CD14 gene polymorphism in COVID-19 convalescents: analysis of (C-159)T

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Cluster of differentiation 14 (CD14) is a pattern recognition receptor for lipopolysaccharide of gram-negative flora and has a close relationship with toll-like receptor 4 (TLR4). The interaction between CD14 and TLR 4 leads to the synthesis of cytokines such as interleukin-1, interleukin-6 and tumor necrosis factor-á. The TLR4 receptor is associated with the penetration of the new coronavirus infection virus into the cell, additionally stimulating the expression of the angiotensin converting enzyme 2 molecule and suppressing apoptosis in infected cells. Work on the study of the (159C)T polymorphism of the CD14 gene in COVID-19 is represented by only a few publications describing observations only in the Western European region. The purpose of our study was to study the association between single nucleotide polymorphism (SNP) of the CD14 gene – (159C)T (rs2569190) and susceptibility to a new coronavirus infection in the population of the Republic of Crimea. The study included 158 patients (87 women (55%) and 71 (45%) men, average age 45.6±6.14 years) who had COVID-19. Verification of previous COVID-19 was based on anamnestic data and data from studies performed at the time of illness (PCR). The control group consisted of 85 respondents who had not suffered a new coronavirus infection. To analyze the (C-159)T polymorphism of the CD14 gene, allele-specific PCR with electrophoretic detection in a 3% agarose gel (NPF "Litekh", Russia) was used. To compare the frequencies of allele combinations, the ÷2 test and odds ratio (95% CI) were used. The distribution of CD14 mutations followed Hardy-Weinberg equilibrium (p > 0.05). The results of the study showed that the distribution of CD14 gene genotypes did not differ significantly in all study groups. The dominant genotype was the heterozygous genotype CT of the (C-159)T polymorphism of the CD14 gene. The analysis showed that the presence of CT and TT SNPs was not associated with the risk of developing a new coronavirus infection (p > 0.05). Conclusions. The CD14 SNP (C-159)T is not associated with a higher risk of COVID-19 infection. The distribution of occurrence of SNP variants in the group of recovered individuals did not differ significantly from that in the control group (p > 0.05).

About the authors

I. A. Yatskov

Order of Labor Red Banner S. Georgievsky Medical Institute, V. Vernadsky Crimean Federal University

Email: ageevaeliz@rambler.ru

PhD (Medicine), Associate Professor, Department of Internal Medicine No. 2

Russian Federation, Simferopol, Republic of Crimea

V. A. Beloglazov

Order of Labor Red Banner S. Georgievsky Medical Institute, V. Vernadsky Crimean Federal University

Email: ageevaeliz@rambler.ru

PhD, MD (Medicine), Professor, Head, Department of Internal Medicine No. 2

Simferopol, Republic of Crimea

E. S. Ageeva

Order of Labor Red Banner S. Georgievsky Medical Institute, V. Vernadsky Crimean Federal University

Author for correspondence.
Email: ageevaeliz@rambler.ru

PhD, MD (Medicine), Associate Professor, Head, Department of Medical Biology

Russian Federation, Simferopol, Republic of Crimea

N. V. Rymarenko

Order of Labor Red Banner S. Georgievsky Medical Institute, V. Vernadsky Crimean Federal University

Email: ageevaeliz@rambler.ru

PhD, MD (Medicine), Professor, Professor, Department of Pediatrics with a Course in Childhood Infectious Diseases

Russian Federation, Simferopol, Republic of Crimea

A. A. Zhukova

Order of Labor Red Banner S. Georgievsky Medical Institute, V. Vernadsky Crimean Federal University

Email: ageevaeliz@rambler.ru

PhD (Biology), Associate Professor, Department of Medical Biology

Russian Federation, Simferopol, Republic of Crimea

R. N. Ablayeva

Order of Labor Red Banner S. Georgievsky Medical Institute, V. Vernadsky Crimean Federal University

