ISSN (print): 1811-0932, ISSN (online): 2411-9202 Учредитель: ООО «Эко-Вектор» Главный редактор: Инге-Вечтомов Сергей Георгиевич, академик РАН, д-р биол. наук, профессор Периодичность / доступ: 4 выпуска в год / подписка Входит в: Белый список (3 уровень), перечень ВАК, РИНЦ, Scopus
Направляя рукопись статьи для публикации в данном журнале, авторы соглашаются со следующим: авторы сохраняют за собой авторские права на произведение и предоставляют издателю исключительную лицензию на публикацию и распространение произведения; авторы сохраняют за собой право на распространение произведения в соответствии с условиями политики самоархивирования, принятой в журнале (см. подробнее); направляемая авторами в редакцию рукопись будет принята к публикации только по решению редакционной коллегии и главного редактора — в соответствии с правилами отбора контента в данном журнале (см. подробнее); опубликованное в журнале произведение будет распространяться в печатном и электронном виде по подписке или на условиях открытого доступа по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0) — по решению издателя или в соответствии с отдельным договором издателя с авторским коллективом. Передаваемая авторами исключительная лицензия позволяет издателю использовать произведение следующими способами: воспроизведение статьи или ее отдельной части, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках в любой материальной форме, в том числе на бумажном и электронном носителе в виде отдельного произведения в журналах и/или базах данных (локальных или в сети Интернет) издателя и/или иных лиц, по усмотрению издателя; распространение статьи или ее отдельной части, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках на любом носителе в составе журнала и/или базах данных издателя или иных лиц, по усмотрению издателя, или в виде самостоятельного произведения по всему миру на условиях открытого доступа или за плату без выплаты вознаграждения авторам; доведение статьи или отдельной ее части, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках до всеобщего сведения таким образом, что любое лицо может получить доступ к статье из любого места и в любое время по собственному выбору (в том числе через Интернет); выдача разрешения/ий на использование статьи или ее отдельных частей, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках третьим лицам с уведомлением автора об этом путем размещения соответствующей информации на сайте журнала без выплаты вознаграждения автору; переработка, в том числе перевод статьи на иностранные языки, и использование переработанной (переведенной) статьи вышеуказанными способами; Иные права, прямо не переданные издателю авторами, включая патентные права на любые процессы, способы или методы и прочее, описанные авторами в статье, а также права на товарные знаки, сохраняются за авторами. ПОЛНЫЙ ТЕКСТ АВТОРСКОГО ДОГОВОРА (ОФЕРТЫ) — СКАЧАТЬ ПРОЧИТАТЬ Авторское соглашение (публичная оферта) о публикации статьи в научном журнале «Экологическая генетика» ООО «Эко-Вектор» в лице генерального директора Щепина Евгения Валентиновича, действующего на основании Устава (далее — Издатель), с одной стороны, предлагает неопределенному кругу лиц (далее — Автор), с другой стороны, далее совместно именуемым Стороны, заключить настоящее соглашение (далее — Соглашение) о публикации результатов интеллектуальной деятельности в форме научного произведения (далее – Статья) в журнале «Экологическая генетика» (далее — Журнал) на нижеуказанных условиях. I. Общие положения Настоящее Соглашение, в соответствии с п. 2 ст. 437 Гражданского кодекса РФ, является публичной офертой (далее — Оферта), полным и безоговорочным принятием (акцептом), которой, в соответствии со ст. 438 Гражданского кодекса РФ, считается отправка Автором своего произведения путем загрузки его в сетевую электронную систему подачи рукописей, размещенную в соответствующем разделе сайта Журнала в информационно-телекоммуникационной сети «Интернет» (далее — Интернет). В соответствии с действующим законодательством РФ в части соблюдения авторского права на электронные информационные ресурсы, материалы сайта, электронного журнала не могут быть воспроизведены полностью или частично в любой форме (электронной или печатной) без предварительного письменного согласия Автора и редакции Журнала, (которое, при опубликовании Статьи в открытом доступе, может быть выражено путем размещения соответствующего разрешения — открытой лицензии Creative Commons — в соответствующем разделе сайта Журнала (по месту размещения публикуемых материалов) в сети Интернет). При разрешенном использовании опубликованного произведения в контексте других документов обязательна ссылка на первоисточник. II. Термины, используемые в Соглашении Автор – физическое лицо (лица), творческим трудом которого создана Рукопись научной статьи или представитель авторского коллектива, уполномоченный представлять его интересы. Рукопись статьи — результат интеллектуальной деятельности в форме научного произведения, содержащего текст, графические и числовые данные, аудиовизуальную информацию, программный код и иные элементы, представленный Автором для публикации в Журнале. Акцепт Оферты – полное и безоговорочное принятие Оферты на условиях, указанных в пункте 3 Соглашения (автор проводит акцепт Оферты путем отправки Заявки Издателю – загрузки Рукописи