Преспективы использования протеомных технологий в диагностике ИППП и заболеваний кожи


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Представлены данные литературы, освещающие современные методы диагностики сифилиса, применяемые в Россий-
ской Федерации. Описана основная методическая база протеомики, приведены результаты применения протеомных
технологий в диагностике заболеваний, в том числе инфекционных, дана оценка перспектив и возможностей использо-
вания прямого протеомного профилирования для разработки нового метода диагностики сифилитической инфекции.

Об авторах

Н В КИТАЕВА

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

ведущий научный сотрудник отделения сифилидологии, д.м.н; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

Н В ФРИГО

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

главный научный сотрудник, заведующая отделом лабораторной диагностики ИПППи болезней кожи, д.м.н; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

С В РОТАНОВ

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

ведущий научный сотрудник отделения лабораторной диагностики сифилиса отделалабораторной диагностики ИППП и болезней кожи, д.м.н., доцент; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

Р Ф ХАЙРУЛИН

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

младший научный сотрудник отделения микробиологических методов диагностики; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

Список литературы

  1. Дмитриев Г. А., Фриго Н. В. Сифилис. Дифференциальный клинико-лабораторный диагноз М.: Мед. книга, 2004.
  2. Johnson P. C., Farnie M. A.; Testing for syphilis. Dermatol Clin; 1994;12 (1); 9-17.
  3. Ресурсы и деятельность кожно-венерологических учреждений. Заболеваемость за 2002-2006 годы. Статистические материалы, М., 2003, 2004, 2005, 2006, 2007.
  4. Pangborn M. C.; A new serologically active phospholipids from beef heart. Proc Soc Exp Biol Med; 1949; 48 484-486.
  5. Приказ Минздрава Российской Федерации № 87 от 26.03.01 «О совершенствовании серологической диагностики сифилиса».
  6. Jurado R. L., Campbell J., Martin P. D.; Prozone phenomenon in secondary syphilis. Has its time arrived? Arch Intern Med; 1993;153 (21); 2496-2498.
  7. Говорун В. М., Арчаков А. И. Протеомные технологии в современной биомедицинской науке. Биохимия; 2002; 67 (10); 1341-1359.
  8. Czelusta A., Yen-Moore A., Van Der Straten M., et al.; An overview of sexually transmitted diseases. Part III. Sexually transmitted diseases in HIV-infected patients. J Am Acad Dermatol; 2000; 43 (3); 409-432; 433-406.
  9. Неспецифические положительные результаты серологических реакций на сифилис. Количественные модификации современных серологических реакций. Методические рекомендации. М., 1990.
  10. Nelson R. A., Mayer M. M.; Immobilization of treponema pallidum in vitro by antibody produced in syphilitic infection. The Journal of Experimental Medicine; 1949;89 (4); 369-393.
  11. Резайкина А. В. РИФ-абс с сывороткой крови, РИФц и РСК на холоде с ликвором в выявлении сифилиса среди соматических больных и декретированных контингентов: Автореф. дисс. канд. мед. наук. М.; 1979.
  12. Пшеничная Л. А. Материалы к изучению возможности выпадения ложноположительных результатов реакции иммобилизации бледных трепонем при некоторых хронических заболеваниях несифилитической этиологии.: Автореф. дисс. канд. мед. наук. М.; 1971
