Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 27, № 3 (2022)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Прогностическая модель исходов COVID-19 у пациентов с ВИЧ-инфекцией на продвинутых стадиях заболевания

Цыганкова А.Э., Герасимов А.Н., Потекаева С.А., Краснова С.В., Цветкова Н.А., Малолетнева Н.В., Волчкова Е.В., Чуланов В.П.

Аннотация

Обоснование. Анализ международных и отечественных публикаций показал практически полное отсутствие исследований по течению и исходам COVID-19 у пациентов с ВИЧ-инфекцией на поздних стадиях заболевания, что послужило основанием для проведения настоящего исследования.

Цель исследования — выявление предикторов неблагоприятных исходов COVID-19 у пациентов с ВИЧ на стадии вторичных заболеваний для разработки прогностической модели исходов с целью упрощения принятия решений по тактике их ведения врачам практического здравоохранения в зависимости от клинико-лабораторных показателей и результатов инструментальных исследований на момент госпитализации.

Материалы и методы. В исследование вошли 300 пациентов старше 18 лет с ВИЧ-инфекцией на стадии вторичных заболеваний со среднетяжёлым или тяжёлым течением COVID-19. Исследование носило одноцентровый характер и проходило на базе Инфекционной клинической больницы № 2 г. Москвы в 2020–2021 гг.

Результаты. Летальность в исследуемой группе пациентов составила 27,3% (95% доверительный интервал 22,7–32,4%). Неблагоприятными (в рамках многофакторной прогностической модели) стали факторы, отражающие дыхательную недостаточность, иммунодефицит, снижение уровня белка, альбумина и повышение уровня мочевины. Получена прогностическая модель неблагоприятных исходов COVID-19 у пациентов с ВИЧ-инфекцией на поздних стадиях заболевания.

Заключение. Разработана математическая модель, направленная на помощь врачу практического здравоохранения в принятии быстрого, обоснованного решения о госпитализации пациента в палату интенсивного наблюдения и проведении активных терапевтических мер.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2022;27(3):148-163
pages 148-163 views

Анализ микробиома кишечника ВИЧ-инфицированных пациентов с использованием 16S рРНК секвенирования

Попова Д.М., Вознесенский С.Л., Петрова Е.В., Климкова П.В.

Аннотация

Обоснование. Микробиота желудочно-кишечного тракта является одним из важных факторов, обеспечивающих нормальную жизнедеятельность человеческого организма. Пациенты с ВИЧ-инфекцией наиболее подвержены кишечным инфекциям и изменениям в составе микробиоты как вследствие воздействия самого вируса, так и в результате снижения иммунитета. В данной статье описываются изменения в составе кишечной микрофлоры пациентов с ВИЧ-инфекцией на стадии вторичных заболеваний, получающих и не получающих антиретровирусную терапию.

Цель исследования — определить состав микробиома кишечника у пациентов с ВИЧ-инфекцией на антиретровирусной терапии и вне её с помощью секвенирования ДНК гипервариабельных регионов гена 16S рРНК.

Материалы и методы. Объектом исследования была группа пациентов в количестве 10 человек с документально подтверждённым диагнозом ВИЧ-инфекции и диарейным синдромом. С целью уточнения возможного этиологического фактора и определения особенностей микробиоценоза желудочно-кишечного тракта был проведён анализ кала методом 16S рРНК секвенирования.

Результаты. В ходе исследования выявлены значительные изменения в составе микробиома: обеднение типа Bacteroidetes, повышенное число типа Proteobacteria. Установлена статистически значимая разница в составе типов микробиоты здоровых людей и c ВИЧ-инфекцией (p <0,05). Нормофлора была представлена всего лишь двумя микроорганизмами — Bifidobacterium breve и Lactobacillus rhamnosus. Были выявлены условно-патогенные виды микроорганизмов: Enterococcus faecium, E. faecalis, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter freundii, E. durans, Klebsiella sp., Pantoea agglomerans, K. variicola, E. hirae, E. coli TOP550-1, Clostridioides difficile, Staphylococcus aureus. Данные бактерии могут быть причиной диарейного синдрома у пациентов с ВИЧ-инфекцией.