статьи, дополнительных файлов и сопроводительных материалов в сетевую электронную систему подачи рукописей, размещенную в соответствующем разделе сайта Журнала в сети Интернет). Журнал – научный рецензируемый журнал, зарегистрированный как средство массовой информации в реестре Федеральной службы по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзора). Заявка – электронное обращение Автора к Издателю на публикацию Статьи в Журнале посредством загрузки Рукописи статьи, дополнительных файлов и сопроводительных материалов в сетевую электронную систему подачи рукописей, размещенную в соответствующем разделе сайта Журнала в сети Интернет). Издатель – ООО "Эко-Вектор", являющееся учредителем и издателем Журнала. Метаданные Статьи – информация о Рукописи статьи и/или Статье, предназначенная для включения в Международные Научные Базы Данных (МНБД), а именно: название статьи; сведения об авторах (фамилия, имя, отчество автора (авторов) полностью, место работы каждого автора с указанием почтового адреса, контактная информация (email), идентификаторы МНБД для каждого автора; аннотация; ключевые слова; тематический рубрикатор: УДК либо другие библиотечно-библиографические классификационные и предметные индексы; библиографический список (список ссылок). Оферта – настоящий документ (предложение Автору подать Заявку и опубликовать Статью путем размещения ее на сайте Журнала в сети Интернет). Публикация – размещение Статьи в Журнале. Статья – Рукопись статьи, прошедшая процесс рецензирования и редакционно-издательской обработки. Редакция Журнала – творческий коллектив, осуществляющий подготовку Журнала к выпуску. Стороны – Автор и Издатель. Требования к рукописям – требования к публикуемым в Журнале материалам (их оформлению, структуре, содержанию, оригинальности, этичности), размещенные в разделе «Авторам» сайта Журнала в сети Интернет. III. Предмет Соглашения (Оферты) По настоящему соглашению Автор предоставляет Издателю на безвозмездной основе на весь срок действия исключительных прав, предусмотренный законодательством РФ, исключительную лицензию на использование созданной Автором Статьи для опубликования в Журнале, а также права на использование Статьи, следующими способами: воспроизведение Статьи или ее отдельной части, а также метаданных Статьи на русском и иностранных языках в любой материальной форме, в том числе на бумажном и электронном носителе в виде отдельного произведения в журналах и/или базах данных (локальных или в сети Интернет) Издателя и/или иных лиц, по усмотрению Издателя; распространение Статьи или ее отдельной части, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках на любом носителе в составе Журнала и/или базах данных Издателя или иных лиц, по усмотрению Издателя, или в виде самостоятельного произведения по всему миру на условиях открытого доступа или за плату без выплаты вознаграждения Автору; доведение Статьи или отдельной ее части, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках до всеобщего сведения таким образом, что любое лицо может получить доступ к Статье из любого места и в любое время по собственному выбору (в том числе через Интернет); выдача разрешения/ий на использование Статьи или ее отдельных частей, а также метаданных статьи на русском и иностранных языках третьим лицам с уведомлением Автора об этом путем размещения соответствующей информации на сайте Журнала без выплаты вознаграждения Автору; переработка, в том числе перевод Статьи на иностранные языки, и использование переработанной (переведенной) Статьи вышеуказанными способами; иные права, прямо не переданные Издателю по настоящему Соглашению, включая патентные права на любые процессы, способы или методы и прочее, описанные Автором в Статье, а также права на товарные знаки, сохраняются за Автором. Территория, на которой допускается использование прав на Статью – весь мир. Действие условий настоящего Соглашения, обязывающих Издателя опубликовать Статью, а также предоставляющих Издателю и Автору право использовать Статью в пределах, установленных Соглашением, возникает только в случае принятия Статьи к публикации в Журнале. Моментом принятия Статьи к публикации в Журнале является момент отправки уведомления о принятии Статьи к публикации Автору с официальной электронной почты Журнала. Права предоставляются Автором Издателю безвозмездно, и публикация Статьи в Журнале не влечет никаких финансовых отчислений Автору. В случае принятия Редакцией Журнала решения об отклонении Заявки, отказе в опубликовании Статьи в Журнале, снятии Статьи с публикации (ретракции) настоящее Соглашение утрачивает силу. Решение об отказе в опубликовании направляется Автору по адресу электронной почты, указанной в Заявке. IV. Права и обязанности Сторон Автор гарантирует: что он является законным обладателем/распорядителем прав на переданные в составе Рукописи статьи материалы; что права, предоставленные Издателю по настоящему Соглашению, не передавались ранее и не будут передаваться третьим лицам; что Рукопись статьи содержит все предусмотренные действующим законодательством об авторском праве ссылки на цитируемых авторов и/или произведения (материалы); что Автором получены все необходимые разрешения на используемые в Рукописи статьи результаты, факты и иные заимствованные материалы, правообладателем/распорядителем которых Автор не является; что Рукопись статьи не содержит