A “Low-Molecular” Approach to the Identification of Microorganisms by MALDI Mass Spectrometry


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

A new approach to the identification of microorganisms is presented. It includes the transformation of their MALDI mass spectra aimed at reducing mass scale by one order of magnitude and the use of standard software for building mass spectral libraries of low-molecular compounds and library searches. A library of 728 transformed (“rescaled”) mass spectra of 182 strains for some Streptococcus species was built. With this library, the rate of true microorganism identification was estimated by cross-comparison between library mass spectra (internal validation of the approach). The true identification rate was 84% for three Streptococcus species, which corresponds to the average trueness of species identification by MALDI as found in the literature. The proposed approach to identification can be considered as a method of choice for solving identification problems under consideration.

Об авторах

B. Milman

Institute of Experimental Medicine

Автор, ответственный за переписку.
Email: bmilman@mail.rcom.ru
Россия, St. Petersburg, 197376

Yu. Ilyasov

Institute of Experimental Medicine

Email: bmilman@mail.rcom.ru
Россия, St. Petersburg, 197376

N. Lugovkina

Institute of Experimental Medicine; Institute of Toxicology

Email: bmilman@mail.rcom.ru
Россия, St. Petersburg, 197376; St. Petersburg, 192019

A. Golovina

Institute of Experimental Medicine

Email: bmilman@mail.rcom.ru
Россия, St. Petersburg, 197376

A. Dmitriev

Institute of Experimental Medicine

Email: bmilman@mail.rcom.ru
Россия, St. Petersburg, 197376

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Ltd., 2017

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).