МикроРНК как диагностический маркер при Т-клеточных лимфомах кожи

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование. В последние годы благодаря развитию методов молекулярно-генетического анализа одним из перспективных маркеров для диагностики многих заболеваний человека становится микроРНК.

Цель ― изучение микроРНК в плазме крови для ранней диагностики грибовидного микоза.

Материал и методы. В исследование были включены 30 пациентов с гистологически подтверждённым диагнозом Т-клеточной лимфомы кожи, у 25 был диагностирован грибовидный микоз, у 5 ― синдром Сезари. Группу контроля составили 10 пациентов с доброкачественными лимфопролиферативными дерматозами. Пациентам проводилось определение микроРНК 223, 16, 326, 663, 423, 711 в плазме крови. Проведено также определение микроРНК в плазме у пациентов с Т-клеточными лимфомами кожи на ранних и поздних стадиях.

Результаты. Выявлена статистически значимая разница микроРНК 223, 16, 326, 711 в плазме крови у пациентов с грибовидным микозом в сравнении с пациентами с доброкачественными лимфопролиферативными дерматозами, микроРНК 663 у пациентов с Т-клеточными лимфомами кожи на ранней и поздней стадиях, а также микроРНК 223, 711 у пациентов с грибовидным микозом на ранней стадии в сравнении с пациентами с доброкачественными лимфопролиферативными дерматозами.

Заключение. Определение микроРНК 223, 16, 326, 711 в плазме крови может быть использовано для ранней диагностики Т-клеточной лимфомы кожи.

Об авторах

Ольга Юрьевна Олисова

Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)

Email: olisovaolga@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-2482-1754
SPIN-код: 2500-7989

д.м.н., профессор

Россия, Москва

Владимир Витальевич Демкин

Институт молекулярной генетики

Email: vdemkin@img.ras.ru
ORCID iD: 0000-0002-3408-6100
SPIN-код: 5130-8270

к.м.н.

Россия, Москва

Наталья Геннадьевна Чернова

Городская клиническая больница № 40

Email: ngchernova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0827-4052
SPIN-код: 2683-1517

к.м.н.

Россия, Москва

Джессика Рафаэлевна Амшинская

Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)

Автор, ответственный за переписку.
Email: dr.jessika@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-3907-2189
SPIN-код: 6770-5019

аспирант

Россия, Москва

Андрей Аркадьевич Казаков

Институт молекулярной генетики

Email: andrey20079@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5559-6003
Россия, Москва