материалы, не подлежащие опубликованию в открытой печати в соответствии с действующими законодательными актами РФ, и ее опубликование и распространение не приведут к разглашению секретной (конфиденциальной) информации (включая государственную тайну); что Автор проинформировал других соавторов относительно условий этого Соглашения и получил согласие всех соавторов на заключение настоящего Соглашения на условиях, предусмотренных Соглашением. Автор обязуется: вносить в Рукопись статьи изменения в соответствии с «Правилами для авторов», указанным на сайте Журнала, и рекомендациями редакции; не использовать в коммерческих целях и в других изданиях без согласия Издателя электронную копию Статьи, подготовленную Издателем; В процессе подготовки Рукописи статьи к публикации Автор обязуется: вносить в текст Рукописи статьи исправления, рекомендованные рецензентами и принятые Редакцией Журнала, и/или, при необходимости, по требованию Издателя и Редакции доработать Рукопись статьи; своевременно (в указанные Редакцией сроки) осуществлять проверку и согласование внесенной в Рукопись статьи редакторской правки (в том числе — отвечать на вопросы редакторов), и вычитку сверстанной Статьи (оригинал-макета в PDF); на этапе вычитки сверстанной Статьи предлагать к внесению только тот минимум исправлений, который связан с необходимостью устранения допущенных фактических ошибок. Автор имеет право: пользоваться печатными или электронными допечатными версиями неопубликованной Статьи в форме и содержании, принятыми Издателем для публикации в Журнале. Такие допечатные версии могут быть размещены в виде электронных файлов на веб-сайтах Автора (соавторов) или на защищенных внешних веб-сайтах работодателей Автора Статьи, но не для коммерческих продаж или систематического внешнего распространения третьей стороной. При этом Автор (соавторы) должен: включить в допечатную версию следующее предупреждение: «Это допечатная версия статьи, принятой к публикации в (название Журнала), ©, Эко-Вектор, год.»; указать электронную ссылку на сайт Издателя URL: https://journals.eco-vector.com/ безвозмездно копировать или передавать коллегам копию опубликованной Статьи целиком или частично для их личного или профессионального некоммерческого использования, для продвижения результатов академических или научных исследований или для информационных целей работодателя Автора. использовать материалы из опубликованной Статьи в написанной кем-либо из соавторов книге или ином непериодическом научной или учебном издании. использовать отдельные рисунки, таблицы и фрагменты текста из Статьи в собственных целях обучения или для включения их в другую работу, издаваемую (в печатном или электронном формате) третьей стороной, или для представления в электронном формате во внутренней компьютерной сети или на публичном веб-сайте Автора (соавторов) или его работодателя. включать материалы Статьи в учебные сборники для безвозмездного распространения Статьи студентам Автора (соавторов) или сохранять Статью в электронном формате на локальном сервере для доступа студентов, как к части курса обучения, а также для внутренних обучающих программ в учреждении работодателя Автора. Издатель обязуется: опубликовать в печатной и электронной форме Статью Автора в Журнале в соответствии с условиями настоящего Соглашения; по решению Редакции Журнала, в случае необходимости, предоставить Автору сверстанную Статью и внести обоснованную правку Автора; предоставить Автору неограниченный по времени доступ к электронной версии опубликованной Статьи через личный кабинет Автора на сайте журнала со дня выхода соответствующего выпуска Журнала в свет; соблюдать предусмотренные действующим законодательством права Автора, а также осуществлять их защиту и принимать все необходимые меры для предупреждения нарушения авторских прав третьими лицами. Издатель имеет право: проводить экспертизу Рукописи статьи и предлагать Автору внести необходимые изменения, до выполнения которых Статья не будет опубликована в Журнале; осуществлять техническое и литературное редактирование Рукописи статьи, не изменяющее ее (основное содержание); при любом последующем разрешенном использовании Автором (и/или иными лицами) Журнала и/или Статьи (в том числе любой ее отдельной части, фрагмента) требовать от указанных лиц указания ссылки на Журнал, Издателя, Автора или иных обладателей авторских прав, название Статьи, номер выпуска Журнала и год опубликования, указанные в Журнале; размещать в СМИ и других информационных источниках предварительную и/или рекламную информацию о предстоящей публикации Статьи; вносить изменения в Оферту в установленном Офертой порядке. Редакции Журнала, возглавляемой главным редактором, принадлежат исключительные права отбора и/или отклонения материалов, публикуемых в Журнале. Рукопись статьи, направляемая Автором в Редакцию Журнала, возврату не подлежит. Редакция Журнала не вступает в переписку по вопросам отклонения Заявки. Во всех случаях, не оговоренных и не предусмотренных в настоящем Соглашении, Стороны обязаны руководствоваться действующим законодательством Российской Федерации. V. Акцепт Оферты и заключение Соглашения. Срок действия Соглашения Автор производит Акцепт Оферты посредством отправки Заявки Издателю через сетевую электронную систему подачи рукописей, размещенную в соответствующем разделе сайта Журнала в сети