  13. Anderson R. I., Kent J. F., Sanders R. W.; Frozen syphilomatous rabbit testes as source of Treponema pallidum for the immobilization (TPI) test for syphilis. Am J Syph Gonorrhea Vener Dis; 1954; 38 (6); 527-530.
  14. Kern A.; Die problematic und Bedeutung der unspezifisch positiven- Reactionen in der Lues Serologie Derm Wschr 145 (25); 633.
  15. White M. Y., Van Eyk J. E.; Cardiovascular proteomics: past, present, and future. Mol Diagn Ther 2007;11 (22); 83-95.
  16. Дмитриев Г. А., Брагина Е. Е. Современные методы лабораторной диагностики сифилиса. Часть II. Вестн. дерматол., 1996; 3 33-38.
  17. Zhang Z., Bast R. C., Y. Y., et al.; Three Biomarkers Identified from Serum Proteomic Analysis for the Detection of Early Stage Ovarian Cancer. Cancer Research; 2004; 64 (16); 5882-5890.
  18. Беднова В. Н., Дмитриев Г. А., Бабий А. В. и др. Новая тест- система ИФА на сифилис. Вестн. дерматол. венерол.; 1994; 4 51.
  19. Рассказов Н. И., Ермолин Г. А., Чалов В. В. и др. Применение иммуноферментного анализа для регистрации специфических IgM-антител у больных сифилисом. Вестн. дерматол. венерол. 1990; 11 12-16.
  20. Backhouse J. L., Nesteroff S. I.; Treponema pallidum western blot: comparison with the FTA-ABS test as a confirmatory test for syphilis. Diagn Microbiol Infect Dis; 2001;39 (1); 9-14.
  21. Кубанова А. А., Фриго Н. В., Ротанов С. В., и др. Применение метода иммуноблоттинга для диагностики сифилиса с по-мощью коммерческой тест-системы INNO-LIA™ Syphilis Score. M.: 2005. 48.
  22. Ляхов В. Ф. Разработка иммуноферментного ловушечного метода определения IgM и IgG антител при сифилисе с помощью пероксидазного трепонемного конъюгата: Автореф. дисс. канд. мед. наук. М.; 1991.
  23. Scarlett C. J., Saxby A. J., Nielsen A., et al.; Proteomic profiling of cholangiocarcinoma: Diagnostic potential of SELDI-TOF MS in malignant bile duct stricture. Hepatology; 2006; 44 (3); 658-666.
  24. Рассказов Н. И., Ермолин Г. А., Ефремов Е. Е., и др. Возможные механизмы формирования ложной позитивности в иммуноферментном анализе. Вестн. дерматол. 1988;4 26-29.
  25. Сидорова Е. В., Ляхов В. Ф.; Значение определения противотрепонемных IgM - антител в серодиагностике сифилиса. ЗППП 1995; 4 11-14.
  26. Lobos P., Ortega R., Vera C., et al.; Prevalencia de serología falsa positiva para sífilis en una población de embarazadas. Rev Med Chil; 1992;120 (10); 1121-1126.
  27. Rawstron S. A., Mehta S., Marceffino L. E. A.; Congenital syphilis and fluorescent treponemal antibody test reactivity after the age of 1 year Sex. Transm. Dis; 1994; 280 319-324.
  28. Беднова В. Н., Тимченко Г. Ф. Сравнительное изучение РПГА с диагностикумами из патогенных и культуральных бледных трепонем при различных формах сифилиса. Вестн. дермат., 1987; 4 43-45.
  29. Дмитриев Г. А., Тимченко Г. Ф. Современное состояние реакции пассивной гемагглютинации в серодиагностике сифилиса. В кн. Кожные и венерические болезни. Сборник научных работ сотрудников ЦКВИ, посвященный 75-летию института. М.: 1996. 171-175.
  30. Лечение и профилактика сифилиса. Методические указания. М., 1999.
  31. Luger A. F., Schmidt B. L., Kaulich M.; Significance of laboratory findings for the diagnosis of neurosyphilis. Int J STD AIDS; 2000;11 (4); 224-234.
  32. Титов В. Н., Дугин С. Ф., Крылин В. В. Протеомика, метаболомика и будущее клинической лабораторной диагностики (лекция) КЛД; 2007; 1 23-34.