Заключение. У пациентов с ВИЧ-инфекцией снижено бактериальное разнообразие, обеднена нормофлора, формируется специфический микробный профиль. Ряд условно-патогенных микроорганизмов могут быть причиной диареи у пациентов с ВИЧ-инфекцией. Анализ 16S рРНК секвенирования может использоваться как неинвазивный метод диагностики изменения состава кишечной микрофлоры и с целью уточнения этиологического фактора диарейного синдрома.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2022;27(3):164-174
pages 164-174 views

Разработка и изучение эффективности набора реагентов для идентификации Vibrio cholerae и Vibrio parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической полимеразной цепной реакции при проведении клинических испытаний

Чемисова О.С., Полеева М.В., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Трухачев А.Л., Писанов Р.В., Кругликов В.Д., Носков А.К.

Аннотация

Обоснование. Холера относится к группе инфекций, борьба с которыми регламентируется Международными медико-санитарными правилами ВОЗ (2005). На сегодняшний день разработано большое число тест-систем для ПЦР-детекции штаммов Vibrio cholerae. Однако зарегистрированные тест-системы ПЦР для выявления ДНК V. parahaemolyticus в клиническом материале в России отсутствуют.

Цель исследования — разработка, проведение клинических испытаний и оценка эффективности набора реагентов для идентификации V. cholerae и V. parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР (набор реагентов «Vibrio-скрин FL») в рамках процедуры государственной регистрации указанного медицинского изделия.

Материалы и методы. В статье публикуются результаты клинических испытаний набора реагентов для идентификации V. cholerae и V. parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР, разработанного с целью оптимизации средств и методов идентификации и дифференциации возбудителей инфекционных заболеваний на основе данных о разнообразии геномов. Клинические испытания проводились на базе Головного центра гигиены и эпидемиологии ФМБА (лицензия от 02.12.2013 № ФС-99-01-008342; разрешение Минздрава РФ от 16.05.2013 № 300н) в соответствии с программой клинических испытаний от 23.09.2020 № 20.ПМКИ-042/10.20 (акт клинических испытаний от 12.10.2020 № 01.АК-042/10.20). Для проведения клинических испытаний разработанного набора реагентов «Vibrio-скрин FL» в качестве целевых аналитов были использованы клинические штаммы микроорганизмов рода Vibrio, а также ряд гетерологичных микроорганизмов. Методы исследования — бактериологический метод и мультилокусная ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией.

Результаты. В ходе испытаний образцы испытуемого набора реагентов «Vibrio-скрин FL» показали надёжность и удобство обращения в условиях практической лаборатории. Аналитическая чувствительность набора реагентов составила при определении принадлежности к роду Vibrio не менее 106 копий гена SecY; к виду V. cholerae — не менее 106 копий гена hlyA, к виду V. parahaemolyticus — не менее 106 копий гена vppC. При определении аналитической специфичности отсутствовали неспецифические реакции с образцами ДНК гетерологичных микроорганизмов. Медицинское изделие для диагностики in vitro «Набор реагентов для идентификации V. cholerae и V. parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР (Vibrio-скрин FL)» соответствует предлагаемым методам использования, что позволяет применять его для дифференциации штаммов V. cholerae и V. parahaemolyticus, выделенных из клинического образца после культивирования методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией. Получено регистрационное удостоверение от 08.02.2021 № РЗН 2021/13360. Приказом Росздравнадзора от 08.02.2021 № 1041 набор реагентов «Vibrio-скрин FL» (ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора) допущен к обращению на территории Российской Федерации.

Выводы. Набор реагентов «Vibrio-скрин FL» является качественным, эффективным и безопасным диагностическим медицинским изделием для диагностики in vitro с достаточной диагностической чувствительностью и специфичностью для выявления специфических участков нуклеиновых кислот Vibrio spp., V. cholerae и V. parahaemolyticus, что позволяет использовать его в клинической лабораторной диагностике для решения эпидемиологических задач и выявления случаев заболеваний, вызванных патогенными вибрионами.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2022;27(3):175-183
pages 175-183 views

СИСТЕМАТИЧЕСКИЕ ОБЗОРЫ

Чувствительность Streptococcus pneumoniae к антибиотикам и пол пациента: систематический обзор и метаанализ

Семенов С.А., Хасанова Г.Р.

