ANALYSIS OF CONTINUOUS DATA USING R


Cite item

Full Text

Abstract

The article presents basic algorithms of R software using for continuous data analysis. The basic algorithms for comparing quantitative data of one, two and three or more independent and related samples using parametric and non-parametric criteria are presented.

About the authors

V L Egoshin

Semey State Medical University, Pavlodar Campus

S V Ivanov

I.P. Pavlov First St. Petersburg State Medical University

N V Savvina

North-Eastern Federal University

S B Kalmakhanov

Al-Farabi Kazakh National University

L M Zhamaliyeva

West Kazakhstan Marat Ospanov State Medical University

A M Grjibovski

North-Eastern Federal University; Al-Farabi Kazakh National University; West Kazakhstan Marat Ospanov State Medical University; Northern State Medical University

Email: Andrej.Grjibovski@gmail.com
доктор медицины, заведующий ЦНИЛ; профессор; визитинг-профессор

References

  1. Кабаков Р. И. R в действии. Анализ и визуализация данных в программе R / пер. с англ. П. А. Волковой. М.: ДМК Пресс, 2014. 588 с
  2. Мастицкий С. Э., Шитиков В. К. Статистический анализ и визуализация данных с помощью R. М.: ДМК Пресс, 2015. 496 с
  3. Мастицкий С. Э. R: Анализ и визуализация данных. 2017. URL: http://r-analytics.blogspot.com (дата обращения 18.09.2018)
  4. Усынина А. А., Одланд И. О., Пылаева Ж. А., Пастбина И. М., Гржибовский А. М. Регистр родов Архангельской области как важный информационный ресурс для науки и практического здравоохранения // Экология человека. 2017. № 2. С. 58-64
  5. Altman D. G., Bland J. M. Parametric V Non-Parametric Methods for Data Analysis. BMJ. 2009, 338, p. a3167.
  6. Anuar, Roee. 2017. Ties Should Not Be Present ’in One-Sample Kolmgorov-Smirnov Test in R. Available from: https://stats.stackexchange.com/questions/232011/ties-should-not-be-present-in-one-sample-kolmgorov-smirnov-test-in-r/232067 (accessed: 18.09.2018).
  7. Bland J. M., Altman D. G. Analysis of continuous data from small samples. BMJ. 2009, 338, p. a3166.
  8. Bland J. M., Altman D. G. Statistics Notes: Transforming Data. BMJ. 1996, 312, p. 770.
  9. Cafiso S., DiGraziano A., Pappalardo G. Using the Delphi method to evaluate opinions of public transport managers on bus safety. Safety Science. 2013, 57 (8), pp. 254-263.
  10. Cohen J. 1988. Statistical Power Analys is for the Behavioral Sciences. 2nd ed. Lawrence Erlbaum Associates, Hillsdale, New Jersey, 1988.
  11. Crawley M. J. The R Book. 2nd ed. Wiley, 2013.
  12. Gung. 2015. Effect Size for a One-Sinple T-Test. Available from: https://stats.stackexchange.com/questions/116514/effect-size-for-a-one-sample-t-test (accessed: 18.09.2018).
  13. Hoekstra R., Morey R. D., Rouder J. N., Wagenmakers E. J. Robust misinterpretation of confidence intervals. Psychon Bull Rev. 2014, 21 (5), pp. 1157-1 164.
  14. Keselman H. J., Othman A. R., Wilcox R. R. Preliminary Testing for Normality: Is This a Good Practice? Journal of Modern Applied Statistical Methods. 2013, 12 (2), pp. 2-19.
  15. Lakens D. Calculating and reporting effect sizes to facilitate cumulative science: A practical primer for t-tests and ANOVAs. Frontiers in Psychology. 2013, 4, p. 863.
  16. Logan M. Biostatistical Design and Analysis Using R: A Practical Guide. Wiley-Blackwell, 2010.
  17. Mans T. 2014. Is Normality Testing ’Essentially Useless’? Available from: https://stats.stackexchange.com/questions/2492/is-normality-testing-essentially-useless/2501#2501 (accessed: 18.09.2018).
  18. Moyé L. Statistical Methods for Cardiovascular Researchers. Circulation Research. 2016, 118 (3), pp. 439453.
  19. Olejnik S., Algina J. Generalized Eta and Omega Squared Statistics: Measures of Effect Size for Some Common Research Designs. Psychological Methods. 2003, 8 (4), pp. 434-447.
  20. Pearson Ronald K. 2011. The Many Uses of Q-Q Plots. Available from: https://exploringdatablog.blogspot.com/2011/03/many-uses-of-q-q-plots.html (accessed: 18.09.2018).
  21. Peter Statistics. 2017. Crash Course. Available from: https://peterstatistics.com/CrashCourse/index.html (accessed: 18.09.2018).
  22. Rochon J., Gondan M., Kieser M. To test or not to test: Preliminary assessment of normality when comparing two independent samples. BMC Medical Research Methodology. 2012, 12 (1), p. 81.
  23. Rosenthal R. Meta-analytic procedures for social research. Newbury Park, CA, SAGE Publications, Incorporated, 1991.
  24. Schoder V., Himmelmann A., Wilhelm K. P. Preliminary testing for normality: some statistical aspects of a common concept. Clin Exp Dermatol. 2006, 31 (6), pp. 757-761.
  25. STAT500. Penn State. 2018. Applied Statistics. Available from: https://newonlinecourses.science.psu.edu/stat500/ (accessed: 18.09.2018).
  26. STAT502. Penn State. 2018. Analysis of Variance and Design of Experiments. Available from: https:// https://onlinecourses.science.psu.edu/stat502/ (accessed: 18.09.2018).
  27. Tomczak M., Tomczak E. The need to report effect size estimates revisited. An overview of some recommended measures of effect size. Trends in Sport Sciences. 2014, 1 (21), pp. 19-25.
  28. Wickham H. 2014. Tidy Data. Journal of Statistical Software. 2014, 59 (10).

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2018 Human Ecology


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».