  33. Anderson N. L., Anderson N. G.; The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics; 2002;1 (11); 845-867.
  34. Дынник О. Б., Залесский В. Н. Современные биоаналитические (протеомные) технологии в лабораторной диагностике ревматических заболеваний. Укр. ревм. журнал, 2006; 2 (24); 17-24.
  35. Arevalo-Ferro C., Hentzer M., Reil G., et al.; Identification of quorum-sensing regulated proteins in the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa by proteomics. Environ Microbiol; 2003; 5 (12); 1350-1369.
  36. Liberatori S., Bini L., De Felice C., et al.; Acute-phase proteins in perinatal human plasma. Electrophoresis; 1997; 18 (3-4); 520-526.
  37. Власова М. А., Мошковский С. А., Сафарова М. Р. Молекулярная диагностика рака яичника с использованием протеомных технологий. Биомедицинская химия; 2005; 51 (4); 367-383.
  38. Weber G. F. U.; Kasuistischer Beitrag zur Unspezifitat des «Nelson- Testes» bie der Lues lateens. Z Hautkr 1973; 48 (18); 775-778.
  39. Humphery-Smith I., Cordwell S. J., Blackstock W. P.; Proteome research: complementarity and limitations with respect to the RNA and DNA worlds. Electrophoresis; 1997; 18 (8); 1217-1242.
  40. Link A. J. 2-D Proteome Analysis Protocols. New Jersey Humana Press; 1999.
  41. Matsui N. M., Smith-Beckerman D. M., Fishman J., et al. 2-D Proteome Analysis Protocols. New Jersey Humana Press; 1999.
  42. G. Y., W. S.-L., Meyer J. L., et al.; Proteomic Analysis of High- Grade Dysplastic Cervical Cells Obtained from ThinPrep Slides Using Laser Capture Microdissection and Mass Spectrometry. Journal of Proteome Research; 2007; 6 (11); 4256-4268.
  43. Link A. J., Eng J., Schieltz D. M., et al.; Direct analysis of protein complexes using mass spectrometry. Nat Biotechnol; 1999; 17 (7); 676-682.
  44. Issaq H. J., Veenstra T. D., Conrads T. P., et al.; The SELDI-TOF MS approach to proteomics: protein profiling and biomarker identification. Biochem Biophys Res Commun; 2002; 292 (3); 587-592.
  45. Veldkamp J., Visser A. M.; Application of Enzyme - linked Immunosorbent Assay (ELISA) in the serodiagnosis of syphilis. Br J Veneral Dis 1975; 51 227-231.
  46. Van Baar B. L.; Characterisation of bacteria by matrix-assisted laser desorption/ionisation and electrospray mass spectrometry. FEMS Microbiol Rev; 2000; 24 (2); 193-219.
  47. Diamandis E. P.; Point: Proteomic patterns in biological fluids: do they represent the future of cancer diagnostics? Clin Chem; 2003; 49 (8); 1272-1275.
  48. Young H.; Guidelines for serological testing for syphilis. Sexually transmitted infections; 2000; 76 (5); 403-405.
  49. Takikawa M., Akiyama Y., Maruyama K., et al.; Proteomic analysis of a highly metastatic gastric cancer cell line using two-dimensional differential gel electrophoresis. Oncol Rep 2006; 16 (4); 705-711.
  50. Melle C., Bogumil R., Ernst G., et al.; Detection and identification of heat shock protein 10 as a biomarker in colorectal cancer by protein profiling. PROTEOMICS; 2006;6 (8); 2600-2608.
  51. Holt G. E., Schwartz H. S., Caldwell R. L.; Proteomic profiling in musculoskeletal oncology by MALDI mass spectrometry. Clin Orthop Relat Res; 2006; 450 105-110.
  52. Faca V., Krasnoselsky A., Hanash S.; Innovative proteomic approaches for cancer biomarker discovery. Biotechniques; 2007; 43 (3); 279, 281-273, 285.
