Эпидемический сезон 2021–2022 годов. Частота ко-инфекции респираторными вирусными патогенами

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование. В настоящем исследовании определены особенности циркуляции разных вирусных респираторных патогенов в период эпидемического сезона 2021–2022 годов, а также частота ко-инфекции на фоне SARS-CoV-2 и гриппа.

Цель исследования — оценить развитие эпидемии гриппа и частоту случаев ко-инфекции респираторными патогенами у пациентов с острыми респираторными вирусными инфекциями в сезоне 2021–2022 годов.

Материалы и методы. В статье использованы методы, применяемые в традиционном и госпитальном эпидемиологическом надзоре за острыми респираторными вирусными инфекциями.

Результаты. Эпидемический сезон 2021–2022 годов характеризовался ранней активностью вируcа гриппа A(H3N2), а также появлением и быстрым распространением нового варианта SARS-CoV-2 (“Omicron”). Чётко прослежена зависимость по долевому участию разных респираторных патогенов в период эпидемического сезона 2021–2022 годов: доминирующая роль принадлежала SARS-CoV-2 (18,8%), затем — вирусам гриппа (10,6%) и, наконец, возбудителям других острых респираторных вирусных инфекций (0,4–3,7%). В отношении вирусов гриппа A(H3N2) и В отмечена гетерогенность их популяции и дрейф-изменчивость по отношению к вакцинным вирусам.

Обсуждение. Частота ко-инфекции разными острыми респираторными вирусными инфекциями была низкой: по данным традиционного надзора — не более 0,1%, госпитального надзора — не более 9,2%. Дано обоснование актуализации состава гриппозных вакцин для стран Северного полушария в сезоне 2022–2023 годов.

Заключение. На сегодняшний день большое значение приобретает ранняя диагностика гриппозной инфекции, так как в отношении этого возбудителя существуют эффективные препараты с прямым механизмом действия для профилактики и лечения. Своевременное применение противогриппозных препаратов снизит риски тяжёлого течения, развития осложнений и летального исхода, в том числе при ко-инфекции с SARS-CoV-2.

Об авторах

Елена Ивановна Бурцева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Автор, ответственный за переписку.
Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2518-6801
SPIN-код: 2707-1446

д.м.н.

Россия, Москва

Анна Дмитриевна Панова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9322-6273
Россия, Москва

Людмила Васильевна Колобухина

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-5775-3343
Россия, Москва

Анна Викторовна Игнатьева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6206-2299
Россия, Москва

Елена Сергеевна Кириллова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7977-7530
Россия, Москва

Наталья Владимировна Бреслав

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-6946-5119
Россия, Москва

Светлана Викторовна Трушакова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9610-3041
Россия, Москва

Евгения Андреевна Мукашева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5688-5309
Россия, Москва

Елена Леонидовна Феодоритова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1472-1357
Россия, Москва

Кирилл Геннадьевич Краснослободцев

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1745-9128
Россия, Москва

Лилия Николаевна Меркулова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7260-0879
Россия, Москва

Ирина Николаевна Хлопова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7419-590X
Россия, Москва

Лидия Борисовна Кистенева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7336-409X
Россия, Москва

Ирина Сергеевна Кружкова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1983-481X
Россия, Москва

Юлия С. Левочкина

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи; Инфекционная клиническая больница № 2

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7750-2311
Россия, Москва; Москва

Анастасия Сергеевна Крепкая

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7272-4011
Россия, Москва

Александра Геннадьевна Росаткевич

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0008-8711
Россия, Москва

Андрей Борисович Комиссаров

Научно-исследовательский институт гриппа имени А.А. Смородинцева

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1733-1255
Россия, Санкт-Петербург

Светлана Борисовна Яцышина

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4737-941X
Россия, Москва

Андрей Андреевич Почтовый

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1107-9351
Россия, Москва

Дарья Дмитриевна Кустова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-8382-275X
Россия, Москва