Список литературы

  1. Riou-Gotta M.O., Fournier E., Mermet I., et al. Primary cutaneous lymphomas: a population-based descriptive study of 71 consecutive cases diagnosed between 1980 and 2003 // Leuk Lymphoma. 2008. Vol. 49, N 8. Р. 1537–1544. doi: 10.1080/10428190802136368
  2. Kohnken R., Mishra A. MicroRNAs in cutaneous T-cell lymphoma: the future of therapy // J Investigative Dermatol. 2019. Vol. 139, N 3. Р. 528–534. doi: 10.1016/j.jid.2018.10.035
  3. Jawed S.I., Myskowski P.L., Horwitz S., et al. Primary cutaneous T-cell lymphoma (mycosis fungoides and Sézary syndrome): part I. Diagnosis: clinical and histopathologic features and new molecular and biologic markers // J Am Acad Dermatol. 2014. Vol. 70, N 2. Р. 205–222. doi: 10.1016/j.jaad.2013.07.049
  4. Hristov A.C., Tejasvi T., Wilcox R.A. Mycosis fungoides and Sézary syndrome: 2019 update on diagnosis, risk-stratification, and management // Am J Hematol. 2019. Vol. 94, N 9. Р. 1027–1041. doi: 10.1002/ajh.25577
  5. Ralfkiaer U., Lindahl L.M., Litman T., et al. MicroRNA expression in early mycosis fungoides is distinctly different from atopic dermatitis and advanced cutaneous T-cell lymphoma // Anticancer Res. 2014. Vol. 34, N 12. Р. 7207–7217.
  6. Shen X., Wang B., Li K., et al. MicroRNA signatures in diagnosis and prognosis of cutaneous T-cell lymphoma // J Invest Dermatol. 2018. Vol. 138, N 9. Р. 2024–2032. doi: 10.1016/j.jid.2018.03.1500
  7. Горенкова Л.Г., Рыжикова Н.В., Моисеева Т.Н., и др. Т-клеточные лимфомы кожи (грибовидный микоз) в практике гематолога // Гематология и трансфузиология. 2020. Т. 65, № 1. C. 133.
  8. Da Silva Almeida A.C., Abate F., Khiabanian H., et al. The mutational landscape of cutaneous T-cell lymphoma and Sézary syndrome // Nat Genet. 2015. Vol. 47, N 12. Р. 1465–1470. doi: 10.1038/ng.3442
  9. Spicknall K.E. Sézary syndrome-clinical and histopathologic features, differential diagnosis, and treatment // Semin Cutan Med Surg. 2018. Vol. 37, N 1. Р. 18–23. doi: 10.12788/j.sder.2018.005
  10. Dummer R., Heald P.W., Nestle F.O., et al. Sézary syndrome T-cell clones display T-helper 2 cytokines and express the accessory factor-1 (interferon-gamma receptor beta-chain) // Blood. 1996. Vol. 88, N 4. Р. 1383–1389.
  11. Rodriguez A., Griffiths-Jones S., Ashurst J.L., Bradley A. Identification of mammalian microRNA host genes and transcription units // Genome Res. 2004. Vol. 14, N 10. Р. 1902–1910. doi: 10.1101/gr.2722704
  12. Kozomara A., Griffiths-Jones S. miRBase: integrating microRNA annotation and deep-sequencing data // Nucleic Acids Res. 2011. Vol. 39. Р. 152–157. doi: 10.1093/nar/gkq1027
  13. Peterson S.M., Thompson J.A., Ufkin M.L., et al. Common features of microRNA target prediction tools // Frontiers Genetics. 2014. Vol. 5. Р. 23. doi: 10.3389/fgene.2014.00023
  14. Di Leva G., Garofalo M., Croce C.M. MicroRNAs in cancer // Annu Rev Pathol. 2014. Vol. 9. Р. 287–314. doi: 10.1146/annurev-pathol-012513-104715
  15. Sadakierska-Chudy A. MicroRNAs: diverse mechanisms of action and their potential applications as cancer epi-therapeutics // Biomolecules. 2020. Vol. 10, N 9. Р. 1285. doi: 10.3390/biom10091285
  16. Ma L., Teruya-Feldstein J., Weinberg R.A. Tumour invasion and metastasis initiated by microRNA-10b in breast cancer // Nature. 2007. Vol. 449, N 7163. Р. 682–688. doi: 10.1038/nature06174
  17. Androvic P., Valihrach L., Elling J., et al. Two-tailed RT-qPCR: a novel method for highly accurate miRNA quantification // Nucleic Acids Res. 2017. Vol. 45, N 15. Р. 144. doi: 10.1093/nar/gkx588
  18. Leti F., DiStefano J.K. miRNA quantification method using quantitative polymerase chain reaction in conjunction with cq method // Methods Mol Biol. 2018. Vol. 1706. Р. 257–265. doi: 10.1007/978-1-4939-7471-9_14
  19. Pistol Tanase C., Albulescu R., Neagu M. Application of 3D hydrogel microarrays in molecular diagnostics: advantages and limitations // Expert Rev Mol Diagn. 2011. Vol. 11, N 5. Р. 461–464. doi: 10.1586/erm.11.30
  20. Kappel A., Backes C., Huang Y., et al. MicroRNA in vitro diagnostics using immunoassay analyzers // Clin Chem. 2015. Vol. 61, N 4. Р. 600–607. doi: 10.1373/clinchem.2014.232165
  21. Ballabio E., Mitchell T., van Kester M.S., et al. MicroRNA expression in Sezary syndrome: identification, function, and diagnostic potential // Blood. 2010. Vol. 116, N 7. Р. 1105–1113. doi: 10.1182/blood-2009-12-256719
  22. Ralfkiaer U., Hagedorn P.H., Bangsgaard N., et al. Diagnostic microRNA profiling in cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) // Blood. 2011. Vol. 118, N 22. Р. 5891–5900. doi: 10.1182/blood-2011-06-358382
  23. Van Kester M.S., Ballabio E., Benner M.F., et al. miRNA expression profiling of mycosis fungoides // Mol Oncol. 2011. Vol. 5, N 9. Р. 273–280. doi: 10.1016/j.molonc.2011.02.003
  24. Narducci M.G., Arcelli D., Picchio M.C., et al. MicroRNA profiling reveals that miR-21, miR486 and miR-214 are upregulated and involved in cell survival in Sézary syndrome // Cell Death Dis. 2011. Vol. 2, N 4. Р. 151. doi: 10.1038/cddis.2011.32
  25. Benner A., Zucknick M., Hielscher T., et al. High-dimensional Cox models: the choice of penalty as part of the model building process // Biom J. 2010. Vol. 52, N 1. Р. 50–69. doi: 10.1002/bimj.200900064
  26. Flores-Sandoval E., Eklund D.M., Bowman J.L. A Simple auxin transcriptional response system regulates multiple morphogenetic processes in the liverwort marchantia polymorpha // PLoS Genetics. 2015. Vol. 11, N 5. Р. e1005207. doi: 10.1371/journal.pgen.1005207
  27. Qin J., Li Y., Cai Z., et al. A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabete // Nature. 2012. Vol. 490, N 7418. Р. 55–60. doi: 10.1038/nature11450
  28. Marstrand T., Ahler C.B., Ralfkiaer U., et al. Validation of a diagnostic microRNA classifier in cutaneous T-cell lymphomas // Leuk Lymphoma. 2014. Vol. 55, N 4. Р. 957–958. doi: 10.3109/10428194.2013.815352
  29. Hagag N.A., Ali Y.B., Elsharawy A.A., Talaat R.M. Clinical impact of circulated miR-1291 in plasma of patients with liver cirrhosis (LC) and hepatocellular carcinoma (HCC): implication on glypican-3 expression // J Gastrointest Cancer. 2020. Vol. 51, N 1. Р. 234–241. doi: 10.1007/s12029-019-00234-9
  30. Dusílková N., Bašová P., Polívka J., et al. Plasma miR-155, miR-203, and miR-205 are biomarkers for monitoring of primary cutaneous T-cell lymphomas // Int J Mol Sci. 2017. Vol. 18, N 10. Р. 2136. doi: 10.3390/ijms18102136
  31. Hassan H., Salami A., Ghssein G., et al. Seroprevalence of Brucella abortus in cattle in Southern Lebanon using different diagnostic tests // Veterinary World. 2020. Vol. 13, N 10. Р. 2234–2242. doi: 10.1080/20008686.2018.1555445

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Анализ чувствительности и специфичности микроРНК 223.

Скачать (62KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Анализ чувствительности и специфичности микроРНК 16.

Скачать (59KB)
Метаданные

© Олисова О.Ю., Демкин В.В., Чернова Н.Г., Амшинская Д.Р., Казаков А.А., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».