  53. Banerjee H. N., Verma M.; Use of nanotechnology for the development of novel cancer biomarkers. Expert Rev Mol Diagn; 2006; 6 (5); 679-683.
  54. Downes M. R., Byrne J. C., Dunn M. J., et al.; Application of proteomic strategies to the identification of urinary biomarkers for prostate cancer: a review. Biomarkers; 2006; 11 (5); 406-416.
  55. Lim M. S., Elenitoba-Johnson K. S.; Mass spectrometry-based proteomic studies of human anaplastic large cell lymphoma. Mol Cell Proteomics; 2006; 5 (10); 1787-1798.
  56. Sinz A., Bantscheff M., Mikkat S., et al.; Mass spectrometric proteome analyses of synovial fluids and plasmas from patients suffering from rheumatoid arthritis and comparison to reactive arthritis or osteoarthritis. Electrophoresis; 2002; 23 (19); 3445-3456.
  57. Trcka J., Kunz M.; Functional Genome and Proteome Analyses of Cutaneous Autoimmune Diseases. Curr Pharm Des 2006; 12 (29); 3787-3798.
  58. Wasinger V. C., Cordwell S. J., Cerpa-Poljak A., et al.; Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium. Electrophoresis; 1995; 16 (1); 1090-1094.
  59. Randolph T. W., Mitchell B. L., Mclerran D. F.; Quantifying peptide signal in MALDI-TOF mass spectrometry data. Mol Cell Proteomics; 2005; 4 (12); 1990-1999.
  60. Zhou L., Cheng L., Tao L., et al.; Detection of hypopharyngeal squamous cell carcinoma using serum proteomics. Acta Oto-laryngologica; 2006; 126 (8); 853-860.
  61. Vlahou A., Schorge J. O., Gregory B. W., et al.; Diagnosis of Ovarian Cancer Using Decision Tree Classification of Mass Spectral Data. J Biomed Biotechnol.; 2003; 5 308-314.
  62. Howard B. A., Wang M. Z., Campa M. J., et al.; Identification and validation of a potential lung cancer serum biomarker detected by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight spectra analysis. PROTEOMICS; 2003; 3 (9); 1720-1724.
  63. Khan N., Cromer C. J., Campa M., et al.; Clinical utility of serum amyloid A and macrophage migration inhibitory factor as serum biomarkers for the detection of nonsmall cell lung carcinoma. Cancer; 2004; 101 (2); 379-384.
  64. Kimura M., Tomita Y., Imai T., et al.; Significance of serum amyloid A on the prognosis in patients with renal cell carcinoma. Cancer; 2001; 92 (8); 2072-2075.
  65. Chait A., Han C. Y., Oram J. F., et al.; Thematic review series: The immune system and atherogenesis. Lipoprotein-associated inflammatory proteins: markers or mediators of cardiovascular disease? J Lipid Res; 2005; 46 (3); 389-403.
  66. Emanuel F. P., Ali M. A., Ben A. H., et al.; Use of proteomic patterns in serum to identify ovarian cancer. The Lancet; 2002; 359 (9306); 572-577.
  67. Cho W. C. S., Yip T. T. C., Yip C., et al.; Identification of Serum Amyloid A Protein As a Potentially Useful Biomarker to Monitor Relapse of Nasopharyngeal Cancer by Serum Proteomic Profiling. Clinical Cancer Research; 2004; 10 (1); 43-52.
  68. Massion P. P., Caprioli R. M.; Proteomic strategies for the characterization and the early detection of lung cancer. J Thorac Oncol; 2006; 1 (9); 1027-1039.
  69. Stockwin L. H., Blonder J., Bumke M. A., et al.; Proteomic Analysis of Plasma Membrane from Hypoxia-Adapted Malignant Melanoma. Journal of Proteome Research; 2006; 5 (11); 2996-3007.
  70. Ohshiro K., I. R. D., Koomen J. M., et al.; Pre-analytic saliva processing affect proteomic results and biomarker screening of head and neck squamous carcinoma. International journal of oncology; 2007; 30 (3); 743-749.
