Гетерогенность по признаку антибиотикочувствительности и генотипу штаммов холерных вибрионов Эль-Тор, выделенных из объектов окружающей среды на территории России
- Авторы: Селянская Н.А.1, Левченко Д.А.1, Егиазарян Л.А.1, Пасюкова Н.И.1
-
Учреждения:
- Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
- Выпуск: Том 25, № 6 (2020)
- Страницы: 246-252
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- URL: https://bakhtiniada.ru/1560-9529/article/view/81069
- DOI: https://doi.org/10.17816/EID81069
- ID: 81069
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Ежегодно в мире регистрируется до 4 млн случаев этой инфекции, из них более чем 100 тыс. заканчиваются летальным исходом. Пластичность генома возбудителя холеры, мобильность генетических элементов, несущих факторы патогенности и антибиотикорезистентности, способствуют вариабельности и непредсказуемости спектра устойчивости, формированию новых фено- и генотипов. Один изолят Vibrio cholerae может содержать до 40 различных генов, которые могут придавать устойчивость к 22 антибиотикам, представляющим 9 различных классов противомикробных препаратов. Способность холерного вибриона к долгосрочному выживанию в водных экосистемах, в которых активно идёт обмен генетической информацией и могут возникать новые, имеющие потенциальные преимущества в адаптации микроорганизмов к неблагоприятным условиям экологические линии, подчёркивает сложность путей передачи этой инфекции и необходимость проведения исследований на уровне окружающей среды. Периодические завозы холеры на территорию Российской Федерации с/без распространения возбудителя инфекции, контаминация V. cholerae поверхностных водоёмов, используемых в качестве источников водоснабжения и с целью рекреационного водопользования, возможность реализации основного при холере (водного) пути распространения возбудителя инфекции свидетельствуют о необходимости проведения ежегодного мониторинга антимикробной резистентности в рамках эпидемиологического надзора за холерой с целью получения информации о распространении, характере и динамике резистентности в конкретный период времени на данной территории.
Цель исследования ― анализ спектра антибиотикорезистентности штаммов холерных вибрионов серогруппы О1, выделенных из объектов окружающей среды на различных территориях Российской Федерации в 2020 г.
Материал и методы. Чувствительность/устойчивость 25 штаммов V. cholerae О1 El Tor, выделенных из объектов окружающей среды в Российской Федерации в 2020 г., к 13 антибактериальным препаратам определяли методом серийных разведений на плотной питательной среде в соответствии с МУК 4.2.2495-09. Генотипирование штаммов V. cholerae El Tor методом полимеразной цепной реакции проводили по 14 генам-мишеням с последующим кластерным анализом.
Результаты. У штаммов выявлены маркеры устойчивости к фуразолидону, триметоприму/сульфаметоксазолу, ампициллину, налидиксовой кислоте, цефтриаксону, которые образовали 5 фенотипов. ПЦР-генотипирование 14 генов-мишеней распределило штаммы на 5 генотипов (А1–А5), соответствующих определённым территориям. Профили антибиотикорезистентности в пределах одного генотипа у V. cholerae О1 El Tor, принадлежащих к разным территориям, были как одинаковыми, так и разными.
Заключение. Выявлены генотипическое разнообразие изолированных штаммов, вариабельность маркеров резистентности даже в одном регионе, что свидетельствует как об изменениях в популяции холерного вибриона, так и возможности циркуляции различных гено- и фенотипов, и подчёркивает важность постоянного наблюдения за данными патогенами.
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Надежда Александровна Селянская
Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: ppdn@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-0008-4705
SPIN-код: 7920-3340
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории экспериментально-биологических моделей
Россия, 344002, Россия, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40Дарья Александровна Левченко
Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: levchenko_da@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-4676-0377
SPIN-код: 7896-9092
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Лиана Альбертовна Егиазарян
Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: caturyanliana@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6350-065X
SPIN-код: 1300-9523
младший научный сотрудник лаборатории биологической безопасности и лечения ООИ
Россия, 344002, Россия, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40Нина Ивановна Пасюкова
Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Автор, ответственный за переписку.
