Том 10, № 1 (2012)
- Год: 2012
- Статей: 10
- URL: https://bakhtiniada.ru/ecolgenet/issue/view/332
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen101
Статьи
СОПРЯЖЕННЫЕ СИМБИОТИЧЕСКИЕ ПОПУЛЯЦИИ. ЧАСТЬ I: АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ РИЗОБИАЛЬНОГО КОМПОНЕНТА
Аннотация
В статье приводятся результаты изучения сопряженной коллекции бобово-ризобиальной симбиотической системы (коллекция растений-хозяев люцерны и донника и выделенных из этих растений ризобий). Анализ таких коллекций делает возможным понимание коэволюционных процессов в симбиотической системе. Приведены результаты анализа ризобиального компонента симбиотической системы: определен генетический полиморфизм по 6 геномным локусам - хромосомным и симбиотическим. Проведен анализ таких популяционных характеристик, как таксономическая структура популяции, гетерогенность популяции по участкам ризобиального генома, дифференциация популяции по отдельным участкам генома, а также неравновесие по сцеплению между генетическими маркерами. Проанализированы различия между ризобиями, выделенными из различных растений-хозяев, а также между клубеньковыми и почвенными изолятами.
Экологическая генетика. 2012;10(1):3-11
3-11
СОПРЯЖЕННЫЕ СИМБИОТИЧЕСКИЕ ПОПУЛЯЦИИ. ЧАСТЬ II: АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА РЕЦЕПТОРНОГО ГЕНА NFR5 С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКИНГА
Аннотация
В настоящей работе был проведен анализ нуклеотидного и аминокислотного полиморфизма рецепторной части гена nfr5 у 15 растений сопряженной коллекции (растительный компонент - Melilotus albus; бактериальный компонент - Sinorhizobium meliloti). Определена доменная структура изучаемого участка и показано, что максимумы нуклеотидного полиморфизма приходятся на LysM домены этого гена. Выявлена четкая связь нуклеотидного и аминокислотного полиморфизма растительного рецепторного участка гена nfr5 с генетическим разнообразием ризобиального компонента сопряженной системы (симбиотический локус nodD). На основании полученных данных проведено компьютерное моделирование связывания бактериального Nod-фактора с двумя вариантами растительного рецептора.
Экологическая генетика. 2012;10(1):12-18
12-18
ТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ ЛОКУСА SYM31 В III ГРУППЕ СЦЕПЛЕНИЯ ГОРОХА
Аннотация
Проведен анализ совместного наследования симбиотического локуса sym31 и 12 молекулярных и морфологических маркеров III группы сцепления гороха. Показано сцепление симбиотического локуса sym31 c 11 проанализированными маркерами. С использованием компьютерной программы AntMap была построена подробная генетическая карта района локализации локуса sym31 и определено его точное положение в III группе сцепления гороха.
Экологическая генетика. 2012;10(1):27-33
27-33
ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ПОПУЛЯЦИЙ КАРЕЛЬСКОЙ БЕРЕЗЫ В КАРЕЛИИ С ПОМОЩЬЮ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ
Аннотация
Впервые изучена генетическая структура популяций карельской березы Betula pendula var. carelica (Mercklin) Hämet-Ahti, у которой естественное возобновление отсутствует. На основании величин ожидаемой и наблюдаемой гетерозиготности установлен преимущественный отбор гомозигот на фоне снижения доли гетерозигот. Обнаруженная межпопуляционная дифференциация (Fst= 0,145) свидетельствует о высокой частоте близкородственных скрещиваний. Выявленные популяционно-генетические особенности позволяют считать, что в наблюдающемся сокращении численности популяций карельской березы и деградации ее генофонда, наряду с другими причинами, участвуют генетические механизмы.
Экологическая генетика. 2012;10(1):34-37
34-37
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ МОТОРНЫХ ФУНКЦИЙ DROSOPHILA MELANOGASTER
Аннотация
Для исследования молекулярных механизмов функционирования центральных генераторов моторного паттерна (ЦГМП ) проведен скрининг коллекции Р-инсерционных мутантов дрозофилы на сильные отклонения в локомоции и песне ухаживания. У 21 мутанта был установлен сайт инсерции P-элемента в геноме путем секвенирования фланговых последовательностей геномной ДНК. Биоинформационный анализ позволил определить группу генов- кандидатов, возможных участников развития и функционирования ЦГМП. Для некоторых из выявленных генов возможность участия в ритмических моторных актах предполагается впервые (CG 15630, Map205).
