Детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах Vibrio spp., выделенных на территории Волгоградской области


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В настоящей работе установлено присутствие интегративных конъюгативных элементов (ICEs) семейства SXT/R391 в штаммах Vibrio spp., выделенных из воды открытых водоемов на территории Волгоградской области в период 2003-2014 г. В составе ICEs штаммов V. cholerae non-O1/non-O139 серогрупп идентифицированы гены резистентности к триметоприму (dfr18), стрептомицину (strB), сульфометаксазолу (sulII). У ICEs штаммов Vibrio spp., не относящихся к виду V. cholerae, обнаружен другой вариант гена дигидрофолатредуктазы - dfrA1, локализованный вне кластера. Полученные результаты показывают, что штаммы водной вибриофлоры могут быть потенциальными резервуарами генов резистентности.

Об авторах

Ирина Борисовна Захарова

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

Email: zib279@gmail.com
канд. биол. наук, зав. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Юлия Александровна Кузютина

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Мария Васильевна Подшивалова

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Антон Александрович Замарин

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Андрей Владимирович Топорков

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

доктор мед. наук, директор ФКУЗ Волгоградский научноисследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Дмитрий Викторович Викторов

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

доктор биол. наук, доцент, зам. директора по научно-экспериментальной работе ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Список литературы

  1. Thompson F.L., Iida T., Swings J. Biodiversity of vibrios. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004; 68: 403-31.
  2. MacDonald D., Demarre G., Bouvier M., Mazel D., Gopaul D.N. Structural basis for broad DNA-specificity in integron recombination. Nature. 2006; 440: 1157-62.
  3. Mazel D. Integrons: agents of bacterial evolution. Nature Rev. Microbiol. 2006; 4: 608-20.
  4. Rodríguez-Blanco A., Lemos M., Osorio C. Integrating conjugative elements as vectors of antibiotic, mercury, and quaternary ammonium compound resistance in marine aquaculture environments. Antimicrob. Agents Chemother. 2012; 56 (5): 2619-26.
  5. Gillings M., Boucher Y., Labbate M., Holmes A., Krishnan S., Holley M., Stokes H.W. The evolution of class 1 integrons and the rise of antibiotic resistance. J. Bacteriol. 2008; 190 (4): 5095-100.
  6. Waldor M., Tschäpe H., Mekalanos J. A new type of conjugative transposon encodes resistance to sulfamethoxazole, trimethoprim, and streptomycin in Vibrio cholerae O139. J. Bacteriol. 1996; 178 (14); 4157-65.
  7. Burrus V., Marrero J., Waldor M. The current ICE age: biology and evolution of SXT-related integrating conjugative elements. Plasmid. 2006; 55 (3): 173-83.
  8. Wozniak R.A., Fouts D.E., Spagnoletti M., Colombo M.M., Ceccarelli D., Garriss G. et al. Comparative ICE genomics: insights into the evolution of the SXT/R391 family of ICEs. PLoS Genet. 2009; 5 (12): e1000786. doi: 10.1371/journal.pgen.1000786.
  9. Захарова И.Б., Викторов Д.В. Интегративные конъюгативные элементы микроорганизмов (ICEs). Молекул. генетика. 2015; 33 (3): 9-16.
  10. Подшивалова М.В., Кузютина Ю.А., Захарова И.Б. Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2014; (3): 34-9.
  11. Тетерятникова Н.Н., Захарова И.Б., Подшивалова М.В., Романова А.В., Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Молекулярная детекция интегронов класса 1 у Burkholderia pseudomallei. Проблемы особо опасных инфекций. 2011; [2 (108)]: 46-9.
  12. Hochhut B., Lotfi Y., Mazel D., Faruque S. M., Woodgate R. Molecular analysis of antibiotic resistance gene clusters in Vibrio cholerae O139 and O1 SXT constins. Antimicrob. Agents Chemother. 2001; 45: 2991-3000.
  13. Ramachandran D., Bhanumathi R., Singh D.V. Multiplex PCR for detection of antibiotic resistance genes and the SXT element: application in the characterization of Vibrio cholerae. J. Med. Microbiol. 2007; 56: 346-51.
  14. Burrus V., Quezada-Calvillo R., Marrero J., Waldor M.K. SXTrelated integrating conjugative element in new world Vibrio cholerae. Appl. Environ. Microbiol. 2006; 72: 3054-7.
  15. Kitiyodom S., Khemtong S., Wongtavatchai J., Chuanchuen R. Characterization of antibiotic resistance in Vibrio spp. isolated from farmed marine shrimps (Penaeus monodon). FEMS Microbiol. Ecol. 2010; 72: 219-27.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-вектор", 2016


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».