Молекулярная диагностика в верификации туберкулезного плеврита в Марокко

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Туберкулезный плеврит (pleural tuberculosis — pTB) является очень распространенной формой внелегочного туберкулеза (ТБ). Его диагностика представляет собой серьезную проблему во всем мире из-за недостатков традиционных диагностических методов. К последним относятся микроскопическое исследование плевральной жидкости на наличие кислотоустойчивых микроорганизмов, культивирование микобактерий из плеврального экссудата на твердых или жидких средах и гистологическое исследование биопсии плевры.

В связи с этим наше внимание было направлено на разработку новых диагностических тестов, основанных на амплификации нуклеиновых кислот (ПЦР и РТ-ПЦР), как наиболее точных, быстрых, высокочувствительных и специфичных. В этом контексте данное исследование было проведено для оценки эффективности методов молекулярной диагностики при дифференциации микобактерий туберкулеза и нетуберкулезных микобактерий в плевральном экссудате. Пятьдесят пациентов с плевритом были включены в проспективное исследование в г. Рабат, Марокко. Эффективность ПЦР двух ДНК-мишеней — IS6110 и микобактериального внутреннего транскрибируемого спейсера (MYITS) — для диагностики туберкулезного плеврита оценивали на основании сравнения с результатами гистологического исследования и культивирования. Наши результаты показали, что IS6110-ПЦР может выявить pTB с чувствительностью и специфичностью 41,6 и 85,7% соответственно. Таким образом, полученные результаты подтверждают, что молекулярные тесты имеют относительно высокую специфичность для диагностики внелегочного туберкулеза, но более низкую чувствительность, поэтому положительный результат рассматривается как подтверждение pTB, тогда как отрицательный тест не может исключать заболевание. Хотя исследование было ограничено небольшим размером выборки, оно добавляет к совокупности доказательств полезности молекулярного тестирования в качестве дополнения к гистологическому исследованию для точной диагностики pTB, своевременного лечения и предотвращения появления и распространения лекарственно-устойчивого pTB. Необходимы дальнейшие исследования для повышения чувствительности молекулярных методов и определения оптимальных молекулярных мишеней, которые могут быть полезны в клинической практике.

Об авторах

И. Шауи

Национальный центр энергетики, ядерных наук и технологий

Автор, ответственный за переписку.
Email: im_chaoui@yahoo.fr
ORCID iD: 0000-0002-4681-1461

Шауи Имане - кандидат наук, научный сотрудник отдела медикобиологических исследований департамента наук о жизни Национального центра энергетики, ядерных наук и технологий.

10001, Рабат, п.я. 1382.

Тел.: +212 537 713 205; Факс: +212 537 711 846

Марокко

С. Тауди

Больница им. Мулая Юссефа

Email: im_chaoui@yahoo.fr

Кандидат наук, научный сотрудник отделения фтизиопульмонологии больницы им. Мулая Юссефа.

Рабат.

Марокко

А. Удгири

Национальный центр энергетики, ядерных наук и технологий

Email: im_chaoui@yahoo.fr

Кандидат наук, научный сотрудник отдела медикобиологических исследований департамента наук о жизни Национального центра энергетики, ядерных наук и технологий.

Рабат.

Марокко

Д. Бенамор

Больница им. Мулая Юссефа

Email: im_chaoui@yahoo.fr

Профессор, врач-фтизиопульмонолог отделения фтизиопульмонологии Больницы им. Мулая Юссефа.

Рабат.

Марокко

Д. Буркади

Больница им. Мулая Юссефа

Email: im_chaoui@yahoo.fr

Профессор, врач-фтизиопульмонолог отделения фтизиопульмонологии Больницы им. Мулая Юссефа.

Рабат.

Марокко

М. Эль Мзибри

Национальный центр энергетики, ядерных наук и технологий

Email: im_chaoui@yahoo.fr

Кандидат наук, руководитель Департамента наук о жизни Национального центра энергетики, ядерных наук и технологий.

Рабат.

