Видовое разнообразие стрептококков, выделенных в отделениях гнойной хирургии и колопроктологии многопрофильного стационара, и их антибиотикорезистентность

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования. Определение частоты встречаемости и особенностей чувствительности к антибиотикам стрептококков разных видов, выделенных от пациентов отделений гнойной хирургии и колопроктологии многопрофильного стационара г. Москвы.

Материалы и методы. Проведено эпидемиологическое наблюдательное описательное сплошное ретроспективное исследование с использованием данных пациентов гнойной хирургии (n = 2094) и колопроктологии (n = 1933) за 2017–2022 гг. в возрасте 18 лет и старше. Проанализирована чувствительность к антибиотикам 1208 культур стрептококка, выделенных в отделении гнойной хирургии, и 827 культур полученных в отделении колопроктологии. Чувствительность к антибиотикам определяли с помощью микробиологических анализаторов BD Phoenix M50 и VITEK 2XL в соответствии с рекомендациями EUCAST и CLSI.

Результаты. В отделении гнойной хирургии статистически значимо чаще выделяли Streptococcus pyogenes (28,53%), Streptococcus agalactiae (22,0%), Streptococcus anginosus (16,49%), в отделении колопроктологии – S. anginosus (41,66%), Streptococcus constellatus (15,99%), S. agalactiae (14,54%). Значительная доля культур S. agalactiae проявляла резистентность к тетрациклину (80,32%) и клиндамицину (41,13%). В отделении гнойной хирургии резистентность S. agalactiae к эритромицину с 2019 по 2021 г. возросла с 15,4 до 38,3%, в отделении колопроктологии – с 16,67 до 38,46%.

Заключение. Полученные результаты выявили достоверные различия в антимикробной резистентности стрептококков и показали нецелесообразность использования тетрациклина и эритромицина для лечения пациентов в отделении гнойной хирургии.

Об авторах

Азамат Олегович Кайтуков

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет)

Автор, ответственный за переписку.
Email: dodta1510@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4399-081X

аспирант кафедры эпидемиологии и доказательной медицины

Россия, Москва

Екатерина Владимировна Глушкова

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет)

Email: glushkova_e_v@staff.sechenov.ru
ORCID iD: 0000-0001-6997-7598

к.м.н., доцент кафедры эпидемиологии и доказательной медицины

Россия, Москва

Елизавета Аркадьевна Дымент

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет)

Email: elizavetadyment@mail.ru
ORCID iD: 0009-0001-1048-5844

студентка 6-го курса по программе «Медико-профилактическое дело»

Россия, Москва

Татьяна Анатольевна Салмина

Городская клиническая больница № 67 им. Л.А. Ворохобова Департамента здравоохранения города Москвы

Email: sta_1172@mail.ru

заведующая отделом эпидемиологии

Россия, Москва

Василий Георгиевич Крыжановский

Городская клиническая больница № 67 им. Л.А. Ворохобова Департамента здравоохранения города Москвы

Email: kryzhanv@yandex.ru

заместитель главного врача по санитарно-эпидемиологическим вопросам

Россия, Москва

Ольга Евгеньевна Орлова

Городская клиническая больница № 67 им. Л.А. Ворохобова Департамента здравоохранения города Москвы

Email: o.e.orlova@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7210-1116

к.б.н., заведующая микробиологической лабораторией

Россия, Москва

Николай Иванович Брико

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет)

Email: nbrico@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6446-2744

академик РАН, д.м.н., профессор, заслуженный деятель науки РФ, заведующий кафедрой эпидемиологии и доказательной медицины, директор

