


Том 27, № 3 (2022)
- Год: 2022
- Статей: 5
- URL: https://bakhtiniada.ru/1560-9529/issue/view/6615
- DOI: https://doi.org/10.17816/EID.273
ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
Прогностическая модель исходов COVID-19 у пациентов с ВИЧ-инфекцией на продвинутых стадиях заболевания
Аннотация
Обоснование. Анализ международных и отечественных публикаций показал практически полное отсутствие исследований по течению и исходам COVID-19 у пациентов с ВИЧ-инфекцией на поздних стадиях заболевания, что послужило основанием для проведения настоящего исследования.
Цель исследования — выявление предикторов неблагоприятных исходов COVID-19 у пациентов с ВИЧ на стадии вторичных заболеваний для разработки прогностической модели исходов с целью упрощения принятия решений по тактике их ведения врачам практического здравоохранения в зависимости от клинико-лабораторных показателей и результатов инструментальных исследований на момент госпитализации.
Материалы и методы. В исследование вошли 300 пациентов старше 18 лет с ВИЧ-инфекцией на стадии вторичных заболеваний со среднетяжёлым или тяжёлым течением COVID-19. Исследование носило одноцентровый характер и проходило на базе Инфекционной клинической больницы № 2 г. Москвы в 2020–2021 гг.
Результаты. Летальность в исследуемой группе пациентов составила 27,3% (95% доверительный интервал 22,7–32,4%). Неблагоприятными (в рамках многофакторной прогностической модели) стали факторы, отражающие дыхательную недостаточность, иммунодефицит, снижение уровня белка, альбумина и повышение уровня мочевины. Получена прогностическая модель неблагоприятных исходов COVID-19 у пациентов с ВИЧ-инфекцией на поздних стадиях заболевания.
Заключение. Разработана математическая модель, направленная на помощь врачу практического здравоохранения в принятии быстрого, обоснованного решения о госпитализации пациента в палату интенсивного наблюдения и проведении активных терапевтических мер.



Анализ микробиома кишечника ВИЧ-инфицированных пациентов с использованием 16S рРНК секвенирования
Аннотация
Обоснование. Микробиота желудочно-кишечного тракта является одним из важных факторов, обеспечивающих нормальную жизнедеятельность человеческого организма. Пациенты с ВИЧ-инфекцией наиболее подвержены кишечным инфекциям и изменениям в составе микробиоты как вследствие воздействия самого вируса, так и в результате снижения иммунитета. В данной статье описываются изменения в составе кишечной микрофлоры пациентов с ВИЧ-инфекцией на стадии вторичных заболеваний, получающих и не получающих антиретровирусную терапию.
Цель исследования — определить состав микробиома кишечника у пациентов с ВИЧ-инфекцией на антиретровирусной терапии и вне её с помощью секвенирования ДНК гипервариабельных регионов гена 16S рРНК.
Материалы и методы. Объектом исследования была группа пациентов в количестве 10 человек с документально подтверждённым диагнозом ВИЧ-инфекции и диарейным синдромом. С целью уточнения возможного этиологического фактора и определения особенностей микробиоценоза желудочно-кишечного тракта был проведён анализ кала методом 16S рРНК секвенирования.
Результаты. В ходе исследования выявлены значительные изменения в составе микробиома: обеднение типа Bacteroidetes, повышенное число типа Proteobacteria. Установлена статистически значимая разница в составе типов микробиоты здоровых людей и c ВИЧ-инфекцией (p <0,05). Нормофлора была представлена всего лишь двумя микроорганизмами — Bifidobacterium breve и Lactobacillus rhamnosus. Были выявлены условно-патогенные виды микроорганизмов: Enterococcus faecium, E. faecalis, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter freundii, E. durans, Klebsiella sp., Pantoea agglomerans, K. variicola, E. hirae, E. coli TOP550-1, Clostridioides difficile, Staphylococcus aureus. Данные бактерии могут быть причиной диарейного синдрома у пациентов с ВИЧ-инфекцией.
Заключение. У пациентов с ВИЧ-инфекцией снижено бактериальное разнообразие, обеднена нормофлора, формируется специфический микробный профиль. Ряд условно-патогенных микроорганизмов могут быть причиной диареи у пациентов с ВИЧ-инфекцией. Анализ 16S рРНК секвенирования может использоваться как неинвазивный метод диагностики изменения состава кишечной микрофлоры и с целью уточнения этиологического фактора диарейного синдрома.