Email: ppdn@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-1525-5693
SPIN-код: 9950-9439
научный сотрудник лаборатории экспериментально-биологических моделей
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Список литературы
- Moehling T.J., Lee D.H., Henderson M.E., et al. A smartphone-based particle diffusometry platform for sub-attomolar detection of Vibrio cholerae in environmental water // Biosens Bioelectron. 2020. Vol. 167. P. 112497. doi: 10.1016/j.bios.2020.112497
- Ali M., Nelson A.R., Lopez A.L., Sack D. Updated global burden of cholera in endemic countries // PLoS Negl Trop Dis. 2015. Vol. 9, N 6. Р. e0003832. doi: 10.1371/journal.pntd.0003832
- Wozniak R.A., Waldor M.K. Integrative and conjugative elements: mosaic mobile genetic elements enabling dynamic lateral gene flow // Nat Rev Microbiol. 2010. Vol. 8, N 8. P. 552–563. doi: 10.1038/nrmicro2382
- Mavian C., Paisie T.K., Alam M.T., et al. Toxigenic Vibrio choleraе evolution and establishment of reservoirs in aquatic ecosystems // Proc Natl Acad Sci USA. 2020. Vol. 117, N 14. P. 7897–7904. doi: 10.1073/pnas.1918763117
- Москвитина Э.А., Янович Е.Г., Куриленко М.Л., и др. Холера: мониторинг эпидемиологической обстановки в мире и России (2010–2019 гг.). Прогноз на 2020 г. // Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 2. С. 38–47. doi: 10.21055/0370-1069-2020-2-38-47
- Методические указания 4.2.2495-09 «Определение чувствительности возбудителей опасных бактериальных инфекций (чума, сибирская язва, холера, туляремия, бруцеллез, сап, мелиоидоз) к антибактериальным препаратам». Москва, 2009. 59 с.
- Кругликов В.Д., Левченко Д.А., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б. ПЦР-генотипирование нетоксигенных штаммов холерных вибрионов как один из подходов их актуализации в плане эпиднадзора за холерой // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2018. № 2. С. 28–35. doi: 10.18565/epidem.2018.2.28-35
- Селянская Н.А., Егиазарян Л.А., Ежова М.И., и др. Анализ устойчивости к антибактериальным препаратам холерных вибрионов, выделенных из объектов окружающей среды в России в 2019 г. // Антибиотики и химиотерапия. 2021. Т. 66, № 3-4. С. 4–11. doi: 10.37489/0235-2990-2021-66-3-4-4-11
- Abana D., Gyamfi E., Dogbe M., et al. Investigating the virulence genes and antibiotic susceptibility patterns of Vibrio cholerae O1 in environmental and clinical isolates in Accra, Ghana // BMC Infect Dis. 2019. Vol. 19, N 1. P. 76. doi: 10.1186/s12879-019-3714-z
- Fu H., Yu P., Liang W., et al. Virulence, resistance, and genomic fingerprint traits of vibrio cholerae isolated from 12 species of aquatic products in shanghai, China // Microb Drug Resist. 2020. Vol. 26, N 12. P. 1526–1539. doi: 10.1089/mdr.2020.0269
- Verma J., Bag S., Saha B., et al. Genomic plasticity associated with antimicrobial resistance in Vibrio cholerae // Proc Natl Acad Sci USA. 2019. Vol. 116, N 13. P. 6226–6231. doi: 10.1073/pnas.1900141116
- Das B., Verma J., Kumar P., et al. Antibiotic resistance in Vibrio cholerae: Understanding the ecology of resistance genes and mechanisms // Vaccine. 2020. Vol. 38, Suppl. 1. P. A83–A92. doi: 10.1016/j.vaccine.2019.06.031
- Imamura D., Morita M., Sekizuka T., et al. Comparative genome analysis of VSP-II and SNPs reveals heterogenic variation in contemporary strains of Vibrio cholerae O1 isolated from cholera patients in Kolkata, India // PLoS Negl Trop Dis. 2017. Vol. 11, N 2. P. e0005386. doi: 10.1371/journal.pntd.0005386
Дополнительные файлы
