Моделирование эволюции бобово-ризобиального симбиоза в условиях экологической нестабильности

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Построена математическая модель, описывающая влияние хаотически меняющихся условий среды на частотные и продуктивные характеристики партнеров бобово-ризобиального симбиоза. Наиболее чувствительными к внешним воздействиям оказались адаптационно перспективные штаммы бактерий, специфичные по отношению к хозяину и способные активно эволюционировать на повышение симбиотической эффективности. Возрастание стабильности этих штаммов может быть важным фактором, определяющим эффективность взаимодействия партнеров.

Об авторах

Николай Иванович Воробьев

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: vorobyov@arriam.spb.ru
к. техн. н., руководитель группы биоинформатики и математического моделирования

Николай Александрович Проворов

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: provorov@newmail.ru
д. б. н., заместитель директора

Список литературы

  1. Воробьев Н. И., Проворов Н. А. (2008) Моделирование эволюции бобово-ризобиального симбиоза при мульти-штаммовой конкуренции бактерий за инокуляцию симбиотических ниш. Экологич. генетика. Т. 6(4): С. 3-11.
  2. Воробьев Н. И., Проворов Н. А. (2010) Моделирование эволюции бобово-ризобиального симбиоза на повышение функциональной интегрированности партнеров и экологической эффективности их взаимодействия. Экологич. генетика. Т. 8(3): С. 16-26.
  3. Добровольский В. В. (1989) География почв с основами почвоведения. М.: Высшая школа, 320 с.
  4. Ермаков С. М., (2009) Метод Монте-Карло в вычислительной математике. Вводный курс. СПб.: Невский Диалект, 192 с.
  5. Кнут Д. Э. (2000) Случайные числа. Искусство программирования. Т. 2. Получисленные алгоритмы. 3-е изд. М.: Вильямс, 832 с.
  6. Проворов Н. А., Воробьев Н. И. (2012) Генетические основы эволюции растительно-микробного симбиоза. Под ред. И. А. Тихоновича. СПб.: Информ-Навигатор, 400 с.
  7. Проворов Н. А., Воробьев Н. И. (2013) Адаптивная и прогрессивная эволюция растительно-микробного симбиоза. Экологич. генетика. Т. 9(1): С. 12-22.
  8. Проворов Н. А., Тихонович И. А. (2003) Эколого-генетические принципы селекции растений на повышение эффективности взаимодействия с микроорганизмами. С.-х. биология. № 3: С. 11-25.
  9. Тихонович И. А., Проворов Н. А. (2009) Симбиозы растений и микроорганизмов: молекулярная генетика агросистем будущего. СПб.: Изд-во СПбГУ, 210 с.
  10. Тихонович И. А., Проворов Н. А. (2012) Развитие подходов симбиогенетики для изучения изменчивости и наследственности надвидовых систем. Генетика. Т. 48(4): С. 437-450.
  11. Pershina E. V., Andronov E. E., Pinaev A. G., Provorov N. A. (2013) Recent advances and perspectives in metagenomic studies of soil microbial communities. Management of Microbial Resources in the Environment. Malik A., Grohmann E., Alves M. (eds.). Springer. P. 141-166.
  12. Provorov N. A., Vorobyov N. I. (2000) Population genetics of rhizobia: construction and analysis of an “infection and release” model. J. Theor. Biol. V. 205: P. 105-119.
  13. Provorov N. A., Vorobyov N. I. (2008) Equilibrium between the “genuine mutualists” and “symbiotic cheaters” in the bacterial population co-evolving with plants in a facultative symbiosis. Theor. Population Biol. V. 74: P. 345-355.
  14. Provorov N. A., Vorobyov N. I. (2010) Simulation of evolution implemented in the mutualistic symbioses towards enhancing their ecological efficiency, functional integrity and genotypic specificity. Theor. Population Biology.V. 78: P. 259-269.
  15. Seckbach J. (2002) Symbiosis: mechanisms and model systems. Dordrecht, Boston, London: Kluwer Acad. Publ., 800 pp.
  16. Sprent J. I. (2001) Nodulation in legumes. Kew, Royal Botanical Gardens: Cromwell Press Ltd, 148 pp.
  17. Sprent J. I. (2005) West African legumes: the role of nodulation and nitrogen fixation. New Phytologist. V. 167: P. 326-330.
  18. van de Velde W., Zehirov G., Szatmari A., Debreczeny M., Ishihara H., Kevei Z., Farkas A., Mikulass K., Nagy A., Tiricz H., Satiat-Jeunemaître B., Alunni B., Bourge M., Kucho K., Abe M., Keresz A., Maroti G., Toshiki T., Kondorosi E., Mergaert P. (2010) Plant peptides govern terminal differentiation of bacteria in symbiosis. Science. V. 327: P. 1122-1126.
  19. Wang D., Yang S., Tang F., Zhu H. (2012) Symbiosis specificity in the legume - rhizobial mutualism.Cell. Microbiol. V. 14: P. 334-342.
  20. Wier B. S. (1996) Genetic data analysis II: methods for discrete population genetic data. Massachusetts: Sinauer Associates, Inc. Publ., 458 p.
  21. Wright J. S. (2002) Plant diversity in tropical forests: a review of mechanisms of species coexistence. Oecologia. V. 130: Р. 1-14.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Воробьев Н.И., Проворов Н.А., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».