Россия, Москва

Список литературы

  1. Исматуллин Д.Д., Бочкарева П.В., Бажутова И.В., Лямин А.В., Галиева, Р.Р., Жестков Р.Р. и др. Видовое разнообразие стрептококков при локальных и системных инфекциях. Клиническая лабораторная диагностика 2023; 68(10): 597–603. doi: 10.51620/0869-2084-2023-68-10-597-603 Ismatullin D.D., Bochkarjova P.V., Bazhutova I.V., Ljamin A.V., Galieva R.R., Zhestkov R.R. et al. [Species diversity of streptococci in localized and systemic infections]. Clinical Laboratory Diagnostics 2023; 68(10): 597–603. (In Russ.). doi: 10.51620/0869-2084-2023-68-10-597-603
  2. Морозов А.М., Беляк М.А., Соболь Е.А., Минакова Ю.Е. О микрофлоре хирургических инфекций мягких тканей: Материалы VIII Республиканской науч.-практ. конф. с международным участием «Современные достижения молодых ученых в медицине – 2021». Гродно, Гродненский государственный медицинский университет, 2021: 196–8. Morozov A.M., Beljak M.A., Sobol’ E.A., Minakova Yu.E. [On the microflora of surgical infections of soft tissues: Proceedings of VIII Republican Scientific and Practical Conference with International Participation «Modern Achievements of Young Scientists in Medicine – 2021»]. Grodno, Grodno State Medical University 2021: 196–8. (In Russ.).
  3. Пинчук А.Н., Лептеева Т.Н., Гончарова А.И., Шилин В.Е., Окулич В.К. Тест-системы для идентификации стрептококков и определения их чувствительности к антибиотикам с учетом способности образовывать биопленку. БГМУ в авангарде медицинской науки и практики. Минск, Белорусский государственный медицинский университет, 2021: 364–9. Pinchuk A.N., Lepteeva T.N., Goncharova A.I., Shilin V.E., Okulich V.K. [Test systems for identification of streptococci and determination of their sensitivity to antibiotics taking into account the ability to form a biofilm]. BSMU at the forefront of medical science and practice. Minsk, Belarusian State Medical University 2021: 364–9. (In Russ.).
  4. Сухина М.А., Лягина И.А., Сафин А.Л., Фролов С.А., Кашников, В.Н. Роль кишечной микробиоты в колоректальном канцерогенезе (Обзор литературы). Колопроктология 2021; 20(1): 68–76. doi: 10.33878/2073-7556-2021-20-1-68-76 Sukhina M.A., Ljagina I.A., Safin A.L., Frolov S.A., Kashnikov V.N. [The role of intestinal microbiota in colorectal carcinogenesis (Literature review)]. Coloproctology 2021; 20(1): 68–76. (In Russ.). doi: 10.33878/2073-7556-2021-20-1-68-76
  5. Ракитская И.В., Тарадин Г.Г., Пономарева Е.Ю., Куликова С.О. Этиологическая структура инфекционного эндокардита у отдельных категорий пациентов (Обзор литературы). Архивъ внутренней медицины 2023; 13(1): 24–35. doi: 10.20514/2226-6704-2023-13-1-24-35 Rakitskaуa I.V., Taradin G.G., Ponomareva E.Ju., Kulikova S.O. [Etiological structure of infective endocarditis in certain categories of patients (Literature review)]. Archives of Internal Medicine 2023; 13(1): 24–35. (In Russ.). doi: 10.20514/2226-6704-2023-13-1-24-35
  6. Oppegaard O., Glambek M., Skutlaberg D.H., Skrede S., Sivertsen A., Kittang, B.R. Streptococcus dysgalactiae Bloodstream Infections, Norway, 1999–2021. Emerging Inf. Dis. 2023; 29(2): 260–7. doi: 10.3201/eid2902.221218
  7. Брико Н.И., Дмитриева Н.Ф., Клейменов Д.А., Липатов К.В., Глушкова Е.В., Котин В.В. Чувствительность к антибиотикам стрептококков группы А различных emm генотипов, выделенных от больных инвазивными и неинвазивными инфекциями мягких тканей. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2015; 17(1): 67–72. Briko N.I., Dmitrieva N.F., Klejmenov D.A., Lipatov K.V., Glushkova E.V., Kotin V.V. [Sensitivity to antibiotics of group A streptococci of various emm genotypes isolated from patients with invasive and non-invasive soft tissue infections]. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy 2015; 17(1): 67–72. (In Russ.).
