Состояние кишечной микробиоты у пациентов с сахарным диабетом 2 типа в зависимости от наличия хронического пиелонефрита на додиализных стадиях хронической болезни почек – наблюдательное исследование «случай-контроль»

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование: Сахарный диабет (СД) 2 типа принадлежит к числу основных причин хронической болезни почек (ХБП) и терминальной стадии почечной недостаточности. В медицинском сообществе продолжаются дискуссии о возможном влиянии нарушения состава кишечной микробиоты (КМ) на прогрессирование ХБП. КМ представляет собой совокупность микроорганизмов, играющих важную роль в поддержании здоровья макроорганизма и участвующих в различных физиологических процессах. Одной из актуальных проблем является исследование состава КМ у пациентов с ХБП и СД 2 типа. Большинство исследований КМ были проведены у пациентов с ХБП 4–5 стадий. В данной статье представлены результаты исследования состояния КМ у пациентов с СД 2 типа с ХБП на додиализных стадиях в сочетании с хроническим пиелонефритом (ХП), полученные при помощи газовой хромато-масс-спектрометрии (ГХМС) по методике масс-спектрометрии микробных маркеров (МСММ).

Цель исследования: изучение состава КМ в московской популяции пациентов с СД 2 типа в сочетании с ХП на додиализных стадиях ХБП при помощи ГХМС по методике МСММ образцов кала.

Материалы и методы: Анализ КМ проводился с 2021 по 2024 г. у 69 пациентов (23 пациента с СД 2 типа и ХБП 3–4 стадий; 9 – с ХБП 3–4 стадий с СД 2 типа в сочетании с ХП; 23 – с СД 2 типа и ХБП 2 стадии; 14 – с СД 2 типа и без ХБП) и 26 здоровых добровольцев.

Результаты: Установлено, что у пациентов с СД 2 типа без ХБП по сравнению со здоровыми добровольцами наблюдалось достоверное снижение количества Prevotella spp., Propionibacterium jensenii и Bacteroides fragilis, а также достоверное увеличение Bacillus megaterium (Priestia megaterium) (p<0,05). В группе пациентов с СД 2 типа и ХБП 2 стадии по сравнению с пациентами, имеющими только СД 2 типа, выявлено увеличение количества Fusobacterium spp./Haemophilus spp. (p<0,05). Сравнение пациентов с СД 2 типа и ХБП 3–4 стадий с пациентами с СД 2 типа и ХБП 2 стадии показало снижение Lactobacillus spp. и Ruminococcus spp. в группе СД 2 типа и ХБП 3–4 стадий. Одновременно у этих пациентов отмечено достоверное увеличение Propionibacterium acnes (Cutibacterium acnes) и Actinomyces spp. (p<0,05). У пациентов с СД 2 типа и ХБП 3–4 стадий с обострением хронического пиелонефрита, получавших антимикробную терапию, выявлено достоверное увеличение количества Rhodococcus spp., общей микробной нагрузки, общей бактериальной нагрузки, анаэробов и Peptostreptococcus anaerobius 18623 по сравнению с пациентами СД 2 типа, ХБП 3–4 стадии без ХП (все p<0,05).

Заключение: В настоящем исследовании впервые на московской популяции был изучен и сравнен состав КМ у пациентов с СД 2 типа на различных додиализных стадиях ХБП. Полученные результаты определяют необходимость дальнейшего изучения роли КМ и прогностического значения ее изменений при прогрессировании ХБП.

Об авторах

Н. В. Стуров

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Email: sturov_nv@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0002-3138-8410

к.м.н., доцент, зав. кафедрой общей врачебной практики медицинского института

Россия, Москва

Сергей Витальевич Попов

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Автор, ответственный за переписку.
Email: popov_serv@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0002-0567-4616

д.м.н., профессор кафедры общей врачебной практики медицинского института

Россия, Москва

Ж. Д. Кобалава

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Email: kobalava_zhd@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0002-5873-1768

д.м.н., профессор, член-корр. РАН, зав. кафедрой внутренних болезней с курсом кардиологии и функциональной диагностики им. акад. В.С. Моисеева медицинского института, руководитель Института клинической медицины

Россия, Москва

И. И. Беликов

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Email: belikov_ii@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0001-5141-2193

ассистент кафедры общей врачебной практики медицинского института

Россия, Москва

В. А. Жуков

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Email: zhukov_vlan@rudn.ru
ORCID iD: 0000-0001-9995-264X