Интернет. Акцепт Оферты Автором создает Соглашение, заключенное в письменной форме (статьи 438 и 1286.1 Гражданского Кодекса РФ) на условиях Оферты. Настоящее Соглашение действует в течение всего срока действия исключительных прав на Статью. При передаче (отчуждении) исключительного права на Статью Автором третьему лицу действие настоящего Соглашения не прекращается. VI. Порядок изменения и расторжения Соглашения Издатель вправе в одностороннем порядке изменять условия настоящего Соглашения, предварительно, не менее чем за 10 (десять) календарных дней до вступления в силу соответствующих изменений, известив об этом Автора через сайт Журнала или путем направления извещения посредством электронной почты на адрес электронной почты Автора, указанный в Заявке Автора. Изменения вступают в силу с даты, указанной в соответствующем извещении. В случае несогласия Автора с изменениями условий настоящего Соглашения Автор вправе направить Издателю письменное уведомление об отказе от настоящего Соглашения путем загрузки уведомления в сетевую электронную систему подачи рукописей, размещенную в соответствующем разделе сайта Журнала в сети Интернет) или направления уведомления на официальный адрес электронной почты Редакции в сети Интернет) Настоящее Соглашение может быть расторгнуто досрочно: по соглашению Сторон в любое время; по иным основаниям, предусмотренным настоящим Соглашением. Автор вправе в одностороннем порядке отказаться от исполнения настоящего Соглашения, направив Издателю соответствующее уведомление в письменной форме не менее чем за 60 (шестьдесят) календарных дней до предполагаемой даты публикации Статьи Автора в Журнале. Прекращение срока действия Соглашения по любому основанию не освобождает Стороны от ответственности за нарушения условий Соглашения, возникшие в течение срока его действия. VII. Ответственность За неисполнение или ненадлежащее исполнение своих обязательств по Соглашению Стороны несут ответственность в соответствии с действующим законодательством РФ. Все сведения, предоставленные Автором, должны быть достоверными. Автор отвечает за достоверность и полноту передаваемых им Издателю сведений. При использовании недостоверных сведений, полученных от Автора, Издатель не несет ответственности за негативные последствия, вызванные его действиями на основании предоставленных недостоверных сведений. В отношении содержания Статьи Автор самостоятельно несет всю ответственность за соблюдение требований законодательства РФ о рекламе, о защите авторских и смежных прав, об охране товарных знаков и знаков обслуживания, о защите прав потребителей. Издатель не несет никакой ответственности по Соглашению: за какие-либо действия, являющиеся прямым или косвенным результатом неправомерных действий Автора; за какие-либо убытки Автора вне зависимости от того, мог ли Издатель предвидеть возможность таких убытков или нет. Стороны освобождаются от ответственности за нарушение условий Соглашения, если такое нарушение вызвано действием обстоятельств непреодолимой силы (форс-мажор), включая действия органов государственной власти (в т.ч. принятие правовых актов), пожар, наводнение, землетрясение, другие стихийные бедствия, отсутствие электроэнергии и/или сбои работы компьютерной сети, забастовки, гражданские волнения, беспорядки, любые иные обстоятельства. VIII. Порядок разрешения споров Споры и разногласия будут решаться Сторонами путем переговоров, а в случае недостижения согласия – в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации. При наличии неурегулированных разногласий Сторон споры разрешаются в суде по месту нахождения Издателя в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации. IX. Прочие условия Любые уведомления, сообщения, запросы, и т.п. (за исключением документов, которые должны быть направлены в виде подлинных оригиналов в соответствии с законодательством РФ) считаются полученными Автором, если они были переданы (направлены) Издателем через сайт Журнала (в том числе путем публикации), по электронной почте и по другим каналам связи, указанным в Заявке. Стороны признают юридическую силу уведомлений, сообщений, запросов и т.п., переданных (направленных) указанными выше способами. В случае предъявления к Издателю требований, связанных с нарушением исключительных авторских и иных прав интеллектуальной собственности третьих лиц при создании Статьи или в связи с заключением Автором настоящего Соглашения, а также в связи с использованием Издателем Статьи в соответствии с Соглашением, Автор обязуется: немедленно, после получения уведомления Издателя, принять меры к урегулированию споров с третьими лицами, при необходимости вступить в судебный процесс на стороне Издателя и предпринять все зависящие от него действия с целью исключения Издателя из числа ответчиков; возместить Издателю понесенные судебные расходы, расходы и убытки, вызванные применением мер обеспечения иска и исполнения судебного решения, и выплаченные третьему лицу суммы за нарушение исключительных авторских и иных прав интеллектуальной собственности, а также иные убытки, понесенные Издателем в связи с несоблюдением Автором гарантий, предоставленных ими по настоящему Соглашению X. Юридический адрес и реквизиты Издателя ООО «Эко-Вектор» Адрес: 191186, город Санкт-Петербург, переулок Аптекарский, д. 3 литер А, помещение 1Н ИНН: 7806423692; КПП: 784101001; ОГРН: 1099847039907.