  8. Беспятых Ю. А., Шитиков Е. А. Омиксные технологии как инструмент поиска новых потенциальных мишеней для противотуберкулезных препаратов. Проблемы медицинской микологии 2020; 22(3 Тезисы): 50. Bespjatyh Yu.A., Shitikov E.A. [Omics technologies as a tool to search for new potential targets for antituberculosis drugs]. Problems of Medical Mycology 2020; 22(3 Theses): 50. (In Russ.).
  9. Давидович Н.В., Галиева А.С., Давыдова Н.Г., Малыгина О.Г., Кукалевская Н.Н., Симонова Г.В. и др. Спектр и детерминанты резистентности клинических изолятов оральных стрептококков. Клиническая лабораторная диагностика 2020; 65(10): 632–7. doi: 10.18821/0869-2084-2020-65-10-632-637 Davidovich N.V., Galieva A.S., Davydova N.G., Malygina O.G., Kukalevskaja N.N., Simonova G.V. et al. [Spectrum and determinants of resistance of clinical isolates of oral streptococci]. Clinical Laboratory Diagnostics 2020; 65(10): 632–7. (In Russ.). doi: 10.18821/0869-2084-2020-65-10-632-637
  10. ВОЗ. Рост числа случаев скарлатины и инвазивной стрептококковой инфекции группы А – данные по нескольким странам. https://www.who.int/ru/emergencies/disease-outbreak-news/item/2022-DON429 [World Health Organization. Increased incidence of scarlet fever and invasive Group A Streptococcus infection – multi-country]. (In Russ.). https://www.who.int/emergencies/disease-outbreak-news/item/2022-DON429
  11. Добронравов В.А., Ватазин А.В., Смирнов А.В., Батюшин М.М., Бобкова И.Н., Зулькарнаев А.Б. и др. Нефрологическая служба в условиях пандемии COVID-19 (позиция Ассоциации нефрологов). Нефрология 2021; 25(1): 9–17. doi: 10.36485/1561-6274-2021-25-1-9-17 Dobronravov V.A., Vatazin A.V., Smirnov A.V., Batjushin M.M., Bobkova I.N., Zul’karnaev A.B et al. [Nephrological service in the context of the COVID-19 pandemic (position of the Association of Nephrologists)]. Nephrology 2021; 25(1): 9–17. (In Russ.). doi: 10.36485/1561-6274-2021-25-1-9-17
  12. Митрофанова Н.Н., Лебедев М.В., Мельников В.Л., Купрюшин А.С. К вопросу антибиотикорезистентности этиологических агентов гнойно-воспалительных заболеваний у пациентов отделения челюстно-лицевой хирургии многопрофильного стационара. Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Медицинские науки 2017: 3(43): 49–56. doi: 10.21685/2072-3032-2017-3-6 Mitrofanova N.N., Lebedev M.V., Mel’nikov V.L., Kupryushin A.S. [On the issue of antibiotic resistance of etiological agents of purulent-inflammatory diseases in patients of the department of maxillofacial surgery of a multidisciplinary hospital]. News of higher educational institutions. Volga Region. Medical Sciences 2017; 3(43): 49–56. (In Russ.). doi: 10.21685/2072-3032-2017-3-6
  13. Федянин С.Д., Окулич В.К. Мониторинг резистентности к антибиотикам проблемных микроорганизмов у пациентов с гнойными ранами. Проблемы здоровья и экологии 2020; 3(65): 69–74. doi: 10.22263/2312-4156.2020.5.59 Fedyanin S. D., Okulich V. K. [Monitoring of antibiotic resistance of problematic microorganisms in patients with purulent wounds]. Problems of health and ecology 2020; 3(65): 69–74. (In Russ.). doi: 10.22263/2312-4156.2020.5.59
