ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ И ПОДВИДОВАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ СТЕПНОЙ ПЕСТРУШКИ (LAGURUS LAGURUS PALL., CRICETIDAE, RODENTIA) НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ВАРИАЦИЙ МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНА ЦИТОХРОМА b

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

На основе молекулярно-генетических данных, полученных из оригинальной коллекции и депонированных в базе данных NCBI, был проведен филогеографический анализ степной пеструшки (Lagurus lagurus). Проанализированы нуклеотидные последовательности гена cytb. Установлено, что уровень генетической изменчивости и дифференциации вида по ареалу относительно низкий. Все последовательности cytb разделены на три галлогруппы, соответствующие подвидам lagurus, aliorum и abacanicus. Наибольший уровень генетического полиморфизма по данному маркеру выявлен у подвида abacanicus. Низкая генетическая дифференциация подвида agressus указывает на относительно недавнее заселение степной пеструшкой северо-западной части ареала.

Об авторах

Т. А Дупал

Институт систематики и экологии животных СО РАН

Email: gf@eco.nsc.ru
Новосибирск, Россия

И. В Моролдоев

Институт систематики и экологии животных СО РАН

Новосибирск, Россия

А. В Кривопалов

Институт систематики и экологии животных СО РАН

Новосибирск, Россия

Список литературы

  1. Банников А.Г., 1954. Млекопитающие Монгольской Народной Республики. М.: Изд-во АН СССР. 669 с.
  2. Банникова А.А., 2004. Молекулярные маркеры и современная филогенетика млекопитающих // Журнал общей биологии. Т. 65. № 4. С. 278–305.
  3. Блехман А.В., Головчан Н.Н., Ондар С.О., Брандлер О.В., 2025. Генетическая изменчивость монгольской песчанки Meriones unguiculatus в северо-­западной части ареала // Генетика. Т. 61. № 5. С. 96–102.
  4. Громов И.М., Ербаева М.А., 1995. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб. Зоол. ин-т. 520 с.
  5. Громов И.М., Поляков И.Я., 1977. Полевки (Microtinae). Фауна СССР. Млекопитающие / Под ред. Скарлато О.А. Л.: Наука. Т. 3. 504 с.
  6. Дупал Т.А., Андренко О.В., Виноградов В.В., 2013. Млекопитающие перигляциальной гиперзоны конца плейстоцена и становление современной фауны грызунов гор Западной и Средней Сибири // Сибирский экологический журнал. Т. XX. № 1. С. 123–134.
  7. Дупал Т.А., Абрамов С.А., Литвинов Ю.Н., 2022. Морфологическая изменчивость степной пеструшки (Lаgurus lagurus Pall.) на северо-­востоке ареала // Известия РАН, Серия биологическая. № 6. С. 614–625.
  8. Зажигин В.С., 1980. Грызуны позднего плиоцена и антропогена юга Западной Сибири. Труды ГИН. Вып. 339. М.: Наука. 156 с.
  9. Лебедев В.Л., Косушкин С.А., Банникова А.А., 2024. Генетическая концепция вида в приложении к мультилокусным ядерным данным // Журнал общей биологии. Т. 85. № 4. С. 269–283.
  10. Маркова А.К., 2004. Плейстоценовые фауны млекопитающих Восточной Европы // География, общество, окружающая среда. Т. 1. Структура, динамика и эволюция природных геосистем. М.: Городец. С. 583–598.
  11. Маркова А.К., Т. ван Кольфсхотен, Бохнкке Ш., Косинцев П.А., Мол И., Пузаченко А.Ю., Симакова А.Н., Смирнов Н.Г., Верпоорте А., Головачев И.Б., 2008. Эволюция экосистем Европы при переходе от плейстоцена к голоцену (24–8 тыс.л.н.) / Отв.ред. А.К. Маркова, Т. ван Кольфсхотен. М.: Товарищество научных изданий КМК. 556 с.
  12. Млекопитающие Казахстана. В 4 х томах. Т. 1. Ч. 3, 1978. Алма-­Ата: Наука КазССР. 492 с.
  13. Огнев С.И., 1950. Звери СССР и прилежащих стран (звери Восточной Европы и Северной Азии). М.-Л.: Изд-во АН СССР. Т. 7. 706 с.
  14. Павлинов И.Я., 2019. Звери России. Справочник-­определитель. Ч. 1. Насекомоядные, Рукокрылые, Зайцеобразные, Грызуны. М.: Товарищество научных изданий КМК. 340 с.
  15. Петрова Т.В., 2016. Узкочерепная полевка Lasiopodomys (Stenocranius) gregalis (Pallas, 1779): таксономическая структура, положение в системе и эволюция. Автореф. дис. … канд. биол. наук. Санкт-­Петербург: ЗИН РАН. 25 с.