Экологическая генетика. 2012;10(1):51-61
51-61
НОВАЯ СЕРИЯ СИМБИОТИЧЕСКИХ МУТАНТОВ ГОРОХА, ИНДУЦИРОВАННЫХ НА ЛИНИИ SGE
Аннотация
Проведен химический мутагенез лабораторной линии гороха SGE с использованием этилметансульфоната. При анализе 425 семей (2069 растений) поколения М2 было отобрано 45 потенциальных симбиотических мутантов, из них 30 мутантов, формирующих неэффективные клубеньки (фенотип Fix-), 13 мутантов, неспособных формировать клубеньки (фенотип Nod-) и 2 мутанта, формирующих единичные клубеньки (фенотип Nod+/-). Для 1 Nod- и 5 Fix- мутантов было показано моногенное наследование и рецессивное проявление мутантных признаков. Для Fix- мутанта SGEFix--9 показано присутствие дополнительной мутации, приводящей к фенотипу Nod+/-. Комплементационный анализ показал, что мутантный фенотип линии SGEFix--5 определяется мутацией в гене sym33, линии SGEFix--6 - в гене sym40, линии SGEFix--7 - в гене sym27, и линии SGEFix--8 - в гене sym25.
Экологическая генетика. 2012;10(1):19-26
19-26
ГЕН ГОРОХА CRT, КОНТРОЛИРУЮЩИЙ МОРФОГЕНЕТИЧЕСКИЕ РЕАКЦИИ КОРНЯ, ВОВЛЕЧЕН В РЕГУЛЯЦИЮ АКТИВНОСТИ АЦК-ОКСИДАЗЫ
Аннотация
В работе произведено изучение этиленового статуса мутанта гороха SGEcrt, характеризующегося измененной морфологией корневой системы, развитие которой значительно зависит от физико-механических условий среды. Подтверждена зависимость проявления фенотипа корневой системы мутанта от этиленового статуса растения. Показано, что мутант характеризуется повышенной продукцией и повышенной чувствительностью к этилену на фоне нарушения механизмов регуляции биосинтеза этилена, приводящих к повышенной активности этилен-продуцирующего фермента АЦК -оксидазы
Экологическая генетика. 2012;10(1):62-73
62-73
ТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ МУТАЦИИ ПО ЛОКУСУ CDT, ПРИВОДЯЩЕЙ К ПОВЫШЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ ГОРОХА (PISUM SATIVUM L.) К КАДМИЮ
Аннотация
У гороха посевного описан мутант SGECdt (cdt), характеризующийся повышенным уровнем накопления кадмия и устойчивостью к данному тяжелому металлу, по сравнению с исходной линией. Проведенный ранее SSAP анализ позволил локализовать локус cdt в VI группе сцепления гороха. Для более подробного картирования локуса cdt были разработаны молекулярные маркеры, основанные на известных последовательностях генов гороха, выявленных с помощью анализа геномной микросинтении между горохом посевным и модельным бобовым Medicago truncatula. Было выявлено тесное сцепление локуса cdt и маркеров, разработанных на основе генов Pentatricopeptide repeat и Exosome complex exonuclease RRP45. Таким образом, были созданы условия для дальнейшего позиционного клонирования гена cdt.
Экологическая генетика. 2012;10(1):38-45
38-45
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ SS AP-АНАЛИЗА ДЛЯ ПЕРВИЧНОЙ ЛОКАЛИЗАЦИИ МУТАЦИИ CDT (CADMIUM TOLERANCE) В VI ГРУППЕ СЦЕПЛЕНИЯ ГОРОХА
Аннотация
С целью локализации мутации cdt, приводящей к повышенной устойчивости мутанта гороха к кадмию и его увеличенному накоплению в биомассе растений, по сравнению с исходной линией, был проведен сегрегационный анализ F2 и F3 поколений гибридов от скрещивания мутантной линии SGECdt и линии JI281. В эксперименте проанализировано совместное наследование 89 SSAP (от англ. sequence specific amplified polymorphism) маркеров, по которым различались анализируемые линии и мутантного признака устойчивости к кадмию. Было выявлено сцепление 4-х SSAP маркеров (Tps1/146+, Tps1/167+, Tps1/44+ и Tps1/58+), расположенных в VI группе сцепления гороха, с признаком устойчивости к кадмию. Таким образом, продемонстрирована перспективность использования SSAP -анализа для первичной локализации мутации в группе сцепления.
Экологическая генетика. 2012;10(1):46-50
46-50
БЕЛОК PRP И ПЕПТИД АМИЛОИД БЕТА ВЗАИМОДЕЙСТВУЮТ В ДРОЖЖАХ SACCHAROMYCES CEREVISIAE
Аннотация
Исследована возможность взаимодействия белка prp с пептидом амилоид бета в живых клетках дрожжей Saccharomyces cerevisiae методами флуоресцентной микроскопии. используя метод FRET, было показано, что пептид амилоид бета и белок prp взаимодействуют в дрожжевых клетках. Б дальнейшем, дрожжевая модель может быть использована для изучения тонких механизмов этого взаимодействия с использованием методов флуоресцентной микроскопии.
Экологическая генетика. 2012;10(1):74-80
74-80