Этиология энтерококковой бактериемии. обзор литературы и собственные данные

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Актуальность работы обусловлена увеличением в мировом масштабе числа госпитальных инфекций кровотока, связанных с бактериями рода Enterococcus spp. Способность приобретать и распространять детерминанты устойчивости к антибиотикам способствовала превращению энтерококков из условно патогенных микроорганизмов в значимую проблему медицинских учреждений.

Цель настоящего обзора – анализ опубликованных за 2015–2020 годы материалов об эпидемиологических факторах риска для энтерококковой бактериемии и микробной резистентности энтерококков. Обсуждается клиническая разница между Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium, факторы вирулентности, антибиотикотолерантность энтерококков. Приведены собственные данные по энтерококковой бактериемии в раннем периоде у реципиентов жизненно важных органов.

Об авторах

Нина Индзаровна Габриэлян

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр трансплантологии и искусственных органов имени академика В.И. Шумакова» Минздрава России

Email: labgso@mail.ru

д.м.н.

Россия, 123182, г. Москва

Виктория Георгиевна Кормилицина

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр трансплантологии и искусственных органов имени академика В.И. Шумакова» Минздрава России

Email: v16k@rambler.ru
Россия, 123182, г. Москва

Ирина Васильевна Драбкина

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр трансплантологии и искусственных органов имени академика В.И. Шумакова» Минздрава России

Email: drabkina58@mail.ru
Россия, 123182, г. Москва

Ринат Шакирьянович Саитгареев

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр трансплантологии и искусственных органов имени академика В.И. Шумакова» Минздрава России

Email: rinat.saitgareev@rambler.ru

д.м.н., профессор

Россия, 123182, г. Москва

Вячеслав Мефодьевич Захаревич

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр трансплантологии и искусственных органов имени академика В.И. Шумакова» Минздрава России; ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский университет)» Минздрава России

Email: zaharslava@yandex.ru

д.м.н., профессор

Россия, 123182, г. Москва; 119991, г. Москва

Ольга Валерьевна Кисиль

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков имени Г.Ф. Гаузе»

Автор, ответственный за переписку.
Email: olvv@mail.ru

к.х.н.