Молекулярно-генетические основы доместикации риса: контроль осыпаемости семян, размера зерна и окраски перикарпия
Доместикация риса (Oryza sativa L.) как одной из пяти древнейших хлебных культур сопровождалась формированием «синдрома доместикации», включающего утрату естественного рассеивания семян, увеличение размеров и изменение окраски зерна, сокращение периода покоя и переход к однолетнему циклу. На основе археологических, физиолого-генетических и молекулярных данных обобщены механизмы, лежащие в основе ключевых агрономических признаков. Снижение осыпаемости связано с мутациями и аллельной диверсификацией локусов SH4, qSH1, SH5, SHAT1, CPL1, OsSh1 / ObSH3, ObSH11, NPC1, OSH15, GRF4 и OsLG1 / SPR3, которые регулируют закладку и деградацию отделительного слоя колосков. Размер зерна контролируется QTL GW2, GS3, GS5 и TGW6, определяющими клеточное деление и развитие эндосперма, что напрямую влияет на массу тысячи зерен и урожайность. Окраску перикарпия задаютгены Rc и Rd, а также кассета Kala1–Kala3–Kala4; структурные перестройки промотора Kala4 индуцируют эктопическую экспрессию bHLH-фактора и накопление антоцианов, тогда как делеция 14 п. н. в Rc перевела большинство сортов к белому типу зерна и впоследствии была функционально восстановлена методом CRISPR/Cas9. Совокупность представленных сведений формирует генетическую основу для направленного повышения урожайности, технологической пригодности и нутритивной ценности современных сортов риса.
Генетика и селекция на устойчивостьтритикале к возбудителю стеблевой ржавчины Puccinia graminis Pers.: обзор литературы
Стеблевая ржавчина, вызываемая грибом Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt), остается одной из наиболее опасных болезней зерновых культур. В настоящем обзоре представлен анализ эволюции взаимоотношений между тритикале (×Triticosecale Wittmack) и Pgt с момента начала коммерческого культивирования этой культуры, охватывающий исторические аспекты распространения патогена, изменения его вирулентности и адаптации к различным генотипам тритикале, а также меры, предпринимаемые селекционерами для повышения устойчивости культуры к заболеванию. Описаны региональные особенности распространения патогена в России и в мировых центрах выращивания тритикале и пшеницы. Особое внимание уделяется особенностям патологического процесса развития стеблевой ржавчины на тритикале, который, как и у пшеницы, включает стадии прорастания спор, проникновения в ткани растения и формирования уредиопустул. Отмечается, что тритикале, являясь гибридом пшеницы и ржи, подвержена поражению как пшеничной, так и ржаной формами стеблевой ржавчины. Обзор также охватывает современные методы изучения устойчивости тритикале к Pgt, включая использование молекулярных маркеров для идентификации генов резистентности и скрининга селекционного материала. Для тритикале описан ряд генов устойчивости к стеблевой ржавчине, таких как Sr27, Sr31, SrNin, SrSatu, SrBj и SrVen, которые могут быть эффективно использованы в селекционных программах, направленных на создание сортов с долговременной и эффективной устойчивостью к стеблевой ржавчине.