  16. Чертилина О.В., Симонов Е.П., Лопатина Н.В., Литвинов Ю.Н., 2012. Генетическое разнообразие плоскочерепной полевки (Alticola strelzowi (Kastschenko, 1899)) по данным об изменчивости гена цитохрома b // Генетика. Т. 48. № 3. С. 352–360.
  17. Шереметьевa И.Н., Картавцева И.В., Фрисман Л.В., Васильева Т.В., Аднагулова А.В., 2015. Полиморфизм и генетическая структура полевки Максимовича Microtus maximowiczii (Schrenck, 1858) (Rodentia, Cricetidae) среднего Приамурья по данным секвенирования контрольного региона мтДНК // Генетика. Т. 51. № 10. С. 1154–1162.
  18. Шереметьевa И.Н., Картавцева И.В., Павленко М.В., Моролдоев И.В., Баженов Ю.А., Голенищев Ф.Н., 2022. Формирование генетической структуры популяций дальневосточной полевки (Alexandromys fortis, Rodentia, Arvicolinae) на северной периферии ареала // Зоологический журнал. Т. 101. № 10. С. 1173–1189.
  19. Abramson N.I., Bodrov S.Y., Bondareva O.V., Genelt-­Yanovskiy E.A., Petrova T.V., 2021. A mitochondrial genome phylogeny of voles and lemmings (Rodentia: Arvicolinae): Evolu-tionary and taxonomic implications // PLoS ONE. 16(11): e0248198. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0248198
  20. Bandelt H., Forster P., Röhl A., 1999. Median-­joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. V. 16. № 1. P. 37–48.
  21. Bannikova A., Lebedev V., Lissovskii A. et al., 2010. Molecular phylogeny and evolution of the Asian lineage of vole genus Microtus (Rodentia: Arvicolinae) in-ferred from mitochondrial cytochrome b sequence // Biol. J. Linnean Society. № 99. P. 595–613.
  22. Bannikova A.A., Lebedev V.S., Poplavskaya N.S., Simanovsky S.A., Undrakhbayar E., Adiya Y., Surov A.S., 2019. Phylogeny and phylogeography of arvicoline and lagurine voles of Mongolia // Folia Zool. Т. 68 (2). P. 100–113.
  23. Irwin D.M., Kocher T.D., Wilson A.C., 1991. Evolution of the cytochrome b gene of mammals // J. Mol. Evol. V. 32. № 2. P. 128–144.
  24. Krystufek B., Shenbrot G.I., 2022. Voles and Lemmings (Arvicolinae) of the Palaearctic Region. Slovenia, University of Maribor, University Press. 427 p.
  25. Leigh J.W., Bryant D., 2015. PopART: Full-feature software for haplotype network construction // Methods Ecol. Evol. V. 6. № 9. P. 1110–1116.
  26. Ohdachi S.D., Dokuchaev N.E., Hasegawa M., Masuda R., 2001. Intraspecific phylogeny and geographical variation of six species of northeastern Asiatic Sorex shrews based on the mitochondrial cytochrome b sequences // Molecular Ecology. № 10. P. 2199–2213.
  27. Petrova T.V., Zakharov E.S., Samiya R., Abramson N.I., 2015. Phylogeography of the narrow-­headed vole Lasiopodomys (Stenocranius) gregalis (Cricetidae, Rodentia) inferred mitochondrial cytochrome b sequences: an echo Pleistocene prosperity // J. of Zoological Systematics and Evolutionary Research. V. 53. № 2. P. 97–108.
  28. Petrova T.V., Kuksin F.N., Putintsev N.I., Lopatina N.V., Lissovsky A.A., 2023. Phylogeography of Lasiopodomys gregalis (Rodentia, Cricetidae) in the southern part of its geographic range // Russian J. Theriol. V. 22. № 2. P. 102–119.
  29. Rozas J., Ferrer-­Mata A., Sánchez-­DelBarrio J.C., Guirao-­Rico S., Librado P., Ramos-­Onsins S.E., Sánchez-­Gracia A., 2017. DnaSP 6: DNA Sequence Polymor-­phism Analysis of Large Datasets // Mol. Biol. Evol. № 34. Р. 3299–3302.
  30. Sayers E.W., Cavanaugh M., Clark K., Pruitt K.D., Schoch C.L., Sherry S.T., Karsch-­Mizrachi I., 2022. GenBank. Nucleic Acids Res. 50 (D1): D13-D19. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
  31. Sievers F., Higgins D.G., 2017. Clustal Omega for making accurate alignments of many protein sequences // Protein Science. V. 27. № 1. P. 135–145.
  32. Tamura K., Nei M., 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees // Mol. Biol. Evol. V. 10. № 3. P. 512–526.
  33. Tamura K., Stecher G., Kumar S., 2021. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11 // Mol. Biol. Evol. V. 38. № 7. Р. 3022–3027.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».