Coevolution of Thermoreceptor Genes of the TRP Family in 15 Populations of the Altai-Sayan Region, Western Siberia and the Far East

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The analysis of the TRPV3 thermoreceptor gene (rs322937) was carried out in 15 population samples (1503 people) belonging to different language groups living in the regions of the Altai-Sayan Highlands, Western Siberia, the Far East and Canada. The highest frequency of the rare allele was found in the Yakuts (42.9%), and the lowest in the Eskimos (10.7%) and Evenks (10.8%). Deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were found in the population of Siberian Tatars. The greatest interpopulation differences were found between the Yakuts and Evenks, and the smallest between the Kazakhs, Telengits and Khakass, Telengits and Tatars, Khakass and Nanai, Tuvans and Northern Altaians. Transassociation of polymorphic loci of the TRPV1, TRPA1, TRPM8 and TRPV3 genes was carried out using the regression analysis method. Of the six pairs, a positive correlation was found in 3: TRPA1/TRPV3, TRPV3/TRPV1 and TRPV1/TRPM8. Thus, the TRPV3 gene studied by us is positively correlated with TRPV1 and TRPA1 and negatively with TRPM8. The results obtained may indicate different selective pressure in different geographical areas determined by climatic factors.

About the authors

M. A Gubina

Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: marina@bionet.nsc.ru
Novosibirsk, Russia

V. N Babenko

Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Novosibirsk, Russia

A. Yu Gubina

Novosibirsk State Medical University

Novosibirsk, Russia

References

  1. Clapham D.E. TRP channels as cellular sensors // Nature. 2003. V. 426. P. 517–552. https://doi.org/10.1038/nature02196
  2. Clapham D.E., Julius D., Montell C., Schultz G. International union of pharmacology. XLIX. Nomenclature and structure-function relationships of transient receptor potential channels // Pharmacol. Rev. 2005. V. 57. № 4. P. 427–450. https://doi.org/10.1124/pr.57.4
  3. Mulier M., Vriens J., Voets T. TRP channel pores and local calcium signals // Cell Calcium. 2017. V. 66. P. 19–24. doi.org/10.1016/j.ceca.2017.04.007
  4. Smani T., Shapovalov G., Skryma R. et al. Functional and physiopathological implications of TRP channels // Biochim. Biophys. Acta. 2015. V. 1853. P. 1772–1782. https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2015.04.016
  5. Nilius B., Owsianik G., Voets T., Peters J. Transient receptor potential cation channels in disease // Physiol. Rev. 2007. V. 7. P. 165–217. https://doi.org/10.1152/physrev.00021.2006
  6. Caterina M.J., Schumacher M.A., Tominaga M. et al. The capsaicin receptor: A heat-activated ion channel in the pain pathway // Nature. 1997. V. 389. P. 816–824. https://doi.org/10.1038/39807
  7. Liu B., Qin F. Single-residue molecular switch for high-temperature dependence of vanilloid receptor TRPV3 // Proc. Natl Acad Sci. USA. 2017. V. 114. P. 1589–1594. https://doi.org/10.1073/pnas.1615304114
  8. Peier A.M., Reeve A.J., Andersson D.A. et al. A heat-sensitive TRP channel expressed in keratinocytes // Science. 2002. V. 296. P. 2046–2049. https://doi.org/10.1126/science.1073140
  9. Xu H., Ramsey I.S., Kotecha S.A. et al. TRPV3 is a calcium-permeable temperature-sensitive cation channel // Nature. 2002. V. 418. P. 181–186. https://doi.org/10.1038/nature00882
  10. Smith G.D., Gunthorpe M.J., Kelsell R.E. et al. TRPV3 is a temperature-sensitive vanilloid receptor-like protein // Nature. 2002. V. 418. P. 186–190. https://doi.org/10.1038/nature00894
  11. McKemy D.D., Neuhausser W.M., Julius D.D. Identification of a cold receptor reveals a general role for TRP channels in thermosensation // Nature. 2002. V. 416. P. 52–58. https://doi.org/10.1038/nature719
  12. Peier A.M., Moqrich A., Hergarden A.C. et al. A TRP channel that senses cold stimuli and menthol // Cell. 2002. V. 108. P. 705–715. https://doi.org/10.1016/s0092-8674(02)00652-9
  13. Story G.M., Peier A.M., Reeve A.J. et al. ANKTM1, a TRP-like channel expressed in nociceptive neurons, is activated by cold temperatures // Cell. 2003. V. 112. P. 819–829. https://doi.org/10.1016/s0092-8674(03)00158-2
  14. Губина М.А., Орлов П.С., Бабенко В.Н. и др. Полиморфизм генов терморецепторов TRPV1 и TRPA1 человека в популяциях Алтае-Саянского региона и Дальнего Востока // Генетика. 2018. Т. 54. № 2. С. 243–252.
  15. Губина М.А., Бабенко В.Н., Губина Е.Ю. Исследование полиморфного варианта гена холодового рецептора TRPM8 (rs7593557) в 15 популяциях Алтае-Саянского региона, Западной Сибири и Дальнего Востока // Генетика. 2024. Т. 60. № 8. С. 74–81.
  16. Ruhlen M.A. Guide to the World’s Languages. Classification. London, UK: Edward Arnold, 1991. 495 p.
  17. Greenberg J. Indo-European and its Closest Elatives: The Еurasiatic Family: Grammar. Stanford, CA: Stanford Univ. Рress, 2000. 345 p.
  18. Maniatis T., Fritsch E.E., Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab., 1982. 545 p.
  19. Excoffier L., Lischer H.E. Arlequin suite ver. 3.5: А new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows // Mol. Ecol. Res. 2010. V. 10. P. 564–567. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x
  20. XLSTAT | Statistical Software for Excel – http://xlstat.com
  21. The 1000 Genomes Project Consortium. A global reference for human genetic variation // Nature. 2015. V. 526. P. 68–74. https://doi.org/10.1038/nature15393

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».