Россия, 119021, г. Москва

Виктор Васильевич Малеев

ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: maleyev@pcr.ru

д.м.н., профессор, академик РАН

Россия, 111123, г. Москва

Список литературы

  1. Manassero N.C., Navarro M., Rocchi M., di Bella H, Gasparotto A.M, Ocaña Carrizo A.V., et al. Analysis of 117 episodes of enterococcal bacteremia: Study of epidemiology, microbiology and antimicrobial susceptibility // Rev Argent Microbiol. 2016. Vol. 48. N 4. P. 298–302. doi: 10.1016/j.ram.2016.05.002.
  2. who.int [интернет]. World Health Organization (WHO). Global priority list of antibiotic-resistant bacteria to guide research, discovery, and development of new antibiotics [доступ от 24.08.2020]. Доступ по http://www.who.int/medicines/publications/global-priority-list-antibiotic-resistant-bacteria/en/.
  3. Fisher K., Phillips C. The ecology, epidemiology and virulence of Enterococcus // Microbiology (Reading). 2009. Vol. 155. Pt 6. P. 1749–1757. doi: 10.1099/mic.0.026385-0.
  4. Ramos S., Silva V., Dapkevicius M.L.E., Igrejas G., Poeta P. Enterococci, from Harmless Bacteria to a Pathogen // Microorganisms. 2020. Vol. 8. N 8. P. 1118. doi: 10.3390/microorganisms8081118.
  5. Parte A.C. LPSN–list of prokaryotic names with standing in nomenclature // Nucleic Acids Res. 2014. Vol. 42. P. D613–D616. doi: 10.1093/nar/gkt1111.
  6. Гончар Н.В., Алехина Л.А., Суворов А.Н. Пробиотические штаммы энтерококков как средства терапии и профилактики заболеваний кишечника у детей (Обзор литературы) // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2013. № 1. С. 74–78.
  7. Zhou X., Willems R.J.L., Friedrich A.W., Rossen J.W.A., Bathoorn E. Enterococcus faecium: from microbiological insights to practical recommendations for infection control and diagnostics // Antimicrob Resist Infect Control. 2020. Vol. 9. N 1. P. 130. doi: 10.1186/s13756-020-00770-1.
  8. McAuley C.M., Gobius K.S., Britz M.L., Craven H.M. Heat resistance of thermoduric enterococci isolated from milk // Int J Food Microbiol. 2012. Vol. 154. N 3. P. 162–168. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2011.12.033.
  9. Weiner L.M., Webb A.K., Limbago B., Dudeck M.A., Patel J., Kallen A.J., et al. Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: summary of data reported to the national healthcare safety network at the centers for disease control and prevention, 2011-2014 // Infect Control Hosp Epidemiol. 2016. Vol. 37. N 11. P. 1288–1301. doi: 10.1017/ice.2016.174.
  10. Tedim A.P., Ruíz-Garbajosa P., Rodríguez M.C., Rodríguez-Baños M., Lanza V.F., Derdoy L., et al. Long-term clonal dynamics of Enterococcus faecium strains causing bloodstream infections (1995–2015) in Spain // J Antimicrob Chemother. 2017. Vol. 72. N 1. P. 48–55. doi: 10.1093/jac/dkw366.
  11. Buetti N., Atkinson A., Marschall J.A. KronenbergSwiss Centre for Antibiotic Resistance (ANRESIS). Incidence of bloodstream infections: a nationwide surveillance of acute care hospitals in Switzerland 2008-2014 // BMJ Open. 2017. N 7. P. e013665. doi: 10.1136/ bmjopen-2016-013665.
  12. Nielsen S.L., Pedersen C., Jensen T.G., Gradel K.O., Kolmos H.J., Lassen A.T. Decreasing incidence rates of bacteremia: A 9 year population based study // J Infect. 2014. Vol. 69. P. 51–59. doi: 10.1016 / j.jinf.2014.01.014.
  13. Ceci M., Delpech G., Sparo M., Mezzina V., Sánchez Bruni S., Baldaccini B. Clinical and microbiological features of bacteremia caused by Enterococcus faecalis // J Infect Dev Ctries. 2015. Vol. 9. N 11. P. 1195–1203. doi: 10.3855/jidc.6587.
  14. Artico M.J., Rocchi M., Gasparotto A., Ocaña Carrizo V., Navarro M., Mollo V., et al. Community-acquired bacteremia in adult patients attending the emergency service of a teaching hospital // Rev Argent Microbiol. 2012. Vol. 44. N 1. P. 10–15. doi: 10.1590/S0325-75412012000100003.
  15. Gilmore M.S., Coburn P.S., Nallapareddy S.R., Murray B.E. Enterococcal virulence. In: Gilmore MS, editors. The enterococci: pathogenesis, molecular biology, and antibiotic resistance. Washington, DC: ASM Press, 2002.
  16. Koch S., Hufnagel M., Theilacker C., Huebner J. Enterococcal infections: host response, therapeutic, and prophylactic possibilities // Vaccine. 2004. Vol. 22. N 7. P. 822–830. doi: 10.1016/j.vaccine.2003.11.027.
  17. Kramer A, Schwebke I, Kampf G. How long do nosocomial pathogens persist on inanimate surfaces? A systematic review // BMC Infect Dis. 2006. Vol. 6. P. 130. doi: 10.1186/1471-2334-6-130.
  18. Baden L.R., Critchley I.A., Sahm D.F., So W., Gedde M., Porter S., et al. Molecular characterization of vancomycin-resistant Enterococci repopulating the gastrointestinal tract following treatment with a novel glycolipodepsipeptide, ramoplanin // J Clin Microbiol. 2002. Vol. 40. N 4. P. 1160–1163. doi: 10.1128/jcm.40.4.1160-1163.2002.
  19. Billington E.O., Phang S.H., Gregson D.B., Pitout J.D., Ross T., Church D.L., et al. Incidence, risk factors, and outcomes for Enterococcus spp. blood stream infections: a population-based study // Int J Infect Dis. 2014. Vol. 26. P. 76–82. doi: 10.1016/j.ijid.2014.02.012.
  20. Kim Y.J., Jun Y.H., Choi H.J. Impact of enterococcal bacteremia in liver transplant recipients // Transplant Proc. 2019. Vol. 51. N 8. P. 2766–2770. doi: 10.1016/j.transproceed.2019.02.064.
