Molecular analysis of genetic polymorphism and phylogenetic relationships in Ribes L.


Cite item

Full Text

Abstract

The RAPD analysis have been used to study genome polymorphism and phylogenetic relationships in genus Ribes L. Levels of interspecific, intraspecific and intercultivars genome diversity have been evaluated. Revealed polymorphism allows the recognition of closely related cultivars. Genotype-specific RAPD fragments and also group-specific fragments have been identified. Hybrids between blackcurrant and gooseberry have shown more similarity with blackcurrant. Calculated similarity coefficients and dendrogram topology support the genus classifications that recognize equal independent taxonomic level of blackcurrant, redcurrant and gooseberry with genus Ribes L.

Keywords

About the authors

Anna V Pikunova

Orel State Agrarian University, Oryol, Oryol Oblast, RF

Email: pikuanna84@mail.ru

Elena V Martirosyan

Centre Bioengineering RAS, Moscow, RF

Email: marty-elena@yandex.ru

Sergey D Knyazev

All-Russian Research Institute of Horticultural Crops Selection, Oryol, Oryol Oblast, RF

Email: ksd_61@mail.ru

Natalia N Ryzhova

Centre Bioengineering RAS, Moscow, RF

Email: rynatalia@yandex.ru

References

  1. Еленевский А. Г. и др. 2001. Ботаника высших, или наземных растений: Учеб. для студ. высш. пед. учеб. заведений/А. Г. Еленевский, М. П. Соловьева, В. Н. Тихо-миров. М.: Издательский центр «Академия», 432 с.
  2. Еремин Г. В., Исачкин А. В, Казаков И. В. и др., 2004. Общая селекция и сортоведение плодовых и ягодных культур. М.: Мир, 422 с.
  3. Князев С. Д., Огольцова Т. П., 2004. Селекция смородины черной на современном этапе. Орел: Изд-во Всероссийского научно-исследовательского института селекции плодовых культур, 238 с.
  4. Самигуллина Н. С., 2006. Практикум по селекции и сортоведению плодовых и ягодных культур: Учебное издание. Мичуринск: Издательство Мичуринского государственного университета, 197 с.
  5. Berger A., 1924. A taxonomic review of currants and gooseberries//NewYork Agric. Exp. Sta. Techn. Bull. Vol. 109. C. 1-118.
  6. Brennan R., Jorgensen L., Hackett C. et al., 2008. The development of a genetic linkage map of blackcurrant (Ribes nigrum L.) and the identification of regions associated with key fruit quality and agronomic traits//Euphytica. Vol. 161. P. 19-34.
  7. Brennan R. M., 2008. Currants and Gooseberries//Temperate Fruit Crop Breeding/Ed. Hancock J. F., Springer Science+Business Media. P. 177-196.
  8. Coville F. V., Britton N. L., 1908. Grossulariaceae//North American Flora. Vol. 22. P. 193-225.
  9. Cronquist A., 1988. The Evolution and Classification of Flowering Plants. -New York.: The New York Botanical Garden, 555 p.
  10. Hummer K. E., Barney D. 2002. Currants: Comprehensive Crop Report//HortTechnology. Vol. 12. N 3. P. 377-387.
  11. Janczewski E., 1907. Monograph of the currants
  12. Ribes L.//Mem. Soc. Phys. Hist. Nat. Geneve. Vol. 35. P. 199-517.
  13. Keep E., 1962. Interspecific hybridization in Ribes//Genetica. Vol. 33. P. 1-23.
  14. Komarov V. L., 1971. Flora of the (former) USSR. Vol. IX p. 175-208. In: Ribesioideae Engl. (Translated from the Russian by the Israel Program for Scientific Translation, Jerusalem). Keter, London.
  15. Lanham P., Brennan R., Hackett С. et al., 1995. RAPD fingerprinting of blackcurrant (Ribes nigrum L.) cultivar.//Theor Appl genet. Vol. 90. P. 166-172.
  16. Lanham P., Korycinska A. and Brennan R. 2000. Genetic diversity within a secondary gene pool for Ribes nigrum L. revealed by RAPD and ISSR markers//Journal of horticultural Science & Biotechnology. Vol. 75. N 4. Р. 371-375.
  17. Messinger W., Liston A., and Hummer K., 1999. Ribes phylogeny as indicated by restriction-site polymorphisms of PCR-amplified chloroplast DNA//Plant Systematics and Evolution. Vol. 217. P. 185-195.
  18. Peer Van de Y., Wachter R. D., 1994. TREECON for Windows: A software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment//Comput. Appl. Biosci. Vol. 10. P. 569-570.
  19. Puchooa D., 2004. A simple, rapid and efficient method for the extraction of genomic DNA from lychee (Litchinensis Sonn)//African Jornal of Biotechnology. April. Vol. 3. N 4. P. 253-255.
  20. Rehder A., 1954. Manual of cultivated trees and shrubs. -Toronto.: MacMillan and Co. 999 pp.
  21. Schultheis L. M., Donoghue M. J., 2004. Molecular phylogeny and biogeography of Ribes (Grossularia) with an emphasis of gooseberry (subg. Grossularia)//Systematic Botany. Vol. 29. N. 1. Р. 77-96.
  22. Senters A. E. and Soltis D. E., 2003. Phylogenetic relationships in Ribes (Grossulariaceae) inferred from ITS sequence data//TAXON. Vol. 52. P. 51-66.
  23. Sinnott Q. P., 1985. A revision of Ribes L. subg. Grossularia (Mill.) per. Sect. Grossularia (Mill.) Nutt. (Grossulariaceae) in North America//Rhodora. Vol. 87. P. 189-286.
  24. Weigend M., 2007. Flowering plants. Eudiocots. The Families and Genera of Vascular Plants. Vol. 9, P. 168-176.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2011 Pikunova A.V., Martirosyan E.V., Knyazev S.D., Ryzhova N.N.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».