Генетическое разнообразие ризобиальных эндофитов из клубеньков остролодочника Чекановского (Oxytropis czekanowskii Jurtz.), произрастающего в Норильске
Обоснование. Бобовые растения могут играть важнейшую роль при формировании высокопродуктивных пастбищных фитоценозов и обладают значительным потенциалом для интродукции в арктических регионах России с целью устойчивого развития северного животноводства. Одним из ключевых свойств бобовых является формирование взаимовыгодного азотфиксирующего симбиоза с клубеньковыми бактериями (ризобиями), что способствует фиксации атмосферного азота и обеспечивает растения доступными азотистыми соединениями, тем самым увеличивая продуктивность фито- и агроценозов. Остролодочник Чекановского (Oxytropis czekanowskii Jurtz.) — редкий субэндемичный вид многолетнего бобового растения, произрастающий в Якутии и на Таймыре. Цель — создание коллекции и изучение таксономического биоразнообразия бактериальных эндофитов из порядка Hyphomicrobiales, выделенных из клубеньков дикорастущего многолетнего растения O. czekanowskii, произрастающего в Норильске (Красноярский край). Материалы и методы. Ризобиальные штаммы были выделены из корневых клубеньков растений по стандартной методике с использованием маннито-дрожжевой питательной среды YMA после стерилизации клубеньков в течение1 мин в 96% этаноле. Таксономическое положение изолятов изучали с помощью секвенирования и филогенетического анализа последовательностей 16S рДНК и ITS-региона. Результаты. Показано большое генетическое разнообразие изолятов, отнесенных к шести родам и четырем семействам порядка Hyphomicrobiales: Mesorhizobium (сем. Phyllobacteriaceae), Neorhizobium, Pararhizobium и Agrobacterium (сем. Rhizobiaceae), Bosea (сем. Boseaceae) и Tardiphaga (сем. Bradyrhizobiaceae). На основании анализа генов 16S рРНК и ITS-региона изоляты P10/4-1 и P10/5-2 были отнесены к виду Neorhizobium vignae, изоляты P10/1-1 и P10/5-1 —к виду Pararhizobium herbae, тогда как изолят P10/3-1 был идентифицирован как Mesorhizobium qingshengii. При этом штаммы Bosea sp. P10/2-3, P10/1-3 и P10/4-4, показавшие низкий уровень сходства с ближайшим типовым штаммом, потенциально могут быть отнесены к новому виду микроорганизмов. Заключение. Таким образом, дикорастущие северные бобовые являются уникальным источником ценных генетических ресурсов клубеньковых и эндофитных бактерий, перспективных при создании высокопродуктивных многолетних пастбищных и сенокосных злаково-бобовых фитоценозов в экстремальных почвенно-климатических условиях Арктики.
Антимутагенный потенциал четырех штаммов бактерий рода Lactobacillus
Обоснование. Бактерии рода Lactobacillus, обладающие рядом положительных свойств на организм человека, являются перспективным источником создания компонентов функционального питания. Оценка антимутагенной активности лактобацилл позволит использовать препараты на их основе для предотвращения последствий генетически активных факторов окружающей среды. Цель — сравнительный анализ антимутагенного потенциала четырех штаммов бактерий рода Lactobacillus. Материалы и методы. В работе были использованы четыре штамма бактерий Lactobacillus casei 3184, L. casei МБ, L. plantarum АВ, L. plantarum В578. Оценку антимутагенной активности суспензии живых клеток и супернатанта культуральной жидкости лактобацилл проводили с использованием теста Эймса. Результаты. Супернатант штамма L. plantarum В578 в стационарной фазе роста наиболее эффективно подавлял мутагенное действие азида натрия (45,6%) и 2-нитрофлуорена (43,5%). У штаммов L. casei 3184 и L. plantarum АВ антимутагенная активность более выражена для суспензии живых клеток в экспоненциальной фазе роста в отношении азида натрия (40,8 и 39,9% соответственно) и для супернатанта в стационарной фазе роста в отношении 2-нитрофлуорена (39,8 и 37,5% соответственно). Штамм L. casei МБ не оказывал существенного влияния на эффект известных мутагенов: антимутагенная активность всех исследованных образцов для данного штамма в разные фазы роста варьировала от 15,9 до 23,4% в отношении азида натрия и от 15,6 до 28,5% в отношении 2-нитрофлуорена. Заключение. Анализ полученных результатов позволяет предположить, что антимутагенное действие штаммовL. casei 3184 и L. plantarum АВ в отношении азида натрия обусловлено прямым связыванием мутагена клетками лактобацилл, а штамма L. plantarum В578 — экзометаболитами, накапливающимися в культуральной жидкости в стационарной фазе роста культуры. Снижение мутагенного эффекта 2-нитрофлуорена штаммами L. casei 3184, L. plantarum АВ и L. plantarum В578 также может быть обусловлено прямым связыванием мутагена, ингибированием ферментов биотрансформации данного соединения и антиоксидантным эффектом экзометаболитов штаммов лактобацилл. Полученные данные подчеркивают зависимость антимутагенного потенциала лактобацилл от фазы роста культуры и природы мутагенного фактора и свидетельствуют о перспективности использования штаммовL. plantarum В578, L. casei 3184 и L. plantarum АВ для снижения негативных эффектов генотоксичных агентов.
