Study of a Polymorphic Variant of the Cold Receptor Gene Trpm8 (rs7593557) in 15 Populations of the Altai-Sayan Region and the Far East

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

The thermoreceptor gene TRPM8 (rs7593557) was analyzed in 15 population samples living in different regions of Northern Asia, the Altai-Sayan Highlands and Canada. High frequencies of a rare genotype and allele in the populations of the Altai-Sayan region and Western Siberia were found among the Telengits (22.2 and 41.7% respectively), low among the Siberian Tatars (3.2 and 18.5% respectively), and among the peoples of northern Siberia and the Far East high frequency was found among the Nanais (22.2 and 42.6% respectively), and a low frequency among the Yakuts (1.1 and 10.9% respectively). No deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were found. Trans-association of TRPV1, TRPA1 and TRPM8 gene polymorphisms was carried out using the regression analysis method in 14 populations. Of all three pairs, only one, TRPV1/TRPM8, showed a positive correlation (0.55, df = 13, P-value – 0.032). In pairs TRPV1/TRPA and TRPA1/TRPM8, a negative correlation was revealed (–0.545, df = 13, P-value – 0.048) and (–0.46, df = 13, P-value – 0.097) respectively. Our data indicate that the studied polymorphisms of the TRPV1 and TRPM8 genes are correlated with each other and negatively correlated with TRPA. The results obtained may indicate the coevolution of these genes. It was previously shown that TRPV1, as well as TRPM8, was detected with high frequency in the Nanai population. It is likely that these two mutations came simultaneously from East Asia and spread throughout Russia, which explains the fact that they are positively correlated with each other.

全文:

受限制的访问

作者简介

M. Gubina

Federal Research Center, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

编辑信件的主要联系方式.
Email: marina@bionet.nsc.ru
俄罗斯联邦, Novosibirsk, 630090

V. Babenko

Federal Research Center, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: marina@bionet.nsc.ru
俄罗斯联邦, Novosibirsk, 630090

E. Gubina

Sechenov First Moscow State Medical University

Email: marina@bionet.nsc.ru
俄罗斯联邦, Moscow, 119991

参考

  1. Montell C., Rubin G.M. Molecular characterization of the Drosophila TRP locus: A putative integral membrane protein required for phototransduction // Neuron. 1989. V. 2. P. 1313–1323. https://doi.org/10.1016/0896-6273(89)90069-x
  2. Diaz-Franulic I., Poblete H., Miño-Galaz G. et al. Allosterism and structure in thermally activated receptor potential channels // Annu. Rev.Biophys. 2016. V. 5. P. 371–398. https://doi.org/10.1146/annurev-biophys-062215-011034
  3. Talavera K., Yasumatsu K., Voets T. et al. Heat activation of TRPM5 underlies thermal sensitivity of sweet taste // Nature. 2005. V. 438. P. 1022–1025. https://doi.org/10.1038/nature04248
  4. Nilius B., Owsianik G., Voets T. Transient receptor potential cation channels in disease // Physiol. Rev. 2007. V. 87. P. 165–217. https://doi.org/10.1152/physrev.00021.2006
  5. Jordt S.E., McKemy D.D., Julius D. Lessons from peppers and peppermint: The molecular logic of thermosensation // Curr.Opin.Neurobiol. 2003. V. 13. P. 487–492. https://doi.org/10.1016/s0959-4388(03)00101-6
  6. Laursen W.J., Anderson E.O., Hoffstaetter L.J. et al. Species-specific temperature sensitivity of TRPA1 // Temperature (Austin). 2015. V. 11. P. 214–226. https://doi.org/10.1080/23328940.2014.1000702
  7. Губина М.А., Орлов П.С., Бабенко В.Н. и др. Полиморфизм генов терморецепторов TRPV1 и TRPA1 человека в популяциях Алтае-Саянского региона и Дальнего Востока // Генетика. 2018. Т. 54. № 2. 243–252.
  8. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/?q=rs13268757.
  9. Key F.M., Abdul-Aziz M.A., Mundry R. et al. Human local adaptation of the TRPM8 cold receptor along a latitudinal cline // PLoS Genetics. 2018. V. 14. № 5. P. 1–22. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007298
  10. Wei E., Seid D. AG-3-5: A chemical producing sensation of cold // J. Pharm. Pharmacol. 1983. V. 35. P. 110–112.
  11. McKemy D.D., Neuhausser W.M., Julius D. Identification of a cold receptor reveals a general role for TRP channels in thermosensation// Nature. 2002. V. 416. № 6876. P. 52–58. https://doi.org/10.1038/nature719
  12. Tsavaler L., Shapero M.H., Morkowski S., Laus R. Trp-p8, a novel prostate-specific gene, is up-regulated in prostate cancer and other malignancies and shares high homology with transient receptor potential calcium channel proteins //Cancer Res. 2001. V. 61. P. 3760–3769.
  13. Patapoutian A., Peier A., Story G., Viswanath V. Thermo TRP channels and beyond: Mechanisms of temperature sensation // Neuroscience. 2003. V. 4. P. 529–539. https://doi.org/10.1038/nrn1141
  14. Nealen M.L., Gold M.S., Thut P.D., Caterina M.J. TRPM8 mRNA is expressed in a subset of cold-responsive 148 trigeminal neurons from rat // J. Neurophysiol. 2003. V. 90. № 1. P. 515–520. https://doi.org/10.1152/jn.00843.2002
  15. Yee N.S., Zhou W., Lee M. Transient receptor potential channel TRPM8 is overexpressed and required for cellular proliferation in pancreatic adenocarcinoma // Cancer Lett. 2010. V. 297. P. 49–55. https://doi.org/10.1016/j.canlet.2010.04.023
  16. Maniatis T., Fritsch E.E., Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. N.Y.: CSHL, 1982.
  17. Ruhlen M.A. Guide to the World’s Languages. Classification. London: Edward Arnold, 1991.
  18. Greenberg J. Indo-European and Its Closest Elatives: The Eurasiatic Family: Grammar. Stanford, CA: Stanford University Press. 2000.
  19. Slatkin M. An exact test for neutrality based on the Ewens sampling distribution // Genet. Res. 1994. V. 64. P. 71–74. https://doi.org/10.1017/s0016672300032560
  20. Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics dataanalysis //Evol.Bioinform. Online. 2005. V. 1. P. 47–50.
  21. XLStat.com
  22. Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н. и др. Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока // Вестник ВОГиС. 2008. Т. 12. № 4. С. 749–754.
  23. Потапова Т.А., Ромащенко A.Г., Юдин Н.С., Воевода M.И. Этноспецифическое распределение вариантов гена TRPM8 в евразийских популяциях: знаки отбора // Вавилов. журнал генет. и селекции. 2020. Т. 24. № 3. С. 292–298. https://doi.org/18699/VJ20.45-o

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2. Fig. 1. Multidimensional scaling of pairwise genetic distances in 15 studied populations.

下载 (78KB)
索引源数据
3. Fig. 2. Linear regression graph of the frequencies of polymorphisms of the TRPV1/TRPM8 (a), TRPV1/TRPA (b) and TRPA/TRPM8 (c) genes in 14 populations.

下载 (255KB)
索引源数据

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».