Аннотация

Обоснование. Распространение резистентности микроорганизмов к антибиотикам — глобальная проблема современности, которая в последние годы сильнее обострилась в связи со значительным ростом потребления антибиотиков, в том числе и бесконтрольного на фоне пандемии COVID-19. Прямым следствием распространения нечувствительных к антибиотикам штаммов пневмококков является ограничение возможностей лечения таких пациентов и ухудшение прогноза.

Цель исследования — выяснить, является ли пол фактором, ассоциированным с развитием заболеваний, вызванных антибиотикорезистентными штаммами Streptococcus pneumoniae.

Материалы и методы. С использованием электронных баз данных PubMed, ScienceDirect, Google Scholar был проведён поиск статей, опубликованных за период с января 1980 по декабрь 2020 г.; отобраны исследования на английском и русском языках. Отбор статей и метаанализ осуществлялись в соответствии с рекомендациями PRISMA Group и MOOSE. После объединения данных рассчитано отношение шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Проводилась оценка гетерогенности.

Результаты. После применения критериев исключения для анализа была отобрана 41 публикация с охватом 16 635 пациентов с инвазивными и неинвазивными формами пневмококковой инфекции, из них 36 исследований типа «случай — контроль», 5 кросс-секционных. Получены следующие результаты: пол пациента не влияет на частоту выделения штаммов пневмококка, нечувствительных к пенициллину (ОШ=0,92, 95% ДИ 0,82–1,03, I2=7%), резистентных к пенициллину (ОШ=0,85, 95% ДИ 0,67–1,07, I2=1%), нечувствительных к эритромицину (ОШ=0,80, 95% ДИ 0,51–1,24, I2=0%). Мужской пол ассоциирован с резистентностью пневмококка к левофлоксацину (ОШ=1,85, 95% ДИ 1,03–3,33, I2=0%).

Выводы. Пол пациента не является фактором, ассоциированным с выделением нечувствительных и резистентных к пенициллину и эритромицину штаммов S. pneumoniae. При этом мужской пол, вероятно, повышает шанс выделения левофлоксацин-резистентных пневмококков у взрослых с инвазивными пневмококковыми инфекциями.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2022;27(3):184-200
pages 184-200 views

НАУЧНЫЕ ОБЗОРЫ

Принципы функционирования универсальной адаптивной правовой модели социально-полезного поведения личности в период эпидемий: государственные практики периода существования СССР как ключ к решению современных проблем

Суранова Т.Г., Суворов Г.Н., Зенин С.С.

Аннотация

В статье изложены принципы функционирования универсальной адаптивной правовой модели социально полезного поведения личности в период эпидемий (пандемий). Использованы правовые и доктринальные источники, материалы совещаний (съездов) органов власти, представителей общественности, относимые к области противодействия развитию эпидемий, изданные в период существования СССР (1922–1991), а также в современной России. Установлено, что построение универсальной правовой модели социально полезного поведения личности должно быть организовано исходя из условий, способствующих обеспечению уступчивости индивида к соблюдению формальных требований (эмпирическое восприятие риска, степень доверия к формальным правилам, наличие и сила воздействия факторов-препятствий). Предложены принципы функционирования искомой модели: 1) принцип единого источника происхождения, непротиворечивости и фактологической обоснованности применения специальных правил поведения в условиях угрозы распространения опасных заболеваний; 2) принцип научной обоснованности дополнительных ограничений, запретов и обязанностей; 3) принцип системности профилактической работы; 4) принцип рационального планирования, подготовки и использования кадровых и материальных ресурсов общественных организаций волонтёров в работе по предупреждению чрезвычайных ситуаций эпидемиологического характера.

Эпидемиология и инфекционные болезни. 2022;27(3):201-212
pages 201-212 views


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».