Прогнозный анализ эффективности дефицита витамина D с использованием модели дерева решений
- Авторы: Османи Ф.1
-
Учреждения:
- Исследовательский центр инфекционных заболеваний, Бирджандский университет медицинских наук
- Выпуск: Том 13, № 1 (2023)
- Страницы: 141-146
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- URL: https://bakhtiniada.ru/2220-7619/article/view/126042
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-AOT-1642
- ID: 126042
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Актуальность. Печень является основным местом синтеза витамина D (ВД), участвующего в различных патофизиологических механизмах при различных заболеваниях. Поэтому важно спрогнозировать степень дефицита ВД при помощи различных методов. Наше исследование было направлено на оценку эффективности дерева решений (DT) как одной из моделей машинного обучения для прогнозирования степени дефицита ВД. Методы. Всего было обследовано 292 пациента с ХГВ. У каждого из них определен уровень ВД в сыворотке. Для прогнозирования дефицита ВД использовались независимые характеристики, такие как возраст, пол, вес, рост, содержание цинка, индекс массы тела, жировые отложения, частота и продолжительность воздействия солнечного света и потребление молока. Информация 60% пациентов была внесена в обучающий набор данных случайным образом. Для оценки эффективности дерева решений результаты исследований оставшихся 40% пациентов были использованы в качестве набора данных тестирования. Валидация модели оценивалась кривой ROC. Результаты. Распространенность дефицита ВД среди пациентов была высокой (63,0%). Окончательные результаты экспериментов показали, что классификатор DT обеспечивает точность 96% и превосходит по производительности при обучении и тестировании набора данных о ВД. Кроме того, площади под кривой ROC AUC составила (0,78) при применении алгоритма DT со значимыми переменными путем перекрестной проверки, с получением значения AUC = 0,78 и точности 85,3%. Заключение. Мы пришли к выводу, что уровень цинка в сыворотке крови является важным сопутствующим фактором риска для выявления случаев дефицита ВД. Кроме того, риск дефицита ВД можно предсказать с высокой точностью с использованием алгоритма обучения дерева решений. Полученные данные можно применять в ходе противовирусной терапии у пациентов с ХГВ.
Ключевые слова
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Фрэштэх Османи
Исследовательский центр инфекционных заболеваний, Бирджандский университет медицинских наук
Автор, ответственный за переписку.
Email: dr.osmani68@gmail.com
д.н., кафедра биостатистики и эпидемиологии
Иран, г. БирджандСписок литературы
- Azarkar G., Doosti Z., Osmani F., Ziaee M. Analysis of risk factors for nonalcoholic fatty-liver disease in hepatitis B virus infection: a case-control study. Hepat. Med., 2019, vol. 11: 153. doi: 10.2147/HMERS211106
- Bedossa P., Poynard T. An algorithm for the grading of activity in chronic hepatitis C. Hepatology, 1996, vol. 24, no. 2, pp. 289–293. doi: 10.1002/hep.510240201
- Chen E.-Q., Shi Y., Tang H. New insight of vitamin D in chronic liver diseases. Hepatobiliary Pancreat. Dis. Int., 2014, vol. 13, no. 6, pp. 580–585.
- Coussens A.K., Wilkinson R.J., Hanifa Y., Nikolayevskyy V., Elkington P.T., Islam K., Timms P.M., Venton T.R., Bothamley G.H., Packe G.E., Darmalingam M., Davidson R.N., Milburn H.J., Baker L.V., Barker R.D., Mein C.A., Bhaw-Rosun L., Nuamah R., Young D.B., Drobniewski F.A., Griffiths C.J., Martineau A.R. Vitamin D accelerates resolution of inflammatory responses during tuberculosis treatment. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 2012, vol. 109, no. 38, pp. 15449–15454. doi: 10.1073/pnas.1200072109
- Efe C., Kav T., Aydin C., Cengiz M., Imga N.N., Purnak T., Smyk D.S., Torgutalp M., Turhan T., Ozenirler S., Ozaslan E., Bogdanos D.P. Low serum vitamin D levels are associated with severe histological features and poor response to therapy in patients with autoimmune hepatitis. Dig. Dis. Sci., 2014, vol. 59, no. 12, pp. 3035–3042. doi: 10.1007/s10620-014-3267-3
- Farnik H., Bojunga J., Berger A., Allwinn R., Waidmann O., Kronenberger B., Keppler O.T., Zeuzem S., Sarrazin C., Lange C.M. Low vitamin D serum concentration is associated with high levels of hepatitis B virus replication in chronically infected patients. Hepatology, 2013, vol. 58, no. 4, pp. 1270–1276. doi: 10.1002/hep.26488
- Ghaziasadi A., Ziaee M., Norouzi M., Malekzadeh R., Alavian S.M., Saberfar E., Judaki M.A., Ghamari S., Khedive A., Namazi A., Rahimnia R., Jazayeri S.M. The prevalence of hepatitis B virus surface antigen (HBsAg) variations and correlation with the clinical and serologic pictures in chronic carriers from Khorasan Province, North-East of Iran. Acta Med. Iran, 2012, vol. 50, no. 4, pp. 265–272.
