 6, pp. 1087–1093. doi: 10.1007/s10096-019-03499-x
  3. Centers for Disease Control and Prevention. Guillain-Barré Syndrome. 2022. URL: https://cdc.gov/campylobacter/guillain-barre.html
  4. Chlebicz A., Śliżewska K. Campylobacteriosis, Salmonellosis, Yersiniosis, and Listeriosis as Zoonotic Foodborne Diseases: A Review. Int. J. Environ. Res. Public. Health, 2018, vol. 15, no. 5: 863. doi: 10.3390/ijerph15050863
  5. Costa D., Iraola G. Pathogenomics of Emerging Campylobacter Species. Clin. Microbiol. Rev., 2019, vol. 32, no. 4: e00072-18. doi: 10.1128/CMR.00072-18
  6. Dai L., Sahin O., Grover M., Zhang Q. New and alternative strategies for the prevention, control, and treatment of antibiotic-resistant Campylobacter. Transl. Res., 2020, vol. 223, pp. 76–88. doi: 10.1016/j.trsl.2020.04.009
  7. Dunn S.J., Pascoe B., Turton J., Fleming V., Diggle M., Sheppard S.K., McNally A., Manning G. Genomic epidemiology of clinical Campylobacter spp. at a single health trust site. Microb. Genom., 2018, vol. 4, no. 10: e000227. doi: 10.1099/mgen.0.000227
  8. Fitzgerald C. Campylobacter. Clin. Lab. Med., 2015, vol. 35, pp. 289–298. doi: 10.1016/j.cll.2015.03.001
  9. Garin B., Gouali M., Wouafo M., Perchec A.M., Pham M.T., Ravaonindrina N., Urbès F., Gay M., Diawara A., Leclercq A., Rocourt J., Pouillot R. Prevalence, quantification and antimicrobial resistance of Campylobacter spp. on chicken neck-skins at points of slaughter in 5 major cities located on 4 continents. Int. J. Food Microbiol., 2012, vol. 157, no. 1, pp. 102–107. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2012.04.020
  10. Gharbi M., Béjaoui A., Ben Hamda C., Ghedira K., Ghram A., Maaroufi A. Distribution of virulence and antibiotic resistance genes in Campylobacter jejuni and Campylobacter coli isolated from broiler chickens in Tunisia. J. Microbiol. Immunol. Infect., 2022, vol. 55, no. 6 (Pt 2), pp. 1273–1282. doi: 10.1016/j.jmii.2021.07.001
  11. Higham L.E., Scott C., Akehurst K., Dring D., Parnham A., Waterman M., Bright A. Effects of financial incentives and cessation of thinning on prevalence of Campylobacter: a longitudinal monitoring study on commercial broiler farms in the UK. Vet. Rec., 2018, vol. 183, no. 19: 595. doi: 10.1136/vr.104823
  12. Hlashwayo D.F., Sigaúque B., Noormahomed E.V., Afonso S.M.S., Mandomando I.M., Bila C.G. A systematic review and meta-analysis reveal that Campylobacter spp. and antibiotic resistance are widespread in humans in sub-Saharan Africa. PLoS One, 2021, vol. 16, no. 1: e0245951. doi: 10.1371/journal.pone.0245951
  13. Igwaran A., Okoh A.I. Human campylobacteriosis: a public health concern of global importance. Heliyon, 2019, vol. 5, no. 11: e02814. doi: 10.1016/j.heliyon.2019.e02814
  14. Kaakoush N.O., Castaño-Rodríguez N., Mitchell H.M., Man S.M. Global Epidemiology of Campylobacter Infection. Clin. Microbiol. Rev., 2015, vol. 28, no. 3, pp. 687–720. doi: 10.1128/CMR.00006-15
  15. Kreling V., Falcone F.H., Kehrenberg C., Hensel A. Campylobacter sp.: Pathogenicity factors and prevention methods-new molecular targets for innovative antivirulence drugs? Appl. Microbiol. Biotechnol., 2020, vol. 104, no. 24, pp. 10409–10436. doi: 10.1007/s00253-020-10974-5
  16. Lake I.R., Colón-González F.J., Takkinen J., Rossi M., Sudre B., Dias J.G., Tavoschi L., Joshi A., Semenza J.C., Nichols G. Exploring Campylobacter seasonality across Europe using The European Surveillance System (TESSy), 2008 to 2016. Euro Surveill., 2019, vol. 24, no. 13: 1800028. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2019.24.13.180028