© Эко-Вектор, 2025 https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
Изменение экспрессии генов, контролирующихбелки секрета слюнных желез дрозофилы, при повышенной продукции белка СHD1
Обоснование. Генетический материал эукариот в ядре находится в виде нуклеопротеинового комплекса — хроматина. Реализация генетической информации требует ремоделирования хроматина, которое осуществляется АТФ-зависимыми белками ремоделирования хроматина семейства SNF2. Эволюционно консервативный фактор сборки и ремоделирования хроматина CHD1 связан с развитием рака предстательной железы. Развитию этого заболевания способствуют как делеция CHD1, так и увеличение количества белка CHD1 в клетке. Цель — анализ влияния повышенной экспрессии белка CHD1 в модельном организме — дрозофиле — на транскрипцию гормон-зависимых тканеспецифичных генов в слюнных железах. Материалы и методы. Использовали генетическую модель, основанную на сверхэкспрессии белка CHD1 дрозофилы дикого типа либо его каталитически неактивной формы в слюнных железах под действием GAL4-драйвера P{GawB}AB1.Уровень транскрипции генов в слюнных железах исследовали методом обратной транскрипции с последующейполимеразной цепной реакцией в реальном времени. Результаты. Нами показано, что повышенная продукция белка CHD1 в клетках слюнных желез приводит к нарушению прикрепления куколок к поверхности. Этот фенотип обусловлен специфическим подавлением транскрипции генов, кодирующих основные белки секрета слюнных желез SGS (Salivary gland secretion, Sgs). Заключение. Создана модельная система для изучения генетических эффектов, вызванных увеличением количества белка CHD1 в клетках дрозофилы. Эта модель может быть использована для исследования механизмов регуляции транскрипции белком CHD1 и ее нарушений в результате повышенной продукции белка CHD1.
Микробиологическое разнообразие, формирование, экологическая роль и методы исследования микробиоты кишечника свиней: обзор литературы
В работе представлены данные исследований кишечной микробиоты свиней, играющей ключевую роль в поддержании здоровья и физиологии животных. В обзоре обобщены экспериментальные данные, полученные разными группами исследователей о влиянии таких параметров, как возраст, тип диеты и использование антибиотиков, на состав и функциональную активность кишечной микробиоты свиней и их вклад в распространение генов антибиотикорезистентности в условиях животноводства. Особое внимание уделено формированию и динамике состава микробиоты поросят в неонатальном периоде. Рассмотрено влияние различных типов диеты на состав и функциональную активность кишечной микробиоты свиней, в том числе на экспрессию генов гликозидгидролаз и гликозилтрансфераз и возможности модулирования состава микробиоты посредством диеты, что может минимизировать последствия стресса при отъеме и повысить продуктивность животных. Представляет интерес роль кишечной микробиоты в метаболизме аминокислот, витаминов, липидов и желчных кислот, а также функциональной метагеномике микробного сообщества, позволяющей выявлять гены, связанные с адаптацией к различным типам рациона и патологическим состояниям. В обзоре также рассматривается роль свиней в распространении генов антибиотикорезистентности, в том числе с использованием метагеномного и метатранскриптомного профилирования, а также риски, связанные с их попаданием в окружающую среду, и потенциальное воздействие на здоровье животных и человека.
Экстрапарное отцовство пеночки-трещотки в Псковской области, Россия
Обоснование. Экстрапарное отцовство — распространенное явление среди птиц, когда птенцы не являются потомками самца, входящего в сформированную репродуктивную пару. Это ставит под сомнение наличие строгой моногамии и вносит коррективы в понимание процессов полового отбора и репродуктивных стратегий. В то время как экстрапарное отцовство неоднократно регистрировали у таких видов, как пеночка-весничка, его распространенность у близкородственной пеночки-трещотки остается малоизученной. Цель — выявление случаев экстрапарного отцовства в популяции пеночки-трещотки в Псковской области (Северо-Запад России). Материалы и методы. В ходе полевой работы было собрано 124 образца ДНК (27 взрослых самцов, 14 взрослых самок и 83 птенца из 14 семей). Для оценки экстрапарного отцовства использованы три микросателлитных локуса(Ase5, Ase18, Ase27), подходящих для работы с исследуемой популяцией. Результаты. Среди 14 социально моногамных семей экстрапарное отцовство было обнаружено в одном выводке: два птенца из пяти (40%) не являлись потомками самца-хозяина гнезда. Общая частота составила 2,5%, а в 7,1% гнезд обнаружено экстрапарное потомство. Эти показатели значительно ниже, чем в Центральной России, где частота экстрапарного отцовства у данного вида достигает 25%, а экстрапарное потомство встречается в 41% гнезд. Однако из-за малого числа использованных маркеров к полученным результатам следует относиться с осторожностью. Они являются предварительными и требуют дальнейших исследований. Заключение. Более низкая частота экстрапарного отцовства в популяции пеночки-трещотки в Псковской области может быть связана с низкой плотностью гнездования и меньшим числом холостых самцов. Нельзя исключать и заниженную оценку экстрапарного отцовства в результате использования недостаточно большого числа маркеров. Для более полной оценки распространенности экстрапарного отцовства у этого вида и выявления экологических и поведенческих факторов, влияющих на его проявление, необходимы дальнейшие исследования в разных регионах.