- Han J., Pei J., Kamber M. Data mining: concepts and techniques: 3rd ed. Burlington: Morgan Kaufmann Publishers, 2012, pp. 83–124.
- Hauge Matzen L, Christensen J., Hintze H., Schou S., Wenzel A. Diagnostic accuracy of panoramic radiography, stereo-scanography and cone beam C.T. for assessment of mandibular third molars before surgery. Acta Odontol. Scand., 2013, vol. 71, no. 6, pp. 1391–1398. doi: 10.3109/00016357.2013.764574
- Heshmat R., Mohammad K., Majdzadeh S., Forouzanfar M., Bahrami A., Ranjbar Omrani G, Nabipour I., Rajabian R., Hossein-Nezhad A., Rezaei Hemami M., Keshtkar A., Pajouhi M. Vitamin D deficiency in Iran: a multi-center study among different urban areas. Iran J. Public Health, 2008, vol. 37, no. 1, pp. 72–78.
- Hewison M. Vitamin D and immune function: autocrine, paracrine or endocrine? Scand J. Clin. Lab. Invest., 2012, vol. 72, no. 243, pp. 92–102. doi: 10.3109/00365513.2012.682862
- Hoan N.X., Van Tong H, Le Huu Song C.G.M., Velavan T.P. Vitamin D deficiency and hepatitis viruses-associated liver diseases: a literature review. World J. Gastroenterol., 2018, vol. 24, no. 4: 445. doi: 10.3748/wjg.v24.i4.445
- Kitson M.T., Roberts S.K. D-livering the message: the importance of vitamin D status in chronic liver disease. J. Hepatol., 2012, vol. 57, no. 4, pp. 897–909. doi: 10.1016/j.jhep.2012.04.033
- Mahamid M., Nseir W., Elhija O.A., Shteingart S., Mahamid A., Smamra M., Koslowsky B. Normal vitamin D levels are associated with spontaneous hepatitis B surface antigen seroclearance. World J. Hepatol., 2013, vol. 5, no. 6: 328. doi: 10.4254/wjh.v5.i6.328
- Mohamadkhani A., Katoonizadeh A., Poustchi H. Immune-regulatory events in the clearance of HBsAg in chronic hepatitis B: focuses on HLA-DP. Middle East J. Dig. Dis., 2015, vol. 7, no. 1: 5.
- Osmani F. Effect evaluation of vitamin D level amongst patients with chronic hepatitis B. Arch. Pathol. Clin. Res., 2019, vol. 3, pp. 20–21. doi: 10.29328/journal.apcr.1001014
- Osmani F. Problems with reporting accuracy in COVID-19 statistics in Iran. Gastroenterol. Hepatol. Bed Bench, 2020, vol. 13, no. 4, pp. 275–277.
- Osmani F., Hajizadeh E., Rasekhi A., Akbari M.E. Analyzing relationship between local and metastasis relapses with survival of patients with breast cancer: a study using joint frailty model. Int. J. Cancer Manag., 2018, vol. 11, no. 12: e81783. doi: 10.5812/ijcm.81783
- Osmani F., Ziaee M. Assessment of the risk factors for vitamin D3 deficiency in chronic hepatitis B patient using the decision tree learning algorithm in Birjand. Inform. Med. Unlocked, 2021, vol. 23: 100519. doi: 10.1016/j.imu.2021.100519
- Parvaie P., Majd H.S., Ziaee M., Sharifzadeh G., Osmani F. Evaluation of gum health status in hemophilia patients in Birjand (a case-control study). Am. J. Blood Res., 2020, vol. 10, no. 3: 54.
