Автоматизация анализа рентгенограмм позвоночника для объективизации оценки степени тяжести сколиотической деформации при идиопатическом сколиозе (предварительное сообщение)

Обложка

Цитировать

Аннотация

Обоснование. Несмотря на широкий спектр зарубежных исследований по созданию автоматизированного метода измерения угла Кобба на рентгенограмме позвоночника, отечественного вспомогательного инструмента, позволяющего оптимизировать процесс определения степени тяжести сколиотической деформации и выбора эффективного метода лечения, до сих пор не существует.

Цель — исследовать алгоритмы выделения на рентгеновском снимке позвоночного столба, позвонков и построения касательных к межпозвонковым дискам для последующего автоматизированного анализа рентгенограмм позвоночника пациентов, страдающих идиопатическим сколиозом, с целью оценки степени тяжести.

Материалы и методы. Расчерчены ручным методом сертифицированным врачом-рентгенологом и включены в датасет для обучения нейросети 300 цифровых рентгенограмм позвоночника детей и подростков с идиопатическим сколиозом для определения степени сколиоза на основании величины угла Кобба. Использовали два методологических подхода — детерминированный метод скользящих окон и алгоритм на базе нейронной сети, апробация которых показала значительное преимущество последнего.

Результаты. Созданы основы компьютерной системы автоматизации анализа медицинских рентгенологических изображений позвоночного столба. Особый подход к обучению и аугментации данных, а также разметка одним квалифицированным специалистом позволили обучить нейронную сеть и добиться правильного распознавания угла Кобба более чем на 85 % рентгенограмм.

Заключение. Сделан первый шаг к созданию современного отечественного инновационного продукта, основанного на технологии глубоких нейронных сетей — распознавания и 2D-изображений позвоночника и автоматического расчерчивания углов Кобба.

Об авторах

Григорий Аркадьевич Леин

Общество с ограниченной ответственностью «Сколиолоджик.ру»

Автор, ответственный за переписку.
Email: Lein@scoliologic.ru
ORCID iD: 0000-0001-7904-8688

канд. мед. наук, врач — травматолог-ортопед, генеральный директор

Россия, Санкт-Петербург

Наталья Сергеевна Нечаева

Общество с ограниченной ответственностью «Сколиолоджик.ру»

Email: n.nechaeva@scoliologic.ru
ORCID iD: 0000-0003-3510-9164

научный сотрудник, врач-рентгенолог

Россия, Санкт-Петербург

Гульнар Магеррам кызы Мамедова

Общество с ограниченной ответственностью «ИНПРИС»

Email: mgm.gulnar@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9738-9259

аналитик

Россия, Москва

Андрей Александрович Смирнов

Общество с ограниченной ответственностью «ИНПРИС»

Email: smirnov.andrey.aleksandrovich@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-7062-5677

Аналитик

Россия, Москва

Максим Михайлович Стаценко

Общество с ограниченной ответственностью «Мэйл.ру»

Email: maxstatsenko@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6826-9116

