Биобанк ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России как ресурс для проведения исследований в области персонифицированной медицины

Биобанки представляют собой платформу для инновационных биомедицинских исследований в области трансляционной и персонифицированной медицины. Важным аспектом для проведения широкомасштабных исследований в области геномики, транскриптомики, протеомики является наличие выборки задокументированных образцов высокой разрешающей способности. Биобанки решают проблему формирования групп пациентов различных нозологий в пределах интересующей популяции и предоставляют клиническую и лабораторную информацию по каждому образцу. Цель данной статьи – описать работу биобанка ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии» Минздрава России в рамках существующих проектов и собранных коллекций. В обзоре рассмотрены основные этапы систематизированной работы биобанка, описаны методы пробоподготовки различных типов биологического материала, а также приведена статистика собранных коллекций. На сегодняшний день преобладающая часть депозитария состоит из образцов тканей пациентов с диагнозами злокачественных новообразований толстой кишки – 24% и желудка – 23% от общего количества образцов тканей, в то время как количество образцов тканей рака поджелудочной железы составляет 10%, а рака пищевода и рака молочной железы – по 22%. Помимо образцов тканей в биобанке ФГБУ «НМИЦ онкологии» хранятся 24 клеточные линии человеческого происхождения и коллекция из 200 образцов микробиоты, из них 100 – от пациентов с диагнозом рак легкого и 100 – от условно здоровых доноров. В настоящее время на биоматериале из собранных коллекций биобанка выполнены исследования по поиску прогностических биомаркеров и потенциальных мишеней для таргетной терапии методом высокопроизводительного секвенирования у пациентов с диагностированным раком поджелудочной железы и раком мозга. Таким образом, коллекции играют важную роль для исследований в области персонифицированной медицины, обеспечивая раннюю диагностику и эффективные методы лечения каждому пациенту.