  71. Mian S., Ugurel S., Parkinson E., et al.; Serum Proteomic Fingerprinting Discriminates Between Clinical Stages and Predicts Disease Progression in Melanoma Patients. Journal of Clinical Oncology; 2005; 23 (22); 5088-5093.
  72. Xiang Y., Sekine T., Nakamura H., et al.; Proteomic surveillance of autoimmunity in osteoarthritis: Identification of triosephosphate isomerase as an autoantigen in patients with osteoarthritis. Arthritis & Rheumatism; 2004; 50 (5); 1511-1521.
  73. Drake R. R., Cazare L. H., Semmes O. J., et al.; Serum, salivary and tissue proteomics for discovery of biomarkers for head and neck cancers. Expert Rev Mol Diagn; 2005; 5 (1); 93-100.
  74. Carlen L. M., Sanchez F., Bergman A. C., et al.; Proteome analysis of skin distinguishes acute guttate from chronic plaque psoriasis. J Invest Dermatol; 2005; 124 (1); 63-69.
  75. Hueber W., Robinson W. H.; Proteomic biomarkers for autoimmune disease. PROTEOMICS; 2006; 6 (14); 4100-4105.
  76. Turner M. W.; Mannose-binding lectin: the pluripotent molecule of the innate immune system. Immunology Today; 1996; 17 (11); 532-540.
  77. Feghali-Bostwick C. A.; Genetics and proteomics in scleroderma. Curr Rheumatol Rep; 2005; 7 (2); 129-134.
  78. Lucchese A., Willers J., Mittelman A., et al.; Proteomic scan for tyrosinase peptide antigenic pattern in vitiligo and melanoma: role of sequence similarity and HLA-DR1 affinity. J Immunol; 2005; 175 (10); 7009-7020.
  79. X. W. H., Chen Y. D., H. Y., et al.; Preoperatively molecular staging with CM10 ProteinChip and SELDI-TOF-MS for colorectal cancer patients. Journal of Zhejiang University. Science. B; 2006; 7 (3); 235-240.
  80. Andrew B. S., James L. M., Susan J. M., et al.; Expression of Annexin I, II and VII Proteins in Androgen Stimulated and Recurrent Prostate Cancer. The Journal of urology; 2004; 171 (2); 916-920.
  81. Rathlev T.; Haemagglutination test utilizing pathogenic Treponema pallidum for the sero-diagnosis of syphilis. The British journal of venereal diseases; 1967; 43 (3); 181-185.
  82. Wilson L. L., Tran L., Morton D. L., et al.; Detection of Differentially Expressed Proteins in Early-Stage Melanoma Patients Using SELDI-TOF Mass Spectrometry. Annals of the New York Academy of Sciences; 2004; 1022 (1); 317-322.
  83. Chen J. H., Chang Y. W., Yao C. W., et al.; Plasma proteome of severe acute respiratory syndrome analyzed by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry. Proc Natl Acad Sci U S. A; 2004; 101 (49); 17039-17044.
  84. Eckersall P. D., Duthie S., Toussaint M. J., et al.; Standardization of diagnostic assays for animal acute phase proteins. Adv Vet Med; 1999; 41 643-655.
  85. Eisen D. P., Minchinton R. M.; Impact of mannose-binding lectin on susceptibility to infectious diseases. Clin Infect Dis; 2003; 37 (11); 1496-1505.
  86. Hartshorn K. L., Sastry K., White M. R., et al.; Human mannosebinding protein functions as an opsonin for influenza A viruses. J Clin Invest; 1993; 91 (4); 1414-1420.
  87. Uchida T., Fukawa A., Uchida M., et al.; Application of a Novel Protein Biochip Technology for Detection and Identification of Rheumatoid Arthritis Biomarkers in Synovial Fluid. Journal of Proteome Research; 2002; 1 (6); 495-499.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© КИТАЕВА Н.В., ФРИГО Н.В., РОТАНОВ С.В., ХАЙРУЛИН Р.Ф., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».