Total antibodies and neutralizing ability of convalescent sera against three different strains of SARS-CoV-2

Cover Image

Cite item

Abstract

The aim of the study was to assess the level of humoral immunity to SARS-CoV-2 in COVID-19 convalescents.

Materials and methods. We used ELISA for antibody quantitation, microneutralization test using three SARS-CoV-2 strains for neutralizing activity measurement, Illumina MiSeq platform for NGS sequencing and NextClade resource for phylogenetic analysis.

Results. The mean concentration of antibody in convalescents was 133.42 ± 7.2 BAU/mL and the value depended on neither the gender and age of the patients, nor on the time elapsed since COVID-19 infection. The studied SARS-CoV-2 strains were sequenced and deposited in the international GISAID database. According to genetic analysis: EPI_ISL_19424272 phylogenetically belongs to the B1.1 clade, EPI_ISL_19424271 – to B.1.1.397 clade, EPI_ISL_19424270 – to Delta B.1.617.2.122. There were no significant differences in the neutralizing ability of convalescent sera (those who had been ill 2–3 months before the study) for the first two variants of SARS-CoV-2 and it was significantly reduced for the Delta variant, which appeared in the Novosibirsk region later.

Conclusions. The neutralizing activity of convalescent sera was the highest against those variants of the virus that the patient had recovered from, while was reduced or absent against the new variant. The antibody developed to the original variants of the SARS-CoV-2 may not be effective enough against newly emerging strains due to the emergence of mutations in the virus that allow it to evade previously developed humoral immune response.

About the authors

Natalia V. Palyanova

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Author for correspondence.
Email: natalia.palyanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-1783-5798
SPIN-code: 4975-4485
Scopus Author ID: 55983936800
ResearcherId: KAM-6786-2024

junior researcher

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

Lubov S. Adamenko

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Email: aminisib@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6412-3622

junior researcher

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

Olga G. Kurskaya

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Email: kurskaya_og@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1931-2026

Ph.D., Head of the Laboratory of Respiratory Viral Infections, Senior Researcher

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

Tereza A. Saroyan

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Email: 111.st.13@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0001-8071-5425

junior researcher

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

Mariya V. Solomatina

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Email: solomatina.mariyav@yandex.com
ORCID iD: 0000-0003-0736-0271

Ph.D., senior researcher

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

Ivan A. Sobolev

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Email: sobolev.riov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-4561-6517

Ph.D., Senior Researcher, Head of the Laboratory of Genomics and Virus Evolution

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

Alexander M. Shestopalov

Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine

Email: shestopalov2@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9734-0620

Ph.D., professor, Dr. of Sc., Honored Scientist of the Russian Federation, Director Research Institute of Virology FRC FTM

Russian Federation, 630117, Novosibirsk

References

  1. Balakhonov S.V., Dubrovina V.I., Chesnokova M.V., Voitkova V.V., Pyatidesyatnikova A.B., Bryukhova D.D., et al. Studying humoral immune response at mild and asymptomatic COVID-19 forms. Acta Biomedica Scientifica. 2020; 5(5): 26–30. https://doi.org/10.29413/ABS.2020-5.5.3 https://elibrary.ru/mvlnmh (in Russian)
  2. Machhi J., Herskovitz J., Senan A.M., Dutta D., Nath B., Oleynikov M.D., et al. The natural history, pathobiology, and clinical manifestations of SARS-CoV-2 infections. J. Neuroimmune Pharmacol. 2020; 15(3): 359–86. https://doi.org/10.1007/s11481-020-09944-5
  3. Palyanova N., Sobolev I., Alekseev A., Glushenko A., Kazachkova E., Markhaev A., et al. Genomic and epidemiological features of COVID-19 in the Novosibirsk region during the beginning of the pandemic. Viruses. 2022; 14(9): 2036. https://doi.org/10.3390/v14092036
  4. Novikova E.A., Petrova A.G., Moskaleva E.V., Vanyarkina A.S., Rychkova L.V. Retrospective of international serological studies on the formation and dynamics of the humoral immune response to SARS-CoV-2: from 2020 to 2021. Acta Biomedica Scientifica. 2021; 6(2): 47–57. https://doi.org/10.29413/ABS.2021-6.2.5 https://elibrary.ru/sbnnav (in Russian)
  5. Oktay Gültekin E., Gültekin O., Coskun A., Aksak T. Antibody response three months after SARS-CoV-2 infection. J. Med. Virol. 2022; 94(10): 4712–8. https://doi.org/10.1002/jmv.27909
  6. Palyanova N.V., Sobolev I.A., Palyanov A.Y., Kurskaya O.G., Komissarov A.B., Danilenko D.M. et al. The development of the SARS-CoV-2 epidemic in different regions of Siberia in the 2020–2022 Period. Viruses. 2023; 15(10): 2014. https://doi.org/10.3390/v15102014
  7. Tukhvatulin A.I., Dolzhikova I.V., Shcheblyakov D.V., Zubkova O.V., Dzharullaeva A.S., Kovyrshina A.V., et al. An open, non-randomised, phase 1/2 trial on the safety, tolerability, and immunogenicity of single-dose vaccine “Sputnik Light” for prevention of coronavirus infection in healthy adults. Lancet Reg. Health Eur. 2021; 11: 100241. https://doi.org/10.1016/j.lanepe.2021.100241
  8. Evseeva G.P., Lazareva M.A., Vlasova M.A., Nagovitsyna E.В., Suprun S.V., Telepneva R.S. et al. Assessment of the level of immune layer to SARS-CoV-2 in children under conditions of novel coronavirus infection COVID-19. Byulleten’ fiziologii i patologii dykhaniya. 2023; (88): 59–68. https://doi.org/10.36604/1998-5029-2023-88-59-68 https://elibrary.ru/lhyxot (in Russian)
  9. Wang K., Long Q.X., Deng H.J., Hu J., Gao Q.Z., Zhang G.J., et al. Longitudinal dynamics of the neutralizing antibody response to SARS-CoV-2 infection. Clin. Infect. Dis. 2021; 73(3): e531–9. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1143

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. Fig. 1. Dynamics of the number of antibodies. Average number of total antibodies 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7–9 months after COVID-19, quantitative method, BAU/мл (N = 6, 23, 37, 38, 34, 17, 8).

Download (116KB)
3. Fig. 2. The level of total IgM and IgG antibodies to SARS-CoV-2 in 14 study participants who did not have COVID-19 (according to the questionnaire), BAU/mL. Mean values and measurement errors were calculated when possible (more than three antibody concentration measurements). Participant No. 1 had a negative result, the rest of the study participants had a positive result.

Download (158KB)
4. Fig. 3. Change in the concentration of antibodies over 4 months. Dynamic changes in antibody levels within 4 months in the group that had COVID-19 3 months before the start of the study, BAU/mL.

Download (166KB)
5. Fig. 4. Neutralizing ability of convalescent serum against three strains of SARS-CoV-2: EPI_ISL_19424272 (Wuhan 1), EPI_ISL_19424271 (Wuhan 2) и EPI_ISL_19424270 (Delta).

Download (140KB)

Copyright (c) 2025 Palyanova N.V., Adamenko L.S., Kurskaya O.G., Saroyan T.A., Solomatina M.V., Sobolev I.A., Shestopalov A.M.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».