Unique Features of the Luminescent Mushroom Mycena gombakensis

Cover Page
  • Authors: Puzyr A.P1, Posokhina E.D1, Timofeev A.A2,3, Burov A.E1,4, Medvedeva S.E1, Pavlov I.N2,5
  • Affiliations:
    1. Institute of Biophysics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
    2. Institute of Forest of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
    3. Laboratory of Genomic Research and Biotechnology, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
    4. Federal Research Center for Information and Computational Technologies
    5. M.F. Reshetnev Siberian State University of Science and Technology
  • Issue: Vol 69, No 3 (2024)
  • Pages: 594-602
  • Section: Cell biophysics
  • URL: https://bakhtiniada.ru/0006-3029/article/view/262932
  • DOI: https://doi.org/10.31857/S0006302924030154
  • EDN: https://elibrary.ru/OEUFUW
  • ID: 262932

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The paper presents the results of study on the luminescent system of the culture of the fungus Mycena gombakensis derived out of wood samples. The changes on samples stored for duration of 10 years in non-sterile conditions and the dynamics of luminescent signals are described. A phylogenetic approach was used to recognize fungal species. A number of unique features of M. gombakensis are presented expanding the understanding of the properties of luminescent fungi. Research data indicate that M. gombakensis can potentially be used both in biotechnology and in the study of biophysics of the complex system of basidiomycetes.

About the authors

A. P Puzyr

Institute of Biophysics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: apuzyr@mail.ru
Krasnoyarsk, Russia

E. D Posokhina

Institute of Biophysics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Krasnoyarsk, Russia

A. A Timofeev

Institute of Forest of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Laboratory of Genomic Research and Biotechnology, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Krasnoyarsk, Russia; Krasnoyarsk, Russia

A. E Burov

Institute of Biophysics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Federal Research Center for Information and Computational Technologies

Krasnoyarsk, Russia; Novosibirsk, Russia

S. E Medvedeva

Institute of Biophysics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Krasnoyarsk, Russia

I. N Pavlov

Institute of Forest of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center” of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; M.F. Reshetnev Siberian State University of Science and Technology

Krasnoyarsk, Russia; Krasnoyarsk, Russia

References

  1. Sabharwal S. C., Kathuria S. P., and Dhingra M. M. A new bioluminescent fungal system. J. Biosci., 5, 53–62 (1983). doi: 10.1007/BF02702593
  2. Deheyn D. D. and Latz M. I. Bioluminescence characteristics of a tropical terrestrial fungus (Basidiomycetes). Luminescence, 22 (5), 462–467 (2007). doi: 10.1002/bio.985
  3. Puzyr A. P., Medvedeva S. E., and Bondar V. S. The use of glowing wood as a source of luminescent culture of fungus mycelium. Mycosphere, 7 (1), 1–17 (2016). doi: 10.5943/mycosphere/7/1/1
  4. Puzyr A. P. and Medvedeva S. E. Luminescence of wood samples during long-term storage. Mycosphere, 7 (6), 716–727 (2016). doi: 10.5943/mycosphere/7/6/2
  5. Menkis A., Ihrmark K., Stenlid J., and Vasaitis R. Root-associated fungi of Rosa rugosa grown on the frontal dunes of the Baltic Sea Coast in Lithuania. Microb. Ecology, 67, 769–774 (2014). doi: 10.1007/s00248-013-0351-8
  6. Gardes M. and Bruns T. D. ITS Primers with enhanced specificity for basidiomycetes – application to the identification of mycorrhizae and rusts. Mol. Ecology, 2, 113–118 (1993). doi: 10.1111/j.1365294X.1993.tb00005.x
  7. White T. J., Bruns T., Lee S. B., and Taylor J. W. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In PCR protocols: a guide to methods and applications, Ed. by M. A. Innis, D. H. Gelfand, J. J. Sninsky and T. J. White (N.-Y., Acad. Press, 1990), pp. 315–322.
  8. Stielow J. B., Levesque C. A., Seifert K. A., Meyer W., Irinyi L., Smits D., Renfurm R., Verkley G. J. M., Groenewald M., Chaduli D., Lomascolo A., Welti S., Lesage-Meessen L., Favel A., Al-Hatmi A. M. S., Damm U., Yilmaz N., Houbraken J., Lombard L., Quaedvlieg W., Binder M., Vaas L. A. I., Vu D., Yurkov A., Begerow D., Roehl O., Guerreiro M., Fonseca A., Samerpitak K., van Diepeningen A. D., Dolatabadi S., Moreno L. F., Casaregola S., Mallet S., Jacques N., Roscini L., Egidi E., Bizet C., Garcia-Hermoso D., Martin M. P., Deng S., Groenewald J. Z., Boekhout T., de Beer Z. W., Barnes I., Duong T. A., Wingfield M. J., de Hoog G. S., Crous P. W., Lewis C.T., Hambleton S., Moussa T. A. A., Al-Zahrani H. S., Almaghrabi O. A., Louis-Seize G., Assabgui R., McCormick W., Omer G., Dukik K., Cardinali G., Eberhardt U., de Vries M., and Robert V. One fungus, which genes? Development and assessment of universal primers for potential secondary fungal DNA barcodes. Persoonia, 35 (1), 242–263 (2015). doi: 10.3767/003158515X689135
  9. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., and Tamura K. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evolution, 35 (6), 1547–1549 (2018). doi: 10.1093/molbev/msy096
  10. Tajima F. and Nei M. Estimation of evolutionary distance between nucleotide sequences. Mol. Biol. Evolution, 1 (3), 269–285 (1984). doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040317
  11. Chew A. L. C., Desjardin D. E., Tan Y. S., Musa M. Y., and Sabaratnam V. Bioluminescent fungi from Peninsular Malaysia. Fungal Diversity, 70, 149–187 (2014). doi: 10.1007/s13225-014-0302-9
  12. Oliveira A. G., Stevani C. V., Waldenmaier H. E., Viviani V., Emerson J. M., Loros J. J., and Dunlap J. C. Circadian control sheds light on fungal bioluminescence. Curr. Biol., 25 (7), 964–968 (2015). doi: 10.1016/j.cub.2015.02.021

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2024 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».