Email: ageevaeliz@rambler.ru

Assistant professor, Department of Medical Biology

Russian Federation, Simferopol, Republic of Crimea

References

  1. Петров А.А., Страмбовская Н.Н., Говорин А.В., Витковский Ю.А. Генетический полиморфизм CD14, TNF и FCGR2A у больных гриппом A H1N1 в Забайкальском крае // Медицинская иммунология, 2011. Т.13, № 1. С. 83-86. [Petrov V.V., Strambovskaya N.N., Govorin A.V., Vitkovsky Yu.A. Genetic polymorphisms of CD14, TNF and FCGR2A in the patients with influenza A H1N1 in transbaikalia region. Meditsinskaya immunologiya = Medical Immunology (Russia), 2011, Vol. 13, no. 1, pp. 83-86. (In Russ.)] doi: 10.15789/1563-0625-2011-1-83-86.
  2. Areeshi M.Y., Mandal R.K., Panda A.K., Bisht S.C., Haque S. CD14-159 C > T gene polymorphism with increased risk of tuberculosis: evidence from a meta-analysis. PLoS One, 2013, Vol. 8, no. 5, e64747. doi: 10.1371/journal.pone.0064747.
  3. Ayaslioglu E., Kalpaklioglu F., Kavut A.B., Erturk A., Capan N., Birben E. The role of CD14 gene promoter polymorphism in tuberculosis susceptibility. J. Microbiol. Immunol. Infect., 2013, Vol. 46, no. 3, pp. 158-163.
  4. Choudhury A., Mukherjee S. In silico studies on the comparative characterization of the interactions of SARS-CoV-2 spike glycoprotein with ACE-2 receptor homologs and human TLRs. J. Med. Virol., 2020, Vol. 92, no. 10, pp. 2105-2113.
  5. Karhukorpi J., Yan Y., Niemela S., Valtonen J., Koistinen P., Joensuu T. Effect of CD14 promoter polymorphism and H. pylori infection and its clinical outcomes on circulating CD14. Clin. Exp. Immunol., 2002, Vol. 128, no. 2, pp. 326-332.
  6. Martinez F.D. CD14, endotoxin, and asthma risk: actions and interactions. Proc. Am. Thorac. Soc., 2007, Vol. 4, no. 3, pp. 221-225.
  7. Meiler C., Muhlbauer M., Johann M., Hartmann A., Schnabl B., Wodarz N. Different effects of a CD14 gene polymorphism on disease outcome in patients with alcoholic liver disease and chronic hepatitis C infection. World J. Gastroenterol., 2005, Vol. 11, no. 38, pp. 6031-6037.
  8. Moghadampour M., Eskandari-Nasab E., Shabani F. Relationship between CD14-159C/T gene polymorphism and acute brucellosis risk. Asian Pac. J. Trop. Med., 2016, Vol. 9, no. 3, pp. 247-251.
  9. Panda A.K., Tripathy R., Das B. K. CD14 (C-159T) polymorphism is associated with increased susceptibility to SLE, and plasma levels of soluble CD14 is a novel biomarker of disease activity: A hospital-based case-control study. Lupus, 2021, Vol. 30, no. 2, pp. 219-227.
  10. Pati A., Padhi S., Panda D., Suvankar S., Panda A.K. A CD14 Polymorphism (C-159T rs2569190) Is Associated with SARS-CoV-2 Infection and Mortality in the European Population. J. Infect. Dis., 2021, Vol. 224, no. 5, pp. 921-922.
  11. Rupp J., Goepel W., Kramme E., Jahn J., Solbach W., Maass M. CD14 promoter polymorphism -159C > T is associated with susceptibility to chronic Chlamydia pneumoniae infection in peripheral blood monocytes. Genes Immun., 2004, Vol. 5, no. 5, pp. 435-438.
  12. Teixeira J.P., Barone S., Zahedi K., Soleimani M. Kidney Injury in COVID-19: Epidemiology, Molecular Mechanisms and Potential Therapeutic Targets. Int. J. Mol. Sci., 2022, Vol. 23, no. 4, 2242. doi: 10.3390/ijms23042242.
  13. Wu Z., Zhang Z., Lei Z., Lei P. CD14: Biology and role in the pathogenesis of disease. Cytokine Growth Factor Rev., 2019, Vol. 48, pp. 24-31.
  14. Yuan F.F., Boehm I., Chan P.K., Marks K., Tang J.W., Hui D.S. High prevalence of the CD14-159CC genotype in patients infected with severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus. Clin. Vaccine Immunol., 2007, Vol. 14, no. 12, pp. 1644-1645.
  15. Zanoni I., Granucci F. Role of CD14 in host protection against infections and in metabolism regulation. Front. Cell. Infect. Microbiol., 2013, Vol. 3, 32. doi: 10.3389/fcimb.2013.00032.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. Figure 1. Frequencies of genotype (C-159)T polymorphism of the CD14 gene in the studied groups (p > 0.05)

Download (250KB)

Copyright (c) 2024 Yatskov I.A., Beloglazov V.A., Ageeva E.S., Rymarenko N.V., Zhukova A.A., Ablayeva R.N.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».