к.м.н., доцент кафедры общей врачебной практики медицинского института

Россия, Москва

Т. В. Ляпунова

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Email: lyapunova_tv@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0002-1141-0764

к.м.н., доцент кафедры медицинской информатики и телемедицины медицинского института

Россия, Москва

Т. А. Мелешкевич

Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы

Email: meleshkevich_ta@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0003-3229-3357

к.м.н., доцент кафедры госпитальной терапии с курсами эндокринологии, гематологии и клинической лабораторной диагностики медицинского института

Россия, Москва

Список литературы

  1. Ассоциация нефрологов. Клинические рекомендации. Хроническая болезнь почек (ХБП). Москва: Министерство Здравоохранения Российской Федерации; 2024. [Association of Nephrologists. Clinical guidelines for Chronic kidney disease (CKD). Moscow: Ministry of Health of the Russian Federation; 2024. (In Russ.)]
  2. Krukowski H., Valkenburg S., Madella A.M., et al. Gut microbiome studies in CKD: opportunities, pitfalls and therapeutic potential. Nature Reviews Nephrology. 2023;19(2):87–101. doi: 10.1038/s41581-022-00647-z.
  3. Шутов Е.В, Большаков С.А, Макарова Т.А, и др. Микробиота кишечника и заболевания почек. Обзор литературы. Нефрология и диализ. 2024;26(3):283–302. [Shutov E.V, Bol’shakov S.A, Makarova T.A., et al. Intestinal microbiota and kidney diseases. Literature review. Nefrologiya i dializ. 2024;26(3):283–302. (In Russ.)]. doi: 10.28996/2618-9801-2024-3-283-302.
  4. Wong J., Piceno Y.M., DeSantis T.Z., et al. Expansion of urease- and uricase-containing, indole- and p-cresol-forming and contraction of short-chain fatty acid-producing intestinal microbiota in ESRD. Am J Nephrol. 2014;39(3):230–237. doi: 10.1159/000360010.
  5. Xu K.-Y., Xia G.-H., Lu J.-Q., et al. Impaired renal function and dysbiosis of gut microbiota contribute to increased trimethylamine-N-oxide in chronic kidney disease patients. Sci Rep. 2017;7(1):1445. doi: 10.1038/s41598-017-01387-y.
  6. Stadlbauer V., Horvath A., Ribitsch W., et al. Structural and functional differences in gut microbiome composition in patients undergoing haemodialysis or peritoneal dialysis. Sci Rep. 2017;7(1):15601. doi: 10.1038/s41598-017-15650-9.
  7. Vaziri N.D., Yuan J., Nazertehrani S., et al. Chronic kidney disease causes disruption of gastric and small intestinal epithelial tight junction. Am J Nephrol. 2013;38(2):99–103. doi: 10.1159/000353764.
  8. Vaziri N.D., Zhao Y.-Y., Pahl M.V. Altered intestinal microbial flora and impaired epithelial barrier structure and function in CKD: the nature, mechanisms, consequences and potential treatment. Nephrol Dial Transplant. 2016;31(5):737–746. doi: 10.1093/ndt/gfv095.
  9. Wang I.-K., Lai H.-C., Yu C.-J., et al. Real-Time PCR Analysis of the Intestinal Microbiotas in Peritoneal Dialysis Patients. Appl Environ Microbiol. 2012;78(4):1107–1112. doi: 10.1128/AEM.05605-11.
  10. Lun H., Yang W., Zhao S., et al. Altered gut microbiota and microbial biomarkers associated with chronic kidney disease. Microbiologyopen. 2019;8(4):1107-12. doi: 10.1002/mbo3.678.
  11. Tidjani Alou M., Naud S., Khelaifia S., et al. State of the Art in the Culture of the Human Microbiota: New Interests and Strategies. Clin Microbiol Rev. 2020;34(1).doi: 10.1128/cmr.00129-19.
  12. Хафизов К.Ф., Сперанская А.С, Мацвай А.Д, и др. Передовые технологии в диагностике вирусных заболеваний неясной этиологии. Инфекция и иммунитет. 2020;10(1):9–25. [Khafizov K.F., Speranskaya A.S, Matsvai A.D, et al. Advanced technologies in the diagnosis of viral diseases of unknown etiology. Infektsiya i immunitet. 2020;10(1):9–25. (In Russ.)]. doi: 10.15789/2220-7619-ATI-824.