руководитель команды разработки

Россия, Москва

Список литературы

  1. Ferguson AB. The study and treatment of scoliosis. South Med J. 1930;23(2):116-120.
  2. Сobb JR. Outline for the study of scoliosis. Instr Course Lect AAOS. 1948;5:261-275.
  3. Jentschura G. Zur pathogenese der säuglingsskoliose. Archiv für orthopädische und Unfall-Chirurgie, mit besonderer Berücksichtigung der Frakturenlehre und der orthopädisch-chirurgischen Technik. 1956;48(5):582-603.
  4. Абальмасова Е.А. Сколиоз в рентгеновском изображении и его измерение // Ортопедия и травматология. – 1964. – № 5. – С. 49–50. [Abalmasova EA. Skolioz v rentgenovskom izobrazhenii i ego izmerenie. Ortopediya i travmatologiya. 1964;(5):49-50. (In Russ.)]
  5. Тесаков Д.К., Тесакова Д.Д. Рентгенологические методики измерения дуг сколиотической деформации позвоночника во фронтальной плоскости и их сравнительный анализ // Проблемы здоровья и экологии. – 2007. – № 3. – С. 94–103. [Tesakov DK, Tesakova DD. Roetgenological methods of scoliotic spine deformity estimation in frontal plane and their comparative analysis. Problemy zdorov’ya i ekologii. 2007;(3):94-103. (In Russ.)]
  6. SOSORT. Методические рекомендации SOSORT 2011 г. Ортопедическое и реабилитационное лечение подросткового идиопатического сколиоза. 2011. [SOSORT. Metodicheskie rekomendatsii SOSORT 2011 g. Ortopedicheskoe i reabilitatsionnoe lechenie podrostkovogo idiopaticheskogo skolioza. 2011. (In Russ.)]
  7. Ньютон П.О., О’Браен М.Ф., Шаффлбаргер Г.Л., и др. Идиопатический сколиоз. Исследовательская группа Хармса: руководство по лечению. – М.: Лаборатория знаний, 2018. – 479 с. [Newton PO, O’Brien MF, Schafflebarger GL, et al. Idiopaticheskiy skolioz. Issledovatel’skaya gruppa Kharmsa: Rukovodstvo po lecheniyu. Moscow: Laboratoriya znaniy; 2018. 479 p. (In Russ.)]
  8. Wilson MS, Stockwell J, Leedy MG. Measurement of scoliosis by orthopedic surgeons and radiologists. Aviat Space Environ Med. 1983;54(1):69-71.
  9. Tanure MC, Pinheiro AP, Oliveira AS. Reliability assessment of Cobb angle measurements using manual and digital methods. Spine J. 2010;10(9):769-774. https://doi.org/10.1016/j.spinee.2010.02.020.
  10. Suwannarat P, Wattanapan P, Wiyanad A, et al. Reliability of novice physiotherapists for measuring Cobb angle using a digital method. Hong Kong Physiother J. 2017;37:34-38. https://doi.org/10.1016/ j.hkpj.2017.01.003.
  11. Wang J, Zhang J, Xu R, et al. Measurement of scoliosis Cobb angle by end vertebra tilt angle method. J Orthop Surg Res. 2018;13(1):223. https://doi.org/10.1186/s13018-018-0928-5.
  12. Horng MH, Kuok CP, Fu MJ, et al. Cobb angle measurement of spine from X-Ray images using convolutional neural network. Comput Math Methods Med. 2019;2019:6357171. https://doi.org/10.1155/ 2019/6357171.
  13. Pan Y, Chen Q, Chen T, et al. Evaluation of a computer-aided method for measuring the Cobb angle on chest X-rays. Eur Spine J. 2019;28(12):3035-3043. https://doi.org/10.1007/s00586-019-06115-w.
  14. Safari A, Parsaei H, Zamani A, Pourabbas B. A Semi-Automatic algorithm for estimating Cobb angle. J Biomed Phys Eng. 2019;9(3):317-326. https://doi.org/10.31661/jbpe.v9i3Jun.730.
  15. Qiao J, Liu Z, Xu L, et al. Reliability analysis of a smartphone-aided measurement method for the Cobb angle of scoliosis. J Spinal Disord Tech. 2012;25(4):E88-92. https://doi.org/10.1097/BSD.0b013e3182463964.
  16. Jones JK, Krow A, Hariharan S, Weekes L. Measuring angles on digitalized radiographic images using Microsoft PowerPoint. West Indian Med J. 2008;57(1):14-19.
  17. Rigo MD, Villagrasa M, Gallo D. A specific scoliosis classification correlating with brace treatment: Description and reliability. Scoliosis. 2010;5(1):1. https://doi.org/10.1186/1748-7161-5-1.
  18. He К, Gkioxari G, Dollár P, Girshick R. Mask R-CNN. 2017. arXiv: 1703.06870.
  19. Long J, Shelhamer E, Darrell T. Fully Convolutional Networks for Semantic Segmentation. 2014. arXiv: 1411.4038.
  20. He K, Zhang X, Ren S, Sun J. Deep Residual Learning for Image Recognition. 2015. arXiv: 1512.03385.
  21. Ronneberger O, Fischer P, Brox T. U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation. 2015. arXiv: 1505.04597.
  22. Liu W, Rabinovich A, Berg AC. ParseNet: Looking Wider to See Better. 2015. arXiv: 1506.04579.
  23. Mukherjee J, Kundu R, Chakrabarti A. Variability of Cobb angle measurement from digital X-ray image based on different de-noising techniques. Int J Biomed Eng Technol. 2014;16(2):113. https://doi.org/10.1504/ijbet. 2014.065656.
  24. Okashi OA, Du H, Al-Assam H. Automatic spine curvature estimation from X-ray images of a mouse model. Comput Methods Programs Biomed. 2017;140:175-184. https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2016.12.010.
  25. Pinheiro AP, Coelho JC, Veiga ACP, Vrtovec T. A computerized method for evaluating scoliotic deformities using elliptical pattern recognition in X-ray spine images. Comput Methods Programs Biomed. 2018;161:85-92. ttps://doi.org/10.1016/j.cmpb.2018.04.015.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Виды дуг идиопатического сколиоза в соответствии с классификацией М. Rigo et al., 2010: TP — переходная точка (от англ. transitional point), которая может находиться между грудной дугой и поясничной или грудопоясничной относительно центральной крестцовой линии; если TP находится на центральной крестцовой линии — она в балансе, если за пределами указанной линии — она в дисбалансе. T — toracic (грудной), L — lumbar (поясничный), CSL — central sacrum line (центральная крестцовая линия)

Скачать (503KB)
3. Рис. 2. Нейронная сеть U-Net

Скачать (175KB)
4. Рис. 3. Пример результата работы нейронной сети

Скачать (84KB)
5. Рис. 4. Пример результата работы программы: а — результат работы программы; б — тот же снимок, обработанный вручную (цифрами в квадратах указаны величины угла Кобба дуг сколиотической деформации)

Скачать (266KB)
6. 图 1 根据M. Rigo等,2010年的分型分析特发性脊柱侧凸弓型:TP — 过渡点(从英文—transitional point), 可位于胸部弧弓与腰椎弧弓或相对于骶中央线的胸腰段之间;如果TP位于骶中央线,它是平衡的,如果它在指定 的线之外,它是不平衡的。T — toracic(胸部)、L — lumbar(腰部)、CSL — central sacrum line(骶中央线)

Скачать (484KB)
7. 图 2 U-Net神经网络

Скачать (178KB)
8. 图 3 一个神经网络结果的例子

Скачать (84KB)
9. 图 4 程序结果示例:a — 程序的结果;b — 手动 处理相同的图像(方格中的数字表示侧弯变形弧 的Cobb角的值)

Скачать (265KB)

© Леин Г.А., Нечаева Н.С., Мамедова Г.М., Смирнов А.А., Стаценко М.М., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».