Оптимизация условий для продукции шаперонов Hsp70 в клетках Saccharomyces cerevisiae
Обоснование. Молекулярные шапероны регулируют правильную укладку белков в клетке. Члены семейства Hsp70, включая белок Ssa1, — это молекулярные шапероны, которые предотвращают агрегацию белков, способствуют их правильному сворачиванию и деградации, они являются наиболее распространенными среди различных шаперонов, высококонсервативными и присутствуют в различных организмах. Цель — оптимизация методов продукции, выделения и очистки белка Ssa1 из клеток Saccharomyces cerevisiae. Материалы и методы. Последовательности генов SSA1-4 были клонированы в вектор под контролем промоторагена TEF1 и слиты с последовательностью, кодирующей His6-тэг. Штаммы дрожжей с различным генетическим фоном трансформировали полученными конструкциями и оценивали продукцию белков Ssa1-4 при различных условиях культивирования. Для очистки белка Ssa1 использовали методы аффинной и ионообменной хроматографии. Для подтверждения локализации рекомбинантных белков Ssa, слитых с TagRFP-T, в цитоплазме применяли флуоресцентную микроскопию. Результаты и заключение. Оптимизированы методы продукции, выделения и очистки белка Ssa1 из дрожжевых клеток. Этот же подход может быть в дальнейшем использован для очистки других белков семейства Hsp70 и адаптирован для получения различных белков из эукариотических клеток.
Идентификация новых рекомбинантных вариантов вируса Y картофеля
Обоснование. Вирус Y картофеля (PVY) — один из наиболее распространенных РНК-вирусов растений, обладающий большим кругом хозяев как культурных, так и дикорастущих растений разных семейств. PVY существует в виде комплекса штаммов, которые образуют многочисленные рекомбинантные варианты. Изучение генетического разнообразия PVY осложнено тем, что стандартные методы диагностики на основе иммуноферементного анализа и полимеразной цепной реакции в лучшем случае способны выявить штаммовую группу, но не конкретный рекомбинантный вариант. Фактически, только высокопроизводительное секвенирование транскриптомов зараженных растений позволяет определить последовательности вирусных геномов и описать рекомбинантные варианты. Однако использование такого подхода ограничивается относительно высокой стоимостью анализа одного образца, что не позволяет изучать большие выборки растений. Цель — разработать подход для более массового изучения штаммового разнообразия вируса Y картофеля. Материалы и методы. Из образцов листьев картофеля была выделена тотальная РНК и синтезирована кДНКс помощью различных обратных транскриптаз. Амплификация генома PVY проводилась с несколькими различными ДНК-полимеразами. Полученные ампликоны использовали для приготовления библиотек, которые секвенировались на приборе MinION. Прочтения картировали на референс и проводили SNP-сalling для выявления разных изолятов PVY. Результаты. Оценена возможность использования различных обратных транскриптаз и ДНК-полимераз для амплификации фрагмента генома PVY размером 9 кб для последующего секвенирования. Среди исследованной выборки обнаружено 10 изолятов, относящихся к пяти разным рекомбинантам, три из которых относятся к известным и распространенным вариантам, а два выявленных рекомбинантных варианта ранее не были описаны. Один, N-Wi(s), похож на N-Wi, но точка рекомбинации в гене белка Hc-Pro смещена в 5'-сторону и совпадает со штаммом NO-short. Второй, SYR-IIa, похож на штамм SYR-II, однако точка рекомбинации в гене NIb смещена примерно на 50 нуклеотидов в 5'-конец. Заключение. Разнообразие рекомбинантных вариантов PVY является недооцененным, так как даже в небольшой исследованной выборке было обнаружено два новых варианта. Разработанный протокол позволяет проводить исследования штаммового разнообразия вируса Y картофеля. Преимущества подхода состоят в том, что одно прочтение вмещает весь геном, что позволяет однозначно идентифицировать рекомбинантный вариант, а его невысокая себестоимость позволяет увеличивать выборки при анализе биоразнообразия.
Биоинформатика — это быстро развивающаяся дисциплина на стыке биологии, информатики и математики. Научно-технический прогресс в области биологических и биомедицинских наук за последние годы привел к стремительному росту объемов данных. Для анализа и интерпретации больших данных нужны мощные вычислительные инструменты и специалисты с глубокими знаниями в различных областях, включая молекулярную биологию, генетику, программирование и математику. В настоящее время происходит стремительная интеграция методов машинного и глубокого машинного обучения в различные области биологии и медицины, что в существенной степени меняет формат биоинформатических решений и позволяет говорить о наступлении новой эры в биоинформатике. Разработка новых алгоритмов и способов эффективного анализа данных с использованием искусственного интеллекта является основой для будущего развития этой области. В этой связи спрос на специалистов, способных преодолеть разрыв между биологическими и математическими дисциплинами, продолжает расти, что требует соответствующей адаптации учебных программ. В статье рассматриваются последние тенденции в биоинформатике, такие как развитие мультиомиксных подходов и использование искусственного интеллекта, а также подчеркивается важность многопрофильного образования с углубленным обучением в области математики и статистики для подготовки нового поколения ученых, способных стимулировать инновации в этой динамичной области науки.