  13. Бойко Н.Б., Гриневич В.Б., Федосова Н.Ф., и др. Методика масс-спектрометрии микробных маркеров как способ оценки пристеночной кишечной микробиоты при заболеваниях органов пищеварения. Учебно-методическое пособие. СПб., 2013. [Boiko N.B., Grinevich V.B., Fedosova N.F., et al. The technique of mass spectrometry of microbial markers as a way to assess the intestinal microbiota in diseases of the digestive system. Educational and methodological manual. St. Petersburg, 2013. (In Russ.)]
  14. Ситкин С.И., Вахитов Т.Я., Ткаченко Е.И. и др. Филометаболическое ядро микробиоты кишечника. Альманах клинической медицины. 2015;40:12?34. [Sitkin S.I., Vakhitov T.Ya., Tkachenko E.I. et al. Phylometabolic core of intestinal microbiota. Al’manakh klinicheskoi meditsiny. 2015;(40):12–34. (In Russ.)]. doi: 10.18786/2072-0505-2015-40-12-34.
  15. Демидова Т.Ю., Ардатская М.Д. Дисфункция филометаболического ядра микробиоты в патогенезе сахарного диабета 2 типа. FOCUS Эндокринология. 2021;3:16–23. [Demidova T.Yu., Ardatskaya M.D. The phylometabolic core of intestinal microbiota dysfunction in the pathogenesis of diabetes mellitus. FOCUS Endokrinologiya. 2021;3:16–23. (In Russ.)]. doi: 10.47407/ef2021.2.3.0030.
  16. Jeyaraman M., Mariappan T., Jeyaraman N., et al. Gut microbiome: а revolution in type II diabetes mellitus. World J Diabetes. 2024;15(9):1874–1888. doi: 10.4239/wjd.v15.i9.1874.
  17. Чижков П.А., Лагутина С.Н., Котова Ю. А., и др. Особенности разнообразия кишечной микробиоты у пациентов пожилого возраста с метаболическими нарушениями (обзор литературы). Научные результаты биомедицинских исследований. 2023;9(3):366–382. [Chizhkov P. A., Lagutina S. N., Kotova Yu.А. et al. Features of the diversity of the intestinal microbiota in elderly patients with metabolic disorders (literature review). Nauchnye rezul’taty biomeditsinskikh issledovanii. 2023;9(3):366?382. (In Russ.)]. doi: 10.18413/2658-6533-2023-9-3-0-7.
  18. Dyshlyuk L.S., Milentyeva I.S., Asyakina L.K., et al. Using bifidobacterium and propionibacterium strains in probiotic consortia to normalize the gastrointestinal tract. Braz J Biol. 2022;84:e256945. doi: 10.1590/1519-6984.256945.
  19. Zhao J., Ning X., Liu B., et al. Specific alterations in gut microbiota in patients with chronic kidney disease: an updated systematic review. Renal Failure. 2021;43(1):102–112. doi: 10.1080/0886022X.2020.1864404.
  20. Айтбаев К.А., Муркамилов И.Т., Фомин В.В. и др. Воспаление при хронической болезни почек: источники, последствия и противовоспалительная терапия. Клиническая медицина. 2018;4:314–320. [Aitbaev K. A., Murkamilov I. T., Fomin V. et al. Inflammation in chronic kidney disease: sources, consequences, and anti-inflammatory therapy. Klinicheskaya meditsina. 2018;4:314–320. (In Russ.)]. doi: 10.18821/0023-2149-2018-96-4-314-320.
  21. Стуров Н.В., Попов С.В., Беликов И.И. и др. Состояние кишечной микробиоты у пациентов с хронической болезнью почек. Современная наука: актуальные проблемы теории и практики. Серия: Естественные и технические науки. 2022;2-2:199–202. [Sturov N.V., Popov S.V., Belikov I.I., et al. The state of the intestinal microbiota in patients with chronic kidney disease. Sovremennaya nauka: aktual’nye problemy teorii i praktiki. Seriya: Estestvennye i tekhnicheskie nauki. 2022;2-2:199–202. (In Russ.)]. doi: 10.37882/2223-2966.2022.02.33.
  22. Лукичев Б.Г, Румянцев А.Ш, Панина И.Ю. и др. Микробиота кишечника и хроническая болезнь почек. Сообщение второе. Нефрология. 2019;23(1):18–31. [Lukichev B.G, Rumyantsev A.Sh, Panina I.Yu, et al. Intestinal microbiota and chronic kidney disease. The second message. Nefrologiya 2019;23(1):18–31. (In Russ.)]. doi: 10.24884/1561-6274-2019-23-1-18-31.