  14. Oppegaard O., Skrede S., Mylvaganam H., Kittang B.R. Emerging threat of antimicrobial resistance in β-hemolytic streptococci. Frontiers in microbiology 2020; (11): 797. doi: 10.3389/fmicb.2020.00797
  15. Paspaliari D.K., Sarvikivi E., Ollgren J., Vuopio J. Invasive beta-haemolytic streptococcal infections, Finland, 2006 to 2020: increase in Lancefield group C/G infections. Eurosurveillance 2023; 28(31): 2200807. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2023.28.31.2200807
  16. Pilarczyk-Zurek M., Sitkiewicz I., Koziel J. The clinical view on Streptococcus anginosus group–opportunistic pathogens coming out of hiding. Front. Microbiol. 2022; 13: 956677. doi: 10.3389/fmicb.2022.956677
  17. Kuryłek A., Stasiak M., Kern-Zdanowicz I. Virulence factors of Streptococcus anginosus – a molecular perspective. Front. Microbiol. 2022; 13: 1025136. doi: 10.3389/fmicb.2022.1025136
  18. Степанов А.С., Васильева Н.В., Щербина Е.С., Каменева О.А., Косякова К.Г. Резистентность различных серогрупп Streptococcus spp. к антимикробным препаратам. Проблемы медицинской микологии 2018; 20(4): 55–8. Stepanov A.S., Vasil’eva N.V., Shherbina E.S., Kameneva O.A., Kosjakova K.G. [Resistance of various serogroups of Streptococcus spp. to antimicrobial drugs]. Problems of medical mycology 2018; 20(4): 55–8. (In Russ.).
  19. Шалепо К. В., Колоусова К. А. Определение факторов вирулентности и антибиотикорезистентности Streptococcus agalactiae – значение для разработки мер профилактики перинатальных инфекций. Проблемы медицинской микологии 2022; 24(2 Тезисы): 152–3. Shalepo K.V., Kolousova K.A. [Determination of virulence factors and antibiotic resistance of Streptococcus agalactiae – significance for the development of measures for the prevention of perinatal infections]. Problems of medical mycology 2022; 24(2 Thesis): 152–3. (In Russ.).
  20. Середич Ю.С., Хилькевич К.Б., Корж Н.А. Распространение антибиотикорезистентности стафилококков, стрептококков, Е. coli, выделенных от госпитализированных пациентов в стационарах г. Гомеля: Материалы VII Республиканской науч.-практ. молодежной конф. «Декабрьские чтения. Инфекции в медицине – 2017». Гомель, Гомельский государственный медицинский университет, 2017: 99–103. Seredich Yu.S., Khilkevich K.B., Korzh N.A. [Distribution of antibiotic resistance of staphylococci, streptococci, E. сoli isolated from hospitalized patients in the hospitals of Gomel: Proceedings of the VII Republican Scientific and Practical Youth Conference «December Readings. Infections in medicine – 2017»]. Gomel, Gomel State Medical University 2017: 99–103. (In Russ.).
  21. Vannice K.S., Ricaldi J., Nanduri S., Fang F.C., Lynch J.B., Bryson-Cahn C. et al. Streptococcus pyogenes pbp2x mutation confers reduced susceptibility to β-lactam antibiotics. Clin. Infect. Dis. 2020; 71(1): 201–4. doi: 10.1093/cid/ciz1000

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Частота выделения преобладающих микроорганизмов у пациентов ГКБ № 67 а – отделение гнойной хирургии; б – отделение колопроктологии.

Скачать (102KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Удельный вес часто встречающихся стрептококков, выделенных от пациентов ГКБ № 67 в 2017-2022 гг. а – отделение гнойной хирургии; б – отделение колопроктологии.

Скачать (123KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Структура микроорганизмов, выделенных в ассоциации со стрептококками от пациентов ГКБ № 67 в 2017-2022 гг. а – отделение гнойной хирургии; б – отделение колопроктологии.

Скачать (77KB)
Метаданные

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».