Microbial community composition and methanotroph diversity of a subarctic wetland in Russia


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

This study assessed the microbial diversity, activity, and composition of methane-oxidizing communities of a subarctic wetland in Russia with mosaic cover of Sphagnum mosses and lichens of the genera Cladonia and Cetraria. Potential methane-oxidizing activity of peat sampled from lichen-dominated wetland sites was higher than that in the sites dominated by Sphagnum mosses. In peat from lichen-dominated sites, major bacterial groups identified by high-throughput sequencing of the 16S rRNA genes were the Acidobacteria (35.4–41.2% of total 16S rRNA gene reads), Alphaproteobacteria (19.1–24.2%), Gammaproteobacteria (7.9–11.1%), Actinobacteria (5.5–13.2%), Planctomycetes (7.2–9.5%), and Verrucomicrobia (5.1–9.5%). The distinctive feature of this community was high proportion of Subdivision 2 Acidobacteria, which are not characteristic for boreal Sphagnum peat bogs. Methanotrophic community composition was determined by molecular analysis of the pmoA gene encoding particulate methane monooxygenase. Most (~80%) of all pmoA gene fragments revealed in peat from lichen-dominated sites belonged to the phylogenetic lineage represented by a microaerobic spiral-shaped methanotroph, “Candidatus Methylospira mobilis”. Members of the genus Methylocystis, which are typical inhabitants of boreal Sphagnum peat bogs, represented only a minor group of indigenous methanotrophs. The specific feature of a methanotrophic community in peat from lichen-dominated sites was the presence of uncultivated USCα (Upland Soil Cluster alpha) methanotrophs, which are typical for acidic upland soils showing atmospheric methane oxidation. The methanotrophic community composition in lichen-dominated sites of a tundra wetland, therefore, was markedly different from that in boreal Sphagnum peat bogs.

Об авторах

O. Danilova

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology

Email: info@pleiadesonline.com
Россия, Moscow

S. Belova

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology

Email: info@pleiadesonline.com
Россия, Moscow

I. Gagarinova

Center for Arctic Research

Email: info@pleiadesonline.com
Россия, Nadym

S. Dedysh

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology

Email: info@pleiadesonline.com
Россия, Moscow

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Ltd., 2016

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».