Марокко

Список литературы

  1. Aggarwal A.N., Gupta D., Jindal S.K. Diagnosis of tubercular pleural effusion. Indian. J. Chest., 1999, vol. 41, no. 2, pp. 89—100.
  2. Asghar M.U., Mehta S.S., Cheema H.A., Patti R., Pascal W. Sputum smear and culture-negative tuberculosis with associated pleural effusion: a diagnostic challenge. Cureus, 2018, vol. 10, no. 10: e3513. doi: 10.7759/cureus.3513
  3. Cohen L.A., Light R.W. Tuberculous pleural effusion. Turk. Thorac. J., 2015, vol. 16, no. 1, pp. 1—9. doi: 10.5152/ttd.2014.001
  4. Diraa O., Elmdaghri N., Laaboudi L., Boudouma M., Gutierrez M.C., Benbachir M. IS6110 restriction fragment length polymorphism of Mycobacterium tuberculosis isolates from an area of Casablanca, Morocco. Int. J. Tuberc. Lung. Dis., 2005, vol. 9, no. 11, pp. 1294-1296.
  5. Galimi R. Extrapulmonary tuberculosis: tuberculous meningitis new developments. Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci., 2011, vol. 15, no. 4, pp. 365-386.
  6. Gholoobi A., Masoudi-Kazemabad A., Meshkat M., Meshkat Z. Comparison of culture and PCR methods for diagnosis of Mycobacterium tuberculosis in different clinical specimens. Jundishapur. J. Microbiol., 2014, vol. 7, no. 2: e8939. doi: 10.5812/jjm.8939
  7. Greco S., Girardi E., Masciangelo R., Capoccetta G.B., Saltini C. Adenosine desaminase and interferon gamma measurements for the diagnosis of tuberculous pleurisy: a meta-analysis. Int. J. Tuberc. Lung. Dis., 2003, vol. 7, no. 8, pp. 777-786.
  8. Haddaoui H., Mrabet F.Z., Aharmin M., Bourkadi J.E. Multidrug-resistant extrapulmonary tuberculosis: about 7 cases. Pan. Afr. Med. J., 2019, vol. 32: 196. doi: 10.11604/pamj.2019.32.196
  9. Hillemann D., Rusch-Gerdes S., Boehme C., Richter E. Rapid molecular detection of extrapulmonary tuberculosis by the automated GeneXpert MTB/RIF system. J. Clin. Microbiol., 2011, vol. 49, no. 4, pp. 1202-1205. doi: 10.1128/JCM.02268-10
  10. Jeon D. Tuberculous pleurisy: an update. Tuberc. Respir. Dis., 2014, vol. 76, no. 4, pp. 153-159. doi: 10.4046/trd.2014.76.4.153
  11. J0rstad M.D., ABmus J., Marijani M., Sviland L., Mustafa T. Diagnostic delay in extrapulmonary tuberculosis and impact on patient morbidity: a study from Zanzibar. PLoS One, 2018, vol. 13, no. 9: e0203593. doi: 10.1371/journal.pone.0203593
  12. Lee J.Y. Diagnosis and treatment of extrapulmonary tuberculosis. Tuberc. Respir. Dis., 2015, vol. 78, no. 2, pp. 47-55. doi: 10.4046/trd.2015.78.2.47
  13. Light R.W. Pleural effusion in pulmonary embolism. Semin. Respir. Crit. Care. Med., 2010, vol. 31, no. 6, pp. 716-722. doi: 10.1055/s-0030-1269832
  14. Makeshkumar V., Madhavan R., Narayanan S. Polymerase chain reaction targeting insertion sequence for the diagnosis of ex-trapulmonary tuberculosis. Indian J. Med. Res., 2014, vol. 139, no. 1, pp. 161—166.
  15. Mehta P.K., Raj A., Singh N., Khuller G.K. Diagnosis of extrapulmonary tuberculosis by PCR. FEMS Immunol. Med. Microbiol., 2012, vol. 66,pp. 20-36. doi: 10.1111/j.1574-695x.2012.00987.x
  16. Mokaddas E., Ahmad S. Development and evaluation of a multiplex PCR for rapid detection and differentiation of Mycobacterium tuberculosis complex members from non-tuberculous mycobacteria. Jpn. J. Infect. Dis., 2007, vol. 60, no. 2-3, pp. 140-144.
  17. Molaudzi M., Molepo J. The use of real-time polymerase chain reaction and an adenosine deaminase assay for diagnosing pleural tuberculosis. Afr. J. Lab. Med., 2019, vol. 8, no. 1: 731.
  18. Pang Y., An J., Shu W., Huo F., Chu N., Gao M., Qin S., Huang H., Chen X., Xu S. Epidemiology of extrapulmonary tuberculosis among inpatients, China, 2008-2017. Emerg. Infect. Dis., 2019, vol. 25, no. 3, pp. 457-464. doi: 10.3201/eid2503.180572
  19. Roychowdhury T., Mandal S., Bhattacharya A. Analysis of IS6110 insertion sites provides a glimpse into genome evolution of Mycobacterium tuberculosis. Sci. Rep., 2015, vol. 5: 12567. doi: 10.1038/srep12567
  20. Sankar M.M., Singh J., Diana S.C., Singh S. Molecular characterization of Mycobacterium tuberculosis isolates from North Indian patients with extrapulmonary tuberculosis. Tuberculosis (Edinb.), 2013, vol. 93, no. 1, pp. 75-83. doi: 10.1016/j.tube.2012.10.005
  21. Seibert A.F., Haynes J. Jr., Middleton R., Bass J.B. Jr. Tuberculous pleural effusion. Twenty-year experience. Chest, 1991, vol. 99, no. 4, pp. 883-886.
  22. Tyagi S., Sharma N., Tyagi J.S., Haldar S. Challenges in pleural tuberculosis diagnosis: existing reference standards and nucleic acid tests. Future Microbiol., 2017, vol. 12, pp: 1201-1218. doi: 10.2217/fmb-2017-0028
  23. WHO. Global tuberculosis Report 2018. Geneva: WHO, 2018. URL: https://apps.who.int/medicinedocs/documents/s23553en/s23553en.pdf (11.11.2019)
  24. Zhai K., Lu Y., Shi H.Z. Tuberculous pleural effusion. J. Thorac. Dis., 2016, vol. 8, no. 7, pp. E486-E494. doi: 10.21037/jtd.2016.05.87

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Шауи И., Тауди С., Удгири А., Бенамор Д., Буркади Д., Эль Мзибри М., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».