Владимир Алексеевич Гущин

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9397-3762
Россия, Москва

Марина Викторовна Базарова

Инфекционная клиническая больница № 1

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7322-7896
Россия, Москва

Светлана Васильевна Сметанина

Инфекционная клиническая больница № 1

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3763-697X
Россия, Москва

Наталья Александровна Цветкова

Инфекционная клиническая больница № 2

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3323-3401
Россия, Москва

Список литературы

  1. Львов Д.К., Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., и др. Особенности циркуляции вирусов гриппа и ОРВИ в эпидемическом сезоне 2019–2020 гг. в отдельных регионах России // Вопросы вирусологии. 2020. Т. 65, № 6. С. 335–349. doi: 10.36233/0507-4088-2020-65-6-4
  2. Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Воронина О.Л., и др. Особенности циркуляции возбудителей ОРВИ на фоне появления и широкого распространения SARS-CoV-2 в 2018–2021 годы // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2022. Т. 21, № 4. С. 16–26. doi: 10.31631/2073-3046-2022-21-4-16-26
  3. Соминина А.А., Даниленко Д.М., Столяров К.А., и др. Интерференция SARS-CoV-2 с другими возбудителями респираторных вирусных инфекций в период пандемии // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021. Т. 20, № 4. С. 28–39. doi: 10.31631/2073-3046-2021-20-4-28-39
  4. Яцышина С.Б., Мамошина М.В., Елькина М.А., и др. Распространённость возбудителей ОРВИ, гриппа и COVID-19 у лиц с без симптомов респираторной инфекции // Вопросы вирусологии. 2020. Т. 65. С. 267–276. doi:
  5. Huang X.B., Yuan L., Ye C.X., et al. Epidemiological characteristics of respiratory viruses in patients with acute respiratory infections during 2009-2018 in southern China // Int J Infect Dis. 2020. Vol. 98. P. 21–32. doi: 10.1016/j.ijid.2020.06.051
  6. Sanz I., Perez D., Dominguez-Gill M., Lejarazude R.O., Eiros J.M. Coinfection of Influenza and other respiratory viruses are associated to children // An Pediatr (Engl Ed). 2022. Vol. 96, N 4. P. 334–341. doi: 10.1016/j.anpede.2021.03.002
  7. Zhou B., Lin X., Wang W., et al. Universal influenza B virus genomic amplification facilitates sequencing, diagnostics, and reverse genetics // J Clin Microbiol. 2014. Vol. 52, N 5. P. 1330-7. doi: 10.1128/JCM.03265-13
  8. Zhou B., Donnelly M.E., Scholes D.T., et al. Single-reaction genomic amplification accelerates sequencing and vaccine production for classical and Swine origin human influenza a viruses // J Virol. 2009. Vol. 83, N 19. P. 10309-10313. doi: 10.1128/JVI.01109-09
  9. Развитие эпидемии гриппа в Европейском регионе в 2021–2022 гг. [интернет] [дата обращения: 20.04.2023]. Доступ по ссылке: https://www.who.int/teams/global-influenza-programme/surveillance-and-monitoring/influenza-surveillance-outputs.
  10. Рекомендации по составу гриппозных вакцин для стран Северного полушария на сезон 2022–2023 г. Доступно на: https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/recommendations/2022-23_north/en/.
  11. Martínez-Roig A., Salvadó M., Caballero-Rabasco M.A., et al. Viral coinfection in childhood respiratory tract infections // Arch Bronconeumol. 2015. Vol. 51, N 1. P. 5–9. doi: 10.1016/j.arbres.2014.01.018
  12. Meligy B., Sayed A., Ismail D.K., et al. Detection of viral acute lower respiratory tract infection in hospitalized infants using real-time PCR // Gaz Egypt Paediatr Assoc. 2016. Vol. 64, N 1. P. 13–19. doi: 10.1016/j.epag.2015.11.005
  13. Korsun N.S., Angelova S.G., Trifonova I.T., et al. The Prevalence and Genetic Characterization of Human Metapneumovirus in Bulgaria, 2016–2019 // Intervirology. 2021. Vol. 64, N 4. P. 194–202. doi: 10.1159/000516821
  14. Kim D., Quinn J., Pinsky B., Shah N.H., Brown I. Rates of Co-infection Between SARS-CoV-2 and Other Respiratory Pathogens // JAMA. 2020. Vol. 323, N 20. P. 2085–2086. doi: 10.1001/jama.2020.6266
  15. Nowak M.D., Sordillo E.M., Gitman M.R., Paniz Mondolfi A.E. Coinfection in SARS-CoV-2 infected patients: Where are influenza virus and rhinovirus/enterovirus? // J Med Virol. 2020. Vol. 92, N. 10. P. 1699–1700. doi: 10.1002/jmv.25953
  16. Cooksey G.L.S., Morales C., Linde Let al. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 and Respiratory Virus Sentinel Surveillance, California, USA, May 10, 2020–June 12, 2021 // Emerg Infect Dis. 2022. Vol. 28, N 1. P. 9–19. doi: 10.3201/eid2801.211682
  17. Alhumaid S., Al Mutair A., Al Alawi Z., et al. Coinfections with Bacteria, Fungi, and Respiratory Viruses in Patients with SARS-CoV-2: A Systematic Review and Meta-Analysis // Pathogens. 2021. Vol. 10, N 7. P. 809. doi: 10.3390/pathogens10070809
  18. Dadashi M., Khaleghnejad S., Abedi Elkhichi P., et al. COVID-19 and Influenza Co-infection: A Systematic Review and Meta-Analysis // Front Med (Lausanne). 2021/ Vol. 8. P. 681469. doi: 10.3389/fmed.2021.681469
  19. Aggarwal N., Potdar V., Vijay N., et al. SARS-CoV-2 and Influenza Virus Co-Infection Cases Identified through ILI/SARI Sentinel Surveillance: A Pan-India Report // Viruses. 2022. Vol. 14, N 3. P. 627. doi: 10.3390/v14030627
  20. Kinoshita T., Watanabe K., Sakurai Y., et al. Co-infection of SARS-CoV-2 and influenza virus causes more severe and prolonged pneumonia in hamsters // Sci Rep. 2021. Vol. 11, N 1. P. 21259. doi: 10.1038/s41598-021-00809-2
  21. Zhang A.J, Lee A.C., Chan J.F., et al. Coinfection by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 and Influenza A(H1N1)pdm09 Virus Enhances the Severity of Pneumonia in Golden Syrian Hamsters // Clin Infect Dis. 2021. Vol. 72, N 12. P. e978-e992. doi: 10.1093/cid/ciaa1747

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Частота выявления положительных проб на грипп, SARS-CoV-2 и ОРВИ в период эпидемического сезона 2021–2022 годов на отдельных территориях Российской Федерации.

Скачать (542KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Частота ко-инфекции респираторными патогенами на фоне гриппа и SARS-CoV-2 у госпитализированных пациентов в эпидемическом сезоне 2021–2022 годов.

Скачать (410KB)
Метаданные

© Эко-Вектор, 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».