  23. Sturov N.V., Popov S.V., Belikov I.I. Gut microbiota and the ways to correct it in chronic kidney disease. Indian J Nephrol. 2023;33(3):162–169. doi: 10.4103/ijn.ijn_469_21.
  24. Покровская Е.В., Шамхалова М.Ш., Шестакова М.В. Новые взгляды на состояние кишечной микробиоты при ожирении и сахарном диабете 2 типа. Сахарный диабет. 2019;22(3):253–262. [Pokrovskaya E.V., Shamkhalova M.Sh, Shestakova M.V. New views on the state of the intestinal microbiota in obesity and type 2 diabetes mellitus. Sakharnyi diabet. 2019;22(3):253–262. (In Russ.)] doi: 10.14341/DM10194.
  25. Sadagopan A., Mahmoud A., Begg M., et al. Understanding the role of the gut microbiome in diabetes and therapeutics targeting leaky gut: a systematic review. 2023;15(7):e41559. doi: 10.7759/cureus.41559.
  26. Yu J.-X., Chen X., Zang S.-G., et al. Gut microbiota microbial metabolites in diabetic nephropathy patients: far to go. Front Cell Infect Microbiol. 2024;14:1359432. doi: 10.3389/fcimb.2024.1359432.
  27. Демидова Т.Ю., Лобанова К.Г., Ойноткинова О.Ш. Кишечная микробиота как фактор риска развития ожирения и сахарного диабета 2 типа. Терапевтический архив. 2020;10:97–104. [Demidova T. Y., Lobanova K.G., Oinotkinova O.S. Intestinal microbiota as a risk factor for developing obesity and type 2 diabetes. Terapevticheskii arkhiv. 2020;10:97–104. (In Russ.)]. doi: 10.26442/00403660.2020.10.000778.
  28. Bhargava S., Merckelbach E., Noels H., et al. Homeostasis in the Gut Microbiota in Chronic Kidney Disease. Toxins. 2022;14(10):648. doi: 10.3390/toxins14100648.
  29. Voroneanu L., Burlacu A., Brinza C., et al. Gut microbiota in chronic kidney disease: from composition to modulation towards better outcomes - а systematic review. J Clin Med. 2023;12(5):1948. doi: 10.3390/jcm12051948.
  30. Alhhazmi A.A., Alhamawi R.M., Almisned R.M., et al. Gut microbial and associated metabolite markers for colorectal cancer diagnosis. Microorganisms. 2023;11(8):2037. doi: 10.3390/microorganisms11082037.
  31. Методические рекомендации MP 2.3.1.0253-21 Нормы физиологических потребностей в энергии и пищевых веществах для различных групп населения Российской Федерации (утв. Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 22 июля 2021 г.). [Methodological recommendations MP 2.3.1.0253-21 Norms of physiological energy and nutritional requirements for Various Groups of the population of the Russian Federation (approved by the Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare on July 22, 2021) (In Russ.)].
  32. Халиуллина С.В., Анохин В.А., Поздеев О.К. и др. Кишечный дисбиоз – этиологическая и патогенетическая основа синдрома бактериурии. Казанский медицинский журнал. 2003;1:51–53. [Khaliullina S. V., Anokhin V. A., Pozdeev O. K. Intestinal dysbiosis-the etiological and pathogenetic basis of bacteriuria syndrome. Kazanskiy meditsinskiy zhurnal=Kazan Medical Journal. 2003;1:51–53. (In Russ.)]

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис 1. Сравнительная характеристика КМ пациентов с СД 2 типа и здоровых добровольцев

Скачать (61KB)
3. Рис. 2. Сравнительная характеристика КМ пациентов с СД 2 типа и ХБП 2 стадии и больных СД 2 типа без ХБП

Скачать (44KB)
4. Рис 3. Сравнительная характеристика КМ пациентов с СД 2 типа и ХБП 3-4 стадий и больных СД 2 типа и ХБП 2 стадии

Скачать (65KB)
5. Рис 4. Сравнительная характеристика КМ пациентов с СД 2 типа и ХБП 3-4 стадий с ХП и больных СД 2 типа и ХБП 3-4 стадий без ХП

Скачать (53KB)

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».