  21. Gudiol C., Ayats J., Camoez M., Domínguez M.Á., García-Vidal C., Bodro M., et al. Increase in bloodstream infection due to vancomycin-susceptible Enterococcus faecium in cancer patients: risk factors, molecular epidemiology and outcomes // PLoS One. 2013. Vol. 8. N 9. P. e74734. doi: 10.1371/journal.pone.0074734
  22. Akhtar N., Sultan F., Nizamuddin S., Zafar W. Risk factors and clinical outcomes for vancomycin-resistant enterococcus bacteraemia in hospitalised cancer patients in Pakistan: A case-control study // J Pak Med Assoc. 2016. Vol. 66. N 7. P. 829–836.
  23. Friedman G., Stepensky P., Abu Ahmad W., Masarwa R., Temper V., Oster Y., et al. Enterococcal bacteremia in children with malignancies and following hematopoietic stem cell transplantation: A 15-year single-center experience // Pediatr Infect Dis J. 2020. Vol. 39. N 4. P. 318–324. doi: 10.1097/INF.0000000000002579
  24. Furuichi M., Furuichi M., Horikoshi Y., Miyairi I. infectious diseases consultation improves treatment and decreases mortality by enterococcal bacteremia in children // Pediatr Infect Dis J. 2018. Vol. 37. N 9. P. 856–860. doi: 10.1097/INF.0000000000001919
  25. Габриэлян Н.И., Горская Е.М., Цирульникова О.М. Факторы риска и нозокомиальные инфекции, вызываемые энтерококками // Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2015. T. 17. № 2. С. 64–69. doi: 10.15825/1995-1191-2015-2-64-69.
  26. Shanks O.C., Santo Domingo J.W., Graham J.E. Use of competitive DNA hybridization to identify differences in the genomes of bacteria // J Microbiol Methods. 2006. Vol. 66. P. 321–330.
  27. Guzman Prieto A.M., van Schaik W., Rogers M.R., Coque T.M., Baquero F., Corander J., Willems R.J. Global emergence and dissemination of enterococci as nosocomial pathogens: Attack of the clones? // Front Microbiol. 2016. Vol. 7. P. 788. doi: 10.3389/fmicb.2016.00788.
  28. Buffie C.G., Pamer E.G. Microbiota-mediated colonization resistance against intestinal pathogens // Nat Rev Immunol. 2013. Vol. 13. N 11. P. 790–801. doi: 10.1038/nri3535.
  29. Reinseth I.S., Ovchinnikov K.V., Tønnesen H.H., Carlsen H., Diep D.B. The increasing issue of vancomycin-resistant enterococci and the bacteriocin solution // Probiotics Antimicrob Proteins. 2020. Vol. 12. N 3. P. 1203–1217. doi: 10.1007/s12602-019-09618-6.
  30. Adams D.J., Eberly M.D., Goudie A., Nylund C.M. Rising vancomycin-resistant Enterococcus infections in hospitalized children in the United States // Hosp Pediatr. 2016. Vol. 6. N 7. P. 404–411. doi: 10.1542/hpeds.2015-0196.
  31. O’Driscoll T., Crank C.W. Vancomycin-resistant enterococcal infections: epidemiology, clinical manifestations, and optimal management // Infect Drug Resist. 2015. Vol. 8. P. 217–230. doi: 10.2147/IDR.S54125.
  32. Cattoir V., Leclercq R. Twenty-five years of shared life with vancomycin-resistant enterococci: is it time to divorce? // J Antimicrob Chemother. 2013. Vol. 68. N 4. P. 731–742. doi: 10.1093/jac/dks469.
  33. Arredondo-Alonso S., Top J., McNally A., Puranen S., Pesonen M., Pensar J., et al. Plasmids shaped the recent emergence of the major nosocomial pathogen Enterococcus faecium // mBio. 2020. Vol. 11. N 1. P. e03284-19. doi: 10.1128/mBio.03284-19.
  34. Moon T.M., D’Andréa É.D., Lee C.W., Soares A., Jakoncic J., Desbonnet C., et al. The structures of penicillin-binding protein 4 (PBP4) and PBP5 from Enterococci provide structural insights into β-lactam resistance // J Biol Chem. 2018. Vol. 293. N 48. P. 18574–18584. doi: 10.1074/jbc.RA118.006052.
  35. Hollenbeck B.L., Rice L.B. Intrinsic and acquired resistance mechanisms in enterococcus // Virulence. 2012. Vol. 3. N 5. P. 421–433. doi: 10.4161/viru.21282.
  36. Bi R., Qin T., Fan W., Ma P., Gu B. The emerging problem of linezolid-resistant enterococci // J Glob Antimicrob Resist. 2018. Vol. 13. P. 11–19. doi: 10.1016/j.jgar.2017.10.018.
  37. Shariati A., Dadashi M., Moghadam M.T., van Belkum A., Yaslianifard S., Darban-Sarokhalil D. Global prevalence and distribution of vancomycin resistant, vancomycin intermediate and heterogeneously vancomycin intermediate Staphylococcus aureus clinical isolates: a systematic review and meta-analysis // Sci Rep. 2020. Vol. 10. N 1. P. 12689. doi: 10.1038/s41598-020-69058-z.
  38. Corredor N.C., López C., Aguilera P.A., Prieto L.M., Rodríguez-Leguizamón G., Leal A.L., et al. An epidemiological and molecular study regarding the spread of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a teaching hospital in Bogotá, Colombia 2016 // BMC Infect Dis. 2019. Vol. 19. N 1. P. 258. doi: 10.1186/s12879-019-3877-7.
  39. Пошвина Д.В., Щепитова Н.Е., Сычёва М.В. Уткина Т.М., Карташова О.Л. Видовая характеристика и факторы персистенции энтерококков, выделенных от животных в норме и при патологии // Ветеринария. 2015. № 6. С. 26–30.
  40. Gouliouris T., Raven K.E., Ludden C., Blane B., Corander J., Horner C.S., et al. Genomic surveillance of Enterococcus faecium reveals limited sharing of strains and resistance genes between livestock and humans in the United Kingdom // mBio. 2018. Vol. 9. N 6. P. e01780-18. doi: 10.1128/mBio.01780-18.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-Вектор", 2020


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».