Разработка и изучение эффективности набора реагентов для идентификации Vibrio cholerae и Vibrio parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической полимеразной цепной реакции при проведении клинических испытаний
Аннотация
Обоснование. Холера относится к группе инфекций, борьба с которыми регламентируется Международными медико-санитарными правилами ВОЗ (2005). На сегодняшний день разработано большое число тест-систем для ПЦР-детекции штаммов Vibrio cholerae. Однако зарегистрированные тест-системы ПЦР для выявления ДНК V. parahaemolyticus в клиническом материале в России отсутствуют.
Цель исследования — разработка, проведение клинических испытаний и оценка эффективности набора реагентов для идентификации V. cholerae и V. parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР (набор реагентов «Vibrio-скрин FL») в рамках процедуры государственной регистрации указанного медицинского изделия.
Материалы и методы. В статье публикуются результаты клинических испытаний набора реагентов для идентификации V. cholerae и V. parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР, разработанного с целью оптимизации средств и методов идентификации и дифференциации возбудителей инфекционных заболеваний на основе данных о разнообразии геномов. Клинические испытания проводились на базе Головного центра гигиены и эпидемиологии ФМБА (лицензия от 02.12.2013 № ФС-99-01-008342; разрешение Минздрава РФ от 16.05.2013 № 300н) в соответствии с программой клинических испытаний от 23.09.2020 № 20.ПМКИ-042/10.20 (акт клинических испытаний от 12.10.2020 № 01.АК-042/10.20). Для проведения клинических испытаний разработанного набора реагентов «Vibrio-скрин FL» в качестве целевых аналитов были использованы клинические штаммы микроорганизмов рода Vibrio, а также ряд гетерологичных микроорганизмов. Методы исследования — бактериологический метод и мультилокусная ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией.
Результаты. В ходе испытаний образцы испытуемого набора реагентов «Vibrio-скрин FL» показали надёжность и удобство обращения в условиях практической лаборатории. Аналитическая чувствительность набора реагентов составила при определении принадлежности к роду Vibrio не менее 106 копий гена SecY; к виду V. cholerae — не менее 106 копий гена hlyA, к виду V. parahaemolyticus — не менее 106 копий гена vppC. При определении аналитической специфичности отсутствовали неспецифические реакции с образцами ДНК гетерологичных микроорганизмов. Медицинское изделие для диагностики in vitro «Набор реагентов для идентификации V. cholerae и V. parahaemolyticus методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР (Vibrio-скрин FL)» соответствует предлагаемым методам использования, что позволяет применять его для дифференциации штаммов V. cholerae и V. parahaemolyticus, выделенных из клинического образца после культивирования методом мультилокусной аллель-специфической ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией. Получено регистрационное удостоверение от 08.02.2021 № РЗН 2021/13360. Приказом Росздравнадзора от 08.02.2021 № 1041 набор реагентов «Vibrio-скрин FL» (ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора) допущен к обращению на территории Российской Федерации.
Выводы. Набор реагентов «Vibrio-скрин FL» является качественным, эффективным и безопасным диагностическим медицинским изделием для диагностики in vitro с достаточной диагностической чувствительностью и специфичностью для выявления специфических участков нуклеиновых кислот Vibrio spp., V. cholerae и V. parahaemolyticus, что позволяет использовать его в клинической лабораторной диагностике для решения эпидемиологических задач и выявления случаев заболеваний, вызванных патогенными вибрионами.



СИСТЕМАТИЧЕСКИЕ ОБЗОРЫ
Чувствительность Streptococcus pneumoniae к антибиотикам и пол пациента: систематический обзор и метаанализ
Аннотация
Обоснование. Распространение резистентности микроорганизмов к антибиотикам — глобальная проблема современности, которая в последние годы сильнее обострилась в связи со значительным ростом потребления антибиотиков, в том числе и бесконтрольного на фоне пандемии COVID-19. Прямым следствием распространения нечувствительных к антибиотикам штаммов пневмококков является ограничение возможностей лечения таких пациентов и ухудшение прогноза.
Цель исследования — выяснить, является ли пол фактором, ассоциированным с развитием заболеваний, вызванных антибиотикорезистентными штаммами Streptococcus pneumoniae.
Материалы и методы. С использованием электронных баз данных PubMed, ScienceDirect, Google Scholar был проведён поиск статей, опубликованных за период с января 1980 по декабрь 2020 г.; отобраны исследования на английском и русском языках. Отбор статей и метаанализ осуществлялись в соответствии с рекомендациями PRISMA Group и MOOSE. После объединения данных рассчитано отношение шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Проводилась оценка гетерогенности.
Результаты. После применения критериев исключения для анализа была отобрана 41 публикация с охватом 16 635 пациентов с инвазивными и неинвазивными формами пневмококковой инфекции, из них 36 исследований типа «случай — контроль», 5 кросс-секционных. Получены следующие результаты: пол пациента не влияет на частоту выделения штаммов пневмококка, нечувствительных к пенициллину (ОШ=0,92, 95% ДИ 0,82–1,03, I2=7%), резистентных к пенициллину (ОШ=0,85, 95% ДИ 0,67–1,07, I2=1%), нечувствительных к эритромицину (ОШ=0,80, 95% ДИ 0,51–1,24, I2=0%). Мужской пол ассоциирован с резистентностью пневмококка к левофлоксацину (ОШ=1,85, 95% ДИ 1,03–3,33, I2=0%).
Выводы. Пол пациента не является фактором, ассоциированным с выделением нечувствительных и резистентных к пенициллину и эритромицину штаммов S. pneumoniae. При этом мужской пол, вероятно, повышает шанс выделения левофлоксацин-резистентных пневмококков у взрослых с инвазивными пневмококковыми инфекциями.



НАУЧНЫЕ ОБЗОРЫ
Принципы функционирования универсальной адаптивной правовой модели социально-полезного поведения личности в период эпидемий: государственные практики периода существования СССР как ключ к решению современных проблем
Аннотация
В статье изложены принципы функционирования универсальной адаптивной правовой модели социально полезного поведения личности в период эпидемий (пандемий). Использованы правовые и доктринальные источники, материалы совещаний (съездов) органов власти, представителей общественности, относимые к области противодействия развитию эпидемий, изданные в период существования СССР (1922–1991), а также в современной России. Установлено, что построение универсальной правовой модели социально полезного поведения личности должно быть организовано исходя из условий, способствующих обеспечению уступчивости индивида к соблюдению формальных требований (эмпирическое восприятие риска, степень доверия к формальным правилам, наличие и сила воздействия факторов-препятствий). Предложены принципы функционирования искомой модели: 1) принцип единого источника происхождения, непротиворечивости и фактологической обоснованности применения специальных правил поведения в условиях угрозы распространения опасных заболеваний; 2) принцип научной обоснованности дополнительных ограничений, запретов и обязанностей; 3) принцип системности профилактической работы; 4) принцип рационального планирования, подготовки и использования кадровых и материальных ресурсов общественных организаций волонтёров в работе по предупреждению чрезвычайных ситуаций эпидемиологического характера.