  17. Liu F., Ma R., Wang Y., Zhang L. The Clinical Importance of Campylobacter concisus and Other Human Hosted Campylobacter Species. Front. Cell. Infect. Microbiol., 2018, no. 8: 243. doi: 10.3389/fcimb.2018.00243
  18. Mason J., Iturriza-Gomara M., O’Brien S.J., Ngwira B.M., Dove W., Maiden M.C., Cunliffe N.A. Campylobacter infection in children in Malawi is common and is frequently associated with enteric virus co-infections. PLoS One, 2013, vol. 8, no. 3: e59663. doi: 10.1371/journal.pone.0059663
  19. Osimani A., Aquilanti L., Pasquini M., Clementi F. Prevalence and risk factors for thermotolerant species of Campylobacter in poultry meat at retail in Europe. Poult. Sci., 2017, vol. 96, no. 9, pp. 3382–3391. doi: 10.3382/ps/pex143
  20. Paintsil E.K., Ofori L.A., Adobea S., Akenten C.W., Phillips R.O., Maiga-Ascofare O., Lamshöft M., May J., Obiri Danso K., Krumkamp R., Dekker D. Prevalence and antibiotic resistance in Campylobacter spp. isolated from humans and food-producing animals in West Africa: A Systematic Review and Meta-Analysis. Pathogens, 2022, vol. 11, no. 2: 140. doi: 10.3390/pathogens11020140
  21. Platts-Mills J.A., Liu J., Gratz J., Mduma E., Amour C., Swai N., Taniuchi M., Begum S., Peñataro Yori P., Tilley D.H., Lee G., Shen Z., Whary M.T., Fox J.G., McGrath M., Kosek M., Haque R., Houpt E.R. Detection of Campylobacter in stool and determination of significance by culture, enzyme immunoassay, and PCR in developing countries. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, no. 4, pp. 1074–80. doi: 10.1128/JCM.02935-13
  22. Randremanana R.V., Randrianirina F., Sabatier P., Rakotonirina H.C., Randriamanantena A., Razanajatovo I.M., Ratovoson R., Richard V. Campylobacter infection in a cohort of rural children in Moramanga, Madagascar. BMC Infect. Dis., 2014, no. 14: 372. doi: 10.1186/1471-2334-14-372
  23. Samie A., Moropeng R.C., Tanih N.F., Dillingham R., Guerrant R., Bessong P.O. Epidemiology of Campylobacter infections among children of 0-24 months of age in South Africa. Arch. Public Health, 2022, vol. 80, no. 1: 107. doi: 10.1186/s13690-022-00850-1
  24. Shen Z., Wang Y., Zhang Q., Shen J. Antimicrobial Resistance in Campylobacter spp. Microbiol. Spectr., 2018, vol. 6, no. 2. doi: 10.1128/microbiolspec.ARBA-0013-2017
  25. Sasaki Y., Yonemitsu K., Momose Y., Uema M. [Quantitative Survey of Campylobacter on Chicken Livers in Japan]. Shokuhin Eiseigaku Zasshi, 2023, vol. 64, no. 6, pp. 214–217. (In Japanese). doi: 10.3358/shokueishi.64.214
  26. Wallace R.L., Bulach D., McLure A., Varrone L., Jennison A.V., Valcanis M., Smith J.J., Polkinghorne B.G., Glass K., Kirk M.D. Antimicrobial resistance of Campylobacter spp. causing human infection in Australia: an international comparison. Microb. Drug. Resist., 2021, vol. 27, no. 4, pp. 518–528. doi: 10.1089/mdr.2020.0082
  27. Yoo M., Chung S.H., Park Y.S., Oh I.H., Chae W.Y., Kim S.H., Lee K.Y., Song C.W., Son B.K., Kim S.H., Jo Y.K., Jung K.H., Lee H.Y., Chae J.D. Clinical characteristics of Campylobacter enterocolitis in korean adults: a retrospective study at a single center. Korean J. Gastroenterol., 2020, vol. 75, no. 4, pp. 188–197. doi: 10.4166/kjg.2020.75.4.188

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Балдэ Р., Матвеева З.Н., Кафтырева Л.А., Макарова М.А., 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».