- Plum L.A., DeLuca H.F. Vitamin D, disease and therapeutic opportunities. Nat. Rev. Drug Discov., 2010, vol. 9, no. 12, pp. 941–955. doi: 10.1038/nrd3318
- Remelli F., Vitali A., Zurlo A., Volpato S. Vitamin D deficiency and sarcopenia in older persons. Nutrients. 2019, vol. 11, no. 12: 2861. doi: 10.3390/nu11122861
- Schillie S., Xing J., Murphy T., Hu D. Prevalence of hepatitis B virus infection among persons with diagnosed diabetes mellitus in the United States, 1999–2010. J. Viral. Hepat., 2012, vol. 19, no. 9, pp. 674–676. doi: 10.1111/j.1365-2893.2012.01616.x
- Shoaei S.D., Sali S., Karamipour M., Riahi E. Non-invasive histologic markers of liver disease in patients with chronic hepatitis B. Hepat. Mon., 2014, vol. 14, no. 2: e14228. doi: 10.5812/hepatmon.14228
- Tabrizi R., Moosazadeh M., Akbari M., Dabbaghmanesh M.H., Mohamadkhani M., Asemi Z., Heydari S.T., Akbari M., Lankarani K.B. High prevalence of vitamin D deficiency among Iranian population: a systematic review and meta-analysis. Iran. J. Med. Sci., 2018 vol. 43, no. 2: 125.
- Tayefi M., Saberi-Karimian M., Esmaeili H., Zadeh A.A., Ebrahimi M., Mohebati M., Heidari-Bakavoli A., Azarpajouh M.R., Heshmati M., Safarian M., Nematy M., Parizadeh S.M.R., Ferns G.A., Ghayour-Mobarhan M. Evaluating of associated risk factors of metabolic syndrome by using decision tree. Comp. Clin. Pathol., 2018, vol. 27, no. 1, pp. 215–223. doi: 10.1007/s00580-017-2580-6
- Torresi J., Tran B.M., Christiansen D., Earnest-Silveira L., Schwab R.H.M., Vincan E. HBV-related hepatocarcinogenesis: the role of signalling pathways and innovative ex vivo research models. BMC Cancer, 2019, vol. 19, no. 1: 707. doi: 10.1186/s12885-019-5916-6
- Trépo E., Ouziel R., Pradat P., Momozawa Y., Quertinmont E., Gervy C., Gustot T., Degré D., Vercruysse V., Deltenre P., Verset L., Gulbis B., Franchimont D., Devière J., Lemmers A., Moreno C. Marked 25-hydroxyvitamin D deficiency is associated with poor prognosis in patients with alcoholic liver disease. J. Hepatol., 2013, vol. 59, no. 2, pp. 344–350. doi: 10.1016/ j.jhep.2013.03.024
- Tseng T.-C., Kao J.-H. Clinical utility of quantitative HBsAg in natural history and nucleos(t)ide analogue treatment of chronic hepatitis B: new trick of old dog. J. Gastroenterol., 2013, vol. 48, no. 1, pp. 13–21.
- Wang D., Wang Q., Shan F., Liu B., Lu C. Identification of the risk for liver fibrosis on CHB patients using an artificial neural network based on routine and serum markers. BMC Infect. Dis., 2010, vol. 10, no. 1: 251. doi: 10.1186/1471-2334-10-251
- Wong G.L., Chan H.L., Chan H.Y., Tse C.H., Chim A.M., Lo A.O., Wong V.W. Adverse effects of vitamin D deficiency on outcomes of patients with chronic hepatitis B. Clin. Gastroenterol. Hepatol., 2015, vol. 13, no. 4, pp. 783–790.e1. doi: 10.1016/ j.cgh.2014.09.050
- Ziaei S., Norrozi M., Faghihzadeh S., Jafarbegloo E. A randomised placebo-controlled trial to determine the effect of iron supplementation on pregnancy outcome in pregnant women with haemoglobin ≥ 13.2 g/dl. BJOG, 2007, vol. 114, no. 6, pp. 684–688. doi: 10.1111/j.1471-0528.2007.01325.x
