Assessment of clinical data and the species composition of pathogens in the upper respiratory tract of patients with COVID-19 and determination of sensitivity to essential etiotropic drugs

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Objective. To comparatively analyze the clinical and microbiological data of outpatients with COVID-19 who took a bacteriophage-based drug and who did not.

Subjects and methods. The investigation involved 42 outpatients with COVID-19 who were divided into two groups: a study group of 30 patients who received standard therapy for COVID-19, as well as an oral bacteriophage-based drug (15 ml thrice a day for 10 days); a control group of 12 patients who had only the standard COVID-19 therapy. After 10 days of therapy, the clinical manifestations of the disease were comparatively evaluated in the examined groups. A repeated study of the material for bacterial microflora to assess the eradication of the pathogenic microflora in the respiratory tract was conducted on day 21 after the start of therapy.

Results. Klebsiella pneumoniae (77%), Staphylococcus aureus (17%), and streptococci (Streptococcus agalactiae and Streptococcus pyogenes) (6%) were identified in the structure of bacterial pathogens in patients with COVID-19. Microbiological monitoring revealed multidrug-resistant K. pneumoniae in 50% of the patients; that sensitive to antibiotics in 26.7% of cases and that sensitive to a bacteriophage in 100%. The investigation results showed that the use of a polyvalent K. pneumoniae bacteriophage in patients with COVID-19 to prevent bacterial complications contributed to a significant (p < 0.001) elimination of K. pneumoniae. The pathogen isolation rate in the study group decreased significantly (p < 0.001). Thus, the use of phage therapy in combination with etiotropic therapy can be recommended to prevent bacterial complications in patients with COVID-19.

About the authors

S. V. Dolinny

V.P. Demikhov City Clinical Hospital, Moscow Healthcare Department

Email: olgaburgasova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0690-2174
Russian Federation, Moscow

L. A. Kraeva

Pasteur Research Institute of Epidemiology and Microbiology

Email: olgaburgasova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9115-3250

Doctor of Medical Sciences, Professor

Russian Federation, Saint Petersburg

O. A. Burgasova

Peoples’ Friendship University of Russia

Author for correspondence.
Email: olgaburgasova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5486-0837

Doctor of Medical Sciences, Professor

Russian Federation, Moscow

D. A. Ogarkova

N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology

Email: olgaburgasova@mail.ru
Russian Federation, Moscow

References

  1. Chen N., Zhou M., Dong X. et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet. 2020; 395 (10223): 507–13. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30211-7
  2. Bychinin M.V., Antonov I.O., Klypa T.V. et al. Nosocomial Infection in Patients with Severe and Critical COVID-19. General Reanimatology. 2022; 18 (1): 4–10 (in Russ.). doi: 10.15360/1813-9779-2022-1-4-10
  3. Kutsevalova O.Yu., Pokudina I.O., Rozenko D.A., et al. Modern problems of antibiotic resistance gram-negative nosocomial infections in the Rostov Region. Medical Herald of the South of Russia. 2019; 10 (3): 91–6 (in Russ.). doi: 10.21886/2219-8075-2019-10-3-91-96
  4. Vremennye metodicheskie rekomendatsii. Profilaktika, diagnostika i lechenie novoi koronavirusnoi infektsii (COVID-19). Versiya 7 ot 03.06.2020. M.: Minzdrav Rossii (in Russ.). URL: https://static-0.rosminzdrav.ru/system/attachments/attaches/000/050/584/original/03062020_%D0%9CR_COVID-19_v7.pdf
  5. Seligman R., Ramos-Lima L.F., Oliveira Vdo A. et al. Risk factors for infection with multidrug-resistant bacteria in non-ventilated patients with hospital-acquired pneumonia. J Bras Pneumol. 2013; 39 (3): 339–48. doi: 10.1590/S1806-37132013000300011
  6. De Vos P., Garrity G.M., Jones D. et al. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed. Springer, New York, 2009.
  7. Murray P.R. et al. Manual of Clinical Microbiology (2 Volume Set). Elsevier Science, 2007.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. The proportion of the K. pneumoniae strains sensitive to antibacterial drugs and a bacteriophage (Klebsiella polyvalent), which were isolated from